MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Uzinura diaspidicola str. ASNER

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020135	ATTCT	2	10	89	98	20 %	60 %	0 %	20 %	442743029
2	NC_020135	GTAAT	2	10	1389	1398	40 %	40 %	20 %	0 %	442743030
3	NC_020135	GTAAA	2	10	2202	2211	60 %	20 %	20 %	0 %	442743030
4	NC_020135	CTGCA	2	10	4035	4044	20 %	20 %	20 %	40 %	442743031
5	NC_020135	AGAAA	2	10	4260	4269	80 %	0 %	20 %	0 %	442743032
6	NC_020135	ATTTT	2	10	5231	5240	20 %	80 %	0 %	0 %	442743033
7	NC_020135	GAAAT	2	10	7488	7497	60 %	20 %	20 %	0 %	442743034
8	NC_020135	AAAAT	2	10	10603	10612	80 %	20 %	0 %	0 %	442743038
9	NC_020135	CTAAA	2	10	10872	10881	60 %	20 %	0 %	20 %	442743038
10	NC_020135	TTTTC	2	10	16420	16429	0 %	80 %	0 %	20 %	442743044
11	NC_020135	AAAAT	2	10	16553	16562	80 %	20 %	0 %	0 %	442743044
12	NC_020135	TTTAA	2	10	16579	16588	40 %	60 %	0 %	0 %	442743044
13	NC_020135	TTGAT	2	10	18081	18090	20 %	60 %	20 %	0 %	442743047
14	NC_020135	TAAAA	2	10	18276	18285	80 %	20 %	0 %	0 %	442743047
15	NC_020135	ATTTG	2	10	18957	18966	20 %	60 %	20 %	0 %	442743048
16	NC_020135	TTGAT	2	10	19649	19658	20 %	60 %	20 %	0 %	442743048
17	NC_020135	GTAGA	2	10	19970	19979	40 %	20 %	40 %	0 %	442743048
18	NC_020135	TCAAA	2	10	20152	20161	60 %	20 %	0 %	20 %	442743048
19	NC_020135	AGATA	2	10	20370	20379	60 %	20 %	20 %	0 %	442743048
20	NC_020135	ACAGA	2	10	20393	20402	60 %	0 %	20 %	20 %	442743048
21	NC_020135	TAAGA	2	10	21309	21318	60 %	20 %	20 %	0 %	442743048
22	NC_020135	ATTAG	2	10	22426	22435	40 %	40 %	20 %	0 %	442743049
23	NC_020135	TAAAG	2	10	23745	23754	60 %	20 %	20 %	0 %	442743049
24	NC_020135	AATGC	2	10	24241	24250	40 %	20 %	20 %	20 %	442743049
25	NC_020135	AGGTA	2	10	25488	25497	40 %	20 %	40 %	0 %	442743049
26	NC_020135	ATTTT	2	10	26652	26661	20 %	80 %	0 %	0 %	442743050
27	NC_020135	TTTTA	2	10	27765	27774	20 %	80 %	0 %	0 %	442743051
28	NC_020135	TAGAT	2	10	30217	30226	40 %	40 %	20 %	0 %	442743055
29	NC_020135	TTAGT	2	10	31367	31376	20 %	60 %	20 %	0 %	442743055
30	NC_020135	AAAGA	2	10	32022	32031	80 %	0 %	20 %	0 %	442743056
31	NC_020135	TTCCT	2	10	32317	32326	0 %	60 %	0 %	40 %	442743056
32	NC_020135	AAGAA	2	10	33285	33294	80 %	0 %	20 %	0 %	442743057
33	NC_020135	GATTT	2	10	33393	33402	20 %	60 %	20 %	0 %	442743057
34	NC_020135	AAATT	2	10	33823	33832	60 %	40 %	0 %	0 %	442743057
35	NC_020135	TTTTA	2	10	34121	34130	20 %	80 %	0 %	0 %	442743057
36	NC_020135	GAACA	2	10	34805	34814	60 %	0 %	20 %	20 %	442743058
37	NC_020135	TAATT	2	10	36073	36082	40 %	60 %	0 %	0 %	442743059
38	NC_020135	AAAAT	2	10	37585	37594	80 %	20 %	0 %	0 %	442743061
39	NC_020135	ATAGC	2	10	39039	39048	40 %	20 %	20 %	20 %	442743063
40	NC_020135	TAAAA	2	10	47396	47405	80 %	20 %	0 %	0 %	442743066
41	NC_020135	ATGCT	2	10	48210	48219	20 %	40 %	20 %	20 %	442743066
42	NC_020135	GAAAT	2	10	48307	48316	60 %	20 %	20 %	0 %	442743066
43	NC_020135	ACTTT	2	10	49997	50006	20 %	60 %	0 %	20 %	442743067
44	NC_020135	TTCCC	2	10	50074	50083	0 %	40 %	0 %	60 %	442743067
45	NC_020135	AATAT	2	10	50389	50398	60 %	40 %	0 %	0 %	442743068
46	NC_020135	GTTTT	2	10	50616	50625	0 %	80 %	20 %	0 %	442743068
47	NC_020135	AAGAA	2	10	54263	54272	80 %	0 %	20 %	0 %	442743069
48	NC_020135	ATTTT	2	10	55797	55806	20 %	80 %	0 %	0 %	442743070
49	NC_020135	GCTGC	2	10	57866	57875	0 %	20 %	40 %	40 %	442743071
50	NC_020135	TAAAA	2	10	58863	58872	80 %	20 %	0 %	0 %	442743072
51	NC_020135	TATAT	2	10	58905	58914	40 %	60 %	0 %	0 %	442743072
52	NC_020135	ATTTT	2	10	59394	59403	20 %	80 %	0 %	0 %	442743074
53	NC_020135	TGATC	2	10	60438	60447	20 %	40 %	20 %	20 %	442743075
54	NC_020135	GAAAA	2	10	60788	60797	80 %	0 %	20 %	0 %	442743075
55	NC_020135	TGCAT	2	10	61065	61074	20 %	40 %	20 %	20 %	442743075
56	NC_020135	TTTCT	2	10	63369	63378	0 %	80 %	0 %	20 %	442743076
57	NC_020135	TAAAT	2	10	63805	63814	60 %	40 %	0 %	0 %	442743076
58	NC_020135	AAGAA	2	10	64540	64549	80 %	0 %	20 %	0 %	442743076
59	NC_020135	GAATT	2	10	65061	65070	40 %	40 %	20 %	0 %	442743076
60	NC_020135	TCTTT	2	10	65889	65898	0 %	80 %	0 %	20 %	442743076
61	NC_020135	AAAAT	2	10	68672	68681	80 %	20 %	0 %	0 %	442743080
62	NC_020135	GTTTA	2	10	68844	68853	20 %	60 %	20 %	0 %	442743080
63	NC_020135	AAATA	2	10	69180	69189	80 %	20 %	0 %	0 %	442743080
64	NC_020135	CTTTT	2	10	69982	69991	0 %	80 %	0 %	20 %	442743081
65	NC_020135	AGAAA	2	10	70639	70648	80 %	0 %	20 %	0 %	442743082
66	NC_020135	TAAAA	2	10	71190	71199	80 %	20 %	0 %	0 %	442743082
67	NC_020135	AAATA	2	10	73649	73658	80 %	20 %	0 %	0 %	442743085
68	NC_020135	ATAAA	2	10	75901	75910	80 %	20 %	0 %	0 %	442743086
69	NC_020135	AATGG	2	10	78585	78594	40 %	20 %	40 %	0 %	442743087
70	NC_020135	ATTTC	2	10	79184	79193	20 %	60 %	0 %	20 %	442743088
71	NC_020135	CTAAA	2	10	80552	80561	60 %	20 %	0 %	20 %	442743089
72	NC_020135	AGAGA	2	10	81181	81190	60 %	0 %	40 %	0 %	442743089
73	NC_020135	TTACC	2	10	82311	82320	20 %	40 %	0 %	40 %	442743090
74	NC_020135	TTTTA	2	10	82321	82330	20 %	80 %	0 %	0 %	442743090
75	NC_020135	AAAGA	2	10	84127	84136	80 %	0 %	20 %	0 %	442743091
76	NC_020135	AAATA	2	10	84470	84479	80 %	20 %	0 %	0 %	442743091
77	NC_020135	AAGAT	2	10	85878	85887	60 %	20 %	20 %	0 %	442743093
78	NC_020135	CTTTT	2	10	87011	87020	0 %	80 %	0 %	20 %	442743094
79	NC_020135	GAAAA	2	10	87043	87052	80 %	0 %	20 %	0 %	442743094
80	NC_020135	TAAAT	2	10	87900	87909	60 %	40 %	0 %	0 %	442743094
81	NC_020135	TATTT	2	10	88790	88799	20 %	80 %	0 %	0 %	442743094
82	NC_020135	TAAAG	2	10	91420	91429	60 %	20 %	20 %	0 %	442743096
83	NC_020135	CTTAC	2	10	92205	92214	20 %	40 %	0 %	40 %	442743098
84	NC_020135	ATAAA	2	10	92217	92226	80 %	20 %	0 %	0 %	442743098
85	NC_020135	AAAAT	2	10	99958	99967	80 %	20 %	0 %	0 %	442743103
86	NC_020135	ATACA	2	10	100670	100679	60 %	20 %	0 %	20 %	442743105
87	NC_020135	TGTAT	2	10	101407	101416	20 %	60 %	20 %	0 %	442743106
88	NC_020135	TAAAA	2	10	101799	101808	80 %	20 %	0 %	0 %	442743106
89	NC_020135	CCCAA	2	10	102257	102266	40 %	0 %	0 %	60 %	442743107
90	NC_020135	TTAAA	2	10	103005	103014	60 %	40 %	0 %	0 %	442743107
91	NC_020135	ACTAT	2	10	104189	104198	40 %	40 %	0 %	20 %	442743108
92	NC_020135	ACAAA	2	10	105475	105484	80 %	0 %	0 %	20 %	442743109
93	NC_020135	ATTTT	2	10	108813	108822	20 %	80 %	0 %	0 %	442743112
94	NC_020135	GAGAT	2	10	109879	109888	40 %	20 %	40 %	0 %	442743113
95	NC_020135	GAACC	2	10	111132	111141	40 %	0 %	20 %	40 %	442743114
96	NC_020135	ACATC	2	10	111574	111583	40 %	20 %	0 %	40 %	442743115
97	NC_020135	AAATA	2	10	112194	112203	80 %	20 %	0 %	0 %	442743115
98	NC_020135	TATTT	2	10	113739	113748	20 %	80 %	0 %	0 %	442743118
99	NC_020135	ACATT	2	10	114830	114839	40 %	40 %	0 %	20 %	442743118
100	NC_020135	AGTAA	2	10	115510	115519	60 %	20 %	20 %	0 %	442743119
101	NC_020135	GTTTA	2	10	116557	116566	20 %	60 %	20 %	0 %	442743120
102	NC_020135	ATTCT	2	10	117348	117357	20 %	60 %	0 %	20 %	442743120
103	NC_020135	TCCAC	2	10	117536	117545	20 %	20 %	0 %	60 %	442743120
104	NC_020135	GAGTT	2	10	119866	119875	20 %	40 %	40 %	0 %	442743123
105	NC_020135	TAAAA	2	10	120422	120431	80 %	20 %	0 %	0 %	442743123
106	NC_020135	TACTT	2	10	121259	121268	20 %	60 %	0 %	20 %	442743124
107	NC_020135	TGATT	2	10	121586	121595	20 %	60 %	20 %	0 %	442743124
108	NC_020135	ATATA	2	10	121622	121631	60 %	40 %	0 %	0 %	442743124
109	NC_020135	TATAT	2	10	121819	121828	40 %	60 %	0 %	0 %	442743125
110	NC_020135	TATAG	2	10	122588	122597	40 %	40 %	20 %	0 %	442743126
111	NC_020135	TATTT	2	10	124444	124453	20 %	80 %	0 %	0 %	442743127
112	NC_020135	CAAAA	2	10	125072	125081	80 %	0 %	0 %	20 %	442743128
113	NC_020135	TAAAT	2	10	126829	126838	60 %	40 %	0 %	0 %	442743129
114	NC_020135	AAATT	2	10	127879	127888	60 %	40 %	0 %	0 %	442743129
115	NC_020135	ATAAA	2	10	129281	129290	80 %	20 %	0 %	0 %	442743129
116	NC_020135	TAATC	2	10	135750	135759	40 %	40 %	0 %	20 %	442743136
117	NC_020135	GATAA	2	10	139973	139982	60 %	20 %	20 %	0 %	442743139
118	NC_020135	AGAAA	2	10	140981	140990	80 %	0 %	20 %	0 %	442743141
119	NC_020135	AAATA	2	10	141786	141795	80 %	20 %	0 %	0 %	442743142
120	NC_020135	AGGAA	2	10	141843	141852	60 %	0 %	40 %	0 %	442743142
121	NC_020135	AAAAG	2	10	143037	143046	80 %	0 %	20 %	0 %	442743144
122	NC_020135	TGGAT	2	10	143970	143979	20 %	40 %	40 %	0 %	442743146
123	NC_020135	TTATT	2	10	144141	144150	20 %	80 %	0 %	0 %	442743146
124	NC_020135	ATAAA	2	10	146405	146414	80 %	20 %	0 %	0 %	442743148
125	NC_020135	TAATA	2	10	147841	147850	60 %	40 %	0 %	0 %	442743151
126	NC_020135	TGATT	2	10	148970	148979	20 %	60 %	20 %	0 %	442743153
127	NC_020135	TACTC	2	10	149208	149217	20 %	40 %	0 %	40 %	442743153
128	NC_020135	ATAAA	2	10	149253	149262	80 %	20 %	0 %	0 %	442743153
129	NC_020135	TATTT	2	10	150251	150260	20 %	80 %	0 %	0 %	442743155
130	NC_020135	AAGAA	2	10	150421	150430	80 %	0 %	20 %	0 %	442743156
131	NC_020135	AGAAT	2	10	154381	154390	60 %	20 %	20 %	0 %	442743166
132	NC_020135	AAAAG	2	10	155780	155789	80 %	0 %	20 %	0 %	442743168
133	NC_020135	GTACA	2	10	157795	157804	40 %	20 %	20 %	20 %	442743172
134	NC_020135	TAGGT	2	10	158562	158571	20 %	40 %	40 %	0 %	442743173
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136	NC_020135	GATGG	2	10	159479	159488	20 %	20 %	60 %	0 %	442743174
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.