MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020050	CAGA	2	8	158696	158703	50 %	0 %	25 %	25 %	436670084
2502	NC_020050	CTA	2	6	158820	158825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670084
2503	NC_020050	A	6	6	158855	158860	100 %	0 %	0 %	0 %	436670084
2504	NC_020050	TAC	2	6	158924	158929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670084
2505	NC_020050	AAG	2	6	158970	158975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670084
2506	NC_020050	GAT	2	6	158996	159001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670084
2507	NC_020050	AGCC	2	8	159034	159041	25 %	0 %	25 %	50 %	436670084
2508	NC_020050	CAA	2	6	159107	159112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670084
2509	NC_020050	ATT	2	6	159160	159165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670084
2510	NC_020050	CTGTTG	2	12	159180	159191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436670084
2511	NC_020050	AATC	2	8	159196	159203	50 %	25 %	0 %	25 %	436670084
2512	NC_020050	A	6	6	159223	159228	100 %	0 %	0 %	0 %	436670084
2513	NC_020050	GAA	2	6	159269	159274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670084
2514	NC_020050	TTG	2	6	159416	159421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670084
2515	NC_020050	CATA	2	8	159426	159433	50 %	25 %	0 %	25 %	436670084
2516	NC_020050	CAA	2	6	159456	159461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670084
2517	NC_020050	AGA	2	6	159483	159488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670084
2518	NC_020050	TAC	2	6	159723	159728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670085
2519	NC_020050	CAG	2	6	159736	159741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670085
2520	NC_020050	AAT	2	6	159751	159756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670085
2521	NC_020050	GGC	2	6	159800	159805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670085
2522	NC_020050	AGT	2	6	159826	159831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670085
2523	NC_020050	TAA	2	6	159854	159859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670085
2524	NC_020050	CTG	2	6	159860	159865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670085
2525	NC_020050	ATC	2	6	159874	159879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670085
2526	NC_020050	AG	3	6	159896	159901	50 %	0 %	50 %	0 %	436670085
2527	NC_020050	AGA	2	6	159975	159980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670085
2528	NC_020050	TAA	2	6	160007	160012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670085
2529	NC_020050	TTG	2	6	160094	160099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670085
2530	NC_020050	TAG	2	6	160124	160129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670085
2531	NC_020050	GAT	2	6	160155	160160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670085
2532	NC_020050	GCG	2	6	160245	160250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670085
2533	NC_020050	GACT	2	8	160257	160264	25 %	25 %	25 %	25 %	436670085
2534	NC_020050	AT	3	6	160293	160298	50 %	50 %	0 %	0 %	436670085
2535	NC_020050	TAT	2	6	160453	160458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670086
2536	NC_020050	CAA	2	6	160517	160522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670086
2537	NC_020050	ATC	3	9	160591	160599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670086
2538	NC_020050	GCC	2	6	160604	160609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670086
2539	NC_020050	AG	3	6	160611	160616	50 %	0 %	50 %	0 %	436670086
2540	NC_020050	ATC	2	6	160620	160625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670086
2541	NC_020050	CCAAAG	2	12	160657	160668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436670086
2542	NC_020050	TCA	2	6	160682	160687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670086
2543	NC_020050	TGT	2	6	160714	160719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670086
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2545	NC_020050	TGA	2	6	160810	160815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670086
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2550	NC_020050	CAA	2	6	161768	161773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670087
2551	NC_020050	TTA	2	6	161852	161857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670087
2552	NC_020050	GGAA	2	8	161914	161921	50 %	0 %	50 %	0 %	436670087
2553	NC_020050	CAG	2	6	162327	162332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670088
2554	NC_020050	TAG	2	6	162493	162498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670088
2555	NC_020050	GCG	2	6	162530	162535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670088
2556	NC_020050	GAA	2	6	162546	162551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670088
2557	NC_020050	GCAAG	2	10	162578	162587	40 %	0 %	40 %	20 %	436670088
2558	NC_020050	A	8	8	162658	162665	100 %	0 %	0 %	0 %	436670088
2559	NC_020050	TGG	2	6	162672	162677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670088
2560	NC_020050	A	6	6	162691	162696	100 %	0 %	0 %	0 %	436670088
2561	NC_020050	TTG	2	6	162726	162731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670088
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2563	NC_020050	GGC	2	6	162961	162966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670088
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2565	NC_020050	TGT	2	6	163018	163023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670088
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2569	NC_020050	GCG	2	6	163428	163433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670088
2570	NC_020050	ATG	2	6	163465	163470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670088
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2593	NC_020050	GTCA	2	8	164247	164254	25 %	25 %	25 %	25 %	436670088
2594	NC_020050	ATTT	2	8	164287	164294	25 %	75 %	0 %	0 %	436670088
2595	NC_020050	A	6	6	164327	164332	100 %	0 %	0 %	0 %	436670088
2596	NC_020050	GTTC	2	8	164349	164356	0 %	50 %	25 %	25 %	436670088
2597	NC_020050	TGC	2	6	164360	164365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670088
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2602	NC_020050	TCAG	2	8	164483	164490	25 %	25 %	25 %	25 %	436670088
2603	NC_020050	AAG	2	6	164597	164602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670088
2604	NC_020050	TTG	2	6	164604	164609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670088
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2606	NC_020050	TCAT	2	8	164738	164745	25 %	50 %	0 %	25 %	436670088
2607	NC_020050	ACA	2	6	164880	164885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670088
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2609	NC_020050	TAGT	2	8	164962	164969	25 %	50 %	25 %	0 %	436670088
2610	NC_020050	TGC	2	6	165026	165031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670088
2611	NC_020050	GCT	2	6	165120	165125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670088
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2614	NC_020050	ACA	2	6	165214	165219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670088
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2617	NC_020050	ACT	2	6	165277	165282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670088
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2619	NC_020050	CGA	2	6	165441	165446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670088
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2864	NC_020050	ATA	2	6	180496	180501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670102
2865	NC_020050	CAT	2	6	180533	180538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670102
2866	NC_020050	CAA	2	6	180557	180562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670102
2867	NC_020050	A	6	6	180565	180570	100 %	0 %	0 %	0 %	436670102
2868	NC_020050	AAG	2	6	180605	180610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670102
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2872	NC_020050	CTT	2	6	180731	180736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670102
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2887	NC_020050	GAATA	2	10	181520	181529	60 %	20 %	20 %	0 %	436670102
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2891	NC_020050	T	6	6	181636	181641	0 %	100 %	0 %	0 %	436670102
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2980	NC_020050	ATT	2	6	188145	188150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670107
2981	NC_020050	GA	3	6	188219	188224	50 %	0 %	50 %	0 %	436670107
2982	NC_020050	TGC	2	6	188235	188240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670107
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2984	NC_020050	T	6	6	188474	188479	0 %	100 %	0 %	0 %	436670107
2985	NC_020050	GCA	2	6	188511	188516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670107
2986	NC_020050	GCA	2	6	188523	188528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670107
2987	NC_020050	TTG	2	6	188573	188578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670107
2988	NC_020050	GTA	2	6	188599	188604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670107
2989	NC_020050	AAT	2	6	188682	188687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670107
2990	NC_020050	GA	3	6	188694	188699	50 %	0 %	50 %	0 %	436670107
2991	NC_020050	CCTG	2	8	188706	188713	0 %	25 %	25 %	50 %	436670107
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2997	NC_020050	CTTA	2	8	189289	189296	25 %	50 %	0 %	25 %	436670108
2998	NC_020050	TGT	2	6	189326	189331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670108
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3000	NC_020050	TTTG	2	8	189459	189466	0 %	75 %	25 %	0 %	436670108

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