MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020248	CAT	2	6	275811	275816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070914
5002	NC_020248	AGC	2	6	275818	275823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070914
5003	NC_020248	TAT	2	6	275824	275829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070914
5004	NC_020248	GCA	2	6	275831	275836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070914
5005	NC_020248	CT	3	6	275855	275860	0 %	50 %	0 %	50 %	449070914
5006	NC_020248	CAG	2	6	275862	275867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070914
5007	NC_020248	TTA	2	6	275895	275900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070914
5008	NC_020248	GAA	2	6	275903	275908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070914
5009	NC_020248	TGC	2	6	275974	275979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070914
5010	NC_020248	GT	3	6	276032	276037	0 %	50 %	50 %	0 %	449070914
5011	NC_020248	AGG	3	9	276118	276126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070914
5012	NC_020248	TCA	2	6	276147	276152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070914
5013	NC_020248	CT	3	6	276190	276195	0 %	50 %	0 %	50 %	449070914
5014	NC_020248	T	6	6	276208	276213	0 %	100 %	0 %	0 %	449070914
5015	NC_020248	GAT	2	6	276277	276282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070914
5016	NC_020248	CTT	2	6	276314	276319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070914
5017	NC_020248	AAG	2	6	276328	276333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070914
5018	NC_020248	AGA	2	6	276407	276412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070915
5019	NC_020248	AAG	2	6	276414	276419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070915
5020	NC_020248	TCG	2	6	276435	276440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070915
5021	NC_020248	AAT	2	6	276475	276480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070915
5022	NC_020248	TGTT	2	8	276533	276540	0 %	75 %	25 %	0 %	449070915
5023	NC_020248	CTAT	2	8	276763	276770	25 %	50 %	0 %	25 %	449070916
5024	NC_020248	TC	3	6	276795	276800	0 %	50 %	0 %	50 %	449070916
5025	NC_020248	TTC	2	6	276826	276831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070916
5026	NC_020248	TGT	2	6	276842	276847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070916
5027	NC_020248	AG	3	6	276858	276863	50 %	0 %	50 %	0 %	449070916
5028	NC_020248	CGC	2	6	276910	276915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070916
5029	NC_020248	AGC	2	6	276919	276924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070916
5030	NC_020248	AGG	2	6	276934	276939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070916
5031	NC_020248	CTT	2	6	276999	277004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070916
5032	NC_020248	CAGGA	2	10	277089	277098	40 %	0 %	40 %	20 %	449070916
5033	NC_020248	AGA	2	6	277109	277114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070916
5034	NC_020248	CTT	2	6	277194	277199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070916
5035	NC_020248	GAA	2	6	277239	277244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070916
5036	NC_020248	CTG	2	6	277257	277262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070916
5037	NC_020248	CTT	2	6	277326	277331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070916
5038	NC_020248	TTTC	2	8	277347	277354	0 %	75 %	0 %	25 %	449070916
5039	NC_020248	CTG	2	6	277422	277427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070916
5040	NC_020248	GCA	2	6	277433	277438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070916
5041	NC_020248	TGGT	2	8	277627	277634	0 %	50 %	50 %	0 %	449070917
5042	NC_020248	AACA	2	8	277688	277695	75 %	0 %	0 %	25 %	449070917
5043	NC_020248	GTT	2	6	277705	277710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070917
5044	NC_020248	CGC	2	6	277777	277782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070917
5045	NC_020248	GAA	2	6	277862	277867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070917
5046	NC_020248	TCT	2	6	277886	277891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070917
5047	NC_020248	TG	3	6	277915	277920	0 %	50 %	50 %	0 %	449070917
5048	NC_020248	GTT	2	6	277987	277992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070917
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5050	NC_020248	GTT	2	6	278029	278034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070917
5051	NC_020248	TAGT	2	8	278040	278047	25 %	50 %	25 %	0 %	449070917
5052	NC_020248	GTC	2	6	278072	278077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070917
5053	NC_020248	CGTT	2	8	278184	278191	0 %	50 %	25 %	25 %	449070917
5054	NC_020248	GTAAA	2	10	278203	278212	60 %	20 %	20 %	0 %	449070917
5055	NC_020248	CGT	2	6	278214	278219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070917
5056	NC_020248	GACT	2	8	278228	278235	25 %	25 %	25 %	25 %	449070917
5057	NC_020248	GGT	2	6	278260	278265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070917
5058	NC_020248	ATAA	2	8	278290	278297	75 %	25 %	0 %	0 %	449070917
5059	NC_020248	AG	3	6	278310	278315	50 %	0 %	50 %	0 %	449070917
5060	NC_020248	GAA	2	6	278383	278388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070917
5061	NC_020248	AGGA	2	8	278438	278445	50 %	0 %	50 %	0 %	449070917
5062	NC_020248	TAA	2	6	278446	278451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070917
5063	NC_020248	TG	3	6	278465	278470	0 %	50 %	50 %	0 %	449070917
5064	NC_020248	CAG	2	6	278501	278506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070917
5065	NC_020248	TCC	2	6	278524	278529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070917
5066	NC_020248	TTG	2	6	278572	278577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070917
5067	NC_020248	ACA	3	9	278592	278600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070917
5068	NC_020248	TGC	2	6	278611	278616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070917
5069	NC_020248	GTAA	2	8	278636	278643	50 %	25 %	25 %	0 %	449070917
5070	NC_020248	GAA	3	9	278662	278670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070917
5071	NC_020248	AATCC	2	10	278724	278733	40 %	20 %	0 %	40 %	449070917
5072	NC_020248	TCA	2	6	278751	278756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070917
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5074	NC_020248	GA	3	6	278939	278944	50 %	0 %	50 %	0 %	449070917
5075	NC_020248	TCAA	2	8	278951	278958	50 %	25 %	0 %	25 %	449070917
5076	NC_020248	AAG	2	6	278982	278987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070917
5077	NC_020248	CTAAGT	2	12	279045	279056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449070917
5078	NC_020248	TTGT	2	8	279119	279126	0 %	75 %	25 %	0 %	449070917
5079	NC_020248	GA	3	6	279141	279146	50 %	0 %	50 %	0 %	449070917
5080	NC_020248	CAG	2	6	279294	279299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070917
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5089	NC_020248	GTAA	2	8	279767	279774	50 %	25 %	25 %	0 %	449070917
5090	NC_020248	ATA	2	6	279812	279817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070917
5091	NC_020248	CTTC	2	8	279825	279832	0 %	50 %	0 %	50 %	449070917
5092	NC_020248	GA	3	6	279975	279980	50 %	0 %	50 %	0 %	449070917
5093	NC_020248	GT	3	6	279986	279991	0 %	50 %	50 %	0 %	449070917
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5110	NC_020248	GGA	3	9	280571	280579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070917
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5112	NC_020248	AGGC	2	8	280618	280625	25 %	0 %	50 %	25 %	449070917
5113	NC_020248	TGT	2	6	280660	280665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070917
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5117	NC_020248	GTTGT	2	10	280722	280731	0 %	60 %	40 %	0 %	449070917
5118	NC_020248	CTT	2	6	280811	280816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070917
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5122	NC_020248	AGC	2	6	280982	280987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070917
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5124	NC_020248	TAAA	2	8	281654	281661	75 %	25 %	0 %	0 %	449070918
5125	NC_020248	TTC	2	6	281669	281674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070918
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5242	NC_020248	TGGA	2	8	288251	288258	25 %	25 %	50 %	0 %	449070924
5243	NC_020248	AGA	2	6	288274	288279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070924
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5490	NC_020248	TGC	2	6	305933	305938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5491	NC_020248	CAG	2	6	305965	305970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5492	NC_020248	AAC	2	6	305978	305983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070932
5493	NC_020248	GCT	2	6	305988	305993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5494	NC_020248	GCA	2	6	305994	305999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5495	NC_020248	GCTGCA	2	12	306000	306011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5496	NC_020248	AGG	2	6	306049	306054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070932
5497	NC_020248	GAG	2	6	306068	306073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070932
5498	NC_020248	TGC	2	6	306087	306092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070932
5499	NC_020248	TTG	2	6	306288	306293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070932
5500	NC_020248	GTT	2	6	306318	306323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070932

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