MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020134	CTG	2	6	29532	29537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803522
502	NC_020134	GCA	2	6	29556	29561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803522
503	NC_020134	T	6	6	29673	29678	0 %	100 %	0 %	0 %	442803522
504	NC_020134	TTA	2	6	29725	29730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803522
505	NC_020134	TAT	2	6	29881	29886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803522
506	NC_020134	CTT	2	6	29889	29894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803522
507	NC_020134	ATTTC	2	10	30003	30012	20 %	60 %	0 %	20 %	442803522
508	NC_020134	CCG	2	6	30025	30030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803522
509	NC_020134	CAA	2	6	30073	30078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803522
510	NC_020134	ACAG	2	8	30097	30104	50 %	0 %	25 %	25 %	442803522
511	NC_020134	AT	3	6	30192	30197	50 %	50 %	0 %	0 %	442803522
512	NC_020134	TGT	2	6	30220	30225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803522
513	NC_020134	TCT	2	6	30227	30232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803522
514	NC_020134	CAG	2	6	30261	30266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803522
515	NC_020134	TAA	2	6	30448	30453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803522
516	NC_020134	TTG	2	6	30502	30507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803522
517	NC_020134	GTT	2	6	30575	30580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803522
518	NC_020134	ATG	2	6	30615	30620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803522
519	NC_020134	T	6	6	30774	30779	0 %	100 %	0 %	0 %	442803523
520	NC_020134	T	7	7	30834	30840	0 %	100 %	0 %	0 %	442803523
521	NC_020134	AAG	2	6	31019	31024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803524
522	NC_020134	CTT	2	6	31031	31036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803524
523	NC_020134	TGA	2	6	31055	31060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803524
524	NC_020134	T	6	6	31077	31082	0 %	100 %	0 %	0 %	442803524
525	NC_020134	ATA	2	6	31137	31142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803524
526	NC_020134	AACATA	2	12	31173	31184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442803524
527	NC_020134	GAA	2	6	31239	31244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803524
528	NC_020134	GAGAA	2	10	31259	31268	60 %	0 %	40 %	0 %	442803524
529	NC_020134	AGA	2	6	31287	31292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803524
530	NC_020134	TCTT	2	8	31293	31300	0 %	75 %	0 %	25 %	442803524
531	NC_020134	CAA	2	6	31304	31309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803524
532	NC_020134	AGG	2	6	31315	31320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803524
533	NC_020134	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	442803524
534	NC_020134	ACA	2	6	31384	31389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803524
535	NC_020134	TGACT	2	10	31419	31428	20 %	40 %	20 %	20 %	442803524
536	NC_020134	A	7	7	31889	31895	100 %	0 %	0 %	0 %	442803525
537	NC_020134	GCC	2	6	31904	31909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803525
538	NC_020134	TCT	2	6	31984	31989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803525
539	NC_020134	T	6	6	32003	32008	0 %	100 %	0 %	0 %	442803525
540	NC_020134	ATT	2	6	32014	32019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803525
541	NC_020134	GAT	2	6	32078	32083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803525
542	NC_020134	ACAG	2	8	32159	32166	50 %	0 %	25 %	25 %	442803525
543	NC_020134	TTA	2	6	32173	32178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803525
544	NC_020134	AT	4	8	32203	32210	50 %	50 %	0 %	0 %	442803525
545	NC_020134	AGA	2	6	32224	32229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803525
546	NC_020134	T	6	6	32249	32254	0 %	100 %	0 %	0 %	442803525
547	NC_020134	CCG	2	6	32413	32418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803525
548	NC_020134	CAG	2	6	32423	32428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803525
549	NC_020134	GGT	2	6	32432	32437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803525
550	NC_020134	T	7	7	32509	32515	0 %	100 %	0 %	0 %	442803525
551	NC_020134	AAG	2	6	32728	32733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803526
552	NC_020134	TAT	2	6	32830	32835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803526
553	NC_020134	TGG	2	6	32838	32843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803526
554	NC_020134	TTA	2	6	32862	32867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803526
555	NC_020134	ATA	2	6	32873	32878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803526
556	NC_020134	TA	3	6	32877	32882	50 %	50 %	0 %	0 %	442803526
557	NC_020134	TGGA	2	8	32902	32909	25 %	25 %	50 %	0 %	442803526
558	NC_020134	ATTTC	2	10	32960	32969	20 %	60 %	0 %	20 %	442803526
559	NC_020134	T	6	6	32971	32976	0 %	100 %	0 %	0 %	442803526
560	NC_020134	AGGA	2	8	33012	33019	50 %	0 %	50 %	0 %	442803526
561	NC_020134	TGC	2	6	33030	33035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803526
562	NC_020134	CTT	2	6	33056	33061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803526
563	NC_020134	CTTC	2	8	33075	33082	0 %	50 %	0 %	50 %	442803526
564	NC_020134	A	6	6	33140	33145	100 %	0 %	0 %	0 %	442803526
565	NC_020134	T	6	6	33178	33183	0 %	100 %	0 %	0 %	442803526
566	NC_020134	CTGTTT	2	12	33188	33199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442803526
567	NC_020134	AAT	2	6	33247	33252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803526
568	NC_020134	GTAT	2	8	33306	33313	25 %	50 %	25 %	0 %	442803526
569	NC_020134	TA	3	6	33356	33361	50 %	50 %	0 %	0 %	442803526
570	NC_020134	GCT	2	6	33400	33405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803526
571	NC_020134	T	7	7	33453	33459	0 %	100 %	0 %	0 %	442803526
572	NC_020134	CTG	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803526
573	NC_020134	T	6	6	33474	33479	0 %	100 %	0 %	0 %	442803526
574	NC_020134	A	6	6	33493	33498	100 %	0 %	0 %	0 %	442803526
575	NC_020134	TGG	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803526
576	NC_020134	AGC	2	6	33627	33632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803527
577	NC_020134	GAA	2	6	33665	33670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803527
578	NC_020134	GAG	2	6	33711	33716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803527
579	NC_020134	TGGT	2	8	33724	33731	0 %	50 %	50 %	0 %	442803527
580	NC_020134	T	6	6	33731	33736	0 %	100 %	0 %	0 %	442803527
581	NC_020134	CAA	3	9	33760	33768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803527
582	NC_020134	GGAA	2	8	33835	33842	50 %	0 %	50 %	0 %	442803527
583	NC_020134	A	7	7	33845	33851	100 %	0 %	0 %	0 %	442803527
584	NC_020134	TCCC	2	8	33907	33914	0 %	25 %	0 %	75 %	442803527
585	NC_020134	TGA	2	6	33980	33985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803527
586	NC_020134	TGG	2	6	33988	33993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803527
587	NC_020134	TGC	2	6	34081	34086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803527
588	NC_020134	GCC	2	6	34091	34096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803527
589	NC_020134	TGA	2	6	34109	34114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803527
590	NC_020134	A	6	6	34147	34152	100 %	0 %	0 %	0 %	442803527
591	NC_020134	GAACA	2	10	34170	34179	60 %	0 %	20 %	20 %	442803527
592	NC_020134	TAC	2	6	34187	34192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803527
593	NC_020134	TCA	2	6	34252	34257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803527
594	NC_020134	GCA	2	6	34282	34287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803527
595	NC_020134	A	6	6	34299	34304	100 %	0 %	0 %	0 %	442803527
596	NC_020134	A	6	6	34345	34350	100 %	0 %	0 %	0 %	442803527
597	NC_020134	GAA	2	6	34512	34517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803527
598	NC_020134	ATA	2	6	34518	34523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803527
599	NC_020134	A	7	7	34523	34529	100 %	0 %	0 %	0 %	442803527
600	NC_020134	TA	3	6	34531	34536	50 %	50 %	0 %	0 %	442803527
601	NC_020134	T	6	6	34739	34744	0 %	100 %	0 %	0 %	442803528
602	NC_020134	GGCG	2	8	34814	34821	0 %	0 %	75 %	25 %	442803528
603	NC_020134	A	6	6	34828	34833	100 %	0 %	0 %	0 %	442803528
604	NC_020134	A	7	7	34868	34874	100 %	0 %	0 %	0 %	442803528
605	NC_020134	GCC	2	6	34953	34958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803528
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607	NC_020134	GCT	2	6	35165	35170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803528
608	NC_020134	GAA	2	6	35226	35231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803528
609	NC_020134	A	6	6	35239	35244	100 %	0 %	0 %	0 %	442803528
610	NC_020134	GGTA	2	8	35276	35283	25 %	25 %	50 %	0 %	442803528
611	NC_020134	ACG	2	6	35344	35349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803528
612	NC_020134	ACC	2	6	35469	35474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803528
613	NC_020134	GTG	2	6	35577	35582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803528
614	NC_020134	CAG	2	6	35600	35605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803528
615	NC_020134	GAA	2	6	35623	35628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803528
616	NC_020134	A	6	6	35627	35632	100 %	0 %	0 %	0 %	442803528
617	NC_020134	GGA	2	6	35701	35706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803528
618	NC_020134	A	6	6	35794	35799	100 %	0 %	0 %	0 %	442803528
619	NC_020134	AT	3	6	35861	35866	50 %	50 %	0 %	0 %	442803528
620	NC_020134	TAA	2	6	35985	35990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803529
621	NC_020134	GCC	2	6	36029	36034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803529
622	NC_020134	TTGA	2	8	36036	36043	25 %	50 %	25 %	0 %	442803529
623	NC_020134	CGG	2	6	36204	36209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803530
624	NC_020134	T	7	7	36232	36238	0 %	100 %	0 %	0 %	442803530
625	NC_020134	CAA	2	6	36244	36249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803530
626	NC_020134	T	7	7	36261	36267	0 %	100 %	0 %	0 %	442803530
627	NC_020134	TAAA	2	8	36287	36294	75 %	25 %	0 %	0 %	442803530
628	NC_020134	A	6	6	36301	36306	100 %	0 %	0 %	0 %	442803530
629	NC_020134	A	6	6	36323	36328	100 %	0 %	0 %	0 %	442803530
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631	NC_020134	A	6	6	36628	36633	100 %	0 %	0 %	0 %	442803531
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