MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020050	CAA	2	6	37392	37397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
502	NC_020050	ATC	2	6	37471	37476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
503	NC_020050	CAA	2	6	37500	37505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
504	NC_020050	ATTTT	2	10	37522	37531	20 %	80 %	0 %	0 %	436670010
505	NC_020050	AGTA	2	8	37613	37620	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
506	NC_020050	AAAG	2	8	37628	37635	75 %	0 %	25 %	0 %	436670010
507	NC_020050	T	6	6	37657	37662	0 %	100 %	0 %	0 %	436670010
508	NC_020050	AATG	2	8	37676	37683	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
509	NC_020050	AGT	2	6	37706	37711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670010
510	NC_020050	TCT	2	6	37749	37754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670010
511	NC_020050	AAT	2	6	37812	37817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670010
512	NC_020050	CTA	2	6	37838	37843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
513	NC_020050	TCT	2	6	37854	37859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670010
514	NC_020050	CAA	2	6	37883	37888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
515	NC_020050	CAG	2	6	37927	37932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670010
516	NC_020050	AAT	3	9	37962	37970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670010
517	NC_020050	TGT	2	6	38018	38023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670010
518	NC_020050	GAA	2	6	38058	38063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
519	NC_020050	ATTT	2	8	38105	38112	25 %	75 %	0 %	0 %	436670010
520	NC_020050	TTG	2	6	38128	38133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670010
521	NC_020050	ATT	2	6	38154	38159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670010
522	NC_020050	ACT	2	6	38173	38178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
523	NC_020050	GAA	2	6	38193	38198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
524	NC_020050	AGA	2	6	38273	38278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
525	NC_020050	AATT	2	8	38329	38336	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
526	NC_020050	AAG	2	6	38345	38350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
527	NC_020050	CAT	2	6	38359	38364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
528	NC_020050	AT	3	6	38384	38389	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
529	NC_020050	ACA	2	6	38421	38426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
530	NC_020050	AAG	2	6	38482	38487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
531	NC_020050	A	6	6	38548	38553	100 %	0 %	0 %	0 %	436670010
532	NC_020050	GGAA	2	8	38563	38570	50 %	0 %	50 %	0 %	436670010
533	NC_020050	CTG	2	6	38596	38601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670010
534	NC_020050	TCAA	2	8	38659	38666	50 %	25 %	0 %	25 %	436670010
535	NC_020050	CAG	2	6	38743	38748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670010
536	NC_020050	CAA	2	6	38754	38759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
537	NC_020050	CTA	2	6	38760	38765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
538	NC_020050	GAA	2	6	38835	38840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
539	NC_020050	CTC	2	6	39013	39018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670010
540	NC_020050	TTGTC	2	10	39060	39069	0 %	60 %	20 %	20 %	436670010
541	NC_020050	A	7	7	39207	39213	100 %	0 %	0 %	0 %	436670010
542	NC_020050	A	6	6	39238	39243	100 %	0 %	0 %	0 %	436670010
543	NC_020050	ATGT	2	8	39264	39271	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
544	NC_020050	AGG	2	6	39287	39292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670010
545	NC_020050	CAAG	2	8	39333	39340	50 %	0 %	25 %	25 %	436670010
546	NC_020050	TGT	2	6	39343	39348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670010
547	NC_020050	GAA	2	6	39355	39360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
548	NC_020050	ACC	2	6	39368	39373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670010
549	NC_020050	AATG	2	8	39378	39385	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
550	NC_020050	AGG	2	6	39455	39460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670010
551	NC_020050	TG	3	6	39485	39490	0 %	50 %	50 %	0 %	436670010
552	NC_020050	AGA	2	6	39599	39604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
553	NC_020050	AATT	2	8	39667	39674	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
554	NC_020050	CAT	3	9	39703	39711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
555	NC_020050	T	7	7	39722	39728	0 %	100 %	0 %	0 %	436670010
556	NC_020050	TGG	2	6	39739	39744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670010
557	NC_020050	TGC	3	9	39752	39760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670010
558	NC_020050	CAA	2	6	39918	39923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
559	NC_020050	GTTAT	2	10	39947	39956	20 %	60 %	20 %	0 %	436670010
560	NC_020050	TCT	2	6	39957	39962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670010
561	NC_020050	TGGAT	2	10	39972	39981	20 %	40 %	40 %	0 %	436670010
562	NC_020050	AT	3	6	39998	40003	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
563	NC_020050	TAG	2	6	40045	40050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670010
564	NC_020050	TGT	2	6	40055	40060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670010
565	NC_020050	TCTA	2	8	40094	40101	25 %	50 %	0 %	25 %	436670010
566	NC_020050	TGT	2	6	40175	40180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670010
567	NC_020050	TGAT	2	8	40216	40223	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
568	NC_020050	TGG	2	6	40234	40239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670010
569	NC_020050	TCT	2	6	40257	40262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670010
570	NC_020050	CCAAC	2	10	40280	40289	40 %	0 %	0 %	60 %	436670010
571	NC_020050	GAA	2	6	40322	40327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
572	NC_020050	TGG	2	6	40376	40381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670010
573	NC_020050	CAC	2	6	40407	40412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670010
574	NC_020050	CTA	2	6	40468	40473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670010
575	NC_020050	AAT	2	6	40518	40523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670010
576	NC_020050	CAA	2	6	40527	40532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670010
577	NC_020050	AAT	2	6	40533	40538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670010
578	NC_020050	CGT	2	6	40560	40565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670010
579	NC_020050	AGA	2	6	40593	40598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670010
580	NC_020050	TG	3	6	40626	40631	0 %	50 %	50 %	0 %	436670011
581	NC_020050	A	8	8	40688	40695	100 %	0 %	0 %	0 %	436670011
582	NC_020050	TAT	2	6	40744	40749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670011
583	NC_020050	TGA	2	6	40786	40791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670011
584	NC_020050	ATTT	2	8	40875	40882	25 %	75 %	0 %	0 %	436670011
585	NC_020050	ATC	2	6	40884	40889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
586	NC_020050	CTT	2	6	40945	40950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670011
587	NC_020050	AGC	2	6	40969	40974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670011
588	NC_020050	TAT	2	6	40975	40980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670011
589	NC_020050	GTTT	2	8	40995	41002	0 %	75 %	25 %	0 %	436670011
590	NC_020050	GAAT	2	8	41088	41095	50 %	25 %	25 %	0 %	436670011
591	NC_020050	TTC	2	6	41127	41132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670011
592	NC_020050	TAG	2	6	41286	41291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670011
593	NC_020050	AAG	2	6	41394	41399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670011
594	NC_020050	A	6	6	41441	41446	100 %	0 %	0 %	0 %	436670011
595	NC_020050	GGT	2	6	41462	41467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670011
596	NC_020050	GTT	3	9	41480	41488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670011
597	NC_020050	TAA	2	6	41557	41562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670011
598	NC_020050	CAA	2	6	41571	41576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670011
599	NC_020050	GGAACT	2	12	41684	41695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436670011
600	NC_020050	T	6	6	41695	41700	0 %	100 %	0 %	0 %	436670011
601	NC_020050	A	8	8	41754	41761	100 %	0 %	0 %	0 %	436670011
602	NC_020050	CAG	3	9	41811	41819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670011
603	NC_020050	ATTA	2	8	41830	41837	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
604	NC_020050	CTA	2	6	41874	41879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
605	NC_020050	AATCCC	2	12	41891	41902	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	436670011
606	NC_020050	GGA	2	6	42005	42010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670011
607	NC_020050	ATT	2	6	42023	42028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670011
608	NC_020050	GAA	2	6	42032	42037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670011
609	NC_020050	AAT	2	6	42053	42058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670011
610	NC_020050	CTA	2	6	42086	42091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
611	NC_020050	ACT	2	6	42155	42160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
612	NC_020050	GAAA	2	8	42163	42170	75 %	0 %	25 %	0 %	436670011
613	NC_020050	ATC	2	6	42222	42227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
614	NC_020050	CTA	2	6	42249	42254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
615	NC_020050	T	6	6	42352	42357	0 %	100 %	0 %	0 %	436670011
616	NC_020050	TTA	2	6	42479	42484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670011
617	NC_020050	TA	3	6	42490	42495	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
618	NC_020050	AAC	2	6	42502	42507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670011
619	NC_020050	GCA	2	6	42650	42655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670011
620	NC_020050	AGA	2	6	42679	42684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670011
621	NC_020050	ATTG	2	8	42694	42701	25 %	50 %	25 %	0 %	436670011
622	NC_020050	ATA	2	6	42804	42809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670011
623	NC_020050	GCA	2	6	42818	42823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670011
624	NC_020050	GA	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	436670011
625	NC_020050	AAG	2	6	42861	42866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670011
626	NC_020050	TAA	2	6	42876	42881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670011
627	NC_020050	TAC	2	6	43001	43006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
628	NC_020050	AGT	2	6	43052	43057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670011
629	NC_020050	AGT	2	6	43115	43120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670011
630	NC_020050	AGC	2	6	43134	43139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670011
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642	NC_020050	GAA	2	6	44315	44320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670011
643	NC_020050	ATC	2	6	44455	44460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670011
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