MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 1769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020134	GAACA	2	10	584	593	60 %	0 %	20 %	20 %	442803497
2	NC_020134	AAAAT	2	10	2152	2161	80 %	20 %	0 %	0 %	442803499
3	NC_020134	AAATA	2	10	3073	3082	80 %	20 %	0 %	0 %	442803500
4	NC_020134	CCTTT	2	10	7233	7242	0 %	60 %	0 %	40 %	442803503
5	NC_020134	TTTTA	2	10	7657	7666	20 %	80 %	0 %	0 %	442803503
6	NC_020134	AGAGC	2	10	10341	10350	40 %	0 %	40 %	20 %	442803505
7	NC_020134	ATAAA	2	10	10389	10398	80 %	20 %	0 %	0 %	442803505
8	NC_020134	AGAAA	2	10	10563	10572	80 %	0 %	20 %	0 %	442803505
9	NC_020134	GAAAT	2	10	11662	11671	60 %	20 %	20 %	0 %	442803507
10	NC_020134	GAAAA	2	10	11719	11728	80 %	0 %	20 %	0 %	442803507
11	NC_020134	GGAAA	2	10	11785	11794	60 %	0 %	40 %	0 %	442803507
12	NC_020134	GAAAA	2	10	12724	12733	80 %	0 %	20 %	0 %	442803507
13	NC_020134	AGGAA	2	10	13935	13944	60 %	0 %	40 %	0 %	442803508
14	NC_020134	ATGAA	2	10	18846	18855	60 %	20 %	20 %	0 %	442803513
15	NC_020134	AGCCA	2	10	19727	19736	40 %	0 %	20 %	40 %	442803514
16	NC_020134	AAGTT	2	10	20212	20221	40 %	40 %	20 %	0 %	442803514
17	NC_020134	TTTTC	2	10	20615	20624	0 %	80 %	0 %	20 %	442803514
18	NC_020134	GAAGA	2	10	22359	22368	60 %	0 %	40 %	0 %	442803515
19	NC_020134	ATTGG	2	10	22555	22564	20 %	40 %	40 %	0 %	442803515
20	NC_020134	GGGAA	2	10	23594	23603	40 %	0 %	60 %	0 %	442803515
21	NC_020134	TTCCC	2	10	28083	28092	0 %	40 %	0 %	60 %	442803520
22	NC_020134	ATTTC	2	10	28223	28232	20 %	60 %	0 %	20 %	442803520
23	NC_020134	ATTTC	2	10	30003	30012	20 %	60 %	0 %	20 %	442803522
24	NC_020134	GAGAA	2	10	31259	31268	60 %	0 %	40 %	0 %	442803524
25	NC_020134	TGACT	2	10	31419	31428	20 %	40 %	20 %	20 %	442803524
26	NC_020134	ATTTC	2	10	32960	32969	20 %	60 %	0 %	20 %	442803526
27	NC_020134	GAACA	2	10	34170	34179	60 %	0 %	20 %	20 %	442803527
28	NC_020134	GCAGG	2	10	37841	37850	20 %	0 %	60 %	20 %	442803532
29	NC_020134	AAGTG	2	10	37923	37932	40 %	20 %	40 %	0 %	442803532
30	NC_020134	GGAAT	2	10	40671	40680	40 %	20 %	40 %	0 %	442803533
31	NC_020134	CCGTT	2	10	40784	40793	0 %	40 %	20 %	40 %	442803533
32	NC_020134	GTGAC	2	10	40901	40910	20 %	20 %	40 %	20 %	442803533
33	NC_020134	ATATT	2	10	41051	41060	40 %	60 %	0 %	0 %	442803533
34	NC_020134	GGAAA	2	10	44037	44046	60 %	0 %	40 %	0 %	442803535
35	NC_020134	CCGGC	2	10	46252	46261	0 %	0 %	40 %	60 %	442803537
36	NC_020134	AAGCC	2	10	48634	48643	40 %	0 %	20 %	40 %	442803539
37	NC_020134	GATGA	2	10	51073	51082	40 %	20 %	40 %	0 %	442803541
38	NC_020134	GAAGG	2	10	52163	52172	40 %	0 %	60 %	0 %	442803542
39	NC_020134	GGGAA	2	10	52271	52280	40 %	0 %	60 %	0 %	442803542
40	NC_020134	CCGTT	2	10	52595	52604	0 %	40 %	20 %	40 %	442803542
41	NC_020134	CTTAA	2	10	54012	54021	40 %	40 %	0 %	20 %	442803544
42	NC_020134	ATTGT	2	10	54936	54945	20 %	60 %	20 %	0 %	442803545
43	NC_020134	ATGAT	2	10	55747	55756	40 %	40 %	20 %	0 %	442803546
44	NC_020134	GCTGT	2	10	56517	56526	0 %	40 %	40 %	20 %	442803546
45	NC_020134	ATGCC	2	10	61268	61277	20 %	20 %	20 %	40 %	442803550
46	NC_020134	ACGGA	2	10	61525	61534	40 %	0 %	40 %	20 %	442803551
47	NC_020134	CAGTT	2	10	63593	63602	20 %	40 %	20 %	20 %	442803554
48	NC_020134	CTTTG	2	10	67218	67227	0 %	60 %	20 %	20 %	442803556
49	NC_020134	TGATG	2	10	70315	70324	20 %	40 %	40 %	0 %	442803558
50	NC_020134	CTGAA	2	10	71122	71131	40 %	20 %	20 %	20 %	442803559
51	NC_020134	GGAAG	2	10	77524	77533	40 %	0 %	60 %	0 %	442803564
52	NC_020134	AGTGG	2	10	79125	79134	20 %	20 %	60 %	0 %	442803566
53	NC_020134	GACAG	2	10	81035	81044	40 %	0 %	40 %	20 %	442803569
54	NC_020134	TTTAC	2	10	81329	81338	20 %	60 %	0 %	20 %	442803570
55	NC_020134	GACAG	2	10	82042	82051	40 %	0 %	40 %	20 %	442803570
56	NC_020134	GAAAG	2	10	86452	86461	60 %	0 %	40 %	0 %	442803575
57	NC_020134	GTGAT	2	10	87463	87472	20 %	40 %	40 %	0 %	442803576
58	NC_020134	AAAAC	2	10	87747	87756	80 %	0 %	0 %	20 %	442803577
59	NC_020134	TGATA	2	10	90293	90302	40 %	40 %	20 %	0 %	442803579
60	NC_020134	AAAGG	2	10	90541	90550	60 %	0 %	40 %	0 %	442803580
61	NC_020134	ACGGT	2	10	90639	90648	20 %	20 %	40 %	20 %	442803580
62	NC_020134	GTTTT	2	10	92907	92916	0 %	80 %	20 %	0 %	442803583
63	NC_020134	GTATT	2	10	94559	94568	20 %	60 %	20 %	0 %	442803583
64	NC_020134	CCTGC	2	10	101111	101120	0 %	20 %	20 %	60 %	442803588
65	NC_020134	ATGGA	2	10	101183	101192	40 %	20 %	40 %	0 %	442803588
66	NC_020134	TAAAA	2	10	102668	102677	80 %	20 %	0 %	0 %	442803589
67	NC_020134	ATGTA	2	10	103589	103598	40 %	40 %	20 %	0 %	442803590
68	NC_020134	TAAAA	2	10	106632	106641	80 %	20 %	0 %	0 %	442803594
69	NC_020134	CTCCC	2	10	107640	107649	0 %	20 %	0 %	80 %	442803595
70	NC_020134	GGGCA	2	10	109846	109855	20 %	0 %	60 %	20 %	442803596
71	NC_020134	CGTAA	2	10	110854	110863	40 %	20 %	20 %	20 %	442803596
72	NC_020134	CAGTG	2	10	112875	112884	20 %	20 %	40 %	20 %	442803598
73	NC_020134	TCAAA	2	10	116730	116739	60 %	20 %	0 %	20 %	442803603
74	NC_020134	GGGTT	2	10	116760	116769	0 %	40 %	60 %	0 %	442803603
75	NC_020134	TAATG	2	10	122642	122651	40 %	40 %	20 %	0 %	442803608
76	NC_020134	TCCTG	2	10	122990	122999	0 %	40 %	20 %	40 %	442803608
77	NC_020134	ACGGA	2	10	124178	124187	40 %	0 %	40 %	20 %	442803610
78	NC_020134	GTTTA	2	10	129008	129017	20 %	60 %	20 %	0 %	442803612
79	NC_020134	TGTAC	2	10	131294	131303	20 %	40 %	20 %	20 %	442803613
80	NC_020134	TTTTA	2	10	132063	132072	20 %	80 %	0 %	0 %	442803614
81	NC_020134	AAAGA	2	10	132447	132456	80 %	0 %	20 %	0 %	442803615
82	NC_020134	TAAAA	2	10	133060	133069	80 %	20 %	0 %	0 %	442803615
83	NC_020134	GCAAA	2	10	133992	134001	60 %	0 %	20 %	20 %	442803617
84	NC_020134	GGAAA	2	10	139683	139692	60 %	0 %	40 %	0 %	442803623
85	NC_020134	GAAAA	2	10	143345	143354	80 %	0 %	20 %	0 %	442803625
86	NC_020134	AAAGC	2	10	146421	146430	60 %	0 %	20 %	20 %	442803628
87	NC_020134	TTTAT	2	10	147846	147855	20 %	80 %	0 %	0 %	442803629
88	NC_020134	TTTTA	2	10	149624	149633	20 %	80 %	0 %	0 %	442803629
89	NC_020134	GAAAT	2	10	150344	150353	60 %	20 %	20 %	0 %	442803629
90	NC_020134	CATTT	2	10	152002	152011	20 %	60 %	0 %	20 %	442803630
91	NC_020134	GAAAG	2	10	153343	153352	60 %	0 %	40 %	0 %	442803632
92	NC_020134	ATTGC	2	10	155580	155589	20 %	40 %	20 %	20 %	442803634
93	NC_020134	TAGGT	2	10	156637	156646	20 %	40 %	40 %	0 %	442803635
94	NC_020134	TTTTA	2	10	157042	157051	20 %	80 %	0 %	0 %	442803635
95	NC_020134	AAGGT	2	10	157557	157566	40 %	20 %	40 %	0 %	442803636
96	NC_020134	TAATA	2	10	158360	158369	60 %	40 %	0 %	0 %	442803637
97	NC_020134	TTCTT	2	10	159234	159243	0 %	80 %	0 %	20 %	442803638
98	NC_020134	TTGGT	2	10	160149	160158	0 %	60 %	40 %	0 %	442803639
99	NC_020134	GGAAT	2	10	160233	160242	40 %	20 %	40 %	0 %	442803639
100	NC_020134	TTATA	2	10	160798	160807	40 %	60 %	0 %	0 %	442803639
101	NC_020134	ATGAA	2	10	161496	161505	60 %	20 %	20 %	0 %	442803640
102	NC_020134	ATATT	2	10	161982	161991	40 %	60 %	0 %	0 %	442803640
103	NC_020134	GAAAT	2	10	162228	162237	60 %	20 %	20 %	0 %	442803640
104	NC_020134	TTCTT	2	10	163108	163117	0 %	80 %	0 %	20 %	442803641
105	NC_020134	TATGA	2	10	163124	163133	40 %	40 %	20 %	0 %	442803641
106	NC_020134	GGTAA	2	10	165331	165340	40 %	20 %	40 %	0 %	442803643
107	NC_020134	ATTAA	2	10	166381	166390	60 %	40 %	0 %	0 %	442803644
108	NC_020134	ATTAT	2	10	166768	166777	40 %	60 %	0 %	0 %	442803645
109	NC_020134	TGGGA	2	10	167446	167455	20 %	20 %	60 %	0 %	442803645
110	NC_020134	AGGGA	2	10	176846	176855	40 %	0 %	60 %	0 %	442803651
111	NC_020134	ATTTG	2	10	177319	177328	20 %	60 %	20 %	0 %	442803651
112	NC_020134	TGTCT	2	10	181254	181263	0 %	60 %	20 %	20 %	442803656
113	NC_020134	TTTTA	2	10	185126	185135	20 %	80 %	0 %	0 %	442803660
114	NC_020134	CACCG	2	10	185431	185440	20 %	0 %	20 %	60 %	442803660
115	NC_020134	AATTT	2	10	188204	188213	40 %	60 %	0 %	0 %	442803660
116	NC_020134	AGAAA	2	10	189552	189561	80 %	0 %	20 %	0 %	442803661
117	NC_020134	TGTTC	2	10	189822	189831	0 %	60 %	20 %	20 %	442803662
118	NC_020134	AAAGC	2	10	192312	192321	60 %	0 %	20 %	20 %	442803665
119	NC_020134	GTTCC	2	10	193681	193690	0 %	40 %	20 %	40 %	442803668
120	NC_020134	TGGAC	2	10	194141	194150	20 %	20 %	40 %	20 %	442803668
121	NC_020134	AAGGG	2	10	195055	195064	40 %	0 %	60 %	0 %	442803669
122	NC_020134	TTTGA	2	10	195665	195674	20 %	60 %	20 %	0 %	442803669
123	NC_020134	GCGCT	2	10	195861	195870	0 %	20 %	40 %	40 %	442803669
124	NC_020134	AAAGC	2	10	195889	195898	60 %	0 %	20 %	20 %	442803669
125	NC_020134	GTTAT	2	10	197050	197059	20 %	60 %	20 %	0 %	442803672
126	NC_020134	TCGGT	2	10	197840	197849	0 %	40 %	40 %	20 %	442803673
127	NC_020134	CCTTT	2	10	209565	209574	0 %	60 %	0 %	40 %	442803680
128	NC_020134	TTTTA	2	10	209989	209998	20 %	80 %	0 %	0 %	442803680
129	NC_020134	CATTC	2	10	211130	211139	20 %	40 %	0 %	40 %	442803682
130	NC_020134	AATCC	2	10	213539	213548	40 %	20 %	0 %	40 %	442803684
131	NC_020134	GTTAG	2	10	215706	215715	20 %	40 %	40 %	0 %	442803686
132	NC_020134	TGAAA	2	10	220203	220212	60 %	20 %	20 %	0 %	442803690
133	NC_020134	ATGAA	2	10	220574	220583	60 %	20 %	20 %	0 %	442803690
134	NC_020134	CTGTG	2	10	223382	223391	0 %	40 %	40 %	20 %	442803693
135	NC_020134	AATAA	2	10	223996	224005	80 %	20 %	0 %	0 %	442803693
136	NC_020134	TTTCA	2	10	224951	224960	20 %	60 %	0 %	20 %	442803694
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148	NC_020134	ATATG	2	10	244227	244236	40 %	40 %	20 %	0 %	442803708
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153	NC_020134	TTCCT	2	10	249167	249176	0 %	60 %	0 %	40 %	442803712
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166	NC_020134	TCATC	2	10	271185	271194	20 %	40 %	0 %	40 %	442803731
167	NC_020134	TCCGG	2	10	272438	272447	0 %	20 %	40 %	40 %	442803732
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243	NC_020134	CAAGG	2	10	378271	378280	40 %	0 %	40 %	20 %	442803829
244	NC_020134	GGAAA	2	10	378624	378633	60 %	0 %	40 %	0 %	442803830
245	NC_020134	GTTTT	2	10	378949	378958	0 %	80 %	20 %	0 %	442803830
246	NC_020134	TGATT	2	10	380050	380059	20 %	60 %	20 %	0 %	442803831
247	NC_020134	AAAGA	2	10	386099	386108	80 %	0 %	20 %	0 %	442803838
248	NC_020134	AGTAC	2	10	387254	387263	40 %	20 %	20 %	20 %	442803839
249	NC_020134	ATTCA	2	10	390463	390472	40 %	40 %	0 %	20 %	442803844
250	NC_020134	ACATG	2	10	391349	391358	40 %	20 %	20 %	20 %	442803845
251	NC_020134	ATTAC	2	10	395957	395966	40 %	40 %	0 %	20 %	442803850
252	NC_020134	TTTGA	2	10	396160	396169	20 %	60 %	20 %	0 %	442803850
253	NC_020134	AATAT	2	10	396431	396440	60 %	40 %	0 %	0 %	442803851
254	NC_020134	GAAAG	2	10	397470	397479	60 %	0 %	40 %	0 %	442803852
255	NC_020134	CAGCG	2	10	398919	398928	20 %	0 %	40 %	40 %	442803853
256	NC_020134	TTTTG	2	10	399648	399657	0 %	80 %	20 %	0 %	442803854
257	NC_020134	AAAAG	2	10	400202	400211	80 %	0 %	20 %	0 %	442803854
258	NC_020134	GCCCG	2	10	400470	400479	0 %	0 %	40 %	60 %	442803854
259	NC_020134	CGAAA	2	10	402538	402547	60 %	0 %	20 %	20 %	442803855
260	NC_020134	TGAAT	2	10	403624	403633	40 %	40 %	20 %	0 %	442803855
261	NC_020134	GAATT	2	10	404319	404328	40 %	40 %	20 %	0 %	442803855
262	NC_020134	AGGCA	2	10	404403	404412	40 %	0 %	40 %	20 %	442803855
263	NC_020134	GAACA	2	10	407390	407399	60 %	0 %	20 %	20 %	442803856
264	NC_020134	ATTTG	2	10	408105	408114	20 %	60 %	20 %	0 %	442803856
265	NC_020134	AAATG	2	10	409891	409900	60 %	20 %	20 %	0 %	442803856
266	NC_020134	ACCCC	2	10	414201	414210	20 %	0 %	0 %	80 %	442803861
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379	NC_020134	TTTTA	2	10	566580	566589	20 %	80 %	0 %	0 %	442804012
380	NC_020134	CCAGG	2	10	566669	566678	20 %	0 %	40 %	40 %	442804012
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383	NC_020134	GAAAA	2	10	572948	572957	80 %	0 %	20 %	0 %	442804020
384	NC_020134	TGATA	2	10	574080	574089	40 %	40 %	20 %	0 %	442804023
385	NC_020134	GACAA	2	10	576634	576643	60 %	0 %	20 %	20 %	442804025
386	NC_020134	ATTCA	2	10	578778	578787	40 %	40 %	0 %	20 %	442804026
387	NC_020134	CAAAA	2	10	579061	579070	80 %	0 %	0 %	20 %	442804027
388	NC_020134	GATAT	2	10	579743	579752	40 %	40 %	20 %	0 %	442804027
389	NC_020134	ACAAT	2	10	579863	579872	60 %	20 %	0 %	20 %	442804028
390	NC_020134	ACGGT	2	10	580427	580436	20 %	20 %	40 %	20 %	442804028
391	NC_020134	TACCT	2	10	580988	580997	20 %	40 %	0 %	40 %	442804029
392	NC_020134	ATGTC	2	10	581403	581412	20 %	40 %	20 %	20 %	442804029
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