MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 1178

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019777	AAT	2	6	52798	52803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771827
1002	NC_019777	CCG	2	6	52806	52811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771827
1003	NC_019777	AAT	3	9	52813	52821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771827
1004	NC_019777	A	6	6	52841	52846	100 %	0 %	0 %	0 %	428771827
1005	NC_019777	CCATG	2	10	52849	52858	20 %	20 %	20 %	40 %	428771827
1006	NC_019777	TAC	2	6	52882	52887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771827
1007	NC_019777	AAT	2	6	52929	52934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771827
1008	NC_019777	CTA	2	6	53076	53081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771827
1009	NC_019777	CCA	2	6	53085	53090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771827
1010	NC_019777	CTT	2	6	53123	53128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771827
1011	NC_019777	T	6	6	53189	53194	0 %	100 %	0 %	0 %	428771827
1012	NC_019777	TAT	2	6	53205	53210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771827
1013	NC_019777	TACT	2	8	53238	53245	25 %	50 %	0 %	25 %	428771827
1014	NC_019777	TTC	2	6	53289	53294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771827
1015	NC_019777	TTC	2	6	53365	53370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771827
1016	NC_019777	TGG	2	6	53422	53427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771827
1017	NC_019777	TAT	3	9	53472	53480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771827
1018	NC_019777	AAG	2	6	53505	53510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771827
1019	NC_019777	TCT	2	6	53516	53521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771827
1020	NC_019777	TAA	2	6	53530	53535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771827
1021	NC_019777	TA	3	6	53550	53555	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
1022	NC_019777	ATTA	2	8	53626	53633	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
1023	NC_019777	AT	3	6	53634	53639	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
1024	NC_019777	GGT	2	6	53684	53689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771827
1025	NC_019777	A	8	8	53724	53731	100 %	0 %	0 %	0 %	428771827
1026	NC_019777	TGA	2	6	53734	53739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771827
1027	NC_019777	TTAA	2	8	53744	53751	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
1028	NC_019777	AT	3	6	53778	53783	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
1029	NC_019777	TAAA	2	8	53791	53798	75 %	25 %	0 %	0 %	428771827
1030	NC_019777	ATT	2	6	53804	53809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771827
1031	NC_019777	TCT	2	6	54004	54009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771828
1032	NC_019777	TTG	2	6	54036	54041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771828
1033	NC_019777	CAAT	2	8	54052	54059	50 %	25 %	0 %	25 %	428771828
1034	NC_019777	TA	3	6	54113	54118	50 %	50 %	0 %	0 %	428771828
1035	NC_019777	TAA	2	6	54159	54164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771828
1036	NC_019777	GGT	2	6	54173	54178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771828
1037	NC_019777	GAA	2	6	54194	54199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771828
1038	NC_019777	A	6	6	54198	54203	100 %	0 %	0 %	0 %	428771828
1039	NC_019777	ATGAA	2	10	54237	54246	60 %	20 %	20 %	0 %	428771828
1040	NC_019777	AG	4	8	54377	54384	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
1041	NC_019777	TGT	2	6	54385	54390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771829
1042	NC_019777	TAT	2	6	54419	54424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771829
1043	NC_019777	ACGAAG	2	12	54449	54460	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428771829
1044	NC_019777	GA	4	8	54499	54506	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
1045	NC_019777	ATT	2	6	54521	54526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771829
1046	NC_019777	TGG	2	6	54556	54561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771829
1047	NC_019777	AT	3	6	54609	54614	50 %	50 %	0 %	0 %	428771829
1048	NC_019777	AGA	2	6	54964	54969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771830
1049	NC_019777	TAAA	2	8	55011	55018	75 %	25 %	0 %	0 %	428771830
1050	NC_019777	ATA	3	9	55095	55103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771830
1051	NC_019777	TAAT	2	8	55279	55286	50 %	50 %	0 %	0 %	428771831
1052	NC_019777	AGA	2	6	55319	55324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771831
1053	NC_019777	CAAA	2	8	55325	55332	75 %	0 %	0 %	25 %	428771831
1054	NC_019777	CCA	2	6	55407	55412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771831
1055	NC_019777	TGA	2	6	55421	55426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771831
1056	NC_019777	TAAT	2	8	55437	55444	50 %	50 %	0 %	0 %	428771831
1057	NC_019777	TAA	3	9	55559	55567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771832
1058	NC_019777	TTAA	2	8	55590	55597	50 %	50 %	0 %	0 %	428771832
1059	NC_019777	AAT	2	6	55803	55808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771832
1060	NC_019777	AAAT	2	8	55832	55839	75 %	25 %	0 %	0 %	428771832
1061	NC_019777	CAA	2	6	55900	55905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771833
1062	NC_019777	ATT	2	6	55918	55923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771833
1063	NC_019777	TGG	2	6	55963	55968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771833
1064	NC_019777	TTA	2	6	55971	55976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771833
1065	NC_019777	GGAA	2	8	55981	55988	50 %	0 %	50 %	0 %	428771833
1066	NC_019777	ATC	2	6	56028	56033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771833
1067	NC_019777	AGA	2	6	56048	56053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771833
1068	NC_019777	ATT	3	9	56063	56071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771833
1069	NC_019777	TAAA	2	8	56586	56593	75 %	25 %	0 %	0 %	428771834
1070	NC_019777	TGT	2	6	56614	56619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771834
1071	NC_019777	TA	3	6	56664	56669	50 %	50 %	0 %	0 %	428771834
1072	NC_019777	TATCA	2	10	56696	56705	40 %	40 %	0 %	20 %	428771834
1073	NC_019777	ACA	2	6	56706	56711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771834
1074	NC_019777	ATA	2	6	56721	56726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771834
1075	NC_019777	TAAA	2	8	57023	57030	75 %	25 %	0 %	0 %	428771835
1076	NC_019777	A	6	6	57028	57033	100 %	0 %	0 %	0 %	428771835
1077	NC_019777	TAA	2	6	57096	57101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771835
1078	NC_019777	CAA	2	6	57166	57171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771835
1079	NC_019777	AAC	2	6	57302	57307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771836
1080	NC_019777	ATA	2	6	57310	57315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771836
1081	NC_019777	GTT	2	6	57401	57406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771836
1082	NC_019777	AATT	2	8	57434	57441	50 %	50 %	0 %	0 %	428771836
1083	NC_019777	ATT	2	6	57756	57761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771837
1084	NC_019777	GAA	2	6	57794	57799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771837
1085	NC_019777	ATT	2	6	57856	57861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771837
1086	NC_019777	CAT	2	6	57866	57871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771837
1087	NC_019777	GTA	2	6	57878	57883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771837
1088	NC_019777	GAA	2	6	57909	57914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771837
1089	NC_019777	TC	3	6	57929	57934	0 %	50 %	0 %	50 %	428771837
1090	NC_019777	GAA	2	6	57941	57946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771837
1091	NC_019777	GGA	2	6	57965	57970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771837
1092	NC_019777	A	6	6	57970	57975	100 %	0 %	0 %	0 %	428771837
1093	NC_019777	A	7	7	58244	58250	100 %	0 %	0 %	0 %	428771838
1094	NC_019777	AGGAA	2	10	58377	58386	60 %	0 %	40 %	0 %	428771838
1095	NC_019777	TGA	2	6	58412	58417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771838
1096	NC_019777	TAA	2	6	58633	58638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771839
1097	NC_019777	TAG	2	6	58672	58677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771839
1098	NC_019777	GAG	2	6	58687	58692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771839
1099	NC_019777	GAAA	2	8	58722	58729	75 %	0 %	25 %	0 %	428771839
1100	NC_019777	ATT	2	6	58833	58838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771839
1101	NC_019777	AT	3	6	58883	58888	50 %	50 %	0 %	0 %	428771839
1102	NC_019777	TTA	2	6	58908	58913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771839
1103	NC_019777	AGT	2	6	58985	58990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771839
1104	NC_019777	A	6	6	59250	59255	100 %	0 %	0 %	0 %	428771840
1105	NC_019777	AAT	2	6	59260	59265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771840
1106	NC_019777	AAGA	2	8	59292	59299	75 %	0 %	25 %	0 %	428771840
1107	NC_019777	TAT	2	6	59347	59352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771840
1108	NC_019777	GAT	2	6	59575	59580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771841
1109	NC_019777	ACA	2	6	59622	59627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771841
1110	NC_019777	TGA	2	6	59658	59663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771841
1111	NC_019777	ATA	2	6	59672	59677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771841
1112	NC_019777	TA	3	6	59716	59721	50 %	50 %	0 %	0 %	428771841
1113	NC_019777	AAG	2	6	59723	59728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771841
1114	NC_019777	AAT	2	6	59846	59851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771842
1115	NC_019777	TCA	2	6	59864	59869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771842
1116	NC_019777	AATT	2	8	59929	59936	50 %	50 %	0 %	0 %	428771842
1117	NC_019777	AAGA	2	8	59942	59949	75 %	0 %	25 %	0 %	428771842
1118	NC_019777	AATT	2	8	59968	59975	50 %	50 %	0 %	0 %	428771842
1119	NC_019777	GAA	2	6	60027	60032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771842
1120	NC_019777	AGA	2	6	60064	60069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771842
1121	NC_019777	CCA	2	6	60109	60114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771842
1122	NC_019777	ATA	2	6	60121	60126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771842
1123	NC_019777	TTAA	2	8	60288	60295	50 %	50 %	0 %	0 %	428771842
1124	NC_019777	ATAA	2	8	60367	60374	75 %	25 %	0 %	0 %	428771842
1125	NC_019777	ATT	2	6	60603	60608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771843
1126	NC_019777	GTT	2	6	60682	60687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771843
1127	NC_019777	TCT	2	6	60714	60719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771843
1128	NC_019777	AAG	2	6	60733	60738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771843
1129	NC_019777	AAG	2	6	60786	60791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771843
1130	NC_019777	ATTG	2	8	60944	60951	25 %	50 %	25 %	0 %	428771843
1131	NC_019777	ATT	2	6	60953	60958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771843
1132	NC_019777	GGAA	2	8	60989	60996	50 %	0 %	50 %	0 %	428771843
1133	NC_019777	TAA	2	6	61025	61030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771843
1134	NC_019777	TTA	2	6	61100	61105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771843
1135	NC_019777	GAA	2	6	61182	61187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771843
1136	NC_019777	TAA	2	6	61252	61257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771843
1137	NC_019777	AGA	2	6	61271	61276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771843
1138	NC_019777	GAAAA	2	10	61561	61570	80 %	0 %	20 %	0 %	428771844
1139	NC_019777	TAA	2	6	61595	61600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771844
1140	NC_019777	CAT	2	6	61614	61619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771844
1141	NC_019777	TAA	2	6	61620	61625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771844
1142	NC_019777	AT	3	6	61635	61640	50 %	50 %	0 %	0 %	428771844
1143	NC_019777	GA	3	6	61665	61670	50 %	0 %	50 %	0 %	428771844
1144	NC_019777	ATT	2	6	61672	61677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771844
1145	NC_019777	T	6	6	61764	61769	0 %	100 %	0 %	0 %	428771845
1146	NC_019777	ATTA	2	8	61787	61794	50 %	50 %	0 %	0 %	428771845
1147	NC_019777	GA	3	6	61830	61835	50 %	0 %	50 %	0 %	428771845
1148	NC_019777	AGTT	2	8	61839	61846	25 %	50 %	25 %	0 %	428771845
1149	NC_019777	AAT	2	6	61872	61877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771845
1150	NC_019777	AAT	2	6	62001	62006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771846
1151	NC_019777	ATAA	2	8	62011	62018	75 %	25 %	0 %	0 %	428771846
1152	NC_019777	ATATT	2	10	62040	62049	40 %	60 %	0 %	0 %	428771846
1153	NC_019777	AAG	2	6	62123	62128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771846
1154	NC_019777	AAG	2	6	62159	62164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771846
1155	NC_019777	AGAA	2	8	62171	62178	75 %	0 %	25 %	0 %	428771846
1156	NC_019777	GAAT	2	8	62190	62197	50 %	25 %	25 %	0 %	428771846
1157	NC_019777	TGA	2	6	62198	62203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771846
1158	NC_019777	AAG	2	6	62213	62218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771846
1159	NC_019777	ATTT	2	8	62236	62243	25 %	75 %	0 %	0 %	428771846
1160	NC_019777	GTT	2	6	62246	62251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771846
1161	NC_019777	TAA	2	6	62282	62287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771846
1162	NC_019777	TAA	2	6	62306	62311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771846
1163	NC_019777	AAG	2	6	62312	62317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771846
1164	NC_019777	T	7	7	62356	62362	0 %	100 %	0 %	0 %	428771847
1165	NC_019777	TCT	2	6	62373	62378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771847
1166	NC_019777	C	6	6	62408	62413	0 %	0 %	0 %	100 %	428771847
1167	NC_019777	GCTTCT	2	12	62443	62454	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428771847
1168	NC_019777	ATC	2	6	62478	62483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771847
1169	NC_019777	GGT	2	6	62492	62497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771847
1170	NC_019777	ACA	2	6	62557	62562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771847
1171	NC_019777	GA	3	6	62631	62636	50 %	0 %	50 %	0 %	428771847
1172	NC_019777	TTG	2	6	62667	62672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771847
1173	NC_019777	TTC	2	6	62715	62720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771847
1174	NC_019777	CGG	2	6	62731	62736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771847
1175	NC_019777	CAT	2	6	62753	62758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771847
1176	NC_019777	TTC	2	6	62787	62792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771847
1177	NC_019777	ATT	2	6	62857	62862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771847
1178	NC_019777	ATT	2	6	62869	62874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771847

< Previous 1 23Next >