MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 35376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019791	AAT	3	9	226802	226810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5003	NC_019791	ATA	2	6	226849	226854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5004	NC_019791	AGA	2	6	226868	226873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216446
5005	NC_019791	GTT	2	6	226885	226890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216446
5006	NC_019791	GTT	2	6	226926	226931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216446
5007	NC_019791	CAA	2	6	226953	226958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216446
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5009	NC_019791	ATA	2	6	227083	227088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5010	NC_019791	TAA	2	6	227140	227145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5011	NC_019791	TTA	2	6	227199	227204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216446
5012	NC_019791	GA	3	6	227228	227233	50 %	0 %	50 %	0 %	429216446
5013	NC_019791	TCC	2	6	227261	227266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216446
5014	NC_019791	AAT	2	6	227331	227336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5015	NC_019791	TGA	2	6	227351	227356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216446
5016	NC_019791	AT	3	6	227378	227383	50 %	50 %	0 %	0 %	429216446
5017	NC_019791	AT	3	6	227390	227395	50 %	50 %	0 %	0 %	429216446
5018	NC_019791	ATA	2	6	227431	227436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5019	NC_019791	GAA	2	6	227478	227483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216446
5020	NC_019791	GAA	2	6	227517	227522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216446
5021	NC_019791	TA	3	6	227536	227541	50 %	50 %	0 %	0 %	429216446
5022	NC_019791	GAA	2	6	227542	227547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216446
5023	NC_019791	ATTG	2	8	227555	227562	25 %	50 %	25 %	0 %	429216446
5024	NC_019791	ATT	3	9	227580	227588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216446
5025	NC_019791	GAA	2	6	227655	227660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216446
5026	NC_019791	GTTA	2	8	227723	227730	25 %	50 %	25 %	0 %	429216446
5027	NC_019791	GTA	2	6	227808	227813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216446
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5030	NC_019791	GAT	2	6	227891	227896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216446
5031	NC_019791	TAGG	2	8	227914	227921	25 %	25 %	50 %	0 %	429216446
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5033	NC_019791	AACA	2	8	227990	227997	75 %	0 %	0 %	25 %	429216446
5034	NC_019791	AAT	2	6	228002	228007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216446
5035	NC_019791	ACA	2	6	228144	228149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216446
5036	NC_019791	CATAT	2	10	228182	228191	40 %	40 %	0 %	20 %	429216446
5037	NC_019791	TGA	2	6	228257	228262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216447
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5039	NC_019791	AATT	2	8	228322	228329	50 %	50 %	0 %	0 %	429216447
5040	NC_019791	CAT	2	6	228382	228387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216447
5041	NC_019791	AT	3	6	228386	228391	50 %	50 %	0 %	0 %	429216447
5042	NC_019791	AATT	2	8	228461	228468	50 %	50 %	0 %	0 %	429216447
5043	NC_019791	AGA	3	9	228476	228484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216447
5044	NC_019791	AGA	2	6	228497	228502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216447
5045	NC_019791	CAG	2	6	228632	228637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216447
5046	NC_019791	TA	3	6	228640	228645	50 %	50 %	0 %	0 %	429216447
5047	NC_019791	TGA	2	6	228650	228655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216447
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5050	NC_019791	AGA	2	6	228737	228742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216447
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5052	NC_019791	TAAT	2	8	228795	228802	50 %	50 %	0 %	0 %	429216448
5053	NC_019791	AATG	2	8	228844	228851	50 %	25 %	25 %	0 %	429216448
5054	NC_019791	GGAA	2	8	228882	228889	50 %	0 %	50 %	0 %	429216448
5055	NC_019791	ATT	2	6	228909	228914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216448
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5057	NC_019791	TAA	2	6	228952	228957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216448
5058	NC_019791	AATAG	2	10	228998	229007	60 %	20 %	20 %	0 %	429216448
5059	NC_019791	GAA	2	6	229046	229051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216448
5060	NC_019791	AGA	2	6	229105	229110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216448
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5064	NC_019791	GTATT	2	10	229251	229260	20 %	60 %	20 %	0 %	429216448
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5071	NC_019791	TAA	2	6	229404	229409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216448
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5079	NC_019791	AAG	2	6	229785	229790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216448
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5082	NC_019791	AGG	2	6	229834	229839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216448
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5088	NC_019791	TAT	3	9	230077	230085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216448
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5090	NC_019791	AT	3	6	230109	230114	50 %	50 %	0 %	0 %	429216448
5091	NC_019791	GTG	2	6	230136	230141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216448
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5094	NC_019791	CAT	2	6	230355	230360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216449
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5096	NC_019791	ATCA	2	8	230392	230399	50 %	25 %	0 %	25 %	429216449
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5102	NC_019791	AT	4	8	230658	230665	50 %	50 %	0 %	0 %	429216449
5103	NC_019791	T	6	6	230698	230703	0 %	100 %	0 %	0 %	429216449
5104	NC_019791	CAA	2	6	230835	230840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216449
5105	NC_019791	GGA	2	6	230913	230918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216449
5106	NC_019791	TTTTGC	2	12	230941	230952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429216449
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5108	NC_019791	TTCA	2	8	231118	231125	25 %	50 %	0 %	25 %	429216450
5109	NC_019791	TAA	2	6	231247	231252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216450
5110	NC_019791	ATT	2	6	231331	231336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216450
5111	NC_019791	TAT	2	6	231355	231360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216450
5112	NC_019791	TAA	2	6	231406	231411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216450
5113	NC_019791	A	6	6	231419	231424	100 %	0 %	0 %	0 %	429216450
5114	NC_019791	GGC	2	6	231484	231489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429216450
5115	NC_019791	A	7	7	231636	231642	100 %	0 %	0 %	0 %	429216450
5116	NC_019791	GCA	2	6	231644	231649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216450
5117	NC_019791	TGCTAT	2	12	231670	231681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216450
5118	NC_019791	TTA	2	6	231683	231688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216450
5119	NC_019791	CTATAG	2	12	231741	231752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216450
5120	NC_019791	TC	3	6	231766	231771	0 %	50 %	0 %	50 %	429216450
5121	NC_019791	AAT	2	6	231778	231783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216450
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5123	NC_019791	TAA	2	6	231870	231875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216450
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5233	NC_019791	AGGT	2	8	235790	235797	25 %	25 %	50 %	0 %	429216455
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5495	NC_019791	T	6	6	246828	246833	0 %	100 %	0 %	0 %	429216469
5496	NC_019791	TCT	2	6	246881	246886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216469
5497	NC_019791	CTG	2	6	246891	246896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216469
5498	NC_019791	TGT	2	6	246937	246942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216469
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