MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020053	TTC	2	6	381054	381059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737185
6002	NC_020053	TTTG	2	8	381137	381144	0 %	75 %	25 %	0 %	436737185
6003	NC_020053	AGC	2	6	381151	381156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737185
6004	NC_020053	TCGA	2	8	381189	381196	25 %	25 %	25 %	25 %	436737185
6005	NC_020053	TGA	2	6	381296	381301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737185
6006	NC_020053	GCT	2	6	381574	381579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737186
6007	NC_020053	CTG	2	6	381599	381604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737186
6008	NC_020053	GCT	2	6	381607	381612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737186
6009	NC_020053	TGC	2	6	381615	381620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737186
6010	NC_020053	TGTGGT	2	12	381625	381636	0 %	50 %	50 %	0 %	436737186
6011	NC_020053	GTA	2	6	381671	381676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737186
6012	NC_020053	CGAA	2	8	381761	381768	50 %	0 %	25 %	25 %	436737187
6013	NC_020053	CAT	2	6	381876	381881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737187
6014	NC_020053	CAG	2	6	381927	381932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737187
6015	NC_020053	GAAC	2	8	382017	382024	50 %	0 %	25 %	25 %	436737187
6016	NC_020053	CTA	2	6	382047	382052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737187
6017	NC_020053	CCA	2	6	382058	382063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737187
6018	NC_020053	ACT	2	6	382081	382086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737187
6019	NC_020053	GTA	2	6	382154	382159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737187
6020	NC_020053	TAA	2	6	382213	382218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737187
6021	NC_020053	AAT	2	6	382240	382245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737187
6022	NC_020053	AATC	2	8	382400	382407	50 %	25 %	0 %	25 %	436737188
6023	NC_020053	AGAC	2	8	382476	382483	50 %	0 %	25 %	25 %	436737188
6024	NC_020053	AGC	2	6	382490	382495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737188
6025	NC_020053	AATC	2	8	382518	382525	50 %	25 %	0 %	25 %	436737188
6026	NC_020053	AGC	2	6	382568	382573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737188
6027	NC_020053	TCA	2	6	382790	382795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737188
6028	NC_020053	CTG	2	6	382827	382832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737188
6029	NC_020053	T	7	7	382869	382875	0 %	100 %	0 %	0 %	436737188
6030	NC_020053	CT	3	6	383087	383092	0 %	50 %	0 %	50 %	436737189
6031	NC_020053	TCA	2	6	383093	383098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737189
6032	NC_020053	CA	3	6	383205	383210	50 %	0 %	0 %	50 %	436737189
6033	NC_020053	ATA	3	9	383216	383224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737189
6034	NC_020053	ATT	2	6	383225	383230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737189
6035	NC_020053	ATTAA	2	10	383258	383267	60 %	40 %	0 %	0 %	436737189
6036	NC_020053	AT	3	6	383287	383292	50 %	50 %	0 %	0 %	436737189
6037	NC_020053	AATG	2	8	383333	383340	50 %	25 %	25 %	0 %	436737189
6038	NC_020053	CAGGCA	2	12	383429	383440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737190
6039	NC_020053	ATTTG	2	10	383636	383645	20 %	60 %	20 %	0 %	436737190
6040	NC_020053	TGTA	2	8	383688	383695	25 %	50 %	25 %	0 %	436737190
6041	NC_020053	CAT	2	6	384223	384228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737191
6042	NC_020053	AAAG	3	12	384247	384258	75 %	0 %	25 %	0 %	436737191
6043	NC_020053	AGT	2	6	384284	384289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737191
6044	NC_020053	AAT	2	6	384302	384307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737191
6045	NC_020053	AGC	2	6	384339	384344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737191
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6047	NC_020053	A	6	6	384383	384388	100 %	0 %	0 %	0 %	436737191
6048	NC_020053	AAC	2	6	384408	384413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737191
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6050	NC_020053	A	7	7	384458	384464	100 %	0 %	0 %	0 %	436737191
6051	NC_020053	GAC	2	6	384520	384525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737191
6052	NC_020053	AG	3	6	384535	384540	50 %	0 %	50 %	0 %	436737191
6053	NC_020053	AAT	2	6	384541	384546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737191
6054	NC_020053	GCA	3	9	384554	384562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737191
6055	NC_020053	TAG	2	6	384654	384659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737191
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6057	NC_020053	AAT	2	6	384685	384690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737191
6058	NC_020053	GAA	2	6	384707	384712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737191
6059	NC_020053	GAA	2	6	384761	384766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737191
6060	NC_020053	AGT	2	6	384829	384834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737191
6061	NC_020053	CAGA	2	8	384837	384844	50 %	0 %	25 %	25 %	436737191
6062	NC_020053	AAAT	2	8	384861	384868	75 %	25 %	0 %	0 %	436737191
6063	NC_020053	A	6	6	384897	384902	100 %	0 %	0 %	0 %	436737191
6064	NC_020053	GAAT	2	8	384949	384956	50 %	25 %	25 %	0 %	436737191
6065	NC_020053	TAA	2	6	384975	384980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737191
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6069	NC_020053	AGA	2	6	385060	385065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737191
6070	NC_020053	GCA	2	6	385082	385087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737191
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6072	NC_020053	A	6	6	385122	385127	100 %	0 %	0 %	0 %	436737191
6073	NC_020053	AGC	2	6	385182	385187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737191
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6081	NC_020053	ATT	2	6	385374	385379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737191
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6083	NC_020053	CT	3	6	385587	385592	0 %	50 %	0 %	50 %	436737192
6084	NC_020053	GCA	3	9	385671	385679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737192
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6086	NC_020053	T	6	6	385726	385731	0 %	100 %	0 %	0 %	436737192
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6089	NC_020053	CGAT	3	12	386109	386120	25 %	25 %	25 %	25 %	436737193
6090	NC_020053	T	7	7	386222	386228	0 %	100 %	0 %	0 %	436737193
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6094	NC_020053	AACC	2	8	386613	386620	50 %	0 %	0 %	50 %	436737194
6095	NC_020053	TCT	2	6	386636	386641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737194
6096	NC_020053	AATA	2	8	386668	386675	75 %	25 %	0 %	0 %	436737194
6097	NC_020053	AAT	2	6	386698	386703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737194
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6100	NC_020053	ACCA	2	8	386888	386895	50 %	0 %	0 %	50 %	436737194
6101	NC_020053	AGC	2	6	386905	386910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737194
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6103	NC_020053	ATC	2	6	387025	387030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737194
6104	NC_020053	CAG	2	6	387072	387077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737194
6105	NC_020053	ATA	2	6	387078	387083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737194
6106	NC_020053	TTC	2	6	387255	387260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737195
6107	NC_020053	T	6	6	387264	387269	0 %	100 %	0 %	0 %	436737195
6108	NC_020053	AAAC	2	8	387339	387346	75 %	0 %	0 %	25 %	436737195
6109	NC_020053	CGAT	2	8	387359	387366	25 %	25 %	25 %	25 %	436737195
6110	NC_020053	TAA	2	6	387375	387380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737195
6111	NC_020053	AACCC	2	10	387419	387428	40 %	0 %	0 %	60 %	436737195
6112	NC_020053	TCA	2	6	387443	387448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737195
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6117	NC_020053	TAATCA	2	12	387662	387673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436737195
6118	NC_020053	CAA	2	6	387725	387730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737195
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6120	NC_020053	ACG	2	6	387898	387903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737195
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6491	NC_020053	TCT	2	6	407551	407556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737209
6492	NC_020053	TAA	2	6	407624	407629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737209
6493	NC_020053	TCT	2	6	407641	407646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737209
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