MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020050	CAGC	2	8	68380	68387	25 %	0 %	25 %	50 %	436670025
1002	NC_020050	TTTG	2	8	68388	68395	0 %	75 %	25 %	0 %	436670025
1003	NC_020050	CT	3	6	68406	68411	0 %	50 %	0 %	50 %	436670025
1004	NC_020050	AGC	2	6	68481	68486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1005	NC_020050	GCCTTA	2	12	68518	68529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436670025
1006	NC_020050	CAA	2	6	68554	68559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670025
1007	NC_020050	TGCT	2	8	68576	68583	0 %	50 %	25 %	25 %	436670025
1008	NC_020050	TGC	2	6	68655	68660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1009	NC_020050	TG	3	6	68680	68685	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
1010	NC_020050	GAT	2	6	68701	68706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1011	NC_020050	A	6	6	68735	68740	100 %	0 %	0 %	0 %	436670025
1012	NC_020050	GAT	2	6	68787	68792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1013	NC_020050	A	6	6	68827	68832	100 %	0 %	0 %	0 %	436670025
1014	NC_020050	ATT	2	6	68915	68920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670025
1015	NC_020050	TG	3	6	68941	68946	0 %	50 %	50 %	0 %	436670025
1016	NC_020050	GTT	2	6	68970	68975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670025
1017	NC_020050	GAA	2	6	69014	69019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1018	NC_020050	CA	3	6	69036	69041	50 %	0 %	0 %	50 %	436670025
1019	NC_020050	CCA	2	6	69186	69191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670025
1020	NC_020050	A	6	6	69301	69306	100 %	0 %	0 %	0 %	436670025
1021	NC_020050	TTAC	2	8	69327	69334	25 %	50 %	0 %	25 %	436670025
1022	NC_020050	ACC	2	6	69354	69359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670025
1023	NC_020050	GGAAA	2	10	69387	69396	60 %	0 %	40 %	0 %	436670025
1024	NC_020050	TGA	2	6	69417	69422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1025	NC_020050	GAT	2	6	69463	69468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1026	NC_020050	TTA	2	6	69476	69481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670025
1027	NC_020050	GCA	2	6	69493	69498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1028	NC_020050	CAG	2	6	69508	69513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1029	NC_020050	CAA	2	6	69541	69546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670025
1030	NC_020050	TGA	2	6	69549	69554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1031	NC_020050	ACTG	2	8	69750	69757	25 %	25 %	25 %	25 %	436670025
1032	NC_020050	AAT	2	6	69766	69771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670025
1033	NC_020050	AGA	2	6	69789	69794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1034	NC_020050	CTC	2	6	69855	69860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670025
1035	NC_020050	AATG	2	8	69910	69917	50 %	25 %	25 %	0 %	436670025
1036	NC_020050	TCC	2	6	69958	69963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670025
1037	NC_020050	GGT	2	6	70084	70089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670025
1038	NC_020050	AATT	2	8	70145	70152	50 %	50 %	0 %	0 %	436670025
1039	NC_020050	GAA	2	6	70309	70314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1040	NC_020050	CTG	2	6	70379	70384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1041	NC_020050	GTT	2	6	70387	70392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670025
1042	NC_020050	AGA	2	6	70414	70419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1043	NC_020050	T	6	6	70506	70511	0 %	100 %	0 %	0 %	436670025
1044	NC_020050	TAT	2	6	70538	70543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670025
1045	NC_020050	TGC	2	6	70575	70580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670025
1046	NC_020050	T	6	6	70598	70603	0 %	100 %	0 %	0 %	436670025
1047	NC_020050	TTA	2	6	70605	70610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670025
1048	NC_020050	GAT	2	6	70654	70659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1049	NC_020050	ATT	2	6	70720	70725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670025
1050	NC_020050	GAA	2	6	70726	70731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1051	NC_020050	ACT	2	6	70749	70754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670025
1052	NC_020050	CAA	3	9	70990	70998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670025
1053	NC_020050	AGG	2	6	71043	71048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670025
1054	NC_020050	CATT	2	8	71050	71057	25 %	50 %	0 %	25 %	436670025
1055	NC_020050	GAA	2	6	71128	71133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670025
1056	NC_020050	TAG	2	6	71159	71164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670025
1057	NC_020050	A	6	6	71167	71172	100 %	0 %	0 %	0 %	436670025
1058	NC_020050	AAC	2	6	71178	71183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670025
1059	NC_020050	ACA	2	6	71190	71195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670025
1060	NC_020050	GAG	2	6	71227	71232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670025
1061	NC_020050	CTT	2	6	72960	72965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670026
1062	NC_020050	GTT	2	6	72987	72992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670026
1063	NC_020050	AAT	2	6	73003	73008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670026
1064	NC_020050	TCA	2	6	73041	73046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670026
1065	NC_020050	AGC	2	6	73055	73060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1066	NC_020050	AG	3	6	73065	73070	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
1067	NC_020050	GTG	2	6	73090	73095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
1068	NC_020050	CAG	2	6	73105	73110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1069	NC_020050	CCAA	2	8	73139	73146	50 %	0 %	0 %	50 %	436670026
1070	NC_020050	TGG	2	6	73223	73228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
1071	NC_020050	GGT	2	6	73255	73260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
1072	NC_020050	ACTC	2	8	73342	73349	25 %	25 %	0 %	50 %	436670026
1073	NC_020050	GTT	2	6	73353	73358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670026
1074	NC_020050	GTTT	2	8	73390	73397	0 %	75 %	25 %	0 %	436670026
1075	NC_020050	CCA	2	6	73527	73532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670026
1076	NC_020050	A	6	6	73601	73606	100 %	0 %	0 %	0 %	436670026
1077	NC_020050	ACG	2	6	73741	73746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1078	NC_020050	CCAT	2	8	73759	73766	25 %	25 %	0 %	50 %	436670026
1079	NC_020050	CTT	2	6	73866	73871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670026
1080	NC_020050	AGC	2	6	73917	73922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1081	NC_020050	AACT	2	8	74108	74115	50 %	25 %	0 %	25 %	436670026
1082	NC_020050	CAA	2	6	74308	74313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670026
1083	NC_020050	TAG	2	6	74357	74362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670026
1084	NC_020050	AT	3	6	74364	74369	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
1085	NC_020050	CAC	2	6	74391	74396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670026
1086	NC_020050	AT	3	6	74436	74441	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
1087	NC_020050	CAC	2	6	74558	74563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670026
1088	NC_020050	GAA	2	6	74575	74580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670026
1089	NC_020050	ATA	2	6	74581	74586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670026
1090	NC_020050	CTT	2	6	74640	74645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670026
1091	NC_020050	AATT	2	8	74678	74685	50 %	50 %	0 %	0 %	436670026
1092	NC_020050	T	6	6	74732	74737	0 %	100 %	0 %	0 %	436670026
1093	NC_020050	GAA	2	6	74836	74841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670026
1094	NC_020050	TCAA	2	8	74879	74886	50 %	25 %	0 %	25 %	436670026
1095	NC_020050	AGA	2	6	74889	74894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670026
1096	NC_020050	ACA	2	6	74909	74914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670026
1097	NC_020050	CAA	2	6	74962	74967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670026
1098	NC_020050	CGC	2	6	74986	74991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670026
1099	NC_020050	TAC	2	6	74999	75004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670026
1100	NC_020050	CCA	2	6	75059	75064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670026
1101	NC_020050	GGT	2	6	75075	75080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
1102	NC_020050	CAA	2	6	75127	75132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670026
1103	NC_020050	TAT	2	6	75221	75226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670026
1104	NC_020050	CAC	2	6	75238	75243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670026
1105	NC_020050	TGGT	2	8	75255	75262	0 %	50 %	50 %	0 %	436670026
1106	NC_020050	ATTC	2	8	75273	75280	25 %	50 %	0 %	25 %	436670026
1107	NC_020050	ATC	2	6	75321	75326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670026
1108	NC_020050	ATG	2	6	75437	75442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670026
1109	NC_020050	CAATTA	2	12	75451	75462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436670026
1110	NC_020050	TAC	2	6	75504	75509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670026
1111	NC_020050	ACTGA	2	10	75529	75538	40 %	20 %	20 %	20 %	436670026
1112	NC_020050	TTAT	2	8	75580	75587	25 %	75 %	0 %	0 %	436670026
1113	NC_020050	CTG	2	6	75592	75597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1114	NC_020050	GTG	2	6	75629	75634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
1115	NC_020050	T	6	6	75703	75708	0 %	100 %	0 %	0 %	436670026
1116	NC_020050	GAATTA	2	12	75916	75927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436670026
1117	NC_020050	GCA	2	6	76055	76060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1118	NC_020050	CTT	2	6	76143	76148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670026
1119	NC_020050	GTT	2	6	76170	76175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670026
1120	NC_020050	AAT	2	6	76186	76191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670026
1121	NC_020050	TCA	2	6	76224	76229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670026
1122	NC_020050	AGC	2	6	76238	76243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1123	NC_020050	AG	3	6	76248	76253	50 %	0 %	50 %	0 %	436670026
1124	NC_020050	GTG	2	6	76273	76278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670026
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