MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020134	GCA	2	6	118940	118945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803604
2002	NC_020134	GTG	2	6	119515	119520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803605
2003	NC_020134	ATA	2	6	119536	119541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803605
2004	NC_020134	AGA	2	6	119605	119610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803605
2005	NC_020134	ATT	2	6	119645	119650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803605
2006	NC_020134	TTTA	2	8	119669	119676	25 %	75 %	0 %	0 %	442803605
2007	NC_020134	TAT	2	6	119752	119757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803606
2008	NC_020134	A	6	6	119802	119807	100 %	0 %	0 %	0 %	442803606
2009	NC_020134	TGC	2	6	119841	119846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803606
2010	NC_020134	GAA	2	6	119897	119902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803606
2011	NC_020134	TTA	2	6	119916	119921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803606
2012	NC_020134	GGT	2	6	119941	119946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803606
2013	NC_020134	GGT	2	6	119974	119979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803606
2014	NC_020134	TAC	2	6	119987	119992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803606
2015	NC_020134	GAA	2	6	120041	120046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803606
2016	NC_020134	ACA	2	6	120078	120083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803606
2017	NC_020134	ACG	2	6	120108	120113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803606
2018	NC_020134	GATG	2	8	120118	120125	25 %	25 %	50 %	0 %	442803606
2019	NC_020134	GAG	2	6	120242	120247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803606
2020	NC_020134	ATA	2	6	120272	120277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803606
2021	NC_020134	GGA	2	6	120278	120283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803606
2022	NC_020134	TAT	2	6	120332	120337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803606
2023	NC_020134	AT	3	6	120370	120375	50 %	50 %	0 %	0 %	442803606
2024	NC_020134	TGA	2	6	120391	120396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803606
2025	NC_020134	A	7	7	120426	120432	100 %	0 %	0 %	0 %	442803606
2026	NC_020134	TCC	2	6	120448	120453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803606
2027	NC_020134	A	6	6	120549	120554	100 %	0 %	0 %	0 %	442803606
2028	NC_020134	GGA	2	6	120574	120579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803606
2029	NC_020134	TAC	2	6	120590	120595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803606
2030	NC_020134	GAA	2	6	120638	120643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803606
2031	NC_020134	GGA	2	6	120691	120696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803606
2032	NC_020134	ACT	2	6	120699	120704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803606
2033	NC_020134	AGC	2	6	120752	120757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803606
2034	NC_020134	A	6	6	120779	120784	100 %	0 %	0 %	0 %	442803606
2035	NC_020134	TCT	2	6	120904	120909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803606
2036	NC_020134	A	7	7	121189	121195	100 %	0 %	0 %	0 %	442803607
2037	NC_020134	GAA	2	6	121204	121209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803607
2038	NC_020134	AGA	2	6	121210	121215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803607
2039	NC_020134	A	7	7	121226	121232	100 %	0 %	0 %	0 %	442803607
2040	NC_020134	ATG	2	6	121258	121263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803607
2041	NC_020134	CGT	2	6	121272	121277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803607
2042	NC_020134	TATT	2	8	121278	121285	25 %	75 %	0 %	0 %	442803607
2043	NC_020134	AAT	2	6	121317	121322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803607
2044	NC_020134	AATA	2	8	121333	121340	75 %	25 %	0 %	0 %	442803607
2045	NC_020134	AT	3	6	121366	121371	50 %	50 %	0 %	0 %	442803607
2046	NC_020134	TTA	2	6	121453	121458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803607
2047	NC_020134	AAAC	2	8	121653	121660	75 %	0 %	0 %	25 %	442803607
2048	NC_020134	ATT	2	6	121756	121761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803607
2049	NC_020134	AAT	2	6	121773	121778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803607
2050	NC_020134	TAA	2	6	121824	121829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803607
2051	NC_020134	TTATTC	2	12	121877	121888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442803607
2052	NC_020134	GAA	2	6	121904	121909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803607
2053	NC_020134	AAT	2	6	122014	122019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803607
2054	NC_020134	TTG	2	6	122239	122244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803608
2055	NC_020134	GTG	2	6	122256	122261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803608
2056	NC_020134	TG	3	6	122260	122265	0 %	50 %	50 %	0 %	442803608
2057	NC_020134	ATCA	2	8	122294	122301	50 %	25 %	0 %	25 %	442803608
2058	NC_020134	TGC	2	6	122309	122314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803608
2059	NC_020134	AC	3	6	122386	122391	50 %	0 %	0 %	50 %	442803608
2060	NC_020134	GTG	2	6	122430	122435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803608
2061	NC_020134	AGG	2	6	122549	122554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803608
2062	NC_020134	TAATG	2	10	122642	122651	40 %	40 %	20 %	0 %	442803608
2063	NC_020134	GGA	2	6	122681	122686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803608
2064	NC_020134	TA	3	6	122734	122739	50 %	50 %	0 %	0 %	442803608
2065	NC_020134	TAA	2	6	122755	122760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803608
2066	NC_020134	TGC	2	6	122884	122889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803608
2067	NC_020134	AAC	2	6	122912	122917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803608
2068	NC_020134	TATG	2	8	122964	122971	25 %	50 %	25 %	0 %	442803608
2069	NC_020134	TCCTG	2	10	122990	122999	0 %	40 %	20 %	40 %	442803608
2070	NC_020134	GTAT	2	8	123192	123199	25 %	50 %	25 %	0 %	442803609
2071	NC_020134	GCT	2	6	123206	123211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803609
2072	NC_020134	CT	3	6	123226	123231	0 %	50 %	0 %	50 %	442803609
2073	NC_020134	GCTG	2	8	123245	123252	0 %	25 %	50 %	25 %	442803609
2074	NC_020134	CAG	2	6	123271	123276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803609
2075	NC_020134	TAA	2	6	123293	123298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803609
2076	NC_020134	GAT	2	6	123318	123323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803609
2077	NC_020134	TAT	2	6	123324	123329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803609
2078	NC_020134	A	6	6	123432	123437	100 %	0 %	0 %	0 %	442803609
2079	NC_020134	GTTG	2	8	123473	123480	0 %	50 %	50 %	0 %	442803609
2080	NC_020134	TGT	2	6	123514	123519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803609
2081	NC_020134	ATA	2	6	123543	123548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803609
2082	NC_020134	TA	3	6	123579	123584	50 %	50 %	0 %	0 %	442803609
2083	NC_020134	GTTT	2	8	123592	123599	0 %	75 %	25 %	0 %	442803609
2084	NC_020134	A	7	7	123652	123658	100 %	0 %	0 %	0 %	442803609
2085	NC_020134	TAA	2	6	123664	123669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803609
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2087	NC_020134	CTA	2	6	123701	123706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803609
2088	NC_020134	GAA	2	6	123765	123770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803610
2089	NC_020134	TTC	2	6	123896	123901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803610
2090	NC_020134	TCT	2	6	124044	124049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803610
2091	NC_020134	TTG	2	6	124085	124090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803610
2092	NC_020134	TTA	2	6	124170	124175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803610
2093	NC_020134	ACGGA	2	10	124178	124187	40 %	0 %	40 %	20 %	442803610
2094	NC_020134	TTG	2	6	124199	124204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803610
2095	NC_020134	CCG	2	6	124210	124215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803610
2096	NC_020134	CGA	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803610
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2099	NC_020134	CAG	2	6	124483	124488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803610
2100	NC_020134	CGA	2	6	124503	124508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803610
2101	NC_020134	AT	3	6	124579	124584	50 %	50 %	0 %	0 %	442803610
2102	NC_020134	GAA	2	6	124591	124596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803610
2103	NC_020134	ATT	2	6	124606	124611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803610
2104	NC_020134	ATAC	2	8	124613	124620	50 %	25 %	0 %	25 %	442803610
2105	NC_020134	ATC	2	6	124899	124904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803611
2106	NC_020134	ATA	2	6	124968	124973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803611
2107	NC_020134	GTCT	2	8	124974	124981	0 %	50 %	25 %	25 %	442803611
2108	NC_020134	GTT	2	6	125142	125147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803611
2109	NC_020134	TCC	2	6	125150	125155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803611
2110	NC_020134	CAT	2	6	125195	125200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803611
2111	NC_020134	GCA	2	6	125240	125245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803611
2112	NC_020134	CGG	2	6	125265	125270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803611
2113	NC_020134	AGCC	2	8	125329	125336	25 %	0 %	25 %	50 %	442803611
2114	NC_020134	CG	3	6	125386	125391	0 %	0 %	50 %	50 %	442803611
2115	NC_020134	TCT	2	6	125404	125409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803611
2116	NC_020134	GCCG	2	8	125543	125550	0 %	0 %	50 %	50 %	442803611
2117	NC_020134	TAA	2	6	125611	125616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803611
2118	NC_020134	CGC	2	6	125666	125671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803611
2119	NC_020134	CTT	2	6	125744	125749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803611
2120	NC_020134	GTT	2	6	125907	125912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803611
2121	NC_020134	TCG	2	6	126043	126048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803611
2122	NC_020134	CCTG	2	8	126137	126144	0 %	25 %	25 %	50 %	442803611
2123	NC_020134	T	6	6	126292	126297	0 %	100 %	0 %	0 %	442803611
2124	NC_020134	CGT	2	6	126299	126304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803611
2125	NC_020134	T	6	6	126377	126382	0 %	100 %	0 %	0 %	442803611
2126	NC_020134	TGTA	2	8	126419	126426	25 %	50 %	25 %	0 %	442803611
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2128	NC_020134	ATC	2	6	126567	126572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803611
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2132	NC_020134	TGC	2	6	126686	126691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803611
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2142	NC_020134	GGC	2	6	127471	127476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803611
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2145	NC_020134	TTCT	2	8	127628	127635	0 %	75 %	0 %	25 %	442803611
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2155	NC_020134	TA	3	6	128215	128220	50 %	50 %	0 %	0 %	442803611
2156	NC_020134	ATC	2	6	128229	128234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803611
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2223	NC_020134	ATC	2	6	132269	132274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803615
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2226	NC_020134	AAAGA	2	10	132447	132456	80 %	0 %	20 %	0 %	442803615
2227	NC_020134	GCGG	2	8	132478	132485	0 %	0 %	75 %	25 %	442803615
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2231	NC_020134	CGT	2	6	132656	132661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803615
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2234	NC_020134	ATT	2	6	132772	132777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803615
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2236	NC_020134	ATG	2	6	132913	132918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803615
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2238	NC_020134	TAAAA	2	10	133060	133069	80 %	20 %	0 %	0 %	442803615
2239	NC_020134	AC	3	6	133107	133112	50 %	0 %	0 %	50 %	442803616
2240	NC_020134	A	6	6	133179	133184	100 %	0 %	0 %	0 %	442803616
2241	NC_020134	GCGG	2	8	133318	133325	0 %	0 %	75 %	25 %	442803616
2242	NC_020134	GCA	2	6	133352	133357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803616
2243	NC_020134	AAG	2	6	133451	133456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803616
2244	NC_020134	GGAA	2	8	133627	133634	50 %	0 %	50 %	0 %	442803616
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2352	NC_020134	GGAA	2	8	139639	139646	50 %	0 %	50 %	0 %	442803623
2353	NC_020134	A	6	6	139670	139675	100 %	0 %	0 %	0 %	442803623
2354	NC_020134	GGAAA	2	10	139683	139692	60 %	0 %	40 %	0 %	442803623
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2360	NC_020134	AAAG	2	8	139870	139877	75 %	0 %	25 %	0 %	442803623
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2363	NC_020134	AT	4	8	140157	140164	50 %	50 %	0 %	0 %	442803623
2364	NC_020134	TA	4	8	140171	140178	50 %	50 %	0 %	0 %	442803623
2365	NC_020134	AT	3	6	140201	140206	50 %	50 %	0 %	0 %	442803623
2366	NC_020134	ATAA	2	8	140230	140237	75 %	25 %	0 %	0 %	442803623
2367	NC_020134	ACA	2	6	140306	140311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803624
2368	NC_020134	GGCG	2	8	140328	140335	0 %	0 %	75 %	25 %	442803624
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2370	NC_020134	A	7	7	140431	140437	100 %	0 %	0 %	0 %	442803624
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2491	NC_020134	TAAA	2	8	146385	146392	75 %	25 %	0 %	0 %	442803628
2492	NC_020134	AAAGC	2	10	146421	146430	60 %	0 %	20 %	20 %	442803628
2493	NC_020134	AAG	2	6	146488	146493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803628
2494	NC_020134	A	6	6	146506	146511	100 %	0 %	0 %	0 %	442803628
2495	NC_020134	AAATAC	2	12	146542	146553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442803628
2496	NC_020134	A	6	6	146626	146631	100 %	0 %	0 %	0 %	442803628
2497	NC_020134	AGC	2	6	146633	146638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803628
2498	NC_020134	AGA	2	6	146644	146649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803628
2499	NC_020134	AAGA	2	8	146675	146682	75 %	0 %	25 %	0 %	442803628
2500	NC_020134	AGG	2	6	146710	146715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803628

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