MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020053	CAG	2	6	65501	65506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736878
1002	NC_020053	ATT	2	6	65611	65616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736878
1003	NC_020053	GCG	2	6	65682	65687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736878
1004	NC_020053	CGG	2	6	65709	65714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736878
1005	NC_020053	CTG	2	6	65719	65724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736878
1006	NC_020053	TTG	2	6	65728	65733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736878
1007	NC_020053	CCA	2	6	65773	65778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736878
1008	NC_020053	ATTAGA	2	12	65822	65833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436736878
1009	NC_020053	ACT	2	6	65839	65844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736878
1010	NC_020053	ATCG	2	8	65859	65866	25 %	25 %	25 %	25 %	436736878
1011	NC_020053	TTG	2	6	65903	65908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736878
1012	NC_020053	TC	3	6	65994	65999	0 %	50 %	0 %	50 %	436736878
1013	NC_020053	CAA	2	6	66073	66078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736878
1014	NC_020053	T	7	7	66097	66103	0 %	100 %	0 %	0 %	436736878
1015	NC_020053	TCA	2	6	66180	66185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736878
1016	NC_020053	TGT	2	6	66209	66214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736878
1017	NC_020053	TCGA	2	8	66265	66272	25 %	25 %	25 %	25 %	436736878
1018	NC_020053	CA	3	6	66318	66323	50 %	0 %	0 %	50 %	436736878
1019	NC_020053	TAGT	2	8	66360	66367	25 %	50 %	25 %	0 %	436736878
1020	NC_020053	TATT	2	8	66427	66434	25 %	75 %	0 %	0 %	436736879
1021	NC_020053	GCG	2	6	66533	66538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736879
1022	NC_020053	ACA	2	6	66539	66544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736879
1023	NC_020053	ATCG	2	8	66688	66695	25 %	25 %	25 %	25 %	436736879
1024	NC_020053	ATT	2	6	66706	66711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736879
1025	NC_020053	TAGTC	2	10	66716	66725	20 %	40 %	20 %	20 %	436736879
1026	NC_020053	GCG	2	6	66769	66774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736879
1027	NC_020053	TTC	2	6	66802	66807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736879
1028	NC_020053	ATC	2	6	66832	66837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736879
1029	NC_020053	ATT	2	6	66974	66979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736879
1030	NC_020053	GTT	2	6	66992	66997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736879
1031	NC_020053	CCAG	2	8	67042	67049	25 %	0 %	25 %	50 %	436736879
1032	NC_020053	CTA	2	6	67071	67076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736879
1033	NC_020053	GAT	2	6	67105	67110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736879
1034	NC_020053	G	6	6	67475	67480	0 %	0 %	100 %	0 %	436736880
1035	NC_020053	GGT	2	6	67505	67510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736880
1036	NC_020053	ATA	2	6	67518	67523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736880
1037	NC_020053	CTG	2	6	67536	67541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736880
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1040	NC_020053	TAT	2	6	67663	67668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736880
1041	NC_020053	A	6	6	67679	67684	100 %	0 %	0 %	0 %	436736880
1042	NC_020053	GCA	2	6	67699	67704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736880
1043	NC_020053	GAT	2	6	67744	67749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736880
1044	NC_020053	GAT	3	9	67804	67812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736880
1045	NC_020053	CGATG	2	10	67861	67870	20 %	20 %	40 %	20 %	436736880
1046	NC_020053	CAT	2	6	67877	67882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736880
1047	NC_020053	A	6	6	67916	67921	100 %	0 %	0 %	0 %	436736880
1048	NC_020053	CTCG	2	8	67946	67953	0 %	25 %	25 %	50 %	436736880
1049	NC_020053	AG	3	6	68004	68009	50 %	0 %	50 %	0 %	436736880
1050	NC_020053	TAGT	2	8	68027	68034	25 %	50 %	25 %	0 %	436736880
1051	NC_020053	GTT	2	6	68469	68474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736881
1052	NC_020053	AGT	2	6	68525	68530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736881
1053	NC_020053	AGC	2	6	68564	68569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736881
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1055	NC_020053	AT	3	6	68588	68593	50 %	50 %	0 %	0 %	436736881
1056	NC_020053	TTTA	2	8	68667	68674	25 %	75 %	0 %	0 %	436736881
1057	NC_020053	ACC	2	6	68741	68746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736881
1058	NC_020053	A	6	6	69222	69227	100 %	0 %	0 %	0 %	436736882
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1060	NC_020053	AGCT	2	8	69284	69291	25 %	25 %	25 %	25 %	436736882
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1062	NC_020053	AACA	2	8	69372	69379	75 %	0 %	0 %	25 %	436736882
1063	NC_020053	ATAA	2	8	69414	69421	75 %	25 %	0 %	0 %	436736882
1064	NC_020053	AAAG	2	8	69425	69432	75 %	0 %	25 %	0 %	436736882
1065	NC_020053	ACCC	2	8	69705	69712	25 %	0 %	0 %	75 %	436736883
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1085	NC_020053	TGA	2	6	70442	70447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736883
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1091	NC_020053	AGT	2	6	70890	70895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736883
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1093	NC_020053	AAT	2	6	70992	70997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736883
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1096	NC_020053	GGCA	2	8	71089	71096	25 %	0 %	50 %	25 %	436736883
1097	NC_020053	TCTG	2	8	71110	71117	0 %	50 %	25 %	25 %	436736883
1098	NC_020053	AT	3	6	71159	71164	50 %	50 %	0 %	0 %	436736883
1099	NC_020053	CA	3	6	71431	71436	50 %	0 %	0 %	50 %	436736884
1100	NC_020053	GGT	2	6	71479	71484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736884
1101	NC_020053	TAC	2	6	71497	71502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736884
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1104	NC_020053	CACCG	2	10	71723	71732	20 %	0 %	20 %	60 %	436736884
1105	NC_020053	CT	3	6	71805	71810	0 %	50 %	0 %	50 %	436736884
1106	NC_020053	TC	3	6	71841	71846	0 %	50 %	0 %	50 %	436736884
1107	NC_020053	GCT	2	6	71870	71875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736884
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1109	NC_020053	A	6	6	71920	71925	100 %	0 %	0 %	0 %	436736884
1110	NC_020053	TCG	2	6	71926	71931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736884
1111	NC_020053	CAA	2	6	72003	72008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736884
1112	NC_020053	A	6	6	72041	72046	100 %	0 %	0 %	0 %	436736884
1113	NC_020053	CAA	3	9	72060	72068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736884
1114	NC_020053	CCG	2	6	72076	72081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736884
1115	NC_020053	CGAAC	2	10	72096	72105	40 %	0 %	20 %	40 %	436736884
1116	NC_020053	CCG	2	6	72418	72423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736884
1117	NC_020053	CGAT	2	8	72523	72530	25 %	25 %	25 %	25 %	436736884
1118	NC_020053	CAG	2	6	72672	72677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736884
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1125	NC_020053	CG	3	6	73032	73037	0 %	0 %	50 %	50 %	436736884
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