MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020248	AAT	2	6	248553	248558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070886
4502	NC_020248	AAG	2	6	248594	248599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
4503	NC_020248	ATTT	2	8	248630	248637	25 %	75 %	0 %	0 %	449070886
4504	NC_020248	CTT	2	6	248666	248671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070886
4505	NC_020248	TCT	2	6	248719	248724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070886
4506	NC_020248	TCCT	2	8	248778	248785	0 %	50 %	0 %	50 %	449070886
4507	NC_020248	TTC	2	6	248862	248867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070886
4508	NC_020248	GCA	2	6	248894	248899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070886
4509	NC_020248	GAA	2	6	249026	249031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
4510	NC_020248	GAAT	2	8	249050	249057	50 %	25 %	25 %	0 %	449070886
4511	NC_020248	AG	3	6	249093	249098	50 %	0 %	50 %	0 %	449070886
4512	NC_020248	T	6	6	249181	249186	0 %	100 %	0 %	0 %	449070886
4513	NC_020248	ACG	2	6	249187	249192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070886
4514	NC_020248	CAG	2	6	249473	249478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070886
4515	NC_020248	GAA	2	6	249479	249484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
4516	NC_020248	GTT	2	6	249524	249529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070886
4517	NC_020248	TAACA	2	10	249677	249686	60 %	20 %	0 %	20 %	449070886
4518	NC_020248	TGG	2	6	249912	249917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070887
4519	NC_020248	CAG	2	6	250075	250080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070887
4520	NC_020248	CTT	2	6	250093	250098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070887
4521	NC_020248	GA	3	6	250238	250243	50 %	0 %	50 %	0 %	449070888
4522	NC_020248	CTT	2	6	250245	250250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070888
4523	NC_020248	T	6	6	250249	250254	0 %	100 %	0 %	0 %	449070888
4524	NC_020248	TCC	2	6	250377	250382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070888
4525	NC_020248	GT	3	6	250385	250390	0 %	50 %	50 %	0 %	449070888
4526	NC_020248	TTC	2	6	250428	250433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070888
4527	NC_020248	T	6	6	250482	250487	0 %	100 %	0 %	0 %	449070888
4528	NC_020248	TCT	2	6	250498	250503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070888
4529	NC_020248	CAT	2	6	250508	250513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070888
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4531	NC_020248	CTT	2	6	250808	250813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070888
4532	NC_020248	TCT	2	6	250849	250854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070888
4533	NC_020248	AG	3	6	250929	250934	50 %	0 %	50 %	0 %	449070888
4534	NC_020248	CTC	2	6	250971	250976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070888
4535	NC_020248	TGA	2	6	250981	250986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070888
4536	NC_020248	A	6	6	251007	251012	100 %	0 %	0 %	0 %	449070888
4537	NC_020248	GAG	2	6	251026	251031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070888
4538	NC_020248	G	6	6	251099	251104	0 %	0 %	100 %	0 %	449070888
4539	NC_020248	TA	3	6	251112	251117	50 %	50 %	0 %	0 %	449070888
4540	NC_020248	TC	3	6	251382	251387	0 %	50 %	0 %	50 %	449070889
4541	NC_020248	ACAT	2	8	251389	251396	50 %	25 %	0 %	25 %	449070889
4542	NC_020248	T	8	8	251422	251429	0 %	100 %	0 %	0 %	449070889
4543	NC_020248	TTC	2	6	251432	251437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070889
4544	NC_020248	TCA	2	6	251448	251453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070889
4545	NC_020248	AG	3	6	251470	251475	50 %	0 %	50 %	0 %	449070889
4546	NC_020248	ACA	2	6	251481	251486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070889
4547	NC_020248	TTC	2	6	251498	251503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070889
4548	NC_020248	AGG	2	6	251508	251513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070889
4549	NC_020248	A	6	6	251538	251543	100 %	0 %	0 %	0 %	449070889
4550	NC_020248	TGC	2	6	251549	251554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070889
4551	NC_020248	GGA	2	6	251607	251612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070889
4552	NC_020248	TCA	2	6	251661	251666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070889
4553	NC_020248	TCA	2	6	251685	251690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070889
4554	NC_020248	AGC	2	6	251740	251745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070889
4555	NC_020248	T	6	6	251757	251762	0 %	100 %	0 %	0 %	449070889
4556	NC_020248	TTTAT	2	10	251851	251860	20 %	80 %	0 %	0 %	449070890
4557	NC_020248	T	7	7	251888	251894	0 %	100 %	0 %	0 %	449070890
4558	NC_020248	CAT	2	6	251902	251907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070890
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4560	NC_020248	T	7	7	252142	252148	0 %	100 %	0 %	0 %	449070891
4561	NC_020248	CGA	2	6	252164	252169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070891
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4565	NC_020248	T	6	6	252445	252450	0 %	100 %	0 %	0 %	449070892
4566	NC_020248	ATC	2	6	252523	252528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070892
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4572	NC_020248	GAT	2	6	252793	252798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070892
4573	NC_020248	CAG	2	6	252814	252819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070892
4574	NC_020248	ATC	2	6	252902	252907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070892
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4589	NC_020248	ATC	2	6	253917	253922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070894
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4592	NC_020248	GATT	2	8	254024	254031	25 %	50 %	25 %	0 %	449070894
4593	NC_020248	TGA	2	6	254033	254038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070894
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4595	NC_020248	T	7	7	254095	254101	0 %	100 %	0 %	0 %	449070895
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4604	NC_020248	GAA	2	6	254659	254664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070895
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4606	NC_020248	TCA	2	6	254784	254789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070895
4607	NC_020248	TAC	2	6	254806	254811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070895
4608	NC_020248	G	7	7	254933	254939	0 %	0 %	100 %	0 %	449070895
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4610	NC_020248	TGCT	2	8	254986	254993	0 %	50 %	25 %	25 %	449070895
4611	NC_020248	CAT	2	6	255094	255099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070895
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4616	NC_020248	TGAG	2	8	255475	255482	25 %	25 %	50 %	0 %	449070895
4617	NC_020248	CTTTT	2	10	255538	255547	0 %	80 %	0 %	20 %	449070895
4618	NC_020248	T	6	6	255544	255549	0 %	100 %	0 %	0 %	449070895
4619	NC_020248	CTT	2	6	255553	255558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070895
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4994	NC_020248	GGAT	2	8	275588	275595	25 %	25 %	50 %	0 %	449070914
4995	NC_020248	TGC	2	6	275650	275655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070914
4996	NC_020248	CTC	2	6	275656	275661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070914
4997	NC_020248	GCA	2	6	275681	275686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070914
4998	NC_020248	ATT	2	6	275728	275733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070914
4999	NC_020248	CT	3	6	275740	275745	0 %	50 %	0 %	50 %	449070914
5000	NC_020248	TG	3	6	275774	275779	0 %	50 %	50 %	0 %	449070914

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