MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 2264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	AATCT	2	10	1284	1293	40 %	40 %	0 %	20 %	428768416
2	NC_019776	CAAAA	2	10	3097	3106	80 %	0 %	0 %	20 %	428768417
3	NC_019776	AATTT	2	10	4263	4272	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
4	NC_019776	GCGAT	2	10	5783	5792	20 %	20 %	40 %	20 %	428768418
5	NC_019776	TAATT	2	10	5880	5889	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
6	NC_019776	ACCTC	2	10	6346	6355	20 %	20 %	0 %	60 %	428768419
7	NC_019776	TTCTT	2	10	6591	6600	0 %	80 %	0 %	20 %	428768419
8	NC_019776	CCAAA	2	10	7055	7064	60 %	0 %	0 %	40 %	428768419
9	NC_019776	GACTT	2	10	11112	11121	20 %	40 %	20 %	20 %	428768424
10	NC_019776	TCCAT	2	10	12035	12044	20 %	40 %	0 %	40 %	428768424
11	NC_019776	AATTA	2	10	13219	13228	60 %	40 %	0 %	0 %	428768424
12	NC_019776	CTTTC	2	10	14616	14625	0 %	60 %	0 %	40 %	428768426
13	NC_019776	TAAGA	2	10	15311	15320	60 %	20 %	20 %	0 %	428768427
14	NC_019776	GCGTT	2	10	19766	19775	0 %	40 %	40 %	20 %	428768430
15	NC_019776	TAACG	2	10	22536	22545	40 %	20 %	20 %	20 %	428768432
16	NC_019776	AATAG	2	10	26642	26651	60 %	20 %	20 %	0 %	428768435
17	NC_019776	GATGA	2	10	27587	27596	40 %	20 %	40 %	0 %	428768436
18	NC_019776	GATTA	2	10	34096	34105	40 %	40 %	20 %	0 %	428768440
19	NC_019776	TAATT	2	10	37214	37223	40 %	60 %	0 %	0 %	428768444
20	NC_019776	CTAAT	2	10	38404	38413	40 %	40 %	0 %	20 %	428768445
21	NC_019776	CAGTC	2	10	42624	42633	20 %	20 %	20 %	40 %	428768450
22	NC_019776	TTCTT	2	10	44264	44273	0 %	80 %	0 %	20 %	428768452
23	NC_019776	TGAGA	2	10	50656	50665	40 %	20 %	40 %	0 %	428768458
24	NC_019776	ATTTA	2	10	52180	52189	40 %	60 %	0 %	0 %	428768459
25	NC_019776	AGTTG	2	10	52688	52697	20 %	40 %	40 %	0 %	428768459
26	NC_019776	GATGA	2	10	56266	56275	40 %	20 %	40 %	0 %	428768462
27	NC_019776	AATGT	2	10	56676	56685	40 %	40 %	20 %	0 %	428768463
28	NC_019776	ACTTT	2	10	59717	59726	20 %	60 %	0 %	20 %	428768466
29	NC_019776	TCTGG	2	10	60838	60847	0 %	40 %	40 %	20 %	428768467
30	NC_019776	AAAAT	2	10	60923	60932	80 %	20 %	0 %	0 %	428768467
31	NC_019776	AGTTT	2	10	63707	63716	20 %	60 %	20 %	0 %	428768470
32	NC_019776	TTACT	2	10	64641	64650	20 %	60 %	0 %	20 %	428768472
33	NC_019776	ATCCT	2	10	67502	67511	20 %	40 %	0 %	40 %	428768475
34	NC_019776	ATGGA	2	10	73104	73113	40 %	20 %	40 %	0 %	428768482
35	NC_019776	TTTCC	2	10	73545	73554	0 %	60 %	0 %	40 %	428768482
36	NC_019776	TTTCG	2	10	75431	75440	0 %	60 %	20 %	20 %	428768483
37	NC_019776	ATGAT	2	10	75895	75904	40 %	40 %	20 %	0 %	428768484
38	NC_019776	GAACA	2	10	76015	76024	60 %	0 %	20 %	20 %	428768484
39	NC_019776	AGATT	2	10	81581	81590	40 %	40 %	20 %	0 %	428768487
40	NC_019776	TTTTG	2	10	82222	82231	0 %	80 %	20 %	0 %	428768487
41	NC_019776	TCAAA	2	10	82940	82949	60 %	20 %	0 %	20 %	428768487
42	NC_019776	ATGCT	2	10	83759	83768	20 %	40 %	20 %	20 %	428768488
43	NC_019776	TAGAG	2	10	84573	84582	40 %	20 %	40 %	0 %	428768488
44	NC_019776	GATGG	2	10	87081	87090	20 %	20 %	60 %	0 %	428768488
45	NC_019776	GCTTT	2	10	88312	88321	0 %	60 %	20 %	20 %	428768489
46	NC_019776	TGATT	2	10	89356	89365	20 %	60 %	20 %	0 %	428768490
47	NC_019776	AGACA	2	10	91717	91726	60 %	0 %	20 %	20 %	428768492
48	NC_019776	AAATT	2	10	92539	92548	60 %	40 %	0 %	0 %	428768493
49	NC_019776	AACTC	2	10	95452	95461	40 %	20 %	0 %	40 %	428768493
50	NC_019776	TTTGG	2	10	99431	99440	0 %	60 %	40 %	0 %	428768497
51	NC_019776	TAGTT	2	10	99442	99451	20 %	60 %	20 %	0 %	428768497
52	NC_019776	ATTCT	2	10	100495	100504	20 %	60 %	0 %	20 %	428768497
53	NC_019776	AAATT	2	10	100793	100802	60 %	40 %	0 %	0 %	428768497
54	NC_019776	CTCAA	2	10	101046	101055	40 %	20 %	0 %	40 %	428768497
55	NC_019776	TTTTG	2	10	103503	103512	0 %	80 %	20 %	0 %	428768499
56	NC_019776	TTTAT	2	10	105663	105672	20 %	80 %	0 %	0 %	428768501
57	NC_019776	AATTC	2	10	106275	106284	40 %	40 %	0 %	20 %	428768502
58	NC_019776	CTAAG	2	10	113025	113034	40 %	20 %	20 %	20 %	428768505
59	NC_019776	TTTGA	2	10	113143	113152	20 %	60 %	20 %	0 %	428768505
60	NC_019776	TGGCA	2	10	113861	113870	20 %	20 %	40 %	20 %	428768506
61	NC_019776	TAAAT	2	10	114936	114945	60 %	40 %	0 %	0 %	428768507
62	NC_019776	ATTTT	2	10	115412	115421	20 %	80 %	0 %	0 %	428768508
63	NC_019776	TAATA	2	10	116832	116841	60 %	40 %	0 %	0 %	428768509
64	NC_019776	TATCA	2	10	116860	116869	40 %	40 %	0 %	20 %	428768509
65	NC_019776	TTTGA	2	10	118240	118249	20 %	60 %	20 %	0 %	428768510
66	NC_019776	GTCTT	2	10	118873	118882	0 %	60 %	20 %	20 %	428768511
67	NC_019776	AAGAA	2	10	119828	119837	80 %	0 %	20 %	0 %	428768512
68	NC_019776	AAGTT	2	10	122085	122094	40 %	40 %	20 %	0 %	428768514
69	NC_019776	AATCG	2	10	122250	122259	40 %	20 %	20 %	20 %	428768514
70	NC_019776	TAAAA	2	10	123137	123146	80 %	20 %	0 %	0 %	428768514
71	NC_019776	CAATT	2	10	126558	126567	40 %	40 %	0 %	20 %	428768515
72	NC_019776	ATTAC	2	10	129224	129233	40 %	40 %	0 %	20 %	428768517
73	NC_019776	TTGGG	2	10	130244	130253	0 %	40 %	60 %	0 %	428768519
74	NC_019776	GGCAG	2	10	132530	132539	20 %	0 %	60 %	20 %	428768522
75	NC_019776	ACTTT	2	10	135190	135199	20 %	60 %	0 %	20 %	428768524
76	NC_019776	TAATT	2	10	138742	138751	40 %	60 %	0 %	0 %	428768527
77	NC_019776	GGTAT	2	10	141161	141170	20 %	40 %	40 %	0 %	428768529
78	NC_019776	TGATG	2	10	141282	141291	20 %	40 %	40 %	0 %	428768529
79	NC_019776	AATTT	2	10	142324	142333	40 %	60 %	0 %	0 %	428768530
80	NC_019776	CTAAA	2	10	146466	146475	60 %	20 %	0 %	20 %	428768532
81	NC_019776	ACTAA	2	10	147542	147551	60 %	20 %	0 %	20 %	428768533
82	NC_019776	TCTAT	2	10	147647	147656	20 %	60 %	0 %	20 %	428768533
83	NC_019776	CTTTC	2	10	150625	150634	0 %	60 %	0 %	40 %	428768535
84	NC_019776	GTATT	2	10	150941	150950	20 %	60 %	20 %	0 %	428768535
85	NC_019776	TATTC	2	10	152784	152793	20 %	60 %	0 %	20 %	428768537
86	NC_019776	GTTTA	2	10	153420	153429	20 %	60 %	20 %	0 %	428768537
87	NC_019776	TTAAC	2	10	155548	155557	40 %	40 %	0 %	20 %	428768539
88	NC_019776	AAACC	2	10	156047	156056	60 %	0 %	0 %	40 %	428768539
89	NC_019776	TAAAT	2	10	157097	157106	60 %	40 %	0 %	0 %	428768540
90	NC_019776	AATCA	2	10	157309	157318	60 %	20 %	0 %	20 %	428768540
91	NC_019776	ACCAA	2	10	162606	162615	60 %	0 %	0 %	40 %	428768543
92	NC_019776	ATTCA	2	10	163267	163276	40 %	40 %	0 %	20 %	428768544
93	NC_019776	CCTTC	2	10	164338	164347	0 %	40 %	0 %	60 %	428768546
94	NC_019776	TGACT	2	10	164555	164564	20 %	40 %	20 %	20 %	428768546
95	NC_019776	TTCCC	2	10	166282	166291	0 %	40 %	0 %	60 %	428768547
96	NC_019776	ATGGG	2	10	167418	167427	20 %	20 %	60 %	0 %	428768548
97	NC_019776	ATTTT	2	10	176003	176012	20 %	80 %	0 %	0 %	428768555
98	NC_019776	AGATA	2	10	176645	176654	60 %	20 %	20 %	0 %	428768556
99	NC_019776	CTCAT	2	10	178389	178398	20 %	40 %	0 %	40 %	428768557
100	NC_019776	AAATT	2	10	181056	181065	60 %	40 %	0 %	0 %	428768559
101	NC_019776	CCATT	2	10	183291	183300	20 %	40 %	0 %	40 %	428768561
102	NC_019776	ACTTT	2	10	183751	183760	20 %	60 %	0 %	20 %	428768561
103	NC_019776	ATTTT	2	10	184570	184579	20 %	80 %	0 %	0 %	428768562
104	NC_019776	AATTA	2	10	184655	184664	60 %	40 %	0 %	0 %	428768562
105	NC_019776	TAAAC	2	10	185010	185019	60 %	20 %	0 %	20 %	428768562
106	NC_019776	AATTT	2	10	187865	187874	40 %	60 %	0 %	0 %	428768566
107	NC_019776	TAGTA	2	10	192339	192348	40 %	40 %	20 %	0 %	428768571
108	NC_019776	GAAAA	2	10	193398	193407	80 %	0 %	20 %	0 %	428768572
109	NC_019776	TATGA	2	10	194289	194298	40 %	40 %	20 %	0 %	428768572
110	NC_019776	GAATA	2	10	195442	195451	60 %	20 %	20 %	0 %	428768573
111	NC_019776	GCATA	2	10	199811	199820	40 %	20 %	20 %	20 %	428768575
112	NC_019776	ATTCC	2	10	200070	200079	20 %	40 %	0 %	40 %	428768575
113	NC_019776	TCTTT	2	10	200169	200178	0 %	80 %	0 %	20 %	428768575
114	NC_019776	CTACC	2	10	205076	205085	20 %	20 %	0 %	60 %	428768580
115	NC_019776	TTCTT	2	10	207217	207226	0 %	80 %	0 %	20 %	428768582
116	NC_019776	AGAAA	2	10	207997	208006	80 %	0 %	20 %	0 %	428768583
117	NC_019776	AAACT	2	10	209637	209646	60 %	20 %	0 %	20 %	428768586
118	NC_019776	CTACT	2	10	215452	215461	20 %	40 %	0 %	40 %	428768592
119	NC_019776	TAAAT	2	10	215538	215547	60 %	40 %	0 %	0 %	428768592
120	NC_019776	AATTG	2	10	218333	218342	40 %	40 %	20 %	0 %	428768594
121	NC_019776	TTTTA	2	10	218431	218440	20 %	80 %	0 %	0 %	428768594
122	NC_019776	AGTTG	2	10	219125	219134	20 %	40 %	40 %	0 %	428768594
123	NC_019776	GAATT	2	10	222902	222911	40 %	40 %	20 %	0 %	428768597
124	NC_019776	TAATT	2	10	224014	224023	40 %	60 %	0 %	0 %	428768597
125	NC_019776	CAATC	2	10	226095	226104	40 %	20 %	0 %	40 %	428768600
126	NC_019776	TAAAA	2	10	226576	226585	80 %	20 %	0 %	0 %	428768600
127	NC_019776	CAAAA	2	10	226701	226710	80 %	0 %	0 %	20 %	428768600
128	NC_019776	TAAAA	2	10	233879	233888	80 %	20 %	0 %	0 %	428768610
129	NC_019776	TTTAA	2	10	238200	238209	40 %	60 %	0 %	0 %	428768610
130	NC_019776	CTAAT	2	10	238456	238465	40 %	40 %	0 %	20 %	428768610
131	NC_019776	GGTTT	2	10	241089	241098	0 %	60 %	40 %	0 %	428768610
132	NC_019776	AATAT	2	10	241705	241714	60 %	40 %	0 %	0 %	428768610
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134	NC_019776	GTTTA	2	10	245419	245428	20 %	60 %	20 %	0 %	428768610
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