MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 35376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_019791	AT	3	6	246982	246987	50 %	50 %	0 %	0 %	429216469
5503	NC_019791	TTA	2	6	246993	246998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216469
5504	NC_019791	TAT	2	6	247036	247041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216469
5505	NC_019791	CTCC	2	8	247097	247104	0 %	25 %	0 %	75 %	429216469
5506	NC_019791	TCA	2	6	247127	247132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216469
5507	NC_019791	TA	4	8	247176	247183	50 %	50 %	0 %	0 %	429216469
5508	NC_019791	ATG	2	6	247257	247262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216469
5509	NC_019791	T	6	6	247291	247296	0 %	100 %	0 %	0 %	429216469
5510	NC_019791	GTT	2	6	247305	247310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216469
5511	NC_019791	CTT	2	6	247416	247421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216469
5512	NC_019791	T	6	6	247433	247438	0 %	100 %	0 %	0 %	429216469
5513	NC_019791	CTA	2	6	247449	247454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216469
5514	NC_019791	TTC	2	6	247465	247470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216469
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5516	NC_019791	T	6	6	247482	247487	0 %	100 %	0 %	0 %	429216469
5517	NC_019791	TCT	2	6	247493	247498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216469
5518	NC_019791	CTT	2	6	247569	247574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216469
5519	NC_019791	CCT	2	6	247581	247586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216469
5520	NC_019791	ATG	2	6	247599	247604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216469
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5522	NC_019791	TAT	2	6	247615	247620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216469
5523	NC_019791	TAT	2	6	247653	247658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216469
5524	NC_019791	AAACC	2	10	247745	247754	60 %	0 %	0 %	40 %	429216469
5525	NC_019791	AGG	2	6	247789	247794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216469
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5530	NC_019791	GCT	2	6	248105	248110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216469
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5532	NC_019791	G	6	6	248199	248204	0 %	0 %	100 %	0 %	429216469
5533	NC_019791	GCA	3	9	248255	248263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216469
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5535	NC_019791	TAA	2	6	248531	248536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216470
5536	NC_019791	TTA	2	6	248555	248560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216470
5537	NC_019791	TAAA	2	8	248564	248571	75 %	25 %	0 %	0 %	429216470
5538	NC_019791	AATGA	2	10	248578	248587	60 %	20 %	20 %	0 %	429216470
5539	NC_019791	A	6	6	248587	248592	100 %	0 %	0 %	0 %	429216470
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5543	NC_019791	AAT	2	6	248698	248703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216470
5544	NC_019791	A	7	7	248725	248731	100 %	0 %	0 %	0 %	429216470
5545	NC_019791	AGA	2	6	248757	248762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216470
5546	NC_019791	TGA	2	6	248784	248789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216470
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5549	NC_019791	TTA	2	6	248918	248923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216470
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5552	NC_019791	GAA	3	9	249094	249102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216471
5553	NC_019791	TTA	2	6	249112	249117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216471
5554	NC_019791	ATT	2	6	249139	249144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216471
5555	NC_019791	ATA	2	6	249151	249156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216471
5556	NC_019791	ATATG	2	10	249210	249219	40 %	40 %	20 %	0 %	429216471
5557	NC_019791	TAA	2	6	249306	249311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216471
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5559	NC_019791	TAA	3	9	249424	249432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216471
5560	NC_019791	TAA	2	6	249472	249477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216472
5561	NC_019791	TAG	2	6	249478	249483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216472
5562	NC_019791	TAT	2	6	249489	249494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216472
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5602	NC_019791	AT	3	6	251262	251267	50 %	50 %	0 %	0 %	429216473
5603	NC_019791	CTT	2	6	251293	251298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216473
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5605	NC_019791	TAT	2	6	251389	251394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216473
5606	NC_019791	A	6	6	251409	251414	100 %	0 %	0 %	0 %	429216473
5607	NC_019791	TTGATC	2	12	251552	251563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216474
5608	NC_019791	TA	3	6	251575	251580	50 %	50 %	0 %	0 %	429216474
5609	NC_019791	T	7	7	251583	251589	0 %	100 %	0 %	0 %	429216474
5610	NC_019791	TAT	2	6	251602	251607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216474
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5613	NC_019791	CTTC	2	8	251700	251707	0 %	50 %	0 %	50 %	429216474
5614	NC_019791	TCT	2	6	251769	251774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216474
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5622	NC_019791	TAT	2	6	252154	252159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216474
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5996	NC_019791	GGA	2	6	267380	267385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216493
5997	NC_019791	ATTT	2	8	267414	267421	25 %	75 %	0 %	0 %	429216493
5998	NC_019791	A	7	7	267428	267434	100 %	0 %	0 %	0 %	429216493
5999	NC_019791	G	6	6	267468	267473	0 %	0 %	100 %	0 %	429216493
6000	NC_019791	CAT	2	6	267522	267527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216493

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