MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 88035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019753	ATTT	2	8	276345	276352	25 %	75 %	0 %	0 %	428303907
4502	NC_019753	CTT	2	6	276367	276372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303907
4503	NC_019753	AGC	2	6	276555	276560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303907
4504	NC_019753	A	7	7	276565	276571	100 %	0 %	0 %	0 %	428303907
4505	NC_019753	GTT	2	6	276578	276583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303907
4506	NC_019753	TGC	2	6	276840	276845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303907
4507	NC_019753	GTG	2	6	276957	276962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303907
4508	NC_019753	TTA	2	6	276977	276982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303907
4509	NC_019753	GCA	2	6	277003	277008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303907
4510	NC_019753	AGA	2	6	277009	277014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303907
4511	NC_019753	TGA	2	6	277063	277068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303907
4512	NC_019753	AGT	2	6	277114	277119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303907
4513	NC_019753	ACA	3	9	277120	277128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303907
4514	NC_019753	CTG	2	6	277160	277165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303907
4515	NC_019753	GTA	2	6	277167	277172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303907
4516	NC_019753	TGTT	2	8	277173	277180	0 %	75 %	25 %	0 %	428303907
4517	NC_019753	CGAGA	2	10	277190	277199	40 %	0 %	40 %	20 %	428303907
4518	NC_019753	GTT	2	6	277268	277273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303907
4519	NC_019753	GAA	2	6	277469	277474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303908
4520	NC_019753	ATT	2	6	277660	277665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4521	NC_019753	TTTGG	2	10	277718	277727	0 %	60 %	40 %	0 %	428303908
4522	NC_019753	CTA	2	6	277761	277766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303908
4523	NC_019753	ACGAG	2	10	277774	277783	40 %	0 %	40 %	20 %	428303908
4524	NC_019753	AGA	2	6	277825	277830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303908
4525	NC_019753	GCT	2	6	277877	277882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4526	NC_019753	TGAAT	2	10	277912	277921	40 %	40 %	20 %	0 %	428303908
4527	NC_019753	TTA	2	6	277961	277966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4528	NC_019753	CTC	2	6	278065	278070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303908
4529	NC_019753	ATT	2	6	278184	278189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4530	NC_019753	CAA	2	6	278222	278227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303908
4531	NC_019753	AGC	2	6	278365	278370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4532	NC_019753	T	6	6	278377	278382	0 %	100 %	0 %	0 %	428303908
4533	NC_019753	GCA	2	6	278387	278392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4534	NC_019753	TTG	2	6	278427	278432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303908
4535	NC_019753	AGC	2	6	278617	278622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4536	NC_019753	TTTA	2	8	278632	278639	25 %	75 %	0 %	0 %	428303908
4537	NC_019753	TCA	2	6	278689	278694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303908
4538	NC_019753	TAC	2	6	278709	278714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303908
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4540	NC_019753	AAC	2	6	278895	278900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303908
4541	NC_019753	AGC	2	6	278910	278915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4542	NC_019753	CGT	2	6	278963	278968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4543	NC_019753	CGC	2	6	279019	279024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303908
4544	NC_019753	ATTA	2	8	279082	279089	50 %	50 %	0 %	0 %	428303908
4545	NC_019753	TGC	2	6	279169	279174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
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4547	NC_019753	TGT	2	6	279190	279195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303908
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4550	NC_019753	GAA	2	6	279377	279382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303908
4551	NC_019753	T	7	7	279383	279389	0 %	100 %	0 %	0 %	428303908
4552	NC_019753	ACG	2	6	279398	279403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4553	NC_019753	T	6	6	279430	279435	0 %	100 %	0 %	0 %	428303908
4554	NC_019753	CT	4	8	279473	279480	0 %	50 %	0 %	50 %	428303908
4555	NC_019753	ATT	2	6	279498	279503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4556	NC_019753	CGA	2	6	279518	279523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4557	NC_019753	TAA	2	6	279541	279546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303908
4558	NC_019753	ATT	2	6	279611	279616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4559	NC_019753	AGT	2	6	279670	279675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4560	NC_019753	AGT	2	6	279724	279729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4561	NC_019753	A	6	6	279750	279755	100 %	0 %	0 %	0 %	428303908
4562	NC_019753	CAATTT	2	12	279795	279806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428303908
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4564	NC_019753	CAATAC	2	12	279942	279953	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428303908
4565	NC_019753	GCGA	2	8	279970	279977	25 %	0 %	50 %	25 %	428303908
4566	NC_019753	AGA	3	9	279988	279996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303908
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4568	NC_019753	A	6	6	280069	280074	100 %	0 %	0 %	0 %	428303908
4569	NC_019753	AATT	2	8	280101	280108	50 %	50 %	0 %	0 %	428303908
4570	NC_019753	GTTTA	2	10	280131	280140	20 %	60 %	20 %	0 %	428303908
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4573	NC_019753	A	8	8	280253	280260	100 %	0 %	0 %	0 %	428303908
4574	NC_019753	AGTGCG	2	12	280273	280284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428303908
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4578	NC_019753	AATT	2	8	280512	280519	50 %	50 %	0 %	0 %	428303908
4579	NC_019753	AGT	2	6	280642	280647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
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4581	NC_019753	AG	3	6	280679	280684	50 %	0 %	50 %	0 %	428303908
4582	NC_019753	ATC	2	6	280689	280694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303908
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4585	NC_019753	TGCTAG	2	12	280999	281010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428303908
4586	NC_019753	TTA	2	6	281051	281056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303908
4587	NC_019753	TC	3	6	281100	281105	0 %	50 %	0 %	50 %	428303908
4588	NC_019753	ACA	2	6	281141	281146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303908
4589	NC_019753	TGG	2	6	281197	281202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303908
4590	NC_019753	TTAGTT	2	12	281217	281228	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428303908
4591	NC_019753	GCT	2	6	281239	281244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4592	NC_019753	TGA	2	6	281257	281262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4593	NC_019753	TC	3	6	281376	281381	0 %	50 %	0 %	50 %	428303908
4594	NC_019753	ATA	2	6	281415	281420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303908
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4596	NC_019753	CTG	2	6	281625	281630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4597	NC_019753	AGCG	2	8	281969	281976	25 %	0 %	50 %	25 %	428303908
4598	NC_019753	TC	3	6	281994	281999	0 %	50 %	0 %	50 %	428303908
4599	NC_019753	TGA	2	6	282028	282033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4600	NC_019753	CTG	2	6	282054	282059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303908
4601	NC_019753	TTAA	2	8	282068	282075	50 %	50 %	0 %	0 %	428303908
4602	NC_019753	ATA	2	6	282156	282161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303908
4603	NC_019753	CAA	2	6	282264	282269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303908
4604	NC_019753	GAT	2	6	282305	282310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4605	NC_019753	AGT	2	6	282409	282414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303908
4606	NC_019753	ATTTAG	2	12	282423	282434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428303908
4607	NC_019753	AAC	2	6	282482	282487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303908
4608	NC_019753	TGG	2	6	282741	282746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303909
4609	NC_019753	CAA	2	6	282768	282773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303909
4610	NC_019753	A	7	7	282962	282968	100 %	0 %	0 %	0 %	428303909
4611	NC_019753	CAA	2	6	283055	283060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303909
4612	NC_019753	TGA	2	6	283111	283116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303909
4613	NC_019753	GAT	2	6	283148	283153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303909
4614	NC_019753	CAT	2	6	283178	283183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303909
4615	NC_019753	TAC	2	6	283195	283200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303909
4616	NC_019753	CAA	2	6	283277	283282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303909
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4618	NC_019753	TGG	2	6	283326	283331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303909
4619	NC_019753	CCCA	2	8	283348	283355	25 %	0 %	0 %	75 %	428303909
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4621	NC_019753	TGGT	2	8	283384	283391	0 %	50 %	50 %	0 %	428303909
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4988	NC_019753	GGC	2	6	305847	305852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303928
4989	NC_019753	CAG	2	6	306076	306081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303928
4990	NC_019753	A	6	6	306101	306106	100 %	0 %	0 %	0 %	428303928
4991	NC_019753	GCA	2	6	306407	306412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303929
4992	NC_019753	GCA	2	6	306422	306427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303929
4993	NC_019753	GCT	2	6	306467	306472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303929
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4998	NC_019753	ACT	2	6	306722	306727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303929
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