MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019757	ACA	2	6	189190	189195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402350
3002	NC_019757	TGGG	2	8	189203	189210	0 %	25 %	75 %	0 %	434402350
3003	NC_019757	GAG	2	6	189236	189241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402350
3004	NC_019757	ATTC	2	8	189261	189268	25 %	50 %	0 %	25 %	434402350
3005	NC_019757	TTC	2	6	189342	189347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402350
3006	NC_019757	ATT	2	6	189352	189357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402350
3007	NC_019757	GCA	2	6	189387	189392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402350
3008	NC_019757	TA	3	6	189486	189491	50 %	50 %	0 %	0 %	434402350
3009	NC_019757	CTCC	2	8	189516	189523	0 %	25 %	0 %	75 %	434402350
3010	NC_019757	ACCA	2	8	189531	189538	50 %	0 %	0 %	50 %	434402350
3011	NC_019757	GAT	2	6	189568	189573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402350
3012	NC_019757	GCA	2	6	189574	189579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402350
3013	NC_019757	GAG	2	6	189585	189590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402350
3014	NC_019757	AGTC	2	8	189625	189632	25 %	25 %	25 %	25 %	434402350
3015	NC_019757	ATCTG	2	10	189874	189883	20 %	40 %	20 %	20 %	434402351
3016	NC_019757	A	6	6	189888	189893	100 %	0 %	0 %	0 %	434402351
3017	NC_019757	A	7	7	189928	189934	100 %	0 %	0 %	0 %	434402351
3018	NC_019757	GCC	2	6	189978	189983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402351
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3020	NC_019757	ATTA	2	8	190068	190075	50 %	50 %	0 %	0 %	434402352
3021	NC_019757	TC	3	6	190096	190101	0 %	50 %	0 %	50 %	434402352
3022	NC_019757	AGA	2	6	190152	190157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402352
3023	NC_019757	TC	3	6	190165	190170	0 %	50 %	0 %	50 %	434402352
3024	NC_019757	TTC	2	6	190293	190298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402352
3025	NC_019757	GATG	2	8	190302	190309	25 %	25 %	50 %	0 %	434402352
3026	NC_019757	TAAT	2	8	190334	190341	50 %	50 %	0 %	0 %	434402352
3027	NC_019757	AGT	2	6	190561	190566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402352
3028	NC_019757	GGCT	2	8	190616	190623	0 %	25 %	50 %	25 %	434402352
3029	NC_019757	GGT	2	6	190639	190644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402352
3030	NC_019757	TGC	2	6	190713	190718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402352
3031	NC_019757	ATT	2	6	190747	190752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402352
3032	NC_019757	CGTG	2	8	190779	190786	0 %	25 %	50 %	25 %	434402352
3033	NC_019757	TC	3	6	190801	190806	0 %	50 %	0 %	50 %	434402352
3034	NC_019757	ATC	2	6	190915	190920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402352
3035	NC_019757	TGGAA	2	10	190961	190970	40 %	20 %	40 %	0 %	434402352
3036	NC_019757	TGC	2	6	191324	191329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402353
3037	NC_019757	TTC	2	6	191333	191338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402353
3038	NC_019757	TTG	2	6	191399	191404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402353
3039	NC_019757	ACC	2	6	191441	191446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402353
3040	NC_019757	GCG	2	6	191453	191458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402353
3041	NC_019757	TTA	2	6	191460	191465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402353
3042	NC_019757	ATGA	2	8	191549	191556	50 %	25 %	25 %	0 %	434402353
3043	NC_019757	TCT	2	6	191610	191615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402353
3044	NC_019757	CTA	2	6	191623	191628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402353
3045	NC_019757	TTC	2	6	191684	191689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402353
3046	NC_019757	TA	3	6	192418	192423	50 %	50 %	0 %	0 %	434402354
3047	NC_019757	TGA	2	6	192425	192430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402354
3048	NC_019757	AAT	2	6	192464	192469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402354
3049	NC_019757	GA	3	6	192500	192505	50 %	0 %	50 %	0 %	434402354
3050	NC_019757	GCT	2	6	192522	192527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402354
3051	NC_019757	CTA	2	6	192542	192547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402354
3052	NC_019757	AGA	2	6	192569	192574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402354
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3054	NC_019757	GTG	2	6	192597	192602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402354
3055	NC_019757	A	7	7	192723	192729	100 %	0 %	0 %	0 %	434402354
3056	NC_019757	ATT	2	6	192757	192762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402354
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3058	NC_019757	T	6	6	192906	192911	0 %	100 %	0 %	0 %	434402354
3059	NC_019757	AGA	2	6	192941	192946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402354
3060	NC_019757	GGC	2	6	192983	192988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402354
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3062	NC_019757	ATC	2	6	193157	193162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402355
3063	NC_019757	TCT	2	6	193170	193175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402355
3064	NC_019757	GCT	2	6	193191	193196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402355
3065	NC_019757	CAT	2	6	193204	193209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402355
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3067	NC_019757	CAC	2	6	193514	193519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402355
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3071	NC_019757	TAG	2	6	193709	193714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402355
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3086	NC_019757	T	6	6	194585	194590	0 %	100 %	0 %	0 %	434402356
3087	NC_019757	TTG	2	6	194622	194627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402356
3088	NC_019757	TTG	2	6	194631	194636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402356
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3092	NC_019757	CCTA	2	8	194826	194833	25 %	25 %	0 %	50 %	434402356
3093	NC_019757	GTA	2	6	194839	194844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402356
3094	NC_019757	CAGCG	2	10	194871	194880	20 %	0 %	40 %	40 %	434402356
3095	NC_019757	CTGA	2	8	195026	195033	25 %	25 %	25 %	25 %	434402356
3096	NC_019757	AT	3	6	195161	195166	50 %	50 %	0 %	0 %	434402356
3097	NC_019757	GCT	2	6	195178	195183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402356
3098	NC_019757	CTG	2	6	195191	195196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402356
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3100	NC_019757	TGT	2	6	195272	195277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402356
3101	NC_019757	GCT	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402356
3102	NC_019757	GTC	2	6	195331	195336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402356
3103	NC_019757	TAG	2	6	195341	195346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402356
3104	NC_019757	CT	3	6	195367	195372	0 %	50 %	0 %	50 %	434402356
3105	NC_019757	TTC	2	6	195411	195416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402356
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3107	NC_019757	GTTG	2	8	195445	195452	0 %	50 %	50 %	0 %	434402356
3108	NC_019757	TAA	2	6	195607	195612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402357
3109	NC_019757	TGA	2	6	195652	195657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402357
3110	NC_019757	GTT	2	6	195665	195670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402357
3111	NC_019757	ACA	2	6	195712	195717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402357
3112	NC_019757	CAAG	2	8	195725	195732	50 %	0 %	25 %	25 %	434402357
3113	NC_019757	A	6	6	195867	195872	100 %	0 %	0 %	0 %	434402357
3114	NC_019757	GAT	2	6	195890	195895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402357
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3116	NC_019757	TGG	2	6	195923	195928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402357
3117	NC_019757	GGC	2	6	195971	195976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402357
3118	NC_019757	TCC	2	6	196021	196026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402357
3119	NC_019757	C	6	6	196047	196052	0 %	0 %	0 %	100 %	434402357
3120	NC_019757	TGG	2	6	196068	196073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402357
3121	NC_019757	AAG	2	6	196218	196223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402357
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3247	NC_019757	CCAC	2	8	203711	203718	25 %	0 %	0 %	75 %	434402363
3248	NC_019757	TGC	2	6	203719	203724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402363
3249	NC_019757	GCG	2	6	203926	203931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402363
3250	NC_019757	T	6	6	203949	203954	0 %	100 %	0 %	0 %	434402363
3251	NC_019757	GAG	2	6	204526	204531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402364
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3254	NC_019757	GTA	2	6	204821	204826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402364
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3256	NC_019757	AAT	2	6	204961	204966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402364
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3274	NC_019757	GCT	2	6	206658	206663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402367
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3276	NC_019757	TGG	2	6	206747	206752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402367
3277	NC_019757	TGTC	2	8	206757	206764	0 %	50 %	25 %	25 %	434402367
3278	NC_019757	ATG	2	6	206780	206785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402367
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3280	NC_019757	GTGAAG	2	12	206828	206839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434402367
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3284	NC_019757	TGC	3	9	206988	206996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402367
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3358	NC_019757	GATT	2	8	211846	211853	25 %	50 %	25 %	0 %	434402369
3359	NC_019757	TCTCT	2	10	211860	211869	0 %	60 %	0 %	40 %	434402369
3360	NC_019757	T	6	6	211903	211908	0 %	100 %	0 %	0 %	434402369
3361	NC_019757	TTTAT	2	10	211934	211943	20 %	80 %	0 %	0 %	434402369
3362	NC_019757	T	8	8	211946	211953	0 %	100 %	0 %	0 %	434402369
3363	NC_019757	ATC	2	6	211956	211961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402369
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3365	NC_019757	GAA	2	6	212024	212029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402370
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3367	NC_019757	GAC	2	6	212117	212122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402370
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3482	NC_019757	TGC	2	6	220544	220549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402378
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3486	NC_019757	GGGA	2	8	220855	220862	25 %	0 %	75 %	0 %	434402378
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3488	NC_019757	TGG	2	6	221029	221034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402378
3489	NC_019757	A	7	7	221049	221055	100 %	0 %	0 %	0 %	434402378
3490	NC_019757	CCG	2	6	221122	221127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402378
3491	NC_019757	AGT	2	6	221154	221159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402378
3492	NC_019757	GCC	2	6	221169	221174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402378
3493	NC_019757	GTG	3	9	221212	221220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402378
3494	NC_019757	ATC	2	6	221336	221341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402378
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3499	NC_019757	TAA	2	6	221672	221677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402378
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