MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	ACT	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308219
2	NC_019755	TGC	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308219
3	NC_019755	ACT	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308219
4	NC_019755	TAG	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308219
5	NC_019755	AAG	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308219
6	NC_019755	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308219
7	NC_019755	CCA	2	6	720	725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308219
8	NC_019755	TTA	2	6	783	788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308219
9	NC_019755	TAA	2	6	800	805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308219
10	NC_019755	TGG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308220
11	NC_019755	AAT	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308220
12	NC_019755	ATT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308220
13	NC_019755	AAT	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308220
14	NC_019755	TCA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308220
15	NC_019755	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308221
16	NC_019755	CTC	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308221
17	NC_019755	AGG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308221
18	NC_019755	TGG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308222
19	NC_019755	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
20	NC_019755	ATT	2	6	2363	2368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
21	NC_019755	ACT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
22	NC_019755	TGA	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
23	NC_019755	ACA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308222
24	NC_019755	ACT	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
25	NC_019755	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
26	NC_019755	GTG	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308222
27	NC_019755	ACA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308222
28	NC_019755	CAG	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
29	NC_019755	GAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
30	NC_019755	GCT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308222
31	NC_019755	TAC	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
32	NC_019755	ATT	2	6	3294	3299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
33	NC_019755	ACT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
34	NC_019755	GAA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
35	NC_019755	CAG	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
36	NC_019755	AAG	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
37	NC_019755	AAT	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308222
38	NC_019755	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
39	NC_019755	AGA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
40	NC_019755	ACT	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
41	NC_019755	GAT	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
42	NC_019755	CAT	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
43	NC_019755	TTA	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
44	NC_019755	GAC	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
45	NC_019755	ATT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
46	NC_019755	TGA	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
47	NC_019755	CCA	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308222
48	NC_019755	GAC	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
49	NC_019755	GAC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
50	NC_019755	ATC	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
51	NC_019755	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308222
52	NC_019755	TTA	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
53	NC_019755	CTA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
54	NC_019755	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
55	NC_019755	GTA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
56	NC_019755	AGT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
57	NC_019755	AAG	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
58	NC_019755	AGC	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308223
59	NC_019755	TGT	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308223
60	NC_019755	TGC	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308223
61	NC_019755	CTA	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308223
62	NC_019755	AAT	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308223
63	NC_019755	CAA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308223
64	NC_019755	TGT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308223
65	NC_019755	TAA	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308223
66	NC_019755	AGC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
67	NC_019755	TGG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308224
68	NC_019755	TGC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308224
69	NC_019755	CTA	2	6	6170	6175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308224
70	NC_019755	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
71	NC_019755	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308224
72	NC_019755	AGT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
73	NC_019755	GTA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
74	NC_019755	CAC	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308224
75	NC_019755	AGC	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
76	NC_019755	TAG	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
77	NC_019755	ACG	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
78	NC_019755	CAA	2	6	6709	6714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308224
79	NC_019755	CAC	2	6	6741	6746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308224
80	NC_019755	TGA	2	6	7463	7468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308225
81	NC_019755	TAA	2	6	7500	7505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308225
82	NC_019755	TAG	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308225
83	NC_019755	AAC	2	6	7739	7744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308225
84	NC_019755	TAA	2	6	7790	7795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308225
85	NC_019755	TCT	2	6	7842	7847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308225
86	NC_019755	TTG	2	6	7940	7945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308225
87	NC_019755	AAG	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308225
88	NC_019755	CTA	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308225
89	NC_019755	AGA	2	6	8193	8198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308225
90	NC_019755	GAG	2	6	8215	8220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308225
91	NC_019755	AGC	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308225
92	NC_019755	CTT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308226
93	NC_019755	AGA	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308226
94	NC_019755	AGA	2	6	9419	9424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308226
95	NC_019755	AAT	2	6	9425	9430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308226
96	NC_019755	TAA	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308226
97	NC_019755	AAG	2	6	9511	9516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308226
98	NC_019755	CTG	2	6	9589	9594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308226
99	NC_019755	AGA	2	6	9662	9667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308226
100	NC_019755	CAA	2	6	9882	9887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308227
101	NC_019755	TAA	2	6	9927	9932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308227
102	NC_019755	TCT	2	6	9959	9964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308227
103	NC_019755	TTC	2	6	10030	10035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308227
104	NC_019755	TGT	2	6	10080	10085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308227
105	NC_019755	ATT	2	6	10094	10099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308227
106	NC_019755	TGT	2	6	10418	10423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308228
107	NC_019755	GAA	2	6	10464	10469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308228
108	NC_019755	GAT	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308228
109	NC_019755	CAG	2	6	10651	10656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308228
110	NC_019755	AGC	2	6	10748	10753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308228
111	NC_019755	GTG	2	6	10881	10886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308229
112	NC_019755	ACT	2	6	11490	11495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308230
113	NC_019755	GCA	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308230
114	NC_019755	TCG	2	6	11768	11773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308230
115	NC_019755	ATT	2	6	11936	11941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308230
116	NC_019755	TAT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308230
117	NC_019755	ACT	2	6	15488	15493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308231
118	NC_019755	AAT	2	6	15542	15547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308231
119	NC_019755	GTC	2	6	15565	15570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308231
120	NC_019755	CGA	2	6	15585	15590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308231
121	NC_019755	ATA	2	6	15886	15891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308231
122	NC_019755	GAT	2	6	15919	15924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308231
123	NC_019755	AAT	2	6	16543	16548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308232
124	NC_019755	AAG	2	6	16722	16727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308232
125	NC_019755	ACT	2	6	16747	16752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308232
126	NC_019755	TCG	2	6	16796	16801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308232
127	NC_019755	TTC	2	6	17127	17132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308232
128	NC_019755	CTG	2	6	17151	17156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308232
129	NC_019755	CAG	2	6	17234	17239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308232
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.