MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 6384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020050	AAC	2	6	359115	359120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670217
5502	NC_020050	CCT	2	6	359299	359304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670217
5503	NC_020050	ACG	2	6	359312	359317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5504	NC_020050	TCA	2	6	359382	359387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670217
5505	NC_020050	ATT	2	6	359399	359404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670217
5506	NC_020050	A	6	6	359483	359488	100 %	0 %	0 %	0 %	436670217
5507	NC_020050	ATC	2	6	359492	359497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670217
5508	NC_020050	ACG	2	6	359501	359506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5509	NC_020050	CAA	2	6	359588	359593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670217
5510	NC_020050	CCG	2	6	359606	359611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670217
5511	NC_020050	CAGC	2	8	359640	359647	25 %	0 %	25 %	50 %	436670217
5512	NC_020050	ATC	2	6	359663	359668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670217
5513	NC_020050	AGC	2	6	359795	359800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5514	NC_020050	AG	3	6	359810	359815	50 %	0 %	50 %	0 %	436670217
5515	NC_020050	TGG	2	6	359831	359836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670217
5516	NC_020050	T	6	6	359920	359925	0 %	100 %	0 %	0 %	436670217
5517	NC_020050	AGCA	2	8	360011	360018	50 %	0 %	25 %	25 %	436670217
5518	NC_020050	GCT	2	6	360040	360045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5519	NC_020050	T	6	6	360136	360141	0 %	100 %	0 %	0 %	436670217
5520	NC_020050	TGT	2	6	360143	360148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670217
5521	NC_020050	GCA	2	6	360223	360228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5522	NC_020050	CTG	2	6	360314	360319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5523	NC_020050	CAGCTG	2	12	360326	360337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5524	NC_020050	CTG	2	6	360341	360346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670217
5525	NC_020050	AG	3	6	360451	360456	50 %	0 %	50 %	0 %	436670217
5526	NC_020050	TGA	2	6	360459	360464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670217
5527	NC_020050	TAAA	2	8	360539	360546	75 %	25 %	0 %	0 %	436670217
5528	NC_020050	TCC	2	6	360561	360566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670217
5529	NC_020050	AGA	2	6	360567	360572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670217
5530	NC_020050	AAT	2	6	360578	360583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670217
5531	NC_020050	CTC	2	6	360695	360700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670217
5532	NC_020050	TGT	2	6	360717	360722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670217
5533	NC_020050	TCA	2	6	360802	360807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670217
5534	NC_020050	CAA	2	6	360908	360913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670218
5535	NC_020050	ATC	2	6	360920	360925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670218
5536	NC_020050	AAG	2	6	360952	360957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670218
5537	NC_020050	CAC	2	6	360970	360975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670218
5538	NC_020050	CAA	2	6	360982	360987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670218
5539	NC_020050	CAG	2	6	361117	361122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5540	NC_020050	CAG	2	6	361138	361143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5541	NC_020050	ATT	2	6	361145	361150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670218
5542	NC_020050	GAC	2	6	361213	361218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5543	NC_020050	T	6	6	361246	361251	0 %	100 %	0 %	0 %	436670218
5544	NC_020050	GATG	2	8	361298	361305	25 %	25 %	50 %	0 %	436670218
5545	NC_020050	CAC	2	6	361336	361341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670218
5546	NC_020050	AAC	2	6	361380	361385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670218
5547	NC_020050	TTG	2	6	361391	361396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670218
5548	NC_020050	CGT	2	6	361488	361493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5549	NC_020050	T	6	6	361566	361571	0 %	100 %	0 %	0 %	436670218
5550	NC_020050	A	6	6	361604	361609	100 %	0 %	0 %	0 %	436670218
5551	NC_020050	G	6	6	361618	361623	0 %	0 %	100 %	0 %	436670218
5552	NC_020050	GTT	2	6	361651	361656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670218
5553	NC_020050	CGA	2	6	361708	361713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5554	NC_020050	AT	3	6	361728	361733	50 %	50 %	0 %	0 %	436670218
5555	NC_020050	CTT	2	6	361825	361830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670218
5556	NC_020050	CTA	2	6	361894	361899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670218
5557	NC_020050	TCT	2	6	361929	361934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670218
5558	NC_020050	CTA	2	6	362026	362031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670218
5559	NC_020050	TTC	2	6	362090	362095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670218
5560	NC_020050	GAT	3	9	362098	362106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670218
5561	NC_020050	TTC	2	6	362123	362128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670218
5562	NC_020050	T	6	6	362208	362213	0 %	100 %	0 %	0 %	436670218
5563	NC_020050	TGG	2	6	362222	362227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670218
5564	NC_020050	GTG	2	6	362239	362244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670218
5565	NC_020050	ATG	2	6	362245	362250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670218
5566	NC_020050	GATT	2	8	362266	362273	25 %	50 %	25 %	0 %	436670218
5567	NC_020050	T	6	6	362272	362277	0 %	100 %	0 %	0 %	436670218
5568	NC_020050	TAA	2	6	362279	362284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670218
5569	NC_020050	TGT	2	6	362325	362330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670218
5570	NC_020050	TGC	2	6	362337	362342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670218
5571	NC_020050	TCC	2	6	362349	362354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670218
5572	NC_020050	T	6	6	362360	362365	0 %	100 %	0 %	0 %	436670218
5573	NC_020050	TCT	2	6	362391	362396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670218
5574	NC_020050	TGA	2	6	362793	362798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670219
5575	NC_020050	A	6	6	362798	362803	100 %	0 %	0 %	0 %	436670219
5576	NC_020050	CGA	2	6	362841	362846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670219
5577	NC_020050	AAT	2	6	362882	362887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670219
5578	NC_020050	CAAGCA	2	12	362894	362905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436670219
5579	NC_020050	ACA	2	6	362911	362916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670219
5580	NC_020050	TAA	2	6	362956	362961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670219
5581	NC_020050	AAT	2	6	362972	362977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670219
5582	NC_020050	CAA	2	6	362984	362989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670219
5583	NC_020050	ATT	2	6	362992	362997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670219
5584	NC_020050	AGAA	2	8	363006	363013	75 %	0 %	25 %	0 %	436670219
5585	NC_020050	ACA	2	6	363137	363142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670219
5586	NC_020050	CTG	2	6	363162	363167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670219
5587	NC_020050	TTG	2	6	363198	363203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670219
5588	NC_020050	AAATT	2	10	363264	363273	60 %	40 %	0 %	0 %	436670219
5589	NC_020050	TAA	2	6	363322	363327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670219
5590	NC_020050	AAG	2	6	363423	363428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670219
5591	NC_020050	CTG	2	6	363438	363443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670219
5592	NC_020050	AAC	2	6	363466	363471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670219
5593	NC_020050	TAA	2	6	363859	363864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670220
5594	NC_020050	CAC	2	6	363951	363956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670220
5595	NC_020050	AAG	2	6	363960	363965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670220
5596	NC_020050	GGTC	2	8	364054	364061	0 %	25 %	50 %	25 %	436670220
5597	NC_020050	TGC	2	6	364093	364098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670220
5598	NC_020050	GGT	2	6	364115	364120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670220
5599	NC_020050	ACG	2	6	364252	364257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670221
5600	NC_020050	CCA	2	6	364267	364272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670221
5601	NC_020050	ACA	2	6	364337	364342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670221
5602	NC_020050	CAC	2	6	364389	364394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670221
5603	NC_020050	CCT	2	6	364466	364471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670221
5604	NC_020050	T	7	7	364595	364601	0 %	100 %	0 %	0 %	436670221
5605	NC_020050	AAT	2	6	364627	364632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670221
5606	NC_020050	GCA	2	6	364634	364639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670221
5607	NC_020050	TCT	2	6	364646	364651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670221
5608	NC_020050	T	6	6	364651	364656	0 %	100 %	0 %	0 %	436670221
5609	NC_020050	AGT	2	6	364734	364739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670221
5610	NC_020050	GGT	2	6	364757	364762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670221
5611	NC_020050	TGA	2	6	364821	364826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670221
5612	NC_020050	CGA	2	6	364850	364855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670221
5613	NC_020050	CAT	2	6	364905	364910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670221
5614	NC_020050	TGT	2	6	365158	365163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670222
5615	NC_020050	CAA	2	6	365220	365225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670222
5616	NC_020050	GTT	2	6	365390	365395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670222
5617	NC_020050	T	6	6	365469	365474	0 %	100 %	0 %	0 %	436670222
5618	NC_020050	AAT	2	6	365541	365546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670222
5619	NC_020050	AAG	2	6	365617	365622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670222
5620	NC_020050	GAG	2	6	365663	365668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670222
5621	NC_020050	AGA	2	6	365675	365680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670222
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5743	NC_020050	TCG	2	6	377153	377158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670228
5744	NC_020050	TGA	2	6	377165	377170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670228
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