MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020248	GCT	2	6	24849	24854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070657
502	NC_020248	GCT	2	6	24879	24884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070657
503	NC_020248	CTA	2	6	24906	24911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070657
504	NC_020248	TCTG	2	8	24927	24934	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
505	NC_020248	TAGT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	25 %	0 %	449070657
506	NC_020248	TTG	2	6	25016	25021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
507	NC_020248	TGT	2	6	25068	25073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
508	NC_020248	ATT	2	6	25109	25114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
509	NC_020248	T	6	6	25231	25236	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
510	NC_020248	TTGC	2	8	25252	25259	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
511	NC_020248	AGC	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070657
512	NC_020248	TTG	2	6	25385	25390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
513	NC_020248	GAAC	2	8	25440	25447	50 %	0 %	25 %	25 %	449070657
514	NC_020248	GCA	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070657
515	NC_020248	GTT	2	6	25539	25544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
516	NC_020248	CTT	2	6	25585	25590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
517	NC_020248	AG	3	6	25607	25612	50 %	0 %	50 %	0 %	449070657
518	NC_020248	GAGT	2	8	25624	25631	25 %	25 %	50 %	0 %	449070657
519	NC_020248	TAA	2	6	25639	25644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070657
520	NC_020248	CTT	3	9	25645	25653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
521	NC_020248	CAC	2	6	25654	25659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070657
522	NC_020248	TTA	2	6	25674	25679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
523	NC_020248	TTA	2	6	25749	25754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
524	NC_020248	TCAT	2	8	25788	25795	25 %	50 %	0 %	25 %	449070657
525	NC_020248	CCA	2	6	25812	25817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070657
526	NC_020248	A	6	6	25862	25867	100 %	0 %	0 %	0 %	449070657
527	NC_020248	TCT	2	6	25914	25919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
528	NC_020248	T	6	6	25991	25996	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
529	NC_020248	TCTT	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	449070657
530	NC_020248	T	7	7	26049	26055	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
531	NC_020248	GTTT	2	8	26077	26084	0 %	75 %	25 %	0 %	449070657
532	NC_020248	T	6	6	26082	26087	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
533	NC_020248	TAA	2	6	26099	26104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070657
534	NC_020248	TGT	2	6	26207	26212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
535	NC_020248	AGG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070657
536	NC_020248	GTT	2	6	26312	26317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
537	NC_020248	AAC	2	6	26325	26330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070657
538	NC_020248	TAAA	2	8	26470	26477	75 %	25 %	0 %	0 %	449070657
539	NC_020248	TA	3	6	26510	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	449070657
540	NC_020248	AGA	2	6	26519	26524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070657
541	NC_020248	TTA	2	6	26694	26699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
542	NC_020248	A	6	6	26769	26774	100 %	0 %	0 %	0 %	449070658
543	NC_020248	CCA	2	6	26813	26818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070658
544	NC_020248	TTA	2	6	26820	26825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
545	NC_020248	TGA	2	6	26906	26911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070658
546	NC_020248	CTG	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
547	NC_020248	ACA	2	6	27110	27115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
548	NC_020248	TTA	2	6	27129	27134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
549	NC_020248	A	6	6	27144	27149	100 %	0 %	0 %	0 %	449070658
550	NC_020248	AAG	2	6	27271	27276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
551	NC_020248	AGC	2	6	27287	27292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
552	NC_020248	TGGT	2	8	27325	27332	0 %	50 %	50 %	0 %	449070658
553	NC_020248	TA	3	6	27370	27375	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
554	NC_020248	AAG	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
555	NC_020248	TCT	2	6	27411	27416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070658
556	NC_020248	GGT	2	6	27426	27431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070658
557	NC_020248	TC	3	6	27455	27460	0 %	50 %	0 %	50 %	449070658
558	NC_020248	AGA	3	9	27560	27568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
559	NC_020248	ACA	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
560	NC_020248	AC	3	6	27623	27628	50 %	0 %	0 %	50 %	449070658
561	NC_020248	AATC	2	8	27719	27726	50 %	25 %	0 %	25 %	449070658
562	NC_020248	GCT	2	6	27765	27770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
563	NC_020248	GTT	2	6	27789	27794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070658
564	NC_020248	TCA	2	6	27818	27823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070658
565	NC_020248	CAG	2	6	27914	27919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
566	NC_020248	CGC	2	6	27920	27925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070658
567	NC_020248	AATT	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
568	NC_020248	CAA	3	9	27990	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
569	NC_020248	TAA	2	6	28004	28009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070658
570	NC_020248	TA	3	6	28047	28052	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
571	NC_020248	TTG	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070658
572	NC_020248	CTA	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070658
573	NC_020248	ACA	2	6	28101	28106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
574	NC_020248	AGC	2	6	28142	28147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
575	NC_020248	GAAA	2	8	28148	28155	75 %	0 %	25 %	0 %	449070658
576	NC_020248	AGA	2	6	28259	28264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
577	NC_020248	CAA	2	6	28284	28289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
578	NC_020248	T	6	6	28613	28618	0 %	100 %	0 %	0 %	449070658
579	NC_020248	GCT	2	6	28707	28712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
580	NC_020248	CAG	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
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583	NC_020248	AAAT	2	8	28805	28812	75 %	25 %	0 %	0 %	449070658
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587	NC_020248	TAAGTG	2	12	29023	29034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070658
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596	NC_020248	GCCAC	2	10	29443	29452	20 %	0 %	20 %	60 %	449070659
597	NC_020248	CAA	2	6	29458	29463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070659
598	NC_020248	TGT	2	6	29528	29533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070659
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601	NC_020248	GAT	3	9	29596	29604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070659
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603	NC_020248	CGT	2	6	29908	29913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070660
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605	NC_020248	AG	3	6	29922	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	449070660
606	NC_020248	TTG	2	6	29939	29944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070660
607	NC_020248	ATC	2	6	29965	29970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070660
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609	NC_020248	TTG	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070660
610	NC_020248	GTT	2	6	30203	30208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070660
611	NC_020248	TAG	2	6	30229	30234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070660
612	NC_020248	ACCA	2	8	30235	30242	50 %	0 %	0 %	50 %	449070660
613	NC_020248	CCT	2	6	30377	30382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070661
614	NC_020248	AG	3	6	30580	30585	50 %	0 %	50 %	0 %	449070661
615	NC_020248	A	6	6	30622	30627	100 %	0 %	0 %	0 %	449070661
616	NC_020248	T	7	7	30667	30673	0 %	100 %	0 %	0 %	449070661
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618	NC_020248	TTG	2	6	30759	30764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070661
619	NC_020248	GCA	2	6	30916	30921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070662
620	NC_020248	AGC	2	6	30987	30992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070662
621	NC_020248	CCA	2	6	31024	31029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070662
622	NC_020248	GA	3	6	31102	31107	50 %	0 %	50 %	0 %	449070662
623	NC_020248	ATT	2	6	31137	31142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070662
624	NC_020248	AAT	2	6	31173	31178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070662
625	NC_020248	GA	4	8	31232	31239	50 %	0 %	50 %	0 %	449070662
626	NC_020248	T	6	6	31248	31253	0 %	100 %	0 %	0 %	449070662
627	NC_020248	TAA	2	6	31259	31264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070662
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629	NC_020248	GAA	2	6	31328	31333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070662
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