MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019752	GAT	2	6	29526	29531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
502	NC_019752	TAC	2	6	29532	29537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303554
503	NC_019752	CTG	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
504	NC_019752	TGATT	2	10	29681	29690	20 %	60 %	20 %	0 %	428303554
505	NC_019752	ACG	2	6	29733	29738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
506	NC_019752	TCAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	25 %	25 %	428303554
507	NC_019752	CAG	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
508	NC_019752	TGG	3	9	29813	29821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
509	NC_019752	TGGTAA	2	12	29828	29839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
510	NC_019752	GTA	2	6	29845	29850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
511	NC_019752	GTG	2	6	29851	29856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
512	NC_019752	TGG	2	6	29861	29866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
513	NC_019752	GTG	2	6	29872	29877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
514	NC_019752	CAG	2	6	29970	29975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
515	NC_019752	GA	3	6	29983	29988	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
516	NC_019752	AATG	2	8	30029	30036	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
517	NC_019752	ATAG	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
518	NC_019752	ATCA	2	8	30156	30163	50 %	25 %	0 %	25 %	428303554
519	NC_019752	CAG	2	6	30388	30393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
520	NC_019752	CAA	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
521	NC_019752	AAT	2	6	30438	30443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303554
522	NC_019752	GTT	2	6	30576	30581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
523	NC_019752	AAT	2	6	30594	30599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303554
524	NC_019752	GTT	2	6	30699	30704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
525	NC_019752	ACA	2	6	30739	30744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
526	NC_019752	AGC	2	6	30760	30765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
527	NC_019752	GA	3	6	30792	30797	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
528	NC_019752	AGA	2	6	30866	30871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
529	NC_019752	CGT	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
530	NC_019752	CTG	2	6	30916	30921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
531	NC_019752	AAG	2	6	30922	30927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
532	NC_019752	GAA	2	6	30945	30950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
533	NC_019752	TTA	2	6	30952	30957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
534	NC_019752	AGA	2	6	30977	30982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
535	NC_019752	GAA	2	6	31007	31012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
536	NC_019752	TGG	2	6	31088	31093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
537	NC_019752	ATC	2	6	31116	31121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303554
538	NC_019752	AGG	2	6	31124	31129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303554
539	NC_019752	TGA	2	6	31172	31177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
540	NC_019752	TTA	2	6	31312	31317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
541	NC_019752	CTT	2	6	31510	31515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303554
542	NC_019752	TGG	2	6	31613	31618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
543	NC_019752	TCAA	2	8	31621	31628	50 %	25 %	0 %	25 %	428303554
544	NC_019752	TAG	2	6	31670	31675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
545	NC_019752	TGC	2	6	31679	31684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
546	NC_019752	CAA	2	6	31858	31863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
547	NC_019752	AGAT	2	8	31909	31916	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
548	NC_019752	TC	3	6	31921	31926	0 %	50 %	0 %	50 %	428303554
549	NC_019752	ATT	2	6	32097	32102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
550	NC_019752	TC	3	6	32151	32156	0 %	50 %	0 %	50 %	428303554
551	NC_019752	GTA	2	6	32180	32185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
552	NC_019752	CAAA	2	8	33565	33572	75 %	0 %	0 %	25 %	428303555
553	NC_019752	ACC	2	6	33624	33629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303555
554	NC_019752	CATCGA	2	12	33683	33694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303555
555	NC_019752	GA	3	6	33734	33739	50 %	0 %	50 %	0 %	428303555
556	NC_019752	GAA	2	6	33771	33776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303555
557	NC_019752	AAG	2	6	33892	33897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303555
558	NC_019752	CCAC	2	8	33988	33995	25 %	0 %	0 %	75 %	428303555
559	NC_019752	CAA	2	6	34073	34078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303555
560	NC_019752	AAC	2	6	34171	34176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303555
561	NC_019752	TTG	2	6	34225	34230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303555
562	NC_019752	CATC	2	8	34275	34282	25 %	25 %	0 %	50 %	428303555
563	NC_019752	A	7	7	34296	34302	100 %	0 %	0 %	0 %	428303555
564	NC_019752	TTC	2	6	34408	34413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303556
565	NC_019752	CCA	2	6	34445	34450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303556
566	NC_019752	TCG	2	6	34459	34464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303556
567	NC_019752	AGC	2	6	34488	34493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303556
568	NC_019752	TCC	2	6	34521	34526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303556
569	NC_019752	GCC	2	6	34595	34600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303556
570	NC_019752	AAG	2	6	34617	34622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303556
571	NC_019752	CGT	2	6	34627	34632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303556
572	NC_019752	GAC	2	6	34646	34651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303556
573	NC_019752	CGC	2	6	34654	34659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303556
574	NC_019752	ACT	2	6	34735	34740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303556
575	NC_019752	GCA	2	6	34758	34763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303556
576	NC_019752	AGC	2	6	34810	34815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303556
577	NC_019752	AAT	2	6	34874	34879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303556
578	NC_019752	AAGG	2	8	34895	34902	50 %	0 %	50 %	0 %	428303556
579	NC_019752	AAT	2	6	34919	34924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303556
580	NC_019752	A	6	6	34978	34983	100 %	0 %	0 %	0 %	428303556
581	NC_019752	ATT	2	6	35015	35020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303556
582	NC_019752	ATA	2	6	35097	35102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303556
583	NC_019752	AG	4	8	35116	35123	50 %	0 %	50 %	0 %	428303556
584	NC_019752	GAA	2	6	35219	35224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303556
585	NC_019752	TAA	2	6	35266	35271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303556
586	NC_019752	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	428303556
587	NC_019752	ATA	2	6	35451	35456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303556
588	NC_019752	A	6	6	35475	35480	100 %	0 %	0 %	0 %	428303556
589	NC_019752	ATT	2	6	35908	35913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303557
590	NC_019752	CAG	2	6	35932	35937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303557
591	NC_019752	AGT	2	6	35991	35996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303557
592	NC_019752	ATA	2	6	36235	36240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303558
593	NC_019752	AGA	2	6	36267	36272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303558
594	NC_019752	TTG	2	6	36341	36346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303558
595	NC_019752	CAGCAA	2	12	36388	36399	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428303558
596	NC_019752	AGC	3	9	36402	36410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303558
597	NC_019752	AG	3	6	36413	36418	50 %	0 %	50 %	0 %	428303558
598	NC_019752	GGAA	2	8	36482	36489	50 %	0 %	50 %	0 %	428303558
599	NC_019752	CT	3	6	36509	36514	0 %	50 %	0 %	50 %	428303558
600	NC_019752	CTGG	2	8	36560	36567	0 %	25 %	50 %	25 %	428303558
601	NC_019752	AGA	2	6	36681	36686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303558
602	NC_019752	CTGCG	2	10	36781	36790	0 %	20 %	40 %	40 %	428303558
603	NC_019752	GCAAT	2	10	36895	36904	40 %	20 %	20 %	20 %	428303558
604	NC_019752	ACC	2	6	36930	36935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303558
605	NC_019752	AAT	2	6	36957	36962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303558
606	NC_019752	TTCC	2	8	36977	36984	0 %	50 %	0 %	50 %	428303558
607	NC_019752	AC	4	8	37020	37027	50 %	0 %	0 %	50 %	428303558
608	NC_019752	ACC	2	6	37056	37061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303558
609	NC_019752	AGT	2	6	37107	37112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303558
610	NC_019752	GGA	2	6	37140	37145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303558
611	NC_019752	AAT	2	6	37153	37158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303558
612	NC_019752	CAA	2	6	37179	37184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303558
613	NC_019752	TGG	2	6	37323	37328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303558
614	NC_019752	CAA	2	6	37462	37467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303558
615	NC_019752	TAA	2	6	37488	37493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303558
616	NC_019752	AATCC	2	10	37542	37551	40 %	20 %	0 %	40 %	428303558
617	NC_019752	AAT	2	6	37573	37578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303558
618	NC_019752	TGC	2	6	37788	37793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303558
619	NC_019752	ACA	2	6	37896	37901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303558
620	NC_019752	CAAAC	2	10	37936	37945	60 %	0 %	0 %	40 %	428303558
621	NC_019752	CAA	2	6	37990	37995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303558
622	NC_019752	AGT	2	6	38050	38055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303558
623	NC_019752	ACC	3	9	38066	38074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303558
624	NC_019752	TCA	2	6	38115	38120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303558
625	NC_019752	TTC	2	6	38126	38131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303558
626	NC_019752	GCA	2	6	38171	38176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303558
627	NC_019752	CAAT	2	8	38278	38285	50 %	25 %	0 %	25 %	428303558
628	NC_019752	TGC	2	6	38294	38299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303558
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744	NC_019752	ATC	2	6	45096	45101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303563
745	NC_019752	TGAT	2	8	45123	45130	25 %	50 %	25 %	0 %	428303563
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749	NC_019752	TA	3	6	45428	45433	50 %	50 %	0 %	0 %	428303563
750	NC_019752	T	6	6	45512	45517	0 %	100 %	0 %	0 %	428303563
751	NC_019752	CATTC	2	10	45550	45559	20 %	40 %	0 %	40 %	428303563
752	NC_019752	T	6	6	45685	45690	0 %	100 %	0 %	0 %	428303563
753	NC_019752	GCC	2	6	45788	45793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303563
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