MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020053	GAT	2	6	438548	438553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737236
7002	NC_020053	GAT	2	6	438614	438619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737236
7003	NC_020053	ACA	2	6	438639	438644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737236
7004	NC_020053	ACC	2	6	438657	438662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737236
7005	NC_020053	GCA	2	6	438790	438795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737237
7006	NC_020053	A	6	6	438841	438846	100 %	0 %	0 %	0 %	436737237
7007	NC_020053	AAC	2	6	438924	438929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737237
7008	NC_020053	CGAT	2	8	439003	439010	25 %	25 %	25 %	25 %	436737237
7009	NC_020053	AGC	2	6	439094	439099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737237
7010	NC_020053	A	6	6	439211	439216	100 %	0 %	0 %	0 %	436737237
7011	NC_020053	TCG	2	6	439238	439243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737237
7012	NC_020053	CG	3	6	439242	439247	0 %	0 %	50 %	50 %	436737237
7013	NC_020053	ATAA	2	8	439285	439292	75 %	25 %	0 %	0 %	436737237
7014	NC_020053	ACT	2	6	439402	439407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737237
7015	NC_020053	AGG	2	6	439413	439418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737237
7016	NC_020053	GGT	2	6	439476	439481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737237
7017	NC_020053	CTC	2	6	439513	439518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737237
7018	NC_020053	AACC	2	8	439632	439639	50 %	0 %	0 %	50 %	436737237
7019	NC_020053	AGC	2	6	439671	439676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737237
7020	NC_020053	ACA	2	6	439732	439737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737237
7021	NC_020053	A	6	6	439820	439825	100 %	0 %	0 %	0 %	436737237
7022	NC_020053	CAGC	2	8	439957	439964	25 %	0 %	25 %	50 %	436737237
7023	NC_020053	TGG	2	6	440012	440017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737237
7024	NC_020053	GATC	2	8	440025	440032	25 %	25 %	25 %	25 %	436737237
7025	NC_020053	CAA	2	6	440053	440058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737237
7026	NC_020053	TCGA	2	8	440073	440080	25 %	25 %	25 %	25 %	436737237
7027	NC_020053	CTG	2	6	440162	440167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737237
7028	NC_020053	AC	3	6	440186	440191	50 %	0 %	0 %	50 %	436737237
7029	NC_020053	CCTAAG	2	12	440197	440208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436737237
7030	NC_020053	ACC	2	6	440236	440241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737237
7031	NC_020053	GA	3	6	440347	440352	50 %	0 %	50 %	0 %	436737237
7032	NC_020053	CGG	2	6	440430	440435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737237
7033	NC_020053	CCAGAA	2	12	440455	440466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436737237
7034	NC_020053	AAT	2	6	440510	440515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737238
7035	NC_020053	CAT	2	6	440616	440621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737238
7036	NC_020053	TAG	2	6	440622	440627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737238
7037	NC_020053	TCG	2	6	440644	440649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737238
7038	NC_020053	AC	3	6	440695	440700	50 %	0 %	0 %	50 %	436737238
7039	NC_020053	CGAT	2	8	440705	440712	25 %	25 %	25 %	25 %	436737238
7040	NC_020053	AT	4	8	440738	440745	50 %	50 %	0 %	0 %	436737238
7041	NC_020053	CCA	2	6	440774	440779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737238
7042	NC_020053	G	6	6	440838	440843	0 %	0 %	100 %	0 %	436737238
7043	NC_020053	TAC	2	6	440852	440857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737238
7044	NC_020053	A	7	7	440897	440903	100 %	0 %	0 %	0 %	436737238
7045	NC_020053	GAA	2	6	440990	440995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737238
7046	NC_020053	AG	3	6	441030	441035	50 %	0 %	50 %	0 %	436737238
7047	NC_020053	TTA	2	6	441062	441067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737238
7048	NC_020053	GGA	2	6	441214	441219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737238
7049	NC_020053	ATG	2	6	441258	441263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737238
7050	NC_020053	TAC	2	6	441266	441271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737238
7051	NC_020053	TGA	2	6	441319	441324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737238
7052	NC_020053	TCA	2	6	441355	441360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737238
7053	NC_020053	AACAC	2	10	441457	441466	60 %	0 %	0 %	40 %	436737238
7054	NC_020053	CCAG	2	8	441548	441555	25 %	0 %	25 %	50 %	436737239
7055	NC_020053	TAA	2	6	441568	441573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737239
7056	NC_020053	CGA	2	6	441680	441685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7057	NC_020053	TC	4	8	441687	441694	0 %	50 %	0 %	50 %	436737239
7058	NC_020053	GCT	3	9	441707	441715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7059	NC_020053	GGC	2	6	441744	441749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737239
7060	NC_020053	TCG	2	6	441778	441783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7061	NC_020053	CT	3	6	441839	441844	0 %	50 %	0 %	50 %	436737239
7062	NC_020053	CAG	2	6	442053	442058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7063	NC_020053	CGAG	2	8	442060	442067	25 %	0 %	50 %	25 %	436737239
7064	NC_020053	CCA	2	6	442143	442148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737239
7065	NC_020053	CGC	2	6	442184	442189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737239
7066	NC_020053	CAGC	2	8	442214	442221	25 %	0 %	25 %	50 %	436737239
7067	NC_020053	CTCTG	2	10	442313	442322	0 %	40 %	20 %	40 %	436737239
7068	NC_020053	TCGC	2	8	442399	442406	0 %	25 %	25 %	50 %	436737239
7069	NC_020053	T	6	6	442423	442428	0 %	100 %	0 %	0 %	436737239
7070	NC_020053	GAT	2	6	442461	442466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737239
7071	NC_020053	CGA	2	6	442718	442723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7072	NC_020053	GTC	2	6	442761	442766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737239
7073	NC_020053	CAAA	2	8	442871	442878	75 %	0 %	0 %	25 %	436737239
7074	NC_020053	A	7	7	442928	442934	100 %	0 %	0 %	0 %	436737239
7075	NC_020053	CCT	2	6	442974	442979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737239
7076	NC_020053	AAGT	2	8	442981	442988	50 %	25 %	25 %	0 %	436737239
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7079	NC_020053	ATCG	2	8	443081	443088	25 %	25 %	25 %	25 %	436737240
7080	NC_020053	ATA	2	6	443103	443108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737240
7081	NC_020053	GAT	2	6	443144	443149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737240
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7089	NC_020053	AGA	2	6	443593	443598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737240
7090	NC_020053	A	6	6	443617	443622	100 %	0 %	0 %	0 %	436737240
7091	NC_020053	GAG	2	6	443663	443668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737241
7092	NC_020053	A	6	6	443673	443678	100 %	0 %	0 %	0 %	436737241
7093	NC_020053	GAC	2	6	443724	443729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737241
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7098	NC_020053	TTA	2	6	443860	443865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737241
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7100	NC_020053	GCA	2	6	443951	443956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737241
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7103	NC_020053	TCT	2	6	444076	444081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737241
7104	NC_020053	ATATA	2	10	444124	444133	60 %	40 %	0 %	0 %	436737241
7105	NC_020053	ATG	2	6	444172	444177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737241
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7108	NC_020053	TGG	2	6	444255	444260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737241
7109	NC_020053	CAA	2	6	444285	444290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737241
7110	NC_020053	TCG	2	6	444295	444300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737241
7111	NC_020053	GAA	2	6	444515	444520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737241
7112	NC_020053	CAATC	2	10	444542	444551	40 %	20 %	0 %	40 %	436737241
7113	NC_020053	ATTA	2	8	444623	444630	50 %	50 %	0 %	0 %	436737241
7114	NC_020053	TGT	2	6	444747	444752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737242
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7118	NC_020053	TAG	3	9	444903	444911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737242
7119	NC_020053	TAAATA	2	12	444922	444933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737242
7120	NC_020053	TAGAG	2	10	444997	445006	40 %	20 %	40 %	0 %	436737242
7121	NC_020053	ATCG	2	8	445025	445032	25 %	25 %	25 %	25 %	436737242
7122	NC_020053	TAT	2	6	445199	445204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737242
7123	NC_020053	A	9	9	445237	445245	100 %	0 %	0 %	0 %	436737243
7124	NC_020053	ATT	2	6	445283	445288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737243
7125	NC_020053	GA	3	6	445304	445309	50 %	0 %	50 %	0 %	436737243
7126	NC_020053	AGT	2	6	445387	445392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737243
7127	NC_020053	TCGA	2	8	445443	445450	25 %	25 %	25 %	25 %	436737243
7128	NC_020053	TCC	2	6	445465	445470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737243
7129	NC_020053	CAA	2	6	445474	445479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737243

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