MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020053	AGAT	2	8	30397	30404	50 %	25 %	25 %	0 %	436736852
502	NC_020053	AAATT	2	10	30409	30418	60 %	40 %	0 %	0 %	436736852
503	NC_020053	CT	3	6	30419	30424	0 %	50 %	0 %	50 %	436736852
504	NC_020053	TCA	2	6	30427	30432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736852
505	NC_020053	AGA	2	6	30494	30499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736852
506	NC_020053	CA	3	6	30644	30649	50 %	0 %	0 %	50 %	436736852
507	NC_020053	GTA	2	6	30718	30723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736852
508	NC_020053	ATC	2	6	30725	30730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736852
509	NC_020053	ATC	2	6	30775	30780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736852
510	NC_020053	AAACA	2	10	30831	30840	80 %	0 %	0 %	20 %	436736852
511	NC_020053	GCTG	2	8	30896	30903	0 %	25 %	50 %	25 %	436736852
512	NC_020053	TAG	2	6	31048	31053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736852
513	NC_020053	AACT	2	8	31118	31125	50 %	25 %	0 %	25 %	436736852
514	NC_020053	AAC	2	6	31144	31149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736852
515	NC_020053	C	6	6	31160	31165	0 %	0 %	0 %	100 %	436736852
516	NC_020053	AC	3	6	31174	31179	50 %	0 %	0 %	50 %	436736852
517	NC_020053	TCA	2	6	31195	31200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736852
518	NC_020053	TG	3	6	31283	31288	0 %	50 %	50 %	0 %	436736852
519	NC_020053	CGT	2	6	31299	31304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736852
520	NC_020053	TCC	2	6	31309	31314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736852
521	NC_020053	GAA	2	6	31436	31441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736852
522	NC_020053	AGA	2	6	31674	31679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
523	NC_020053	GAAA	2	8	31733	31740	75 %	0 %	25 %	0 %	436736853
524	NC_020053	ATT	2	6	31823	31828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736853
525	NC_020053	TTC	2	6	31841	31846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736853
526	NC_020053	TC	3	6	31868	31873	0 %	50 %	0 %	50 %	436736853
527	NC_020053	ATT	2	6	31914	31919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736853
528	NC_020053	TCG	2	6	32122	32127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736853
529	NC_020053	TTA	2	6	32199	32204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736853
530	NC_020053	AGA	2	6	32210	32215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
531	NC_020053	GAA	2	6	32226	32231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
532	NC_020053	ATT	2	6	32267	32272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736853
533	NC_020053	A	6	6	32273	32278	100 %	0 %	0 %	0 %	436736853
534	NC_020053	A	7	7	32284	32290	100 %	0 %	0 %	0 %	436736853
535	NC_020053	ATCG	2	8	32310	32317	25 %	25 %	25 %	25 %	436736853
536	NC_020053	AGA	2	6	32531	32536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736853
537	NC_020053	TAA	2	6	32594	32599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736853
538	NC_020053	TAT	2	6	32646	32651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736853
539	NC_020053	GCAA	2	8	32656	32663	50 %	0 %	25 %	25 %	436736853
540	NC_020053	TAA	2	6	32785	32790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736854
541	NC_020053	ATCG	2	8	32799	32806	25 %	25 %	25 %	25 %	436736854
542	NC_020053	CGAT	2	8	32838	32845	25 %	25 %	25 %	25 %	436736854
543	NC_020053	GA	3	6	32907	32912	50 %	0 %	50 %	0 %	436736854
544	NC_020053	TAA	3	9	33062	33070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736854
545	NC_020053	AGC	2	6	33352	33357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736855
546	NC_020053	CCT	2	6	33360	33365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736855
547	NC_020053	TCT	2	6	33371	33376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736855
548	NC_020053	CCAC	2	8	33781	33788	25 %	0 %	0 %	75 %	436736856
549	NC_020053	TGAA	2	8	33846	33853	50 %	25 %	25 %	0 %	436736856
550	NC_020053	CGAT	2	8	33885	33892	25 %	25 %	25 %	25 %	436736856
551	NC_020053	CAT	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736856
552	NC_020053	TCCCA	2	10	33963	33972	20 %	20 %	0 %	60 %	436736856
553	NC_020053	GTT	2	6	33989	33994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736856
554	NC_020053	TCCCAA	2	12	34000	34011	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436736856
555	NC_020053	ATC	2	6	34065	34070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736856
556	NC_020053	CTA	2	6	34103	34108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736856
557	NC_020053	GGC	2	6	34113	34118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736856
558	NC_020053	CGAT	2	8	34207	34214	25 %	25 %	25 %	25 %	436736857
559	NC_020053	GGA	2	6	34246	34251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736857
560	NC_020053	CAT	2	6	34264	34269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736857
561	NC_020053	ACT	2	6	34448	34453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736857
562	NC_020053	CTA	2	6	34545	34550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736857
563	NC_020053	GGT	2	6	34578	34583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736857
564	NC_020053	CGC	2	6	34641	34646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736857
565	NC_020053	TCGA	2	8	34679	34686	25 %	25 %	25 %	25 %	436736857
566	NC_020053	CGC	2	6	34688	34693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736857
567	NC_020053	CTG	2	6	34777	34782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736857
568	NC_020053	CGA	2	6	34991	34996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736858
569	NC_020053	TCG	2	6	35053	35058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
570	NC_020053	GAA	2	6	35061	35066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736858
571	NC_020053	TCAAC	2	10	35102	35111	40 %	20 %	0 %	40 %	436736858
572	NC_020053	ATCG	2	8	35148	35155	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
573	NC_020053	TCG	2	6	35227	35232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
574	NC_020053	CGT	2	6	35297	35302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
575	NC_020053	TCA	2	6	35413	35418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736858
576	NC_020053	A	6	6	35418	35423	100 %	0 %	0 %	0 %	436736858
577	NC_020053	AG	3	6	35465	35470	50 %	0 %	50 %	0 %	436736858
578	NC_020053	AAT	2	6	35496	35501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736858
579	NC_020053	ACTA	2	8	35520	35527	50 %	25 %	0 %	25 %	436736858
580	NC_020053	CGA	2	6	35606	35611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736858
581	NC_020053	CA	3	6	35616	35621	50 %	0 %	0 %	50 %	436736858
582	NC_020053	AGCGG	2	10	35674	35683	20 %	0 %	60 %	20 %	436736858
583	NC_020053	CTG	2	6	35691	35696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
584	NC_020053	GACA	2	8	35733	35740	50 %	0 %	25 %	25 %	436736858
585	NC_020053	CGA	2	6	35851	35856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736858
586	NC_020053	GATC	2	8	35900	35907	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
587	NC_020053	TCAC	2	8	36009	36016	25 %	25 %	0 %	50 %	436736858
588	NC_020053	CAA	2	6	36027	36032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736858
589	NC_020053	GTA	2	6	36100	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736858
590	NC_020053	ACG	2	6	36216	36221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736858
591	NC_020053	ATT	2	6	36274	36279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736858
592	NC_020053	AATT	2	8	36307	36314	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
593	NC_020053	ATT	2	6	36320	36325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736858
594	NC_020053	TCGA	2	8	36333	36340	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
595	NC_020053	CGA	2	6	36386	36391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736858
596	NC_020053	AAAG	2	8	36473	36480	75 %	0 %	25 %	0 %	436736858
597	NC_020053	TTGT	2	8	36507	36514	0 %	75 %	25 %	0 %	436736858
598	NC_020053	CTG	2	6	36575	36580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
599	NC_020053	GAAT	2	8	36641	36648	50 %	25 %	25 %	0 %	436736858
600	NC_020053	AGT	2	6	36669	36674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736858
601	NC_020053	TCCT	2	8	36837	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	436736858
602	NC_020053	GCG	2	6	36906	36911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736858
603	NC_020053	AAC	2	6	36952	36957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736858
604	NC_020053	CTG	2	6	36958	36963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
605	NC_020053	TGGGG	2	10	36968	36977	0 %	20 %	80 %	0 %	436736858
606	NC_020053	AAGAA	2	10	36978	36987	80 %	0 %	20 %	0 %	436736858
607	NC_020053	AATT	2	8	37006	37013	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
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609	NC_020053	ATT	2	6	37082	37087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736858
610	NC_020053	ATTA	2	8	37092	37099	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
611	NC_020053	CGAT	2	8	37234	37241	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
612	NC_020053	TGA	2	6	37268	37273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736858
613	NC_020053	TCAA	2	8	37288	37295	50 %	25 %	0 %	25 %	436736858
614	NC_020053	GA	3	6	37376	37381	50 %	0 %	50 %	0 %	436736858
615	NC_020053	CTA	2	6	37411	37416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736858
616	NC_020053	TCC	2	6	37432	37437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736858
617	NC_020053	GCT	2	6	37446	37451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
618	NC_020053	TGA	2	6	37481	37486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736858
619	NC_020053	TAAT	2	8	37510	37517	50 %	50 %	0 %	0 %	436736858
620	NC_020053	AAG	2	6	37546	37551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736858
621	NC_020053	TCGA	2	8	37603	37610	25 %	25 %	25 %	25 %	436736858
622	NC_020053	TTC	2	6	37680	37685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736858
623	NC_020053	CTG	2	6	37705	37710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736858
624	NC_020053	CTGTT	2	10	37812	37821	0 %	60 %	20 %	20 %	436736858
625	NC_020053	GTG	2	6	37863	37868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736858
626	NC_020053	GAA	2	6	37927	37932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736858
627	NC_020053	AAG	2	6	37939	37944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736858
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629	NC_020053	CGC	3	9	37961	37969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736858
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