MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 88035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019753	ACA	2	6	95328	95333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303755
1502	NC_019753	TCC	2	6	95370	95375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303755
1503	NC_019753	CAA	2	6	95559	95564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303756
1504	NC_019753	ATC	2	6	95575	95580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303756
1505	NC_019753	TCT	2	6	95726	95731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303756
1506	NC_019753	AGT	2	6	95751	95756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303756
1507	NC_019753	CTCG	2	8	95769	95776	0 %	25 %	25 %	50 %	428303756
1508	NC_019753	AAT	2	6	95827	95832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303756
1509	NC_019753	CTG	3	9	95838	95846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303756
1510	NC_019753	AGC	2	6	95854	95859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303756
1511	NC_019753	GCT	2	6	95891	95896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303756
1512	NC_019753	CTA	2	6	95946	95951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303756
1513	NC_019753	TTA	2	6	96017	96022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303756
1514	NC_019753	ACTT	2	8	96054	96061	25 %	50 %	0 %	25 %	428303756
1515	NC_019753	TC	3	6	96113	96118	0 %	50 %	0 %	50 %	428303756
1516	NC_019753	T	7	7	96195	96201	0 %	100 %	0 %	0 %	428303756
1517	NC_019753	TCTA	2	8	96264	96271	25 %	50 %	0 %	25 %	428303757
1518	NC_019753	TAG	2	6	96277	96282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303757
1519	NC_019753	CAA	2	6	96289	96294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303757
1520	NC_019753	GTT	2	6	96553	96558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303757
1521	NC_019753	T	6	6	96584	96589	0 %	100 %	0 %	0 %	428303757
1522	NC_019753	ATC	2	6	96593	96598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303757
1523	NC_019753	AGT	2	6	96683	96688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303757
1524	NC_019753	ACTA	2	8	96689	96696	50 %	25 %	0 %	25 %	428303757
1525	NC_019753	TAA	2	6	96721	96726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303757
1526	NC_019753	T	7	7	96727	96733	0 %	100 %	0 %	0 %	428303757
1527	NC_019753	GTG	2	6	97466	97471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303758
1528	NC_019753	ATTG	2	8	97508	97515	25 %	50 %	25 %	0 %	428303758
1529	NC_019753	AATT	2	8	97594	97601	50 %	50 %	0 %	0 %	428303758
1530	NC_019753	ATC	2	6	97642	97647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
1531	NC_019753	TGT	2	6	97689	97694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303758
1532	NC_019753	AGA	2	6	98012	98017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303758
1533	NC_019753	TCAC	2	8	98150	98157	25 %	25 %	0 %	50 %	428303758
1534	NC_019753	ACT	2	6	98256	98261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
1535	NC_019753	ACT	2	6	98279	98284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303758
1536	NC_019753	AAC	2	6	98432	98437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
1537	NC_019753	CAA	3	9	98481	98489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
1538	NC_019753	TACT	2	8	98575	98582	25 %	50 %	0 %	25 %	428303758
1539	NC_019753	CAG	2	6	98614	98619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303758
1540	NC_019753	CTG	2	6	98647	98652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303758
1541	NC_019753	TTAGAT	2	12	98685	98696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428303758
1542	NC_019753	CAA	2	6	98710	98715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
1543	NC_019753	AATT	2	8	98731	98738	50 %	50 %	0 %	0 %	428303758
1544	NC_019753	ATT	2	6	98744	98749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303758
1545	NC_019753	CCAG	2	8	98756	98763	25 %	0 %	25 %	50 %	428303758
1546	NC_019753	AGTTTG	2	12	98772	98783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303758
1547	NC_019753	ATTT	2	8	98803	98810	25 %	75 %	0 %	0 %	428303758
1548	NC_019753	CAA	2	6	98850	98855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303758
1549	NC_019753	TAT	2	6	98951	98956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303759
1550	NC_019753	AGC	2	6	98965	98970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303759
1551	NC_019753	TCT	2	6	99022	99027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
1552	NC_019753	CTT	2	6	99056	99061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
1553	NC_019753	TCTAA	2	10	99175	99184	40 %	40 %	0 %	20 %	428303759
1554	NC_019753	TAG	2	6	99206	99211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303759
1555	NC_019753	TAAGT	2	10	99234	99243	40 %	40 %	20 %	0 %	428303759
1556	NC_019753	TCTA	2	8	99255	99262	25 %	50 %	0 %	25 %	428303759
1557	NC_019753	CCA	2	6	99291	99296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303759
1558	NC_019753	AC	3	6	99339	99344	50 %	0 %	0 %	50 %	428303759
1559	NC_019753	TCC	2	6	99421	99426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303759
1560	NC_019753	TCT	2	6	99508	99513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
1561	NC_019753	GTATT	2	10	99733	99742	20 %	60 %	20 %	0 %	428303759
1562	NC_019753	T	6	6	99765	99770	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
1563	NC_019753	T	6	6	99778	99783	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
1564	NC_019753	CTT	2	6	99790	99795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
1565	NC_019753	TTG	2	6	99845	99850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303759
1566	NC_019753	TTC	2	6	99855	99860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303759
1567	NC_019753	CTG	2	6	99909	99914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303759
1568	NC_019753	CTG	2	6	99921	99926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303759
1569	NC_019753	TAC	2	6	99966	99971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303759
1570	NC_019753	TGA	2	6	100004	100009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303759
1571	NC_019753	CAT	2	6	100040	100045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303759
1572	NC_019753	TAC	2	6	100046	100051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303759
1573	NC_019753	TAATAG	2	12	100064	100075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428303759
1574	NC_019753	ATAA	2	8	100158	100165	75 %	25 %	0 %	0 %	428303759
1575	NC_019753	T	6	6	100220	100225	0 %	100 %	0 %	0 %	428303759
1576	NC_019753	AT	3	6	100253	100258	50 %	50 %	0 %	0 %	428303759
1577	NC_019753	ATT	2	6	100263	100268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303759
1578	NC_019753	TAA	2	6	100269	100274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303759
1579	NC_019753	CAT	2	6	100584	100589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303760
1580	NC_019753	AAC	2	6	100610	100615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303760
1581	NC_019753	ATC	2	6	100648	100653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303760
1582	NC_019753	AAC	2	6	100687	100692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303760
1583	NC_019753	CCCA	2	8	100694	100701	25 %	0 %	0 %	75 %	428303760
1584	NC_019753	CAAG	2	8	100705	100712	50 %	0 %	25 %	25 %	428303760
1585	NC_019753	TTC	2	6	100726	100731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303760
1586	NC_019753	TGA	2	6	100810	100815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303760
1587	NC_019753	ACA	2	6	100873	100878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303761
1588	NC_019753	TCT	2	6	100951	100956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303761
1589	NC_019753	CTG	2	6	100982	100987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
1590	NC_019753	CCT	2	6	100999	101004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
1591	NC_019753	CTTAC	2	10	101020	101029	20 %	40 %	0 %	40 %	428303761
1592	NC_019753	TCC	3	9	101047	101055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
1593	NC_019753	TCC	2	6	101089	101094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
1594	NC_019753	CCT	2	6	101114	101119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
1595	NC_019753	TCA	2	6	101194	101199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303761
1596	NC_019753	CTA	3	9	101201	101209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303761
1597	NC_019753	GTT	2	6	101234	101239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303761
1598	NC_019753	GCT	2	6	101250	101255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
1599	NC_019753	TCT	2	6	101260	101265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303761
1600	NC_019753	ACC	2	6	101376	101381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303761
1601	NC_019753	CCTAAG	2	12	101416	101427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303761
1602	NC_019753	AAC	2	6	101559	101564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303761
1603	NC_019753	CAA	2	6	101606	101611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303761
1604	NC_019753	TGT	2	6	101626	101631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303761
1605	NC_019753	TGA	2	6	101665	101670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303761
1606	NC_019753	CTG	2	6	101705	101710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
1607	NC_019753	ATA	2	6	101791	101796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303761
1608	NC_019753	AGG	2	6	101809	101814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303761
1609	NC_019753	TCG	2	6	101815	101820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
1610	NC_019753	ACCA	2	8	101915	101922	50 %	0 %	0 %	50 %	428303761
1611	NC_019753	GCT	2	6	102013	102018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
1612	NC_019753	TCT	2	6	102046	102051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303761
1613	NC_019753	CTC	2	6	102058	102063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303761
1614	NC_019753	GCC	2	6	102108	102113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303761
1615	NC_019753	TGCC	2	8	102216	102223	0 %	25 %	25 %	50 %	428303761
1616	NC_019753	CTGCCA	2	12	102267	102278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428303761
1617	NC_019753	TTG	2	6	102321	102326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303761
1618	NC_019753	CAAG	2	8	102364	102371	50 %	0 %	25 %	25 %	428303761
1619	NC_019753	GGAAT	2	10	102376	102385	40 %	20 %	40 %	0 %	428303761
1620	NC_019753	TTTG	2	8	102434	102441	0 %	75 %	25 %	0 %	428303761
1621	NC_019753	CCCG	2	8	102506	102513	0 %	0 %	25 %	75 %	428303761
1622	NC_019753	GCT	2	6	102592	102597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
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1624	NC_019753	CTG	2	6	102615	102620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303761
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