MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020053	GAA	2	6	259492	259497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737076
4002	NC_020053	AGG	2	6	259517	259522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737076
4003	NC_020053	TAT	2	6	259544	259549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737076
4004	NC_020053	GAT	2	6	259567	259572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737076
4005	NC_020053	TGA	2	6	259725	259730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737076
4006	NC_020053	GATC	2	8	259803	259810	25 %	25 %	25 %	25 %	436737076
4007	NC_020053	ATT	2	6	259831	259836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737076
4008	NC_020053	GAA	2	6	259846	259851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737076
4009	NC_020053	GAG	2	6	259964	259969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737076
4010	NC_020053	TATC	2	8	259975	259982	25 %	50 %	0 %	25 %	436737076
4011	NC_020053	GT	3	6	260003	260008	0 %	50 %	50 %	0 %	436737076
4012	NC_020053	TGG	2	6	260261	260266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737077
4013	NC_020053	ATC	2	6	260272	260277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737077
4014	NC_020053	ACCC	2	8	260454	260461	25 %	0 %	0 %	75 %	436737077
4015	NC_020053	TCA	2	6	260510	260515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737077
4016	NC_020053	CT	3	6	260530	260535	0 %	50 %	0 %	50 %	436737077
4017	NC_020053	TCG	2	6	260575	260580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737077
4018	NC_020053	CCAG	2	8	260586	260593	25 %	0 %	25 %	50 %	436737077
4019	NC_020053	GATC	2	8	260625	260632	25 %	25 %	25 %	25 %	436737077
4020	NC_020053	AG	3	6	260705	260710	50 %	0 %	50 %	0 %	436737077
4021	NC_020053	CCG	2	6	260722	260727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737077
4022	NC_020053	CAC	2	6	260772	260777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737077
4023	NC_020053	CAT	2	6	260874	260879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737077
4024	NC_020053	GA	3	6	260881	260886	50 %	0 %	50 %	0 %	436737077
4025	NC_020053	CGAT	2	8	261048	261055	25 %	25 %	25 %	25 %	436737077
4026	NC_020053	CTTG	2	8	261170	261177	0 %	50 %	25 %	25 %	436737077
4027	NC_020053	TAG	2	6	261192	261197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737077
4028	NC_020053	TAGA	2	8	261354	261361	50 %	25 %	25 %	0 %	436737078
4029	NC_020053	ACTA	2	8	261416	261423	50 %	25 %	0 %	25 %	436737078
4030	NC_020053	TC	3	6	261547	261552	0 %	50 %	0 %	50 %	436737078
4031	NC_020053	TAT	2	6	261652	261657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737078
4032	NC_020053	AG	3	6	261675	261680	50 %	0 %	50 %	0 %	436737078
4033	NC_020053	ACC	2	6	261689	261694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737078
4034	NC_020053	GCC	2	6	261716	261721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737078
4035	NC_020053	CCT	2	6	261763	261768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737078
4036	NC_020053	TCC	2	6	261774	261779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737078
4037	NC_020053	ATT	2	6	261834	261839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737078
4038	NC_020053	CAG	2	6	262037	262042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737079
4039	NC_020053	GCT	2	6	262048	262053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737079
4040	NC_020053	CG	3	6	262114	262119	0 %	0 %	50 %	50 %	436737079
4041	NC_020053	ATG	2	6	262131	262136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737079
4042	NC_020053	ATA	2	6	262203	262208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737079
4043	NC_020053	TTTG	2	8	262434	262441	0 %	75 %	25 %	0 %	436737080
4044	NC_020053	GA	3	6	262517	262522	50 %	0 %	50 %	0 %	436737080
4045	NC_020053	TGAC	2	8	262553	262560	25 %	25 %	25 %	25 %	436737080
4046	NC_020053	CA	3	6	262681	262686	50 %	0 %	0 %	50 %	436737080
4047	NC_020053	CGGG	2	8	262699	262706	0 %	0 %	75 %	25 %	436737080
4048	NC_020053	GA	3	6	262877	262882	50 %	0 %	50 %	0 %	436737080
4049	NC_020053	A	6	6	262884	262889	100 %	0 %	0 %	0 %	436737080
4050	NC_020053	GAA	2	6	263029	263034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737081
4051	NC_020053	ATTT	2	8	263042	263049	25 %	75 %	0 %	0 %	436737081
4052	NC_020053	GCG	2	6	263103	263108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737081
4053	NC_020053	ATCG	2	8	263236	263243	25 %	25 %	25 %	25 %	436737081
4054	NC_020053	TAGT	2	8	263351	263358	25 %	50 %	25 %	0 %	436737081
4055	NC_020053	TGT	2	6	263376	263381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737081
4056	NC_020053	ATT	2	6	263793	263798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737082
4057	NC_020053	TAC	2	6	263800	263805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737082
4058	NC_020053	GAT	2	6	263825	263830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737082
4059	NC_020053	ATT	2	6	263849	263854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737082
4060	NC_020053	CTC	2	6	263989	263994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737083
4061	NC_020053	GAT	2	6	264036	264041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737083
4062	NC_020053	TAA	2	6	264071	264076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737083
4063	NC_020053	GC	3	6	264102	264107	0 %	0 %	50 %	50 %	436737083
4064	NC_020053	ATA	2	6	264127	264132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737083
4065	NC_020053	TCAAG	2	10	264143	264152	40 %	20 %	20 %	20 %	436737083
4066	NC_020053	GA	3	6	264175	264180	50 %	0 %	50 %	0 %	436737083
4067	NC_020053	GAT	2	6	264245	264250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737083
4068	NC_020053	AAG	2	6	264342	264347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737083
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4070	NC_020053	TGT	2	6	264539	264544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737084
4071	NC_020053	ATCG	2	8	264561	264568	25 %	25 %	25 %	25 %	436737084
4072	NC_020053	GCGA	2	8	264584	264591	25 %	0 %	50 %	25 %	436737084
4073	NC_020053	CAG	2	6	264596	264601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737084
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4075	NC_020053	GCTG	2	8	264791	264798	0 %	25 %	50 %	25 %	436737084
4076	NC_020053	ATT	2	6	265365	265370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737085
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4079	NC_020053	ATT	2	6	265473	265478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737085
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4082	NC_020053	TTTG	2	8	265799	265806	0 %	75 %	25 %	0 %	436737086
4083	NC_020053	GGA	2	6	265823	265828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737086
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4085	NC_020053	TGTC	2	8	265968	265975	0 %	50 %	25 %	25 %	436737086
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4088	NC_020053	ACAG	2	8	266159	266166	50 %	0 %	25 %	25 %	436737086
4089	NC_020053	CAA	2	6	266172	266177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737086
4090	NC_020053	GGCT	2	8	266185	266192	0 %	25 %	50 %	25 %	436737086
4091	NC_020053	TGGC	2	8	266310	266317	0 %	25 %	50 %	25 %	436737086
4092	NC_020053	TGC	2	6	266320	266325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737086
4093	NC_020053	ACT	2	6	266400	266405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737087
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4095	NC_020053	TGGC	2	8	266514	266521	0 %	25 %	50 %	25 %	436737087
4096	NC_020053	TTGC	2	8	266776	266783	0 %	50 %	25 %	25 %	436737088
4097	NC_020053	TCA	2	6	266805	266810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737088
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4099	NC_020053	C	6	6	266855	266860	0 %	0 %	0 %	100 %	436737088
4100	NC_020053	GAC	2	6	266866	266871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737088
4101	NC_020053	T	7	7	266973	266979	0 %	100 %	0 %	0 %	436737088
4102	NC_020053	TAA	2	6	266990	266995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737088
4103	NC_020053	TCGAT	2	10	267003	267012	20 %	40 %	20 %	20 %	436737088
4104	NC_020053	TCGA	2	8	267087	267094	25 %	25 %	25 %	25 %	436737088
4105	NC_020053	ATA	2	6	267114	267119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737088
4106	NC_020053	CTG	3	9	267357	267365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737088
4107	NC_020053	TCGA	2	8	267380	267387	25 %	25 %	25 %	25 %	436737088
4108	NC_020053	TA	3	6	267408	267413	50 %	50 %	0 %	0 %	436737088
4109	NC_020053	CCACGT	2	12	267506	267517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436737088
4110	NC_020053	CCA	2	6	267571	267576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737088
4111	NC_020053	CTA	2	6	267581	267586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737088
4112	NC_020053	TGTT	3	12	267623	267634	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
4113	NC_020053	CAAT	2	8	267640	267647	50 %	25 %	0 %	25 %	436737089
4114	NC_020053	CGA	2	6	267697	267702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
4115	NC_020053	T	7	7	267715	267721	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
4116	NC_020053	TCG	2	6	267738	267743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
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4119	NC_020053	CCA	2	6	267851	267856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737089
4120	NC_020053	TTAG	2	8	267885	267892	25 %	50 %	25 %	0 %	436737089
4121	NC_020053	GCC	2	6	267998	268003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737089
4122	NC_020053	TTG	2	6	268043	268048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737089
4123	NC_020053	TTC	2	6	268112	268117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
4124	NC_020053	GAT	2	6	268195	268200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737089
4125	NC_020053	TTTG	2	8	268207	268214	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
4126	NC_020053	TCA	2	6	268219	268224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737089
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4128	NC_020053	GCT	2	6	268273	268278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
4129	NC_020053	GAC	2	6	268292	268297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
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4143	NC_020053	GCA	2	6	269160	269165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
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4156	NC_020053	GTTT	2	8	269688	269695	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
4157	NC_020053	TCGAGT	2	12	269724	269735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436737089
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4161	NC_020053	T	7	7	270205	270211	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
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4165	NC_020053	GTT	2	6	270429	270434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737089
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4230	NC_020053	CCTTTA	2	12	274868	274879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	436737093
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4232	NC_020053	GCT	2	6	274957	274962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737094
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4234	NC_020053	CAT	2	6	275847	275852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737095
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4240	NC_020053	CGATGA	2	12	276204	276215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436737095
4241	NC_020053	GCC	2	6	276231	276236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737095
4242	NC_020053	ATC	2	6	276237	276242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737095
4243	NC_020053	GCG	2	6	276330	276335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737096
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4367	NC_020053	ACTG	2	8	283171	283178	25 %	25 %	25 %	25 %	436737104
4368	NC_020053	TCG	2	6	283219	283224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737104
4369	NC_020053	CA	3	6	283238	283243	50 %	0 %	0 %	50 %	436737104
4370	NC_020053	AGC	2	6	283298	283303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737104
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4372	NC_020053	A	6	6	283319	283324	100 %	0 %	0 %	0 %	436737104
4373	NC_020053	GTT	2	6	283327	283332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737104
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4375	NC_020053	CGAT	2	8	283408	283415	25 %	25 %	25 %	25 %	436737104
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4379	NC_020053	CCCA	2	8	283884	283891	25 %	0 %	0 %	75 %	436737104
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4387	NC_020053	AGT	2	6	284364	284369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737104
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4432	NC_020053	TCCA	2	8	286695	286702	25 %	25 %	0 %	50 %	436737107
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4485	NC_020053	CTG	2	6	290179	290184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737112
4486	NC_020053	TAA	2	6	290188	290193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737112
4487	NC_020053	TAA	2	6	290328	290333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737113
4488	NC_020053	TTC	3	9	290375	290383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737113
4489	NC_020053	GATG	2	8	290426	290433	25 %	25 %	50 %	0 %	436737113
4490	NC_020053	ATCG	2	8	290594	290601	25 %	25 %	25 %	25 %	436737114
4491	NC_020053	ATC	2	6	290628	290633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737114
4492	NC_020053	CAC	2	6	290757	290762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737114
4493	NC_020053	CAA	2	6	290763	290768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737114
4494	NC_020053	CAAA	2	8	290841	290848	75 %	0 %	0 %	25 %	436737114
4495	NC_020053	CAC	2	6	291048	291053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737114
4496	NC_020053	GAT	2	6	291183	291188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737114
4497	NC_020053	TGACT	2	10	291204	291213	20 %	40 %	20 %	20 %	436737114
4498	NC_020053	CTG	2	6	291214	291219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737114
4499	NC_020053	GTTC	2	8	291281	291288	0 %	50 %	25 %	25 %	436737114
4500	NC_020053	TAA	2	6	291349	291354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737114

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