MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020248	TTA	2	6	50271	50276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070681
1002	NC_020248	TC	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	449070681
1003	NC_020248	TGT	2	6	50525	50530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070681
1004	NC_020248	TA	3	6	50551	50556	50 %	50 %	0 %	0 %	449070681
1005	NC_020248	ATT	2	6	50583	50588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070681
1006	NC_020248	ATG	2	6	50605	50610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070681
1007	NC_020248	TCC	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070681
1008	NC_020248	AACA	2	8	50876	50883	75 %	0 %	0 %	25 %	449070681
1009	NC_020248	ACT	2	6	50894	50899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070681
1010	NC_020248	GAT	2	6	50937	50942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070681
1011	NC_020248	GCA	2	6	50955	50960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070681
1012	NC_020248	ATC	2	6	50969	50974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070681
1013	NC_020248	TCA	2	6	51106	51111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070681
1014	NC_020248	AAT	2	6	51144	51149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070681
1015	NC_020248	AGT	2	6	51188	51193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070681
1016	NC_020248	CCT	2	6	51387	51392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070681
1017	NC_020248	ATG	2	6	51456	51461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070681
1018	NC_020248	TTTGG	2	10	51477	51486	0 %	60 %	40 %	0 %	449070681
1019	NC_020248	CTC	2	6	51543	51548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070681
1020	NC_020248	CAA	2	6	51615	51620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070681
1021	NC_020248	CAT	2	6	51622	51627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070681
1022	NC_020248	TTG	2	6	51631	51636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070681
1023	NC_020248	AAC	2	6	51656	51661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070681
1024	NC_020248	ATT	2	6	51669	51674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070681
1025	NC_020248	TTG	3	9	51730	51738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070681
1026	NC_020248	GTT	2	6	51762	51767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070681
1027	NC_020248	GTT	2	6	51874	51879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070681
1028	NC_020248	CAG	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070681
1029	NC_020248	CAT	2	6	52007	52012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070681
1030	NC_020248	AGT	2	6	52038	52043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070681
1031	NC_020248	GAA	2	6	52047	52052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070681
1032	NC_020248	AAG	2	6	52072	52077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070681
1033	NC_020248	C	6	6	52151	52156	0 %	0 %	0 %	100 %	449070681
1034	NC_020248	CTT	2	6	52911	52916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070682
1035	NC_020248	TTA	2	6	52928	52933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070682
1036	NC_020248	GTT	2	6	52941	52946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070682
1037	NC_020248	ACG	2	6	52966	52971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070682
1038	NC_020248	TGCC	2	8	52972	52979	0 %	25 %	25 %	50 %	449070682
1039	NC_020248	TGT	2	6	53004	53009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070682
1040	NC_020248	GT	3	6	53095	53100	0 %	50 %	50 %	0 %	449070682
1041	NC_020248	T	6	6	53129	53134	0 %	100 %	0 %	0 %	449070682
1042	NC_020248	CTT	2	6	53161	53166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070682
1043	NC_020248	T	6	6	53165	53170	0 %	100 %	0 %	0 %	449070682
1044	NC_020248	CAGCAA	2	12	53181	53192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	449070682
1045	NC_020248	TTC	2	6	53230	53235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070682
1046	NC_020248	AT	3	6	53282	53287	50 %	50 %	0 %	0 %	449070682
1047	NC_020248	AAT	2	6	53338	53343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070682
1048	NC_020248	TCG	2	6	53427	53432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070682
1049	NC_020248	TTCA	2	8	53473	53480	25 %	50 %	0 %	25 %	449070682
1050	NC_020248	A	6	6	53651	53656	100 %	0 %	0 %	0 %	449070682
1051	NC_020248	TCA	2	6	53717	53722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070682
1052	NC_020248	T	6	6	53773	53778	0 %	100 %	0 %	0 %	449070682
1053	NC_020248	CGT	2	6	53836	53841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070682
1054	NC_020248	AGG	2	6	53863	53868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070682
1055	NC_020248	AAG	2	6	53893	53898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070682
1056	NC_020248	GAA	2	6	53910	53915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070682
1057	NC_020248	T	6	6	53931	53936	0 %	100 %	0 %	0 %	449070683
1058	NC_020248	CAG	2	6	53962	53967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070683
1059	NC_020248	AGG	2	6	54030	54035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070683
1060	NC_020248	CGC	2	6	54047	54052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070683
1061	NC_020248	ACC	2	6	54080	54085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070683
1062	NC_020248	GTAT	2	8	54126	54133	25 %	50 %	25 %	0 %	449070683
1063	NC_020248	TCA	2	6	54198	54203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070683
1064	NC_020248	CAG	2	6	54250	54255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070683
1065	NC_020248	TGT	2	6	54277	54282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070683
1066	NC_020248	GTA	2	6	54290	54295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070683
1067	NC_020248	CATA	2	8	54321	54328	50 %	25 %	0 %	25 %	449070683
1068	NC_020248	CTTATC	2	12	54341	54352	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449070683
1069	NC_020248	TTG	2	6	54370	54375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070683
1070	NC_020248	CTT	2	6	54839	54844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070684
1071	NC_020248	TCG	2	6	54859	54864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070684
1072	NC_020248	T	7	7	54899	54905	0 %	100 %	0 %	0 %	449070684
1073	NC_020248	TCT	2	6	54925	54930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070684
1074	NC_020248	T	7	7	54945	54951	0 %	100 %	0 %	0 %	449070684
1075	NC_020248	CTT	2	6	54998	55003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070684
1076	NC_020248	ACG	2	6	55011	55016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070684
1077	NC_020248	TAA	2	6	55025	55030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070684
1078	NC_020248	CTG	2	6	55046	55051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070684
1079	NC_020248	AAATTT	2	12	55102	55113	50 %	50 %	0 %	0 %	449070684
1080	NC_020248	GCA	2	6	55114	55119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070684
1081	NC_020248	ATA	2	6	55120	55125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070684
1082	NC_020248	CTA	2	6	55256	55261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070684
1083	NC_020248	CTT	2	6	55298	55303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070684
1084	NC_020248	AGC	2	6	55320	55325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070684
1085	NC_020248	TTTTC	2	10	55331	55340	0 %	80 %	0 %	20 %	449070684
1086	NC_020248	TCA	2	6	55397	55402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070685
1087	NC_020248	AG	3	6	55418	55423	50 %	0 %	50 %	0 %	449070685
1088	NC_020248	GCT	2	6	55646	55651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070685
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1090	NC_020248	CTT	2	6	55722	55727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070685
1091	NC_020248	GAG	2	6	55737	55742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070685
1092	NC_020248	TAA	2	6	55783	55788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070685
1093	NC_020248	TCA	2	6	55799	55804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070685
1094	NC_020248	TAGC	2	8	55845	55852	25 %	25 %	25 %	25 %	449070685
1095	NC_020248	CAG	2	6	55866	55871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070685
1096	NC_020248	TTG	2	6	55897	55902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070685
1097	NC_020248	TGA	2	6	55914	55919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070685
1098	NC_020248	CTGT	2	8	56024	56031	0 %	50 %	25 %	25 %	449070685
1099	NC_020248	AG	4	8	56032	56039	50 %	0 %	50 %	0 %	449070685
1100	NC_020248	TAG	2	6	56221	56226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070686
1101	NC_020248	GAA	2	6	56239	56244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070686
1102	NC_020248	TGA	2	6	56262	56267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070686
1103	NC_020248	GAA	2	6	56306	56311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070686
1104	NC_020248	CTT	2	6	56316	56321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070686
1105	NC_020248	GCT	2	6	56378	56383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070686
1106	NC_020248	CTTT	2	8	56414	56421	0 %	75 %	0 %	25 %	449070686
1107	NC_020248	AGAA	2	8	56434	56441	75 %	0 %	25 %	0 %	449070686
1108	NC_020248	TTCCCA	2	12	56459	56470	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	449070686
1109	NC_020248	GTT	2	6	56498	56503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070686
1110	NC_020248	GAAG	2	8	56603	56610	50 %	0 %	50 %	0 %	449070686
1111	NC_020248	GTA	2	6	56613	56618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070686
1112	NC_020248	CAA	2	6	56658	56663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070686
1113	NC_020248	ATT	2	6	56692	56697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070686
1114	NC_020248	CAG	2	6	56733	56738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070686
1115	NC_020248	TGC	2	6	56758	56763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070686
1116	NC_020248	CTT	2	6	56772	56777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070686
1117	NC_020248	T	6	6	56794	56799	0 %	100 %	0 %	0 %	449070686
1118	NC_020248	GTAA	2	8	56826	56833	50 %	25 %	25 %	0 %	449070686
1119	NC_020248	CTT	2	6	56841	56846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070686
1120	NC_020248	CTG	2	6	56905	56910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070686
1121	NC_020248	TTAG	2	8	56949	56956	25 %	50 %	25 %	0 %	449070686
1122	NC_020248	T	7	7	56973	56979	0 %	100 %	0 %	0 %	449070687
1123	NC_020248	TCT	2	6	56989	56994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070687
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1125	NC_020248	CT	3	6	57037	57042	0 %	50 %	0 %	50 %	449070687
1126	NC_020248	GA	3	6	57065	57070	50 %	0 %	50 %	0 %	449070687
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