MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020134	A	6	6	89036	89041	100 %	0 %	0 %	0 %	442803578
1502	NC_020134	CAT	2	6	89047	89052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803578
1503	NC_020134	CCG	2	6	89067	89072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803578
1504	NC_020134	GAA	3	9	89111	89119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803578
1505	NC_020134	TA	3	6	89121	89126	50 %	50 %	0 %	0 %	442803578
1506	NC_020134	GGAA	2	8	89138	89145	50 %	0 %	50 %	0 %	442803578
1507	NC_020134	TCA	2	6	89183	89188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803578
1508	NC_020134	GAA	2	6	89207	89212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803578
1509	NC_020134	GA	3	6	89252	89257	50 %	0 %	50 %	0 %	442803578
1510	NC_020134	CCT	2	6	89261	89266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803578
1511	NC_020134	GCT	2	6	89341	89346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803578
1512	NC_020134	AGA	2	6	89349	89354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803578
1513	NC_020134	AGA	2	6	89380	89385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803578
1514	NC_020134	CGTG	2	8	89394	89401	0 %	25 %	50 %	25 %	442803578
1515	NC_020134	GAA	2	6	89444	89449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803578
1516	NC_020134	AGG	2	6	89474	89479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803578
1517	NC_020134	TAA	2	6	89480	89485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803578
1518	NC_020134	AT	4	8	89625	89632	50 %	50 %	0 %	0 %	442803579
1519	NC_020134	AAC	2	6	89700	89705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803579
1520	NC_020134	A	6	6	89733	89738	100 %	0 %	0 %	0 %	442803579
1521	NC_020134	CGG	2	6	89798	89803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803579
1522	NC_020134	ACG	2	6	89845	89850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803579
1523	NC_020134	ACTT	2	8	89865	89872	25 %	50 %	0 %	25 %	442803579
1524	NC_020134	TTA	2	6	90035	90040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803579
1525	NC_020134	AGA	2	6	90095	90100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803579
1526	NC_020134	ATA	2	6	90108	90113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803579
1527	NC_020134	GTG	2	6	90126	90131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803579
1528	NC_020134	A	6	6	90176	90181	100 %	0 %	0 %	0 %	442803579
1529	NC_020134	TGATA	2	10	90293	90302	40 %	40 %	20 %	0 %	442803579
1530	NC_020134	AAAGG	2	10	90541	90550	60 %	0 %	40 %	0 %	442803580
1531	NC_020134	CCT	2	6	90565	90570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803580
1532	NC_020134	TA	3	6	90593	90598	50 %	50 %	0 %	0 %	442803580
1533	NC_020134	AGGT	2	8	90630	90637	25 %	25 %	50 %	0 %	442803580
1534	NC_020134	ACGGT	2	10	90639	90648	20 %	20 %	40 %	20 %	442803580
1535	NC_020134	CGG	2	6	90675	90680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803580
1536	NC_020134	AT	3	6	90762	90767	50 %	50 %	0 %	0 %	442803580
1537	NC_020134	AT	3	6	90869	90874	50 %	50 %	0 %	0 %	442803580
1538	NC_020134	TAAT	2	8	90900	90907	50 %	50 %	0 %	0 %	442803580
1539	NC_020134	CAA	2	6	90985	90990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803580
1540	NC_020134	GAC	2	6	91061	91066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803580
1541	NC_020134	GGA	2	6	91129	91134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803580
1542	NC_020134	TAC	2	6	91189	91194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803580
1543	NC_020134	ATG	2	6	91205	91210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803580
1544	NC_020134	CAA	2	6	91219	91224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803580
1545	NC_020134	TGA	2	6	91352	91357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803581
1546	NC_020134	GAA	2	6	91368	91373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803581
1547	NC_020134	A	6	6	91504	91509	100 %	0 %	0 %	0 %	442803581
1548	NC_020134	AT	3	6	91626	91631	50 %	50 %	0 %	0 %	442803581
1549	NC_020134	GAA	2	6	91763	91768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803582
1550	NC_020134	ACACCC	2	12	91772	91783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803582
1551	NC_020134	TTAT	2	8	91809	91816	25 %	75 %	0 %	0 %	442803582
1552	NC_020134	GTT	2	6	92027	92032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803582
1553	NC_020134	CTT	2	6	92078	92083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803582
1554	NC_020134	ATAA	2	8	92084	92091	75 %	25 %	0 %	0 %	442803582
1555	NC_020134	GTTT	2	8	92104	92111	0 %	75 %	25 %	0 %	442803582
1556	NC_020134	CGC	2	6	92112	92117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803582
1557	NC_020134	CGA	2	6	92143	92148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803582
1558	NC_020134	A	6	6	92148	92153	100 %	0 %	0 %	0 %	442803582
1559	NC_020134	ATCCTT	2	12	92172	92183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442803582
1560	NC_020134	TAG	2	6	92196	92201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803582
1561	NC_020134	TA	3	6	92202	92207	50 %	50 %	0 %	0 %	442803582
1562	NC_020134	TGA	2	6	92317	92322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803582
1563	NC_020134	TGG	2	6	92331	92336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803582
1564	NC_020134	GGA	2	6	92449	92454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803582
1565	NC_020134	A	6	6	92458	92463	100 %	0 %	0 %	0 %	442803582
1566	NC_020134	TCG	2	6	92559	92564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803582
1567	NC_020134	GGAC	2	8	92566	92573	25 %	0 %	50 %	25 %	442803582
1568	NC_020134	CGG	2	6	92662	92667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803582
1569	NC_020134	GAAA	2	8	92722	92729	75 %	0 %	25 %	0 %	442803582
1570	NC_020134	CTT	2	6	92732	92737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803582
1571	NC_020134	GTTTT	2	10	92907	92916	0 %	80 %	20 %	0 %	442803583
1572	NC_020134	TCAACA	2	12	92938	92949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442803583
1573	NC_020134	T	6	6	93022	93027	0 %	100 %	0 %	0 %	442803583
1574	NC_020134	CTC	2	6	93186	93191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803583
1575	NC_020134	CCCA	2	8	93226	93233	25 %	0 %	0 %	75 %	442803583
1576	NC_020134	GGC	2	6	93254	93259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803583
1577	NC_020134	AT	3	6	93332	93337	50 %	50 %	0 %	0 %	442803583
1578	NC_020134	ACAT	2	8	93465	93472	50 %	25 %	0 %	25 %	442803583
1579	NC_020134	TTA	2	6	93481	93486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803583
1580	NC_020134	GAA	2	6	93669	93674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803583
1581	NC_020134	A	6	6	93694	93699	100 %	0 %	0 %	0 %	442803583
1582	NC_020134	T	6	6	93804	93809	0 %	100 %	0 %	0 %	442803583
1583	NC_020134	GCA	2	6	93821	93826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803583
1584	NC_020134	AAT	2	6	93831	93836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803583
1585	NC_020134	TGG	2	6	93844	93849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803583
1586	NC_020134	AT	3	6	93935	93940	50 %	50 %	0 %	0 %	442803583
1587	NC_020134	ACA	2	6	94015	94020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803583
1588	NC_020134	CATG	2	8	94143	94150	25 %	25 %	25 %	25 %	442803583
1589	NC_020134	CGG	2	6	94217	94222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803583
1590	NC_020134	ATT	2	6	94243	94248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803583
1591	NC_020134	A	7	7	94291	94297	100 %	0 %	0 %	0 %	442803583
1592	NC_020134	ATT	2	6	94330	94335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803583
1593	NC_020134	TGCT	2	8	94351	94358	0 %	50 %	25 %	25 %	442803583
1594	NC_020134	ATG	2	6	94441	94446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803583
1595	NC_020134	ACG	2	6	94477	94482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803583
1596	NC_020134	TACC	2	8	94547	94554	25 %	25 %	0 %	50 %	442803583
1597	NC_020134	GTATT	2	10	94559	94568	20 %	60 %	20 %	0 %	442803583
1598	NC_020134	T	6	6	94567	94572	0 %	100 %	0 %	0 %	442803583
1599	NC_020134	AGC	2	6	95067	95072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803584
1600	NC_020134	AT	3	6	95114	95119	50 %	50 %	0 %	0 %	442803584
1601	NC_020134	CTT	2	6	95123	95128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803584
1602	NC_020134	CGA	2	6	95151	95156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803584
1603	NC_020134	AAT	2	6	95200	95205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803584
1604	NC_020134	TAT	2	6	95380	95385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803584
1605	NC_020134	TCGC	2	8	95450	95457	0 %	25 %	25 %	50 %	442803584
1606	NC_020134	TGC	2	6	95548	95553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803584
1607	NC_020134	CAA	2	6	95592	95597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803584
1608	NC_020134	TGA	2	6	95601	95606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803584
1609	NC_020134	ATA	2	6	95612	95617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803584
1610	NC_020134	AAT	2	6	95689	95694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803584
1611	NC_020134	TTG	2	6	95711	95716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803584
1612	NC_020134	GA	3	6	95752	95757	50 %	0 %	50 %	0 %	442803584
1613	NC_020134	TGA	2	6	95765	95770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803584
1614	NC_020134	CGA	2	6	95886	95891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803585
1615	NC_020134	T	8	8	95918	95925	0 %	100 %	0 %	0 %	442803585
1616	NC_020134	GGC	2	6	95934	95939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803585
1617	NC_020134	GAA	2	6	95992	95997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803585
1618	NC_020134	TGC	2	6	96071	96076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803585
1619	NC_020134	GTTGGT	2	12	96118	96129	0 %	50 %	50 %	0 %	442803585
1620	NC_020134	ATA	2	6	96136	96141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803585
1621	NC_020134	GCT	2	6	96210	96215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803585
1622	NC_020134	ATTGGC	2	12	96262	96273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	442803585
1623	NC_020134	GCC	2	6	96274	96279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803585
1624	NC_020134	TGG	2	6	96287	96292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803585
1625	NC_020134	ATTT	2	8	96382	96389	25 %	75 %	0 %	0 %	442803585
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1627	NC_020134	CGG	2	6	96504	96509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803585
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1747	NC_020134	TCA	2	6	103404	103409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803590
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1876	NC_020134	TGG	2	6	111315	111320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803596
1877	NC_020134	CTT	2	6	111423	111428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803596
1878	NC_020134	CGC	2	6	111438	111443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803596
1879	NC_020134	GTT	2	6	111515	111520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803596
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1882	NC_020134	TGC	2	6	111843	111848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803596
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1895	NC_020134	GTA	2	6	112544	112549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803597
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1908	NC_020134	CTGG	2	8	113354	113361	0 %	25 %	50 %	25 %	442803598
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1989	NC_020134	GTTT	2	8	117697	117704	0 %	75 %	25 %	0 %	442803603
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1993	NC_020134	GTT	2	6	117841	117846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803603
1994	NC_020134	CCG	2	6	117920	117925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803603
1995	NC_020134	T	6	6	117991	117996	0 %	100 %	0 %	0 %	442803603
1996	NC_020134	GTG	3	9	118031	118039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803603
1997	NC_020134	AAAG	2	8	118124	118131	75 %	0 %	25 %	0 %	442803603
1998	NC_020134	A	7	7	118709	118715	100 %	0 %	0 %	0 %	442803604
1999	NC_020134	CAA	2	6	118779	118784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803604
2000	NC_020134	A	7	7	118791	118797	100 %	0 %	0 %	0 %	442803604

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