MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020050	GTT	2	6	130518	130523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2002	NC_020050	CTG	3	9	130540	130548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670061
2003	NC_020050	GTG	2	6	130566	130571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670061
2004	NC_020050	GTTCTG	2	12	130587	130598	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436670061
2005	NC_020050	G	6	6	130624	130629	0 %	0 %	100 %	0 %	436670061
2006	NC_020050	AGC	2	6	130631	130636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670061
2007	NC_020050	CCT	2	6	130734	130739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670061
2008	NC_020050	AATGGT	2	12	130771	130782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670061
2009	NC_020050	GTT	2	6	130788	130793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2010	NC_020050	GTT	2	6	130797	130802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2011	NC_020050	TTTGC	2	10	130886	130895	0 %	60 %	20 %	20 %	436670062
2012	NC_020050	CTT	2	6	130904	130909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670062
2013	NC_020050	TTG	2	6	130921	130926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670062
2014	NC_020050	TCTG	2	8	130995	131002	0 %	50 %	25 %	25 %	436670062
2015	NC_020050	T	6	6	131016	131021	0 %	100 %	0 %	0 %	436670062
2016	NC_020050	AAC	2	6	131076	131081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670062
2017	NC_020050	TTG	2	6	131123	131128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670062
2018	NC_020050	CTA	2	6	131459	131464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670063
2019	NC_020050	AAC	2	6	131475	131480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670063
2020	NC_020050	TAA	2	6	131555	131560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670063
2021	NC_020050	GAA	2	6	131622	131627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670064
2022	NC_020050	AACC	2	8	131628	131635	50 %	0 %	0 %	50 %	436670064
2023	NC_020050	CAG	2	6	131686	131691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670064
2024	NC_020050	CTAA	2	8	132395	132402	50 %	25 %	0 %	25 %	436670065
2025	NC_020050	AAC	2	6	132514	132519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670065
2026	NC_020050	CGC	2	6	132557	132562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670065
2027	NC_020050	TGG	2	6	132623	132628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2028	NC_020050	ACCA	2	8	132657	132664	50 %	0 %	0 %	50 %	436670065
2029	NC_020050	CAA	2	6	132703	132708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670065
2030	NC_020050	AAG	2	6	132750	132755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670065
2031	NC_020050	CTT	2	6	132766	132771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670065
2032	NC_020050	GAA	2	6	132833	132838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670065
2033	NC_020050	GACA	2	8	132839	132846	50 %	0 %	25 %	25 %	436670065
2034	NC_020050	TGG	2	6	132853	132858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2035	NC_020050	AAAG	2	8	132913	132920	75 %	0 %	25 %	0 %	436670065
2036	NC_020050	CAG	2	6	132921	132926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2037	NC_020050	CTG	2	6	132936	132941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2038	NC_020050	CCCT	2	8	132957	132964	0 %	25 %	0 %	75 %	436670065
2039	NC_020050	TGG	2	6	132973	132978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2040	NC_020050	AGATGA	2	12	132994	133005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436670065
2041	NC_020050	GCTG	2	8	133160	133167	0 %	25 %	50 %	25 %	436670065
2042	NC_020050	CAG	2	6	133191	133196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2043	NC_020050	CGC	2	6	133225	133230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670065
2044	NC_020050	ACA	2	6	133260	133265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670065
2045	NC_020050	CTA	2	6	133307	133312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670065
2046	NC_020050	C	6	6	133318	133323	0 %	0 %	0 %	100 %	436670065
2047	NC_020050	CAAC	2	8	133336	133343	50 %	0 %	0 %	50 %	436670065
2048	NC_020050	TGGC	2	8	133424	133431	0 %	25 %	50 %	25 %	436670065
2049	NC_020050	GT	3	6	133583	133588	0 %	50 %	50 %	0 %	436670065
2050	NC_020050	AC	3	6	133600	133605	50 %	0 %	0 %	50 %	436670065
2051	NC_020050	AG	3	6	133606	133611	50 %	0 %	50 %	0 %	436670065
2052	NC_020050	TCA	2	6	133653	133658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670065
2053	NC_020050	CGA	2	6	133660	133665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2054	NC_020050	A	6	6	133745	133750	100 %	0 %	0 %	0 %	436670065
2055	NC_020050	CAG	2	6	133768	133773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2056	NC_020050	CCTCT	2	10	133792	133801	0 %	40 %	0 %	60 %	436670065
2057	NC_020050	CTGG	2	8	133841	133848	0 %	25 %	50 %	25 %	436670065
2058	NC_020050	TGC	2	6	133945	133950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2059	NC_020050	TGG	2	6	133975	133980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2060	NC_020050	CAT	2	6	133982	133987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670065
2061	NC_020050	CCAAAT	2	12	134013	134024	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	436670065
2062	NC_020050	TAGCGT	2	12	134092	134103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436670065
2063	NC_020050	CCTAG	2	10	134186	134195	20 %	20 %	20 %	40 %	436670065
2064	NC_020050	CAG	2	6	134232	134237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2065	NC_020050	CTG	2	6	134381	134386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2066	NC_020050	GCG	2	6	134432	134437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670065
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2068	NC_020050	TG	3	6	134510	134515	0 %	50 %	50 %	0 %	436670065
2069	NC_020050	TGC	2	6	134550	134555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2070	NC_020050	TGA	2	6	134566	134571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670065
2071	NC_020050	ATT	2	6	134582	134587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670065
2072	NC_020050	TGC	2	6	134650	134655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2073	NC_020050	ACT	2	6	134669	134674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670065
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2075	NC_020050	CAG	2	6	134765	134770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
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2079	NC_020050	ATT	3	9	134868	134876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670065
2080	NC_020050	TAA	2	6	134944	134949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670065
2081	NC_020050	GTT	2	6	135028	135033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670065
2082	NC_020050	GCTG	2	8	135088	135095	0 %	25 %	50 %	25 %	436670065
2083	NC_020050	GCGATC	2	12	135155	135166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2084	NC_020050	CTTG	2	8	135290	135297	0 %	50 %	25 %	25 %	436670065
2085	NC_020050	TGG	2	6	135342	135347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2086	NC_020050	AAT	2	6	135371	135376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670065
2087	NC_020050	TAGCTG	2	12	135498	135509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436670066
2088	NC_020050	A	7	7	135597	135603	100 %	0 %	0 %	0 %	436670066
2089	NC_020050	GA	3	6	135614	135619	50 %	0 %	50 %	0 %	436670066
2090	NC_020050	TCC	2	6	135625	135630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670066
2091	NC_020050	GGC	2	6	135687	135692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670066
2092	NC_020050	CCT	2	6	135703	135708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670066
2093	NC_020050	TGAC	2	8	135735	135742	25 %	25 %	25 %	25 %	436670066
2094	NC_020050	TTCC	2	8	135746	135753	0 %	50 %	0 %	50 %	436670066
2095	NC_020050	CTC	2	6	135885	135890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670066
2096	NC_020050	TTC	2	6	135918	135923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670066
2097	NC_020050	TA	3	6	136069	136074	50 %	50 %	0 %	0 %	436670066
2098	NC_020050	TCACC	2	10	136093	136102	20 %	20 %	0 %	60 %	436670066
2099	NC_020050	AG	3	6	136121	136126	50 %	0 %	50 %	0 %	436670066
2100	NC_020050	TTA	2	6	136167	136172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670066
2101	NC_020050	CTG	2	6	136203	136208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670066
2102	NC_020050	TTA	2	6	136290	136295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670066
2103	NC_020050	T	7	7	136305	136311	0 %	100 %	0 %	0 %	436670067
2104	NC_020050	CGA	2	6	136318	136323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2105	NC_020050	ATTT	2	8	136346	136353	25 %	75 %	0 %	0 %	436670067
2106	NC_020050	TCG	2	6	136373	136378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2107	NC_020050	CTG	2	6	136400	136405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2108	NC_020050	ATG	2	6	136406	136411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670067
2109	NC_020050	CTG	3	9	136439	136447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670067
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2111	NC_020050	GACT	2	8	136489	136496	25 %	25 %	25 %	25 %	436670067
2112	NC_020050	ATTT	2	8	136523	136530	25 %	75 %	0 %	0 %	436670067
2113	NC_020050	CTG	3	9	136535	136543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2114	NC_020050	GACT	2	8	136555	136562	25 %	25 %	25 %	25 %	436670067
2115	NC_020050	CAC	2	6	136563	136568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670067
2116	NC_020050	CAG	2	6	136607	136612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2117	NC_020050	CAG	2	6	136656	136661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670067
2118	NC_020050	TCAA	2	8	136720	136727	50 %	25 %	0 %	25 %	436670067
2119	NC_020050	TAT	2	6	136808	136813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670067
2120	NC_020050	CAG	2	6	136843	136848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670067
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2122	NC_020050	ACC	2	6	136858	136863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670067
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2243	NC_020050	ATC	2	6	144078	144083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670072
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2365	NC_020050	G	6	6	151500	151505	0 %	0 %	100 %	0 %	436670078
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2373	NC_020050	TACA	2	8	151942	151949	50 %	25 %	0 %	25 %	436670078
2374	NC_020050	AGCCA	2	10	151953	151962	40 %	0 %	20 %	40 %	436670078
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