MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 4381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669980
2	NC_020050	TCA	2	6	249	254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
3	NC_020050	GCT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
4	NC_020050	TGA	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
5	NC_020050	GTT	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669980
6	NC_020050	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
7	NC_020050	GAA	2	6	605	610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
8	NC_020050	CGC	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
9	NC_020050	TCG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
10	NC_020050	GTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
11	NC_020050	GAG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
12	NC_020050	GAA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
13	NC_020050	AAG	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
14	NC_020050	CCA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669980
15	NC_020050	CGT	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
16	NC_020050	CAG	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
17	NC_020050	TAG	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
18	NC_020050	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669980
19	NC_020050	AGA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
20	NC_020050	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669980
21	NC_020050	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
22	NC_020050	AGA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
23	NC_020050	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
24	NC_020050	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
25	NC_020050	AGG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669980
26	NC_020050	GAA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669980
27	NC_020050	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669980
28	NC_020050	CTG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669980
29	NC_020050	GAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
30	NC_020050	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669980
31	NC_020050	AAT	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669980
32	NC_020050	TTC	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669980
33	NC_020050	CGA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669980
34	NC_020050	TGA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
35	NC_020050	CTG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
36	NC_020050	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
37	NC_020050	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669981
38	NC_020050	TAG	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
39	NC_020050	TGG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669981
40	NC_020050	TTG	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669981
41	NC_020050	TGC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669981
42	NC_020050	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669981
43	NC_020050	TAT	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669981
44	NC_020050	GAT	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669981
45	NC_020050	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669981
46	NC_020050	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669982
47	NC_020050	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669982
48	NC_020050	CAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669982
49	NC_020050	CTT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669982
50	NC_020050	AGT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
51	NC_020050	TAA	2	6	7662	7667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
52	NC_020050	ACA	2	6	7709	7714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
53	NC_020050	ATT	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
54	NC_020050	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669983
55	NC_020050	TCT	2	6	7801	7806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669983
56	NC_020050	TGT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669983
57	NC_020050	TAG	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
58	NC_020050	AAT	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
59	NC_020050	AGT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
60	NC_020050	CCA	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669983
61	NC_020050	CAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
62	NC_020050	TAA	2	6	8283	8288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669983
63	NC_020050	AGA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669983
64	NC_020050	CAA	2	6	8516	8521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669983
65	NC_020050	TGG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669983
66	NC_020050	GAT	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
67	NC_020050	AGT	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669983
68	NC_020050	CTA	2	6	8712	8717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669983
69	NC_020050	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
70	NC_020050	AGG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436669984
71	NC_020050	AGA	2	6	8859	8864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
72	NC_020050	GAA	2	6	8950	8955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669984
73	NC_020050	CTA	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669984
74	NC_020050	TGA	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669984
75	NC_020050	GAC	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669984
76	NC_020050	CCA	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669984
77	NC_020050	CGT	2	6	9523	9528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669984
78	NC_020050	GCA	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669984
79	NC_020050	ACA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669984
80	NC_020050	TGA	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669984
81	NC_020050	AGC	2	6	9921	9926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669985
82	NC_020050	TAT	2	6	10053	10058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669985
83	NC_020050	AAT	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669985
84	NC_020050	ATC	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669985
85	NC_020050	TGA	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669985
86	NC_020050	TTG	2	6	10355	10360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669985
87	NC_020050	ACC	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436669986
88	NC_020050	TGG	2	6	10883	10888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669986
89	NC_020050	TGG	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669986
90	NC_020050	ATT	2	6	11096	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436669986
91	NC_020050	CAG	2	6	11133	11138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669986
92	NC_020050	GCC	2	6	11497	11502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669986
93	NC_020050	GAT	3	9	11521	11529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669986
94	NC_020050	GAA	2	6	11599	11604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669986
95	NC_020050	CTA	2	6	11652	11657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669986
96	NC_020050	GCA	2	6	12245	12250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669987
97	NC_020050	TCC	2	6	12311	12316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436669987
98	NC_020050	AAC	2	6	12903	12908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436669988
99	NC_020050	TCA	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669988
100	NC_020050	TCC	2	6	13109	13114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436669989
101	NC_020050	CTT	2	6	13132	13137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669989
102	NC_020050	CTT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669989
103	NC_020050	CTG	2	6	13176	13181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
104	NC_020050	TAA	2	6	13299	13304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669990
105	NC_020050	CGT	2	6	13489	13494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
106	NC_020050	TTG	2	6	13553	13558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
107	NC_020050	TGT	2	6	13643	13648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
108	NC_020050	AAT	2	6	13653	13658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669990
109	NC_020050	TAG	2	6	13727	13732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
110	NC_020050	CAT	2	6	13826	13831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669990
111	NC_020050	ACG	2	6	13880	13885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669990
112	NC_020050	GTC	2	6	13918	13923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
113	NC_020050	TTG	2	6	14041	14046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
114	NC_020050	GCT	2	6	14196	14201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436669990
115	NC_020050	TAA	2	6	14233	14238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436669990
116	NC_020050	AGT	2	6	14247	14252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
117	NC_020050	CGC	2	6	14292	14297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436669990
118	NC_020050	GTA	2	6	14308	14313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
119	NC_020050	GTG	2	6	14411	14416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669990
120	NC_020050	GTG	3	9	14619	14627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436669990
121	NC_020050	TGA	2	6	14715	14720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
122	NC_020050	TTG	2	6	14762	14767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436669990
123	NC_020050	CTA	2	6	14797	14802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436669990
124	NC_020050	TCT	2	6	14985	14990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669990
125	NC_020050	GTA	2	6	15044	15049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436669990
126	NC_020050	TTC	2	6	15173	15178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436669990
127	NC_020050	GAA	2	6	15206	15211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436669990
128	NC_020050	CAG	2	6	17535	17540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436669991
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