MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 109689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019757	T	6	6	97575	97580	0 %	100 %	0 %	0 %	434402267
1502	NC_019757	TCT	2	6	97608	97613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402267
1503	NC_019757	CAT	2	6	97656	97661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402267
1504	NC_019757	AAC	2	6	97677	97682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402267
1505	NC_019757	T	6	6	97843	97848	0 %	100 %	0 %	0 %	434402267
1506	NC_019757	GAA	2	6	97915	97920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402267
1507	NC_019757	A	6	6	97940	97945	100 %	0 %	0 %	0 %	434402267
1508	NC_019757	GCA	2	6	97960	97965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402267
1509	NC_019757	T	7	7	98001	98007	0 %	100 %	0 %	0 %	434402267
1510	NC_019757	GATTT	2	10	98075	98084	20 %	60 %	20 %	0 %	434402267
1511	NC_019757	GGA	2	6	98473	98478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402268
1512	NC_019757	TAG	2	6	98530	98535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402268
1513	NC_019757	TTAA	2	8	98537	98544	50 %	50 %	0 %	0 %	434402268
1514	NC_019757	GTT	2	6	98607	98612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402268
1515	NC_019757	T	6	6	98627	98632	0 %	100 %	0 %	0 %	434402268
1516	NC_019757	TTTAAC	2	12	98641	98652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434402268
1517	NC_019757	T	8	8	98653	98660	0 %	100 %	0 %	0 %	434402268
1518	NC_019757	CAAC	2	8	98693	98700	50 %	0 %	0 %	50 %	434402269
1519	NC_019757	CCA	2	6	98735	98740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402269
1520	NC_019757	GTA	2	6	98748	98753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402269
1521	NC_019757	CAA	2	6	98759	98764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402269
1522	NC_019757	GTG	2	6	98800	98805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402269
1523	NC_019757	TGA	2	6	98839	98844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402269
1524	NC_019757	TGC	2	6	98865	98870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402269
1525	NC_019757	CTG	2	6	98872	98877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402269
1526	NC_019757	TTA	2	6	98946	98951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402269
1527	NC_019757	GTA	2	6	98975	98980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402269
1528	NC_019757	ATA	2	6	99024	99029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402269
1529	NC_019757	T	6	6	99034	99039	0 %	100 %	0 %	0 %	434402269
1530	NC_019757	TCT	2	6	99125	99130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402270
1531	NC_019757	CACC	2	8	99139	99146	25 %	0 %	0 %	75 %	434402270
1532	NC_019757	ACA	2	6	99213	99218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402270
1533	NC_019757	GGA	2	6	99271	99276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402270
1534	NC_019757	GCT	2	6	99390	99395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402270
1535	NC_019757	AGA	2	6	99448	99453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402270
1536	NC_019757	GCG	2	6	99492	99497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402270
1537	NC_019757	CGC	2	6	99571	99576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402270
1538	NC_019757	CT	3	6	99587	99592	0 %	50 %	0 %	50 %	434402270
1539	NC_019757	GTC	2	6	99593	99598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402270
1540	NC_019757	AAT	2	6	99605	99610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402270
1541	NC_019757	G	6	6	99612	99617	0 %	0 %	100 %	0 %	434402270
1542	NC_019757	ATT	2	6	99657	99662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402270
1543	NC_019757	CTACTT	2	12	99728	99739	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434402271
1544	NC_019757	GTT	2	6	99883	99888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402271
1545	NC_019757	TTGGT	2	10	100142	100151	0 %	60 %	40 %	0 %	434402271
1546	NC_019757	GCA	2	6	100171	100176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402271
1547	NC_019757	TATT	2	8	100199	100206	25 %	75 %	0 %	0 %	434402271
1548	NC_019757	TCC	2	6	100219	100224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402271
1549	NC_019757	GAT	2	6	100687	100692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402272
1550	NC_019757	GCAAT	2	10	100700	100709	40 %	20 %	20 %	20 %	434402272
1551	NC_019757	CTA	2	6	100712	100717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402272
1552	NC_019757	GA	3	6	100776	100781	50 %	0 %	50 %	0 %	434402272
1553	NC_019757	TC	3	6	100799	100804	0 %	50 %	0 %	50 %	434402272
1554	NC_019757	ATG	2	6	100826	100831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402272
1555	NC_019757	A	7	7	100835	100841	100 %	0 %	0 %	0 %	434402272
1556	NC_019757	CAA	2	6	100906	100911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402272
1557	NC_019757	CAA	2	6	100996	101001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402272
1558	NC_019757	GCT	2	6	101029	101034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402272
1559	NC_019757	GGC	2	6	101058	101063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402272
1560	NC_019757	CCA	2	6	101103	101108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402272
1561	NC_019757	GCA	2	6	101206	101211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402272
1562	NC_019757	GTA	2	6	101221	101226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402272
1563	NC_019757	GAA	3	9	101404	101412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402272
1564	NC_019757	ATG	2	6	101468	101473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402272
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1566	NC_019757	AAT	2	6	101620	101625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402272
1567	NC_019757	CAG	2	6	101686	101691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402272
1568	NC_019757	TGCT	2	8	101845	101852	0 %	50 %	25 %	25 %	434402273
1569	NC_019757	AATT	2	8	102012	102019	50 %	50 %	0 %	0 %	434402273
1570	NC_019757	ATT	2	6	102027	102032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402273
1571	NC_019757	T	6	6	102075	102080	0 %	100 %	0 %	0 %	434402273
1572	NC_019757	G	6	6	102150	102155	0 %	0 %	100 %	0 %	434402273
1573	NC_019757	TTCT	2	8	102615	102622	0 %	75 %	0 %	25 %	434402274
1574	NC_019757	AGGG	2	8	102695	102702	25 %	0 %	75 %	0 %	434402274
1575	NC_019757	GTA	2	6	102708	102713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402274
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1578	NC_019757	CGCC	2	8	102824	102831	0 %	0 %	25 %	75 %	434402274
1579	NC_019757	TGGA	2	8	102895	102902	25 %	25 %	50 %	0 %	434402274
1580	NC_019757	CCA	2	6	102959	102964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402274
1581	NC_019757	ACT	2	6	102986	102991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402274
1582	NC_019757	TTG	2	6	103024	103029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402274
1583	NC_019757	GCA	2	6	103049	103054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402274
1584	NC_019757	ATAATC	2	12	103109	103120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434402274
1585	NC_019757	ATC	2	6	103126	103131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402274
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1587	NC_019757	CCAT	2	8	103242	103249	25 %	25 %	0 %	50 %	434402274
1588	NC_019757	TTC	2	6	103267	103272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402274
1589	NC_019757	GCTG	2	8	103274	103281	0 %	25 %	50 %	25 %	434402274
1590	NC_019757	ACC	2	6	103300	103305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402274
1591	NC_019757	TGTGG	2	10	103354	103363	0 %	40 %	60 %	0 %	434402274
1592	NC_019757	GCAT	2	8	103379	103386	25 %	25 %	25 %	25 %	434402274
1593	NC_019757	CTG	2	6	103392	103397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402274
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1595	NC_019757	AC	3	6	103557	103562	50 %	0 %	0 %	50 %	434402274
1596	NC_019757	CAA	2	6	103566	103571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402274
1597	NC_019757	GGC	2	6	103573	103578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402274
1598	NC_019757	GGC	2	6	103623	103628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402274
1599	NC_019757	ACTC	2	8	104141	104148	25 %	25 %	0 %	50 %	434402275
1600	NC_019757	CCAA	2	8	104149	104156	50 %	0 %	0 %	50 %	434402275
1601	NC_019757	AAAG	2	8	104183	104190	75 %	0 %	25 %	0 %	434402275
1602	NC_019757	A	7	7	104259	104265	100 %	0 %	0 %	0 %	434402275
1603	NC_019757	AAG	2	6	104277	104282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402275
1604	NC_019757	GCA	2	6	104298	104303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402275
1605	NC_019757	TGA	2	6	104322	104327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402275
1606	NC_019757	ATCC	2	8	104373	104380	25 %	25 %	0 %	50 %	434402275
1607	NC_019757	ATC	2	6	104448	104453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402275
1608	NC_019757	CTA	2	6	104467	104472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402275
1609	NC_019757	CCG	2	6	104477	104482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402275
1610	NC_019757	TAA	2	6	104585	104590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402275
1611	NC_019757	ACA	2	6	104605	104610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402275
1612	NC_019757	GCA	2	6	104679	104684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402275
1613	NC_019757	TAA	3	9	104752	104760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402275
1614	NC_019757	GTC	2	6	104792	104797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402275
1615	NC_019757	AAATT	2	10	104826	104835	60 %	40 %	0 %	0 %	434402275
1616	NC_019757	GA	3	6	104899	104904	50 %	0 %	50 %	0 %	434402275
1617	NC_019757	TCC	2	6	104958	104963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402275
1618	NC_019757	TCA	2	6	104973	104978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402275
1619	NC_019757	CGG	2	6	105056	105061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402275
1620	NC_019757	AGT	2	6	105075	105080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402275
1621	NC_019757	ATC	2	6	105084	105089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402275
1622	NC_019757	GTCC	2	8	105090	105097	0 %	25 %	25 %	50 %	434402275
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1991	NC_019757	AAT	2	6	127220	127225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402298
1992	NC_019757	GTTA	2	8	127349	127356	25 %	50 %	25 %	0 %	434402298
1993	NC_019757	T	6	6	127388	127393	0 %	100 %	0 %	0 %	434402298
1994	NC_019757	CAC	2	6	127486	127491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402298
1995	NC_019757	AGC	2	6	127511	127516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402298
1996	NC_019757	CATAG	2	10	127625	127634	40 %	20 %	20 %	20 %	434402298
1997	NC_019757	GCAAAG	2	12	127764	127775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434402298
1998	NC_019757	ATG	2	6	127884	127889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402298
1999	NC_019757	CAAAGG	2	12	127891	127902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434402298
2000	NC_019757	CTG	2	6	127912	127917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402298

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