MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 38921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771849
2	NC_019778	TCC	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771849
3	NC_019778	CTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
4	NC_019778	GAA	2	6	155	160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
5	NC_019778	CTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
6	NC_019778	AAT	2	6	209	214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771849
7	NC_019778	AAC	2	6	215	220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771849
8	NC_019778	AGA	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
9	NC_019778	ACC	3	9	236	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771849
10	NC_019778	TCA	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
11	NC_019778	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771849
12	NC_019778	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
13	NC_019778	TTA	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771849
14	NC_019778	CTT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
15	NC_019778	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771849
16	NC_019778	CCT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771849
17	NC_019778	TCA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
18	NC_019778	TGT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771849
19	NC_019778	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
20	NC_019778	CGC	3	9	1066	1074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771849
21	NC_019778	ATC	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
22	NC_019778	AAG	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
23	NC_019778	GAG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771849
24	NC_019778	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771849
25	NC_019778	CAG	2	6	1821	1826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771850
26	NC_019778	TGA	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771850
27	NC_019778	ATT	2	6	1944	1949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771850
28	NC_019778	ACA	2	6	1978	1983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771850
29	NC_019778	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771851
30	NC_019778	CAT	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771851
31	NC_019778	CAT	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771851
32	NC_019778	TAG	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771851
33	NC_019778	TTG	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771852
34	NC_019778	TAG	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771852
35	NC_019778	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
36	NC_019778	GGC	2	6	3028	3033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771852
37	NC_019778	TTC	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771852
38	NC_019778	GCG	2	6	3209	3214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771852
39	NC_019778	ACT	3	9	3349	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
40	NC_019778	CTT	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771852
41	NC_019778	ATT	2	6	3560	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
42	NC_019778	GGT	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771852
43	NC_019778	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
44	NC_019778	GCC	2	6	3590	3595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771852
45	NC_019778	CCT	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771852
46	NC_019778	TCC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771852
47	NC_019778	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771852
48	NC_019778	GCC	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771852
49	NC_019778	CAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
50	NC_019778	CAC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771852
51	NC_019778	ATC	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
52	NC_019778	TTG	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771852
53	NC_019778	ACA	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771853
54	NC_019778	CAT	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771853
55	NC_019778	TGG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
56	NC_019778	TAT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771853
57	NC_019778	ACT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771853
58	NC_019778	TGA	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771853
59	NC_019778	TGG	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
60	NC_019778	TAA	2	6	5112	5117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771853
61	NC_019778	TGT	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771853
62	NC_019778	CTT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771853
63	NC_019778	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771853
64	NC_019778	GGT	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
65	NC_019778	TTG	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771853
66	NC_019778	GGA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771853
67	NC_019778	TAA	2	6	5538	5543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771853
68	NC_019778	AGA	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
69	NC_019778	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
70	NC_019778	GAA	2	6	5754	5759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
71	NC_019778	TAT	2	6	5818	5823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771854
72	NC_019778	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
73	NC_019778	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771854
74	NC_019778	ACC	3	9	5970	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771854
75	NC_019778	GAT	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771854
76	NC_019778	CGT	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771854
77	NC_019778	AGA	2	6	6233	6238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
78	NC_019778	AGA	2	6	6413	6418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
79	NC_019778	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771854
80	NC_019778	TAA	2	6	6494	6499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771854
81	NC_019778	GCC	2	6	6522	6527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771854
82	NC_019778	AGA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
83	NC_019778	ACA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771854
84	NC_019778	CCA	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771854
85	NC_019778	CAA	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771854
86	NC_019778	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771854
87	NC_019778	GGT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771854
88	NC_019778	TGC	2	6	6848	6853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771854
89	NC_019778	AGC	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771854
90	NC_019778	AGA	2	6	6923	6928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
91	NC_019778	GGA	2	6	6942	6947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771854
92	NC_019778	AGA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
93	NC_019778	CCA	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771854
94	NC_019778	CGC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771854
95	NC_019778	ATG	2	6	7365	7370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771854
96	NC_019778	ATC	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771855
97	NC_019778	TAA	2	6	7742	7747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771855
98	NC_019778	TAA	2	6	7850	7855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771855
99	NC_019778	TAA	4	12	7988	7999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771855
100	NC_019778	TAT	2	6	8009	8014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771855
101	NC_019778	AGG	2	6	8083	8088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771855
102	NC_019778	GCA	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771856
103	NC_019778	GTG	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771856
104	NC_019778	ATG	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771856
105	NC_019778	AAG	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771856
106	NC_019778	GTT	2	6	8978	8983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771856
107	NC_019778	GTT	2	6	9027	9032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771856
108	NC_019778	ATT	2	6	9106	9111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771856
109	NC_019778	GAA	2	6	9248	9253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771856
110	NC_019778	TTC	3	9	9295	9303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771856
111	NC_019778	TGG	2	6	9340	9345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771856
112	NC_019778	CTG	2	6	9570	9575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771856
113	NC_019778	GAT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771856
114	NC_019778	TGC	2	6	9616	9621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771856
115	NC_019778	GCT	2	6	9644	9649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771856
116	NC_019778	TGG	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771857
117	NC_019778	TAT	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771857
118	NC_019778	CGC	2	6	10203	10208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771857
119	NC_019778	AAG	2	6	10229	10234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771857
120	NC_019778	GAG	2	6	10240	10245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771857
121	NC_019778	GGA	2	6	11558	11563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771858
122	NC_019778	AAT	2	6	11615	11620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771858
123	NC_019778	AAT	2	6	11886	11891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771859
124	NC_019778	CAA	2	6	11947	11952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771859
125	NC_019778	ATT	2	6	12134	12139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771860
126	NC_019778	ATA	2	6	12186	12191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771860
127	NC_019778	AAT	2	6	12199	12204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771860
128	NC_019778	ATT	2	6	12261	12266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771860
129	NC_019778	TAT	2	6	12349	12354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771860
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131	NC_019778	AGG	2	6	12879	12884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771861
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