MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020053	GTT	2	6	226482	226487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737042
3502	NC_020053	GA	3	6	226514	226519	50 %	0 %	50 %	0 %	436737042
3503	NC_020053	TCT	2	6	226523	226528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737042
3504	NC_020053	AGC	2	6	226536	226541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737042
3505	NC_020053	AGT	2	6	226551	226556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737042
3506	NC_020053	C	6	6	226948	226953	0 %	0 %	0 %	100 %	436737043
3507	NC_020053	CGA	2	6	226958	226963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737043
3508	NC_020053	ATG	2	6	226992	226997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737043
3509	NC_020053	GCCA	2	8	227046	227053	25 %	0 %	25 %	50 %	436737043
3510	NC_020053	AAAC	2	8	227079	227086	75 %	0 %	0 %	25 %	436737043
3511	NC_020053	CAGC	2	8	227099	227106	25 %	0 %	25 %	50 %	436737043
3512	NC_020053	CGAT	2	8	227262	227269	25 %	25 %	25 %	25 %	436737043
3513	NC_020053	CGAG	2	8	227319	227326	25 %	0 %	50 %	25 %	436737043
3514	NC_020053	ATA	2	6	227331	227336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737043
3515	NC_020053	T	7	7	227436	227442	0 %	100 %	0 %	0 %	436737044
3516	NC_020053	TAC	2	6	227574	227579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737044
3517	NC_020053	TGC	2	6	227647	227652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737044
3518	NC_020053	ATT	2	6	227661	227666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737044
3519	NC_020053	CGAT	2	8	227679	227686	25 %	25 %	25 %	25 %	436737044
3520	NC_020053	TAA	2	6	227757	227762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737044
3521	NC_020053	TTG	2	6	227778	227783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737044
3522	NC_020053	GTAA	2	8	227790	227797	50 %	25 %	25 %	0 %	436737044
3523	NC_020053	GCC	2	6	227865	227870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737044
3524	NC_020053	GCC	2	6	227940	227945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737044
3525	NC_020053	TGG	2	6	228140	228145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737044
3526	NC_020053	TAG	2	6	228821	228826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737045
3527	NC_020053	AT	3	6	228829	228834	50 %	50 %	0 %	0 %	436737045
3528	NC_020053	AAC	2	6	228840	228845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737045
3529	NC_020053	TGT	3	9	228854	228862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737045
3530	NC_020053	GATC	2	8	228875	228882	25 %	25 %	25 %	25 %	436737045
3531	NC_020053	TGT	2	6	228896	228901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737045
3532	NC_020053	ATCG	2	8	228981	228988	25 %	25 %	25 %	25 %	436737045
3533	NC_020053	GTG	2	6	228995	229000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737045
3534	NC_020053	ATT	2	6	229005	229010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737045
3535	NC_020053	TGC	2	6	229038	229043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737045
3536	NC_020053	TGA	2	6	229049	229054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737045
3537	NC_020053	CTTG	2	8	229100	229107	0 %	50 %	25 %	25 %	436737045
3538	NC_020053	TAG	2	6	229110	229115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737045
3539	NC_020053	GAT	2	6	229205	229210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737045
3540	NC_020053	TGT	2	6	229251	229256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737045
3541	NC_020053	GCC	2	6	229272	229277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737045
3542	NC_020053	TGC	3	9	229365	229373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737045
3543	NC_020053	TCGA	2	8	229378	229385	25 %	25 %	25 %	25 %	436737045
3544	NC_020053	CGATCG	2	12	229412	229423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436737045
3545	NC_020053	CAT	2	6	229484	229489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737045
3546	NC_020053	CTC	2	6	229559	229564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737045
3547	NC_020053	CCG	2	6	229589	229594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737045
3548	NC_020053	CAG	2	6	229622	229627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737045
3549	NC_020053	TGT	2	6	229936	229941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737046
3550	NC_020053	CTG	2	6	229962	229967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737046
3551	NC_020053	GCA	2	6	229996	230001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737046
3552	NC_020053	TCA	2	6	230005	230010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737046
3553	NC_020053	CACG	2	8	230189	230196	25 %	0 %	25 %	50 %	436737046
3554	NC_020053	GTTC	2	8	230267	230274	0 %	50 %	25 %	25 %	436737046
3555	NC_020053	GCA	2	6	230278	230283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737046
3556	NC_020053	A	6	6	230366	230371	100 %	0 %	0 %	0 %	436737046
3557	NC_020053	GCAA	2	8	230404	230411	50 %	0 %	25 %	25 %	436737047
3558	NC_020053	ATC	2	6	230450	230455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737047
3559	NC_020053	CCTG	2	8	230588	230595	0 %	25 %	25 %	50 %	436737047
3560	NC_020053	ATG	2	6	230675	230680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737047
3561	NC_020053	GCC	2	6	230793	230798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737048
3562	NC_020053	CAA	2	6	230863	230868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737048
3563	NC_020053	GGC	2	6	230974	230979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737048
3564	NC_020053	GCT	2	6	231017	231022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737048
3565	NC_020053	CCA	2	6	231095	231100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737048
3566	NC_020053	CTGG	2	8	231169	231176	0 %	25 %	50 %	25 %	436737048
3567	NC_020053	ATT	2	6	231229	231234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737048
3568	NC_020053	TGGT	2	8	231287	231294	0 %	50 %	50 %	0 %	436737048
3569	NC_020053	CTG	2	6	231342	231347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737048
3570	NC_020053	GGT	2	6	231502	231507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737048
3571	NC_020053	TCGA	2	8	231515	231522	25 %	25 %	25 %	25 %	436737048
3572	NC_020053	AAC	2	6	231533	231538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737048
3573	NC_020053	TCGA	2	8	231665	231672	25 %	25 %	25 %	25 %	436737049
3574	NC_020053	TCGCAA	2	12	231744	231755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436737049
3575	NC_020053	CGAT	2	8	231778	231785	25 %	25 %	25 %	25 %	436737049
3576	NC_020053	GAC	2	6	231828	231833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737049
3577	NC_020053	GAA	2	6	231895	231900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737049
3578	NC_020053	CCA	2	6	231911	231916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737049
3579	NC_020053	CAA	2	6	232141	232146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737049
3580	NC_020053	CTA	2	6	232243	232248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737049
3581	NC_020053	TCGA	2	8	232266	232273	25 %	25 %	25 %	25 %	436737049
3582	NC_020053	ATTG	2	8	232539	232546	25 %	50 %	25 %	0 %	436737049
3583	NC_020053	TGAC	2	8	232681	232688	25 %	25 %	25 %	25 %	436737050
3584	NC_020053	CG	3	6	232705	232710	0 %	0 %	50 %	50 %	436737050
3585	NC_020053	TCGT	2	8	232724	232731	0 %	50 %	25 %	25 %	436737050
3586	NC_020053	TCGA	2	8	232809	232816	25 %	25 %	25 %	25 %	436737050
3587	NC_020053	AC	3	6	232917	232922	50 %	0 %	0 %	50 %	436737050
3588	NC_020053	TAA	2	6	232991	232996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737050
3589	NC_020053	TTC	2	6	233170	233175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737051
3590	NC_020053	CATT	2	8	233310	233317	25 %	50 %	0 %	25 %	436737051
3591	NC_020053	ACC	2	6	233455	233460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737051
3592	NC_020053	ATT	2	6	233507	233512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737051
3593	NC_020053	AGT	2	6	233633	233638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737051
3594	NC_020053	GATC	2	8	233649	233656	25 %	25 %	25 %	25 %	436737051
3595	NC_020053	TAG	2	6	233748	233753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737051
3596	NC_020053	CTA	2	6	233762	233767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737051
3597	NC_020053	CGA	2	6	233822	233827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737051
3598	NC_020053	GAT	2	6	233832	233837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737051
3599	NC_020053	TAT	2	6	233928	233933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737052
3600	NC_020053	CTA	2	6	234076	234081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737052
3601	NC_020053	CGC	2	6	234094	234099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737052
3602	NC_020053	ACG	2	6	234228	234233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737052
3603	NC_020053	GTC	3	9	234248	234256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737052
3604	NC_020053	GCT	2	6	234351	234356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737052
3605	NC_020053	ATC	2	6	234383	234388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737052
3606	NC_020053	CGAT	2	8	234394	234401	25 %	25 %	25 %	25 %	436737052
3607	NC_020053	ATCG	2	8	234535	234542	25 %	25 %	25 %	25 %	436737053
3608	NC_020053	ATAA	2	8	234592	234599	75 %	25 %	0 %	0 %	436737053
3609	NC_020053	A	6	6	234619	234624	100 %	0 %	0 %	0 %	436737053
3610	NC_020053	CCGT	2	8	234629	234636	0 %	25 %	25 %	50 %	436737053
3611	NC_020053	TAA	2	6	234720	234725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737053
3612	NC_020053	AAT	2	6	234732	234737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737053
3613	NC_020053	GAT	2	6	234747	234752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737053
3614	NC_020053	TTAG	2	8	234844	234851	25 %	50 %	25 %	0 %	436737053
3615	NC_020053	AACC	2	8	234931	234938	50 %	0 %	0 %	50 %	436737053
3616	NC_020053	ACCA	2	8	234965	234972	50 %	0 %	0 %	50 %	436737053
3617	NC_020053	ATA	2	6	235042	235047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737053
3618	NC_020053	GGA	2	6	235058	235063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737053
3619	NC_020053	GTTT	2	8	235074	235081	0 %	75 %	25 %	0 %	436737053
3620	NC_020053	GTG	2	6	235082	235087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737053
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3622	NC_020053	T	6	6	235110	235115	0 %	100 %	0 %	0 %	436737053
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3988	NC_020053	GAT	2	6	259000	259005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737076
3989	NC_020053	GAA	2	6	259006	259011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737076
3990	NC_020053	AAG	2	6	259043	259048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737076
3991	NC_020053	CTC	3	9	259103	259111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737076
3992	NC_020053	A	6	6	259162	259167	100 %	0 %	0 %	0 %	436737076
3993	NC_020053	TAA	2	6	259178	259183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737076
3994	NC_020053	CCAT	2	8	259217	259224	25 %	25 %	0 %	50 %	436737076
3995	NC_020053	TATTTC	2	12	259244	259255	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	436737076
3996	NC_020053	TGC	2	6	259278	259283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737076
3997	NC_020053	TGA	2	6	259284	259289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737076
3998	NC_020053	ATT	2	6	259316	259321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737076
3999	NC_020053	AGAAT	2	10	259445	259454	60 %	20 %	20 %	0 %	436737076
4000	NC_020053	TCT	2	6	259485	259490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737076

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