MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 19141

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_019815	TAT	2	6	816266	816271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463247
19002	NC_019815	GCA	2	6	816298	816303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429463247
19003	NC_019815	ATAA	2	8	816349	816356	75 %	25 %	0 %	0 %	429463247
19004	NC_019815	TAG	2	6	816428	816433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463247
19005	NC_019815	AT	3	6	816494	816499	50 %	50 %	0 %	0 %	429463247
19006	NC_019815	ATGA	2	8	816543	816550	50 %	25 %	25 %	0 %	429463248
19007	NC_019815	ATT	2	6	816587	816592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463248
19008	NC_019815	GTG	2	6	816634	816639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429463248
19009	NC_019815	TTC	2	6	816647	816652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463248
19010	NC_019815	A	6	6	816672	816677	100 %	0 %	0 %	0 %	429463248
19011	NC_019815	GTT	2	6	816707	816712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463248
19012	NC_019815	CTG	2	6	816739	816744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463248
19013	NC_019815	AT	3	6	816795	816800	50 %	50 %	0 %	0 %	429463248
19014	NC_019815	A	9	9	816802	816810	100 %	0 %	0 %	0 %	429463248
19015	NC_019815	AGA	2	6	816829	816834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429463248
19016	NC_019815	GCT	2	6	816849	816854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463248
19017	NC_019815	CAT	2	6	816906	816911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463248
19018	NC_019815	T	7	7	816913	816919	0 %	100 %	0 %	0 %	429463248
19019	NC_019815	TAT	2	6	816952	816957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463248
19020	NC_019815	A	7	7	817002	817008	100 %	0 %	0 %	0 %	429463248
19021	NC_019815	TAA	2	6	817019	817024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463248
19022	NC_019815	T	6	6	817027	817032	0 %	100 %	0 %	0 %	429463248
19023	NC_019815	TAGATA	2	12	817048	817059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463248
19024	NC_019815	AAT	2	6	817062	817067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463248
19025	NC_019815	CTA	2	6	817126	817131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463248
19026	NC_019815	TAA	2	6	817159	817164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463248
19027	NC_019815	GATA	2	8	817188	817195	50 %	25 %	25 %	0 %	429463248
19028	NC_019815	A	7	7	817209	817215	100 %	0 %	0 %	0 %	429463248
19029	NC_019815	GA	3	6	817241	817246	50 %	0 %	50 %	0 %	429463248
19030	NC_019815	ATT	2	6	817257	817262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463248
19031	NC_019815	T	6	6	817267	817272	0 %	100 %	0 %	0 %	429463248
19032	NC_019815	TGATAA	2	12	817301	817312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463248
19033	NC_019815	ATA	2	6	817396	817401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463248
19034	NC_019815	AAC	2	6	817441	817446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463248
19035	NC_019815	TCA	2	6	817490	817495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463248
19036	NC_019815	TA	4	8	817531	817538	50 %	50 %	0 %	0 %	429463248
19037	NC_019815	ATAA	2	8	817540	817547	75 %	25 %	0 %	0 %	429463248
19038	NC_019815	TTG	2	6	817791	817796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463249
19039	NC_019815	AGC	2	6	817850	817855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429463249
19040	NC_019815	ATTGC	2	10	817890	817899	20 %	40 %	20 %	20 %	429463249
19041	NC_019815	AGCAA	2	10	817968	817977	60 %	0 %	20 %	20 %	429463249
19042	NC_019815	TTCT	2	8	818005	818012	0 %	75 %	0 %	25 %	429463249
19043	NC_019815	ATA	2	6	818071	818076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463249
19044	NC_019815	GGA	2	6	818094	818099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429463249
19045	NC_019815	TGC	2	6	818123	818128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463249
19046	NC_019815	TGA	2	6	818141	818146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463249
19047	NC_019815	AT	3	6	818154	818159	50 %	50 %	0 %	0 %	429463249
19048	NC_019815	TA	3	6	818176	818181	50 %	50 %	0 %	0 %	429463249
19049	NC_019815	GTT	2	6	818196	818201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463249
19050	NC_019815	GAA	2	6	818235	818240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429463249
19051	NC_019815	TCA	2	6	818331	818336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463249
19052	NC_019815	GAA	2	6	818364	818369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429463249
19053	NC_019815	TAA	2	6	818386	818391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463249
19054	NC_019815	ATA	2	6	818407	818412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463249
19055	NC_019815	GCT	2	6	818418	818423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463249
19056	NC_019815	TAG	2	6	818444	818449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463249
19057	NC_019815	TGC	2	6	818522	818527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463249
19058	NC_019815	AATC	2	8	818559	818566	50 %	25 %	0 %	25 %	429463249
19059	NC_019815	ATG	2	6	818641	818646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463249
19060	NC_019815	CTG	2	6	818653	818658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463249
19061	NC_019815	GCAA	2	8	818660	818667	50 %	0 %	25 %	25 %	429463249
19062	NC_019815	GA	3	6	818668	818673	50 %	0 %	50 %	0 %	429463249
19063	NC_019815	AATA	2	8	818777	818784	75 %	25 %	0 %	0 %	429463249
19064	NC_019815	AT	3	6	818837	818842	50 %	50 %	0 %	0 %	429463249
19065	NC_019815	GTATA	2	10	818907	818916	40 %	40 %	20 %	0 %	429463249
19066	NC_019815	ATC	3	9	819442	819450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463250
19067	NC_019815	CTT	3	9	819483	819491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463250
19068	NC_019815	T	8	8	819499	819506	0 %	100 %	0 %	0 %	429463250
19069	NC_019815	AT	3	6	819516	819521	50 %	50 %	0 %	0 %	429463250
19070	NC_019815	T	6	6	819537	819542	0 %	100 %	0 %	0 %	429463250
19071	NC_019815	CTT	2	6	819570	819575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463250
19072	NC_019815	TTTA	2	8	819604	819611	25 %	75 %	0 %	0 %	429463250
19073	NC_019815	TTG	2	6	819643	819648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463250
19074	NC_019815	AT	3	6	819657	819662	50 %	50 %	0 %	0 %	429463250
19075	NC_019815	ATT	2	6	819670	819675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463250
19076	NC_019815	GT	4	8	819677	819684	0 %	50 %	50 %	0 %	429463250
19077	NC_019815	T	6	6	819684	819689	0 %	100 %	0 %	0 %	429463250
19078	NC_019815	TGC	2	6	819696	819701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463250
19079	NC_019815	T	8	8	819708	819715	0 %	100 %	0 %	0 %	429463250
19080	NC_019815	TA	3	6	819718	819723	50 %	50 %	0 %	0 %	429463250
19081	NC_019815	ATA	2	6	819732	819737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463250
19082	NC_019815	TGA	3	9	819751	819759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463250
19083	NC_019815	TTC	2	6	819796	819801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463250
19084	NC_019815	TAT	2	6	820104	820109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463251
19085	NC_019815	CT	3	6	820110	820115	0 %	50 %	0 %	50 %	429463251
19086	NC_019815	TAC	2	6	820116	820121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463251
19087	NC_019815	TTA	2	6	820153	820158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463251
19088	NC_019815	A	6	6	820160	820165	100 %	0 %	0 %	0 %	429463251
19089	NC_019815	ATC	2	6	820182	820187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463251
19090	NC_019815	AT	3	6	820192	820197	50 %	50 %	0 %	0 %	429463251
19091	NC_019815	ATAC	2	8	820259	820266	50 %	25 %	0 %	25 %	429463251
19092	NC_019815	GTA	2	6	820278	820283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463251
19093	NC_019815	AC	4	8	820289	820296	50 %	0 %	0 %	50 %	429463251
19094	NC_019815	T	8	8	820299	820306	0 %	100 %	0 %	0 %	429463251
19095	NC_019815	TCA	2	6	820330	820335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463251
19096	NC_019815	TA	3	6	820340	820345	50 %	50 %	0 %	0 %	429463251
19097	NC_019815	AAC	2	6	820392	820397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463251
19098	NC_019815	ATC	2	6	820459	820464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463251
19099	NC_019815	ACA	2	6	820465	820470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463251
19100	NC_019815	T	6	6	820631	820636	0 %	100 %	0 %	0 %	429463252
19101	NC_019815	TAA	2	6	820658	820663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463252
19102	NC_019815	TTG	2	6	820682	820687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463252
19103	NC_019815	AT	3	6	820802	820807	50 %	50 %	0 %	0 %	429463252
19104	NC_019815	T	6	6	820811	820816	0 %	100 %	0 %	0 %	429463252
19105	NC_019815	G	6	6	820827	820832	0 %	0 %	100 %	0 %	429463252
19106	NC_019815	CAA	2	6	820848	820853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463252
19107	NC_019815	TCT	2	6	820878	820883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463252
19108	NC_019815	AT	4	8	820889	820896	50 %	50 %	0 %	0 %	429463252
19109	NC_019815	GACCA	2	10	820912	820921	40 %	0 %	20 %	40 %	429463252
19110	NC_019815	TCT	2	6	820941	820946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429463252
19111	NC_019815	AAG	2	6	820976	820981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429463252
19112	NC_019815	TTA	2	6	821037	821042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19113	NC_019815	AAC	2	6	821087	821092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463252
19114	NC_019815	TTTA	2	8	821099	821106	25 %	75 %	0 %	0 %	429463252
19115	NC_019815	TAT	2	6	821123	821128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19116	NC_019815	TAT	2	6	821146	821151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19117	NC_019815	A	7	7	821167	821173	100 %	0 %	0 %	0 %	429463252
19118	NC_019815	T	6	6	821185	821190	0 %	100 %	0 %	0 %	429463252
19119	NC_019815	TAA	2	6	821192	821197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429463252
19120	NC_019815	A	6	6	821225	821230	100 %	0 %	0 %	0 %	429463252
19121	NC_019815	TTTC	2	8	821262	821269	0 %	75 %	0 %	25 %	429463252
19122	NC_019815	ATTAG	2	10	821274	821283	40 %	40 %	20 %	0 %	429463252
19123	NC_019815	TCC	2	6	821297	821302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429463252
19124	NC_019815	TAT	2	6	821308	821313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19125	NC_019815	GAA	2	6	821324	821329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429463252
19126	NC_019815	A	8	8	821328	821335	100 %	0 %	0 %	0 %	429463252
19127	NC_019815	T	6	6	821346	821351	0 %	100 %	0 %	0 %	429463252
19128	NC_019815	CAA	2	6	821421	821426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463252
19129	NC_019815	AT	3	6	821428	821433	50 %	50 %	0 %	0 %	429463252
19130	NC_019815	T	6	6	821443	821448	0 %	100 %	0 %	0 %	429463252
19131	NC_019815	GTAT	2	8	821449	821456	25 %	50 %	25 %	0 %	429463252
19132	NC_019815	TAAT	2	8	821488	821495	50 %	50 %	0 %	0 %	429463252
19133	NC_019815	CTG	2	6	821497	821502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429463252
19134	NC_019815	CAT	2	6	821518	821523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463252
19135	NC_019815	TAT	2	6	821548	821553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19136	NC_019815	ATT	2	6	821556	821561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19137	NC_019815	TTAGAA	2	12	821568	821579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463252
19138	NC_019815	TGA	2	6	821597	821602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463252
19139	NC_019815	GTT	2	6	821607	821612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429463252
19140	NC_019815	ATT	2	6	821648	821653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463252
19141	NC_019815	A	6	6	821716	821721	100 %	0 %	0 %	0 %	429463252

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.