MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 88035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019753	CGG	2	6	184963	184968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303830
3002	NC_019753	CCA	2	6	184985	184990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303830
3003	NC_019753	GGTT	2	8	185210	185217	0 %	50 %	50 %	0 %	428303831
3004	NC_019753	CCCTA	2	10	185233	185242	20 %	20 %	0 %	60 %	428303831
3005	NC_019753	CCA	2	6	185250	185255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303831
3006	NC_019753	TCA	2	6	185262	185267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303831
3007	NC_019753	TTG	2	6	185330	185335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303831
3008	NC_019753	CAA	2	6	185341	185346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303831
3009	NC_019753	CAT	2	6	185347	185352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303831
3010	NC_019753	AGT	2	6	185362	185367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303831
3011	NC_019753	CTT	2	6	185370	185375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303831
3012	NC_019753	AGC	2	6	185413	185418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303831
3013	NC_019753	CGG	2	6	185443	185448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303831
3014	NC_019753	CTT	2	6	185473	185478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303831
3015	NC_019753	AGC	3	9	185572	185580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303831
3016	NC_019753	CAG	2	6	185583	185588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303831
3017	NC_019753	ACA	2	6	185688	185693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303831
3018	NC_019753	GT	3	6	185730	185735	0 %	50 %	50 %	0 %	428303831
3019	NC_019753	GGT	2	6	185738	185743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303831
3020	NC_019753	ACC	2	6	185798	185803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303831
3021	NC_019753	AAG	3	9	185841	185849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303831
3022	NC_019753	ACA	2	6	185856	185861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303831
3023	NC_019753	CAT	2	6	185907	185912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303831
3024	NC_019753	CAA	2	6	185914	185919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303831
3025	NC_019753	CTT	2	6	185935	185940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303831
3026	NC_019753	AGT	2	6	185956	185961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303831
3027	NC_019753	TTCAAC	2	12	186017	186028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303831
3028	NC_019753	CAGT	2	8	186029	186036	25 %	25 %	25 %	25 %	428303831
3029	NC_019753	CAT	2	6	186076	186081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303831
3030	NC_019753	GCT	2	6	186149	186154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303831
3031	NC_019753	A	6	6	186677	186682	100 %	0 %	0 %	0 %	428303832
3032	NC_019753	TAG	2	6	186692	186697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303832
3033	NC_019753	GAGT	2	8	186779	186786	25 %	25 %	50 %	0 %	428303832
3034	NC_019753	GGT	2	6	186826	186831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303832
3035	NC_019753	CGC	2	6	186897	186902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303832
3036	NC_019753	A	6	6	186908	186913	100 %	0 %	0 %	0 %	428303832
3037	NC_019753	TGG	2	6	186981	186986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303832
3038	NC_019753	TGT	2	6	187032	187037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303832
3039	NC_019753	AGCCTT	2	12	187038	187049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428303832
3040	NC_019753	AAG	2	6	187063	187068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303832
3041	NC_019753	AAG	2	6	187106	187111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303832
3042	NC_019753	TAA	2	6	187116	187121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303832
3043	NC_019753	TGC	2	6	187143	187148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303832
3044	NC_019753	TGG	2	6	187245	187250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303832
3045	NC_019753	CAA	2	6	187286	187291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303832
3046	NC_019753	GGT	2	6	187297	187302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303832
3047	NC_019753	GAT	2	6	187303	187308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303832
3048	NC_019753	TAC	2	6	187355	187360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303832
3049	NC_019753	AC	3	6	187586	187591	50 %	0 %	0 %	50 %	428303832
3050	NC_019753	AAG	2	6	187652	187657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303832
3051	NC_019753	CT	3	6	187685	187690	0 %	50 %	0 %	50 %	428303832
3052	NC_019753	CAG	2	6	187726	187731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303832
3053	NC_019753	TTC	2	6	187735	187740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303832
3054	NC_019753	CTC	2	6	187939	187944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303833
3055	NC_019753	CTTGGC	2	12	187996	188007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303833
3056	NC_019753	ATG	2	6	188134	188139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303833
3057	NC_019753	GCT	2	6	188163	188168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303833
3058	NC_019753	TGC	2	6	188246	188251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303833
3059	NC_019753	GTT	2	6	188418	188423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303833
3060	NC_019753	CAA	2	6	188445	188450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303833
3061	NC_019753	GAA	2	6	188466	188471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303833
3062	NC_019753	ACC	2	6	188525	188530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303833
3063	NC_019753	TTG	2	6	188605	188610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303833
3064	NC_019753	GAC	2	6	188764	188769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303833
3065	NC_019753	TCA	2	6	188827	188832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303834
3066	NC_019753	A	7	7	188832	188838	100 %	0 %	0 %	0 %	428303834
3067	NC_019753	AGT	2	6	188862	188867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303834
3068	NC_019753	ATT	2	6	188904	188909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303834
3069	NC_019753	AAG	2	6	188945	188950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303834
3070	NC_019753	T	7	7	188961	188967	0 %	100 %	0 %	0 %	428303834
3071	NC_019753	AAC	2	6	188968	188973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303834
3072	NC_019753	GTC	2	6	189031	189036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303834
3073	NC_019753	AGC	2	6	189213	189218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303834
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3076	NC_019753	AAG	3	9	189332	189340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303834
3077	NC_019753	TTG	2	6	189518	189523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303834
3078	NC_019753	CTTC	2	8	189554	189561	0 %	50 %	0 %	50 %	428303834
3079	NC_019753	TTGC	2	8	189574	189581	0 %	50 %	25 %	25 %	428303834
3080	NC_019753	TTA	2	6	189593	189598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303834
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3083	NC_019753	ACAAT	2	10	189792	189801	60 %	20 %	0 %	20 %	428303835
3084	NC_019753	TGGT	2	8	189934	189941	0 %	50 %	50 %	0 %	428303835
3085	NC_019753	CAA	2	6	189968	189973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303835
3086	NC_019753	ACCA	2	8	190259	190266	50 %	0 %	0 %	50 %	428303836
3087	NC_019753	AAG	2	6	190303	190308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303836
3088	NC_019753	GAT	2	6	190389	190394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303836
3089	NC_019753	ACT	2	6	190412	190417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303836
3090	NC_019753	CAA	2	6	190423	190428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303836
3091	NC_019753	AGA	2	6	190457	190462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303836
3092	NC_019753	TAC	2	6	190594	190599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303837
3093	NC_019753	TCA	2	6	190696	190701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303837
3094	NC_019753	ACT	2	6	190746	190751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303837
3095	NC_019753	TGC	2	6	190827	190832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303837
3096	NC_019753	CCA	2	6	190873	190878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303837
3097	NC_019753	AGAA	2	8	190964	190971	75 %	0 %	25 %	0 %	428303837
3098	NC_019753	CAT	2	6	191045	191050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303837
3099	NC_019753	AAT	2	6	191060	191065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303837
3100	NC_019753	CTG	2	6	191116	191121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303837
3101	NC_019753	TCA	3	9	191181	191189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303837
3102	NC_019753	AGC	2	6	191193	191198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303837
3103	NC_019753	TGT	2	6	191233	191238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303837
3104	NC_019753	CAC	2	6	191897	191902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303838
3105	NC_019753	TTTG	2	8	192044	192051	0 %	75 %	25 %	0 %	428303838
3106	NC_019753	A	6	6	192221	192226	100 %	0 %	0 %	0 %	428303838
3107	NC_019753	ATT	2	6	192308	192313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303838
3108	NC_019753	CTG	2	6	192420	192425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303838
3109	NC_019753	ATC	2	6	192496	192501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303838
3110	NC_019753	TTTA	2	8	192708	192715	25 %	75 %	0 %	0 %	428303839
3111	NC_019753	TTC	2	6	192724	192729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303839
3112	NC_019753	CA	3	6	192914	192919	50 %	0 %	0 %	50 %	428303839
3113	NC_019753	AATG	2	8	192927	192934	50 %	25 %	25 %	0 %	428303839
3114	NC_019753	ATTT	2	8	193157	193164	25 %	75 %	0 %	0 %	428303839
3115	NC_019753	T	6	6	193316	193321	0 %	100 %	0 %	0 %	428303840
3116	NC_019753	GTA	2	6	193323	193328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303840
3117	NC_019753	ATG	2	6	193363	193368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303840
3118	NC_019753	ACGC	2	8	193449	193456	25 %	0 %	25 %	50 %	428303840
3119	NC_019753	AGT	2	6	193803	193808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303840
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3121	NC_019753	CAG	2	6	193931	193936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303840
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3488	NC_019753	GTC	2	6	215297	215302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303858
3489	NC_019753	TCA	2	6	215375	215380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303858
3490	NC_019753	ATC	2	6	215402	215407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303858
3491	NC_019753	CCA	2	6	215448	215453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303858
3492	NC_019753	ACG	2	6	215488	215493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303858
3493	NC_019753	AAC	2	6	215504	215509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303858
3494	NC_019753	GCG	2	6	215545	215550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303858
3495	NC_019753	ACC	2	6	215567	215572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303858
3496	NC_019753	GTT	2	6	215637	215642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303858
3497	NC_019753	ACTG	2	8	215644	215651	25 %	25 %	25 %	25 %	428303858
3498	NC_019753	GCT	2	6	215654	215659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303858
3499	NC_019753	AAT	2	6	215710	215715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303858
3500	NC_019753	AGC	2	6	215717	215722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303858

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