MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020053	CAG	2	6	324612	324617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737142
5002	NC_020053	GTC	2	6	324661	324666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5003	NC_020053	TCGATT	2	12	324727	324738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436737143
5004	NC_020053	GATC	2	8	324848	324855	25 %	25 %	25 %	25 %	436737143
5005	NC_020053	CTG	2	6	324874	324879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5006	NC_020053	GGAG	2	8	324896	324903	25 %	0 %	75 %	0 %	436737143
5007	NC_020053	GTCA	2	8	324982	324989	25 %	25 %	25 %	25 %	436737143
5008	NC_020053	CAT	3	9	325004	325012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737143
5009	NC_020053	GACA	2	8	325040	325047	50 %	0 %	25 %	25 %	436737143
5010	NC_020053	TAA	2	6	325265	325270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737143
5011	NC_020053	CGC	2	6	325348	325353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737143
5012	NC_020053	CGA	2	6	325436	325441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5013	NC_020053	TCG	2	6	325495	325500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5014	NC_020053	ACCA	2	8	325519	325526	50 %	0 %	0 %	50 %	436737143
5015	NC_020053	CACT	2	8	325552	325559	25 %	25 %	0 %	50 %	436737143
5016	NC_020053	GCG	2	6	325722	325727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737143
5017	NC_020053	TCC	2	6	325765	325770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737143
5018	NC_020053	TGG	2	6	325911	325916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737143
5019	NC_020053	TGG	2	6	326072	326077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737143
5020	NC_020053	ATT	2	6	326097	326102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737143
5021	NC_020053	ACC	2	6	326107	326112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737143
5022	NC_020053	AAT	2	6	326190	326195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737143
5023	NC_020053	AAG	2	6	326230	326235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737143
5024	NC_020053	CG	3	6	326255	326260	0 %	0 %	50 %	50 %	436737143
5025	NC_020053	TTC	2	6	326277	326282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737143
5026	NC_020053	TC	3	6	326324	326329	0 %	50 %	0 %	50 %	436737143
5027	NC_020053	TCC	2	6	326392	326397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737143
5028	NC_020053	TTC	2	6	326487	326492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737143
5029	NC_020053	AGA	2	6	326576	326581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737143
5030	NC_020053	AAC	2	6	326629	326634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737143
5031	NC_020053	GAG	2	6	326755	326760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737143
5032	NC_020053	GGA	2	6	326771	326776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737143
5033	NC_020053	CCG	2	6	326816	326821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737143
5034	NC_020053	GCT	2	6	326862	326867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5035	NC_020053	TGA	2	6	326896	326901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737143
5036	NC_020053	TCGG	2	8	326902	326909	0 %	25 %	50 %	25 %	436737143
5037	NC_020053	TGC	2	6	326921	326926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5038	NC_020053	AAG	2	6	326959	326964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737143
5039	NC_020053	GGC	2	6	326988	326993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737143
5040	NC_020053	TGT	2	6	327218	327223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737143
5041	NC_020053	CTG	2	6	327258	327263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737143
5042	NC_020053	TAC	2	6	327313	327318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737143
5043	NC_020053	CTG	2	6	327383	327388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5044	NC_020053	CGC	2	6	327402	327407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737144
5045	NC_020053	ACT	2	6	327458	327463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737144
5046	NC_020053	TCCCA	2	10	327493	327502	20 %	20 %	0 %	60 %	436737144
5047	NC_020053	ACC	2	6	327515	327520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5048	NC_020053	CACCG	2	10	327571	327580	20 %	0 %	20 %	60 %	436737144
5049	NC_020053	CAG	2	6	327597	327602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5050	NC_020053	CAT	2	6	327610	327615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737144
5051	NC_020053	CCA	2	6	327617	327622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5052	NC_020053	ACA	2	6	327668	327673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737144
5053	NC_020053	ACC	2	6	327722	327727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5054	NC_020053	ACAG	2	8	327739	327746	50 %	0 %	25 %	25 %	436737144
5055	NC_020053	GAAA	2	8	327808	327815	75 %	0 %	25 %	0 %	436737144
5056	NC_020053	A	6	6	327813	327818	100 %	0 %	0 %	0 %	436737144
5057	NC_020053	GCT	2	6	327821	327826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5058	NC_020053	GAT	2	6	327871	327876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737144
5059	NC_020053	CAA	2	6	327886	327891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737144
5060	NC_020053	GGT	2	6	327932	327937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737144
5061	NC_020053	GGGGGT	2	12	327938	327949	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	436737144
5062	NC_020053	AAT	2	6	327956	327961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737144
5063	NC_020053	AGC	2	6	328036	328041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5064	NC_020053	AAGC	2	8	328055	328062	50 %	0 %	25 %	25 %	436737144
5065	NC_020053	GCA	2	6	328077	328082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5066	NC_020053	ACC	2	6	328088	328093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5067	NC_020053	CAC	2	6	328102	328107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5068	NC_020053	CAG	2	6	328151	328156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5069	NC_020053	CCA	2	6	328224	328229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
5070	NC_020053	AGC	2	6	328276	328281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5071	NC_020053	GCG	2	6	328316	328321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737144
5072	NC_020053	GCG	2	6	328337	328342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737144
5073	NC_020053	CTCG	2	8	328357	328364	0 %	25 %	25 %	50 %	436737144
5074	NC_020053	ACA	2	6	328396	328401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737144
5075	NC_020053	GCC	2	6	328433	328438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737144
5076	NC_020053	GCA	3	9	328487	328495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
5077	NC_020053	CGC	2	6	328502	328507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737144
5078	NC_020053	CAT	2	6	328567	328572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737144
5079	NC_020053	TGG	2	6	328581	328586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737144
5080	NC_020053	GAA	2	6	328600	328605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737144
5081	NC_020053	TTA	2	6	328795	328800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737145
5082	NC_020053	GCC	3	9	328801	328809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737145
5083	NC_020053	AGC	2	6	328821	328826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737145
5084	NC_020053	CCA	2	6	328847	328852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737145
5085	NC_020053	TTA	2	6	328956	328961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737145
5086	NC_020053	CTA	2	6	328966	328971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737145
5087	NC_020053	GTC	2	6	329005	329010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737145
5088	NC_020053	TAC	2	6	329036	329041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737145
5089	NC_020053	A	7	7	329226	329232	100 %	0 %	0 %	0 %	436737145
5090	NC_020053	CAA	2	6	329263	329268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737145
5091	NC_020053	CAG	2	6	329420	329425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737145
5092	NC_020053	CGAT	2	8	329447	329454	25 %	25 %	25 %	25 %	436737145
5093	NC_020053	TTA	2	6	329599	329604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737145
5094	NC_020053	TTGGT	2	10	329670	329679	0 %	60 %	40 %	0 %	436737145
5095	NC_020053	GTT	2	6	329688	329693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737145
5096	NC_020053	TCG	2	6	329723	329728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737145
5097	NC_020053	TAT	2	6	329730	329735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737145
5098	NC_020053	CTA	2	6	329838	329843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737145
5099	NC_020053	GGTAG	2	10	329926	329935	20 %	20 %	60 %	0 %	436737145
5100	NC_020053	GCT	2	6	329944	329949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737145
5101	NC_020053	TGGGGA	2	12	329981	329992	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	436737145
5102	NC_020053	GAA	2	6	330042	330047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737145
5103	NC_020053	TAT	2	6	330156	330161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737146
5104	NC_020053	TC	3	6	330166	330171	0 %	50 %	0 %	50 %	436737146
5105	NC_020053	ATT	2	6	330186	330191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737146
5106	NC_020053	AGT	2	6	330247	330252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737146
5107	NC_020053	CGA	2	6	330278	330283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737146
5108	NC_020053	CTA	2	6	330321	330326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737146
5109	NC_020053	CACC	2	8	330351	330358	25 %	0 %	0 %	75 %	436737146
5110	NC_020053	TCGA	2	8	330394	330401	25 %	25 %	25 %	25 %	436737146
5111	NC_020053	CAA	2	6	330406	330411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737146
5112	NC_020053	GATC	2	8	330459	330466	25 %	25 %	25 %	25 %	436737146
5113	NC_020053	TTA	2	6	330671	330676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737146
5114	NC_020053	GA	3	6	330703	330708	50 %	0 %	50 %	0 %	436737146
5115	NC_020053	GATC	2	8	330717	330724	25 %	25 %	25 %	25 %	436737146
5116	NC_020053	TTGCTG	2	12	330731	330742	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436737146
5117	NC_020053	CAT	2	6	330748	330753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737146
5118	NC_020053	ATT	2	6	330804	330809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737146
5119	NC_020053	ACT	2	6	331050	331055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737146
5120	NC_020053	GAA	2	6	331081	331086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737146
5121	NC_020053	GGT	2	6	331122	331127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737146
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5241	NC_020053	AT	3	6	337757	337762	50 %	50 %	0 %	0 %	436737153
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5484	NC_020053	TCA	2	6	350765	350770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737165
5485	NC_020053	CCCA	2	8	350776	350783	25 %	0 %	0 %	75 %	436737165
5486	NC_020053	TCA	2	6	350843	350848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737165
5487	NC_020053	CTA	2	6	350875	350880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737165
5488	NC_020053	ACC	2	6	350882	350887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737165
5489	NC_020053	CCA	2	6	350889	350894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737165
5490	NC_020053	ATC	2	6	350901	350906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737165
5491	NC_020053	GAA	2	6	350925	350930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737165
5492	NC_020053	ATTAA	2	10	351032	351041	60 %	40 %	0 %	0 %	436737166
5493	NC_020053	TCA	2	6	351054	351059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737166
5494	NC_020053	AGA	2	6	351062	351067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737166
5495	NC_020053	TAC	2	6	351118	351123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737166
5496	NC_020053	AT	3	6	351202	351207	50 %	50 %	0 %	0 %	436737166
5497	NC_020053	TGA	2	6	351214	351219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737166
5498	NC_020053	ACCA	2	8	351224	351231	50 %	0 %	0 %	50 %	436737166
5499	NC_020053	GGC	2	6	351301	351306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737166
5500	NC_020053	GTA	2	6	351410	351415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737166

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