MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 88035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019753	CTG	3	9	216092	216100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303859
3502	NC_019753	AGA	2	6	216123	216128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303859
3503	NC_019753	ACT	2	6	216160	216165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303859
3504	NC_019753	TTAA	2	8	216205	216212	50 %	50 %	0 %	0 %	428303859
3505	NC_019753	CAG	2	6	216266	216271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303859
3506	NC_019753	TTA	2	6	216277	216282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303859
3507	NC_019753	CCA	2	6	216340	216345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303859
3508	NC_019753	TGC	2	6	216386	216391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303859
3509	NC_019753	ATC	2	6	216537	216542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303859
3510	NC_019753	CCG	2	6	216571	216576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303859
3511	NC_019753	CTA	2	6	216914	216919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303859
3512	NC_019753	TAT	2	6	216968	216973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303859
3513	NC_019753	AAAT	2	8	216982	216989	75 %	25 %	0 %	0 %	428303859
3514	NC_019753	CAC	2	6	217031	217036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303859
3515	NC_019753	TAC	2	6	217041	217046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303859
3516	NC_019753	ATA	2	6	217137	217142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303859
3517	NC_019753	ACTG	2	8	217163	217170	25 %	25 %	25 %	25 %	428303859
3518	NC_019753	AGT	2	6	217173	217178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303859
3519	NC_019753	CGT	2	6	217185	217190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303859
3520	NC_019753	AT	3	6	217201	217206	50 %	50 %	0 %	0 %	428303859
3521	NC_019753	CCA	2	6	217249	217254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303859
3522	NC_019753	T	6	6	217634	217639	0 %	100 %	0 %	0 %	428303860
3523	NC_019753	GGT	2	6	217704	217709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303860
3524	NC_019753	CGA	2	6	217731	217736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303860
3525	NC_019753	AGT	2	6	217746	217751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303860
3526	NC_019753	TAA	2	6	217832	217837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303860
3527	NC_019753	CAA	2	6	217863	217868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303860
3528	NC_019753	AATT	2	8	217933	217940	50 %	50 %	0 %	0 %	428303860
3529	NC_019753	AGA	2	6	217967	217972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303860
3530	NC_019753	ATTAC	2	10	217980	217989	40 %	40 %	0 %	20 %	428303860
3531	NC_019753	TCA	2	6	218060	218065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303860
3532	NC_019753	A	6	6	218130	218135	100 %	0 %	0 %	0 %	428303860
3533	NC_019753	AGG	2	6	218146	218151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303860
3534	NC_019753	CGC	2	6	218163	218168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303860
3535	NC_019753	TAC	2	6	218169	218174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303860
3536	NC_019753	CTG	2	6	218224	218229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303860
3537	NC_019753	CAA	2	6	218234	218239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303860
3538	NC_019753	ATGGC	2	10	218247	218256	20 %	20 %	40 %	20 %	428303860
3539	NC_019753	TTA	2	6	218298	218303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303860
3540	NC_019753	GTC	2	6	218342	218347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303860
3541	NC_019753	GAA	2	6	218587	218592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
3542	NC_019753	GGAA	2	8	218652	218659	50 %	0 %	50 %	0 %	428303861
3543	NC_019753	GCC	2	6	218668	218673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303861
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3545	NC_019753	AGA	2	6	218811	218816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
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3548	NC_019753	GTC	2	6	219125	219130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
3549	NC_019753	AAT	2	6	219139	219144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303861
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3551	NC_019753	AGA	2	6	219237	219242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
3552	NC_019753	GTC	2	6	219250	219255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
3553	NC_019753	TAG	2	6	219275	219280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303861
3554	NC_019753	GAA	2	6	219307	219312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
3555	NC_019753	TACA	2	8	219377	219384	50 %	25 %	0 %	25 %	428303861
3556	NC_019753	TGGTGC	2	12	219390	219401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428303861
3557	NC_019753	ACC	2	6	219478	219483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303861
3558	NC_019753	TGC	2	6	219516	219521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
3559	NC_019753	TGG	2	6	219548	219553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303861
3560	NC_019753	TGA	2	6	219567	219572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303861
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3563	NC_019753	TGA	2	6	219720	219725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303861
3564	NC_019753	AAG	2	6	219913	219918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
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3569	NC_019753	CTG	2	6	220039	220044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
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3588	NC_019753	CT	3	6	220897	220902	0 %	50 %	0 %	50 %	428303861
3589	NC_019753	GCA	2	6	220924	220929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303861
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3591	NC_019753	TAC	2	6	220988	220993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303861
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3593	NC_019753	CCTT	2	8	221358	221365	0 %	50 %	0 %	50 %	428303862
3594	NC_019753	TTC	2	6	221390	221395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303862
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3599	NC_019753	ATTC	2	8	221522	221529	25 %	50 %	0 %	25 %	428303862
3600	NC_019753	TCC	2	6	221531	221536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303863
3601	NC_019753	CCT	2	6	221538	221543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303863
3602	NC_019753	A	6	6	221551	221556	100 %	0 %	0 %	0 %	428303863
3603	NC_019753	CTG	2	6	221557	221562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303863
3604	NC_019753	CCAT	2	8	221668	221675	25 %	25 %	0 %	50 %	428303863
3605	NC_019753	AG	3	6	221685	221690	50 %	0 %	50 %	0 %	428303863
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3611	NC_019753	GGT	2	6	222199	222204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303864
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3616	NC_019753	CGGT	2	8	222509	222516	0 %	25 %	50 %	25 %	428303864
3617	NC_019753	CAG	2	6	222562	222567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303864
3618	NC_019753	AAGA	2	8	222817	222824	75 %	0 %	25 %	0 %	428303865
3619	NC_019753	TTA	2	6	222832	222837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303865
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3621	NC_019753	GCTG	2	8	222901	222908	0 %	25 %	50 %	25 %	428303865
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3984	NC_019753	AAC	2	6	242842	242847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303878
3985	NC_019753	GGT	2	6	242987	242992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303878
3986	NC_019753	TCT	2	6	242995	243000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303878
3987	NC_019753	AGC	2	6	243019	243024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303878
3988	NC_019753	AGC	2	6	243040	243045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303878
3989	NC_019753	AGA	2	6	243073	243078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303878
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3999	NC_019753	TTG	2	6	243656	243661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303879
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