MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	AG	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
2	NC_020050	AT	3	6	364	369	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
3	NC_020050	AT	3	6	1210	1215	50 %	50 %	0 %	0 %	436669980
4	NC_020050	AG	3	6	1385	1390	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
5	NC_020050	GA	4	8	1406	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
6	NC_020050	CT	4	8	3074	3081	0 %	50 %	0 %	50 %	436669981
7	NC_020050	AT	3	6	7597	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
8	NC_020050	TA	3	6	8082	8087	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
9	NC_020050	CT	3	6	8320	8325	0 %	50 %	0 %	50 %	436669983
10	NC_020050	AC	3	6	8393	8398	50 %	0 %	0 %	50 %	436669983
11	NC_020050	AT	3	6	8852	8857	50 %	50 %	0 %	0 %	436669984
12	NC_020050	GA	3	6	10335	10340	50 %	0 %	50 %	0 %	436669985
13	NC_020050	TC	3	6	11155	11160	0 %	50 %	0 %	50 %	436669986
14	NC_020050	CG	3	6	11227	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	436669986
15	NC_020050	CA	3	6	13545	13550	50 %	0 %	0 %	50 %	436669990
16	NC_020050	TA	3	6	14185	14190	50 %	50 %	0 %	0 %	436669990
17	NC_020050	TG	3	6	14742	14747	0 %	50 %	50 %	0 %	436669990
18	NC_020050	GT	3	6	18748	18753	0 %	50 %	50 %	0 %	436669992
19	NC_020050	AC	3	6	20744	20749	50 %	0 %	0 %	50 %	436669993
20	NC_020050	AT	3	6	22660	22665	50 %	50 %	0 %	0 %	436669996
21	NC_020050	TA	3	6	24706	24711	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
22	NC_020050	GA	3	6	25194	25199	50 %	0 %	50 %	0 %	436669999
23	NC_020050	AC	3	6	25335	25340	50 %	0 %	0 %	50 %	436669999
24	NC_020050	TA	3	6	25341	25346	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
25	NC_020050	AT	3	6	26075	26080	50 %	50 %	0 %	0 %	436670000
26	NC_020050	GT	3	6	26360	26365	0 %	50 %	50 %	0 %	436670000
27	NC_020050	AG	3	6	26575	26580	50 %	0 %	50 %	0 %	436670000
28	NC_020050	TC	3	6	26925	26930	0 %	50 %	0 %	50 %	436670000
29	NC_020050	AG	3	6	26948	26953	50 %	0 %	50 %	0 %	436670000
30	NC_020050	AG	3	6	27563	27568	50 %	0 %	50 %	0 %	436670001
31	NC_020050	TA	3	6	27938	27943	50 %	50 %	0 %	0 %	436670001
32	NC_020050	CT	3	6	27990	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	436670001
33	NC_020050	CT	3	6	28837	28842	0 %	50 %	0 %	50 %	436670001
34	NC_020050	GA	3	6	28934	28939	50 %	0 %	50 %	0 %	436670001
35	NC_020050	TA	3	6	28959	28964	50 %	50 %	0 %	0 %	436670001
36	NC_020050	CA	3	6	30911	30916	50 %	0 %	0 %	50 %	436670002
37	NC_020050	TA	3	6	32925	32930	50 %	50 %	0 %	0 %	436670004
38	NC_020050	CA	3	6	33394	33399	50 %	0 %	0 %	50 %	436670004
39	NC_020050	TA	3	6	33977	33982	50 %	50 %	0 %	0 %	436670005
40	NC_020050	TG	3	6	34313	34318	0 %	50 %	50 %	0 %	436670006
41	NC_020050	TG	3	6	34668	34673	0 %	50 %	50 %	0 %	436670006
42	NC_020050	AT	3	6	38384	38389	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
43	NC_020050	TG	3	6	39485	39490	0 %	50 %	50 %	0 %	436670010
44	NC_020050	AT	3	6	39998	40003	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
45	NC_020050	TG	3	6	40626	40631	0 %	50 %	50 %	0 %	436670011
46	NC_020050	TA	3	6	42490	42495	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
47	NC_020050	GA	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	436670011
48	NC_020050	CT	3	6	44468	44473	0 %	50 %	0 %	50 %	436670011
49	NC_020050	TC	3	6	45054	45059	0 %	50 %	0 %	50 %	436670011
50	NC_020050	GT	3	6	48515	48520	0 %	50 %	50 %	0 %	436670015
51	NC_020050	TA	3	6	49130	49135	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
52	NC_020050	AT	3	6	49188	49193	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
53	NC_020050	GA	3	6	56727	56732	50 %	0 %	50 %	0 %	436670022
54	NC_020050	TC	3	6	57501	57506	0 %	50 %	0 %	50 %	436670023
55	NC_020050	TA	3	6	57703	57708	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
56	NC_020050	AT	3	6	57918	57923	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
57	NC_020050	AT	3	6	59498	59503	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
58	NC_020050	GA	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
59	NC_020050	AG	3	6	61028	61033	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
60	NC_020050	AT	3	6	61110	61115	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
61	NC_020050	TA	3	6	61329	61334	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
62	NC_020050	CA	3	6	61838	61843	50 %	0 %	0 %	50 %	436670024
63	NC_020050	CA	3	6	62350	62355	50 %	0 %	0 %	50 %	436670024
64	NC_020050	AG	3	6	63083	63088	50 %	0 %	50 %	0 %	436670024
65	NC_020050	TA	3	6	64084	64089	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
66	NC_020050	TC	3	6	64588	64593	0 %	50 %	0 %	50 %	436670024
67	NC_020050	CG	3	6	64793	64798	0 %	0 %	50 %	50 %	436670024
68	NC_020050	TA	3	6	67504	67509	50 %	50 %	0 %	0 %	436670025
69	NC_020050	CT	3	6	68406	68411	0 %	50 %	0 %	50 %	436670025
70	NC_020050	TG	3	6	68680	68685	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
71	NC_020050	TG	3	6	68941	68946	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
72	NC_020050	CA	3	6	69036	69041	50 %	0 %	0 %	50 %	436670025
73	NC_020050	AG	3	6	73065	73070	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
74	NC_020050	AT	3	6	74364	74369	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
75	NC_020050	AT	3	6	74436	74441	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
76	NC_020050	AG	3	6	76248	76253	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
77	NC_020050	CG	3	6	77164	77169	0 %	0 %	50 %	50 %	436670026
78	NC_020050	CA	3	6	78051	78056	50 %	0 %	0 %	50 %	436670026
79	NC_020050	AT	3	6	78903	78908	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
80	NC_020050	TA	3	6	79060	79065	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
81	NC_020050	AT	3	6	79407	79412	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
82	NC_020050	TC	3	6	79863	79868	0 %	50 %	0 %	50 %	436670028
83	NC_020050	GT	3	6	80408	80413	0 %	50 %	50 %	0 %	436670028
84	NC_020050	AT	3	6	80801	80806	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
85	NC_020050	TA	3	6	82505	82510	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
86	NC_020050	CG	3	6	82524	82529	0 %	0 %	50 %	50 %	436670028
87	NC_020050	AG	3	6	83484	83489	50 %	0 %	50 %	0 %	436670028
88	NC_020050	TA	3	6	86184	86189	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
89	NC_020050	CT	3	6	86834	86839	0 %	50 %	0 %	50 %	436670029
90	NC_020050	TG	3	6	88132	88137	0 %	50 %	50 %	0 %	436670029
91	NC_020050	AT	3	6	89207	89212	50 %	50 %	0 %	0 %	436670029
92	NC_020050	AG	3	6	90180	90185	50 %	0 %	50 %	0 %	436670029
93	NC_020050	CA	4	8	91030	91037	50 %	0 %	0 %	50 %	436670029
94	NC_020050	GT	3	6	91901	91906	0 %	50 %	50 %	0 %	436670030
95	NC_020050	AT	3	6	93002	93007	50 %	50 %	0 %	0 %	436670030
96	NC_020050	AT	3	6	93871	93876	50 %	50 %	0 %	0 %	436670032
97	NC_020050	TC	3	6	94565	94570	0 %	50 %	0 %	50 %	436670033
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99	NC_020050	TA	3	6	96224	96229	50 %	50 %	0 %	0 %	436670035
100	NC_020050	TG	3	6	96874	96879	0 %	50 %	50 %	0 %	436670035
101	NC_020050	GT	3	6	97391	97396	0 %	50 %	50 %	0 %	436670036
102	NC_020050	TA	3	6	98249	98254	50 %	50 %	0 %	0 %	436670036
103	NC_020050	GA	3	6	98641	98646	50 %	0 %	50 %	0 %	436670036
104	NC_020050	GT	3	6	99894	99899	0 %	50 %	50 %	0 %	436670037
105	NC_020050	AG	3	6	101127	101132	50 %	0 %	50 %	0 %	436670038
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108	NC_020050	AT	3	6	106168	106173	50 %	50 %	0 %	0 %	436670041
109	NC_020050	TC	3	6	106317	106322	0 %	50 %	0 %	50 %	436670041
110	NC_020050	TC	3	6	107873	107878	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
111	NC_020050	TC	3	6	108089	108094	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
112	NC_020050	AT	3	6	108138	108143	50 %	50 %	0 %	0 %	436670042
113	NC_020050	TG	3	6	108211	108216	0 %	50 %	50 %	0 %	436670042
114	NC_020050	CT	3	6	110334	110339	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
115	NC_020050	TC	4	8	111218	111225	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
116	NC_020050	AT	5	10	111672	111681	50 %	50 %	0 %	0 %	436670043
117	NC_020050	TA	3	6	111817	111822	50 %	50 %	0 %	0 %	436670043
118	NC_020050	AC	3	6	111978	111983	50 %	0 %	0 %	50 %	436670043
119	NC_020050	AG	3	6	112900	112905	50 %	0 %	50 %	0 %	436670043
120	NC_020050	CT	3	6	115426	115431	0 %	50 %	0 %	50 %	436670045
121	NC_020050	GT	3	6	115449	115454	0 %	50 %	50 %	0 %	436670045
122	NC_020050	CT	3	6	116741	116746	0 %	50 %	0 %	50 %	436670047
123	NC_020050	AT	3	6	116937	116942	50 %	50 %	0 %	0 %	436670047
124	NC_020050	CA	3	6	119353	119358	50 %	0 %	0 %	50 %	436670048
125	NC_020050	CT	3	6	121823	121828	0 %	50 %	0 %	50 %	436670051
126	NC_020050	CA	3	6	122117	122122	50 %	0 %	0 %	50 %	436670051
127	NC_020050	CT	3	6	123345	123350	0 %	50 %	0 %	50 %	436670052
128	NC_020050	TC	3	6	123457	123462	0 %	50 %	0 %	50 %	436670052
129	NC_020050	TG	3	6	123551	123556	0 %	50 %	50 %	0 %	436670052
130	NC_020050	AC	3	6	124512	124517	50 %	0 %	0 %	50 %	436670053
131	NC_020050	CT	3	6	125696	125701	0 %	50 %	0 %	50 %	436670054
132	NC_020050	CT	3	6	125865	125870	0 %	50 %	0 %	50 %	436670054
133	NC_020050	CG	3	6	126778	126783	0 %	0 %	50 %	50 %	436670054
134	NC_020050	CA	3	6	129026	129031	50 %	0 %	0 %	50 %	436670057
135	NC_020050	GT	3	6	133583	133588	0 %	50 %	50 %	0 %	436670065
136	NC_020050	AC	3	6	133600	133605	50 %	0 %	0 %	50 %	436670065
137	NC_020050	AG	3	6	133606	133611	50 %	0 %	50 %	0 %	436670065
138	NC_020050	TG	3	6	134510	134515	0 %	50 %	50 %	0 %	436670065
139	NC_020050	AT	3	6	134784	134789	50 %	50 %	0 %	0 %	436670065
140	NC_020050	GA	3	6	135614	135619	50 %	0 %	50 %	0 %	436670066
141	NC_020050	TA	3	6	136069	136074	50 %	50 %	0 %	0 %	436670066
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.