MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 3229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	TGATT	2	10	595	604	20 %	60 %	20 %	0 %	428296780
2	NC_019751	GCTTG	2	10	2993	3002	0 %	40 %	40 %	20 %	428296782
3	NC_019751	CTATG	2	10	4478	4487	20 %	40 %	20 %	20 %	428296785
4	NC_019751	GCGGT	2	10	8710	8719	0 %	20 %	60 %	20 %	428296788
5	NC_019751	AAAAC	2	10	11023	11032	80 %	0 %	0 %	20 %	428296790
6	NC_019751	GTGAT	2	10	14685	14694	20 %	40 %	40 %	0 %	428296792
7	NC_019751	TGGTA	2	10	21740	21749	20 %	40 %	40 %	0 %	428296798
8	NC_019751	TTGGA	2	10	22113	22122	20 %	40 %	40 %	0 %	428296799
9	NC_019751	TATTT	2	10	25079	25088	20 %	80 %	0 %	0 %	428296802
10	NC_019751	TAAAT	2	10	26529	26538	60 %	40 %	0 %	0 %	428296802
11	NC_019751	TGGGA	2	10	29259	29268	20 %	20 %	60 %	0 %	428296804
12	NC_019751	TTTGG	2	10	30373	30382	0 %	60 %	40 %	0 %	428296805
13	NC_019751	TGGGA	2	10	30626	30635	20 %	20 %	60 %	0 %	428296805
14	NC_019751	ATTTT	2	10	34226	34235	20 %	80 %	0 %	0 %	428296810
15	NC_019751	TTTTA	2	10	34249	34258	20 %	80 %	0 %	0 %	428296810
16	NC_019751	ATCGC	2	10	34377	34386	20 %	20 %	20 %	40 %	428296810
17	NC_019751	ATTAG	2	10	34790	34799	40 %	40 %	20 %	0 %	428296810
18	NC_019751	TTTGC	2	10	38569	38578	0 %	60 %	20 %	20 %	428296814
19	NC_019751	TGCTT	2	10	38655	38664	0 %	60 %	20 %	20 %	428296814
20	NC_019751	GCGGT	2	10	40768	40777	0 %	20 %	60 %	20 %	428296816
21	NC_019751	CCACA	2	10	46620	46629	40 %	0 %	0 %	60 %	428296819
22	NC_019751	AGCAA	2	10	51468	51477	60 %	0 %	20 %	20 %	428296824
23	NC_019751	GAATT	2	10	51742	51751	40 %	40 %	20 %	0 %	428296825
24	NC_019751	AGCCG	2	10	52556	52565	20 %	0 %	40 %	40 %	428296825
25	NC_019751	CAGAA	2	10	53078	53087	60 %	0 %	20 %	20 %	428296825
26	NC_019751	AAATG	2	10	53307	53316	60 %	20 %	20 %	0 %	428296825
27	NC_019751	GGTAA	2	10	54688	54697	40 %	20 %	40 %	0 %	428296825
28	NC_019751	GTCCA	2	10	56959	56968	20 %	20 %	20 %	40 %	428296826
29	NC_019751	ATTTG	2	10	58516	58525	20 %	60 %	20 %	0 %	428296827
30	NC_019751	ACCGT	2	10	67658	67667	20 %	20 %	20 %	40 %	428296837
31	NC_019751	AGTGG	2	10	69580	69589	20 %	20 %	60 %	0 %	428296838
32	NC_019751	TTGTT	2	10	69790	69799	0 %	80 %	20 %	0 %	428296838
33	NC_019751	TTTTG	2	10	73432	73441	0 %	80 %	20 %	0 %	428296839
34	NC_019751	AGTTG	2	10	74626	74635	20 %	40 %	40 %	0 %	428296840
35	NC_019751	GAACC	2	10	75349	75358	40 %	0 %	20 %	40 %	428296840
36	NC_019751	AGAAT	2	10	76183	76192	60 %	20 %	20 %	0 %	428296840
37	NC_019751	TCAAT	2	10	78193	78202	40 %	40 %	0 %	20 %	428296841
38	NC_019751	GATTG	2	10	79173	79182	20 %	40 %	40 %	0 %	428296842
39	NC_019751	TGTTT	2	10	81197	81206	0 %	80 %	20 %	0 %	428296844
40	NC_019751	ATGTC	2	10	81686	81695	20 %	40 %	20 %	20 %	428296844
41	NC_019751	CCAAA	2	10	82617	82626	60 %	0 %	0 %	40 %	428296845
42	NC_019751	TAGTT	2	10	85789	85798	20 %	60 %	20 %	0 %	428296849
43	NC_019751	TATCC	2	10	86856	86865	20 %	40 %	0 %	40 %	428296850
44	NC_019751	GGAAT	2	10	90126	90135	40 %	20 %	40 %	0 %	428296853
45	NC_019751	ATCAA	2	10	93766	93775	60 %	20 %	0 %	20 %	428296855
46	NC_019751	ACCAA	2	10	97061	97070	60 %	0 %	0 %	40 %	428296858
47	NC_019751	GTACA	2	10	102999	103008	40 %	20 %	20 %	20 %	428296862
48	NC_019751	CACAA	2	10	105137	105146	60 %	0 %	0 %	40 %	428296863
49	NC_019751	TGAAT	2	10	106438	106447	40 %	40 %	20 %	0 %	428296865
50	NC_019751	AATTA	2	10	108387	108396	60 %	40 %	0 %	0 %	428296867
51	NC_019751	TGGTT	2	10	112458	112467	0 %	60 %	40 %	0 %	428296870
52	NC_019751	TTAAT	2	10	115114	115123	40 %	60 %	0 %	0 %	428296871
53	NC_019751	TTTAA	2	10	115575	115584	40 %	60 %	0 %	0 %	428296871
54	NC_019751	ATATC	2	10	116192	116201	40 %	40 %	0 %	20 %	428296872
55	NC_019751	TTTGT	2	10	116855	116864	0 %	80 %	20 %	0 %	428296872
56	NC_019751	AATAC	2	10	120071	120080	60 %	20 %	0 %	20 %	428296875
57	NC_019751	ATTGC	2	10	122085	122094	20 %	40 %	20 %	20 %	428296878
58	NC_019751	TCTGG	2	10	122252	122261	0 %	40 %	40 %	20 %	428296878
59	NC_019751	ATCTC	2	10	124468	124477	20 %	40 %	0 %	40 %	428296880
60	NC_019751	TGCAT	2	10	124906	124915	20 %	40 %	20 %	20 %	428296881
61	NC_019751	TAATT	2	10	124989	124998	40 %	60 %	0 %	0 %	428296881
62	NC_019751	CAACC	2	10	125126	125135	40 %	0 %	0 %	60 %	428296881
63	NC_019751	CCAAT	2	10	125417	125426	40 %	20 %	0 %	40 %	428296881
64	NC_019751	AAATA	2	10	125783	125792	80 %	20 %	0 %	0 %	428296882
65	NC_019751	ATATT	2	10	127973	127982	40 %	60 %	0 %	0 %	428296884
66	NC_019751	CGAAT	2	10	127988	127997	40 %	20 %	20 %	20 %	428296884
67	NC_019751	ATATT	2	10	128582	128591	40 %	60 %	0 %	0 %	428296884
68	NC_019751	GCACT	2	10	130499	130508	20 %	20 %	20 %	40 %	428296886
69	NC_019751	AATTT	2	10	130921	130930	40 %	60 %	0 %	0 %	428296886
70	NC_019751	AGGTG	2	10	135136	135145	20 %	20 %	60 %	0 %	428296890
71	NC_019751	ATGTT	2	10	136280	136289	20 %	60 %	20 %	0 %	428296892
72	NC_019751	GCAAA	2	10	138146	138155	60 %	0 %	20 %	20 %	428296895
73	NC_019751	GTATG	2	10	141336	141345	20 %	40 %	40 %	0 %	428296899
74	NC_019751	CACTG	2	10	143418	143427	20 %	20 %	20 %	40 %	428296900
75	NC_019751	TTGAT	2	10	148031	148040	20 %	60 %	20 %	0 %	428296904
76	NC_019751	TGTTC	2	10	151835	151844	0 %	60 %	20 %	20 %	428296906
77	NC_019751	AATTG	2	10	152530	152539	40 %	40 %	20 %	0 %	428296906
78	NC_019751	AAATG	2	10	152799	152808	60 %	20 %	20 %	0 %	428296906
79	NC_019751	AATCC	2	10	152914	152923	40 %	20 %	0 %	40 %	428296906
80	NC_019751	GTTAA	2	10	155459	155468	40 %	40 %	20 %	0 %	428296908
81	NC_019751	CATTC	2	10	158614	158623	20 %	40 %	0 %	40 %	428296910
82	NC_019751	TTTCC	2	10	158715	158724	0 %	60 %	0 %	40 %	428296910
83	NC_019751	AATGA	2	10	161906	161915	60 %	20 %	20 %	0 %	428296914
84	NC_019751	CTTTG	2	10	163049	163058	0 %	60 %	20 %	20 %	428296914
85	NC_019751	ACTGG	2	10	163213	163222	20 %	20 %	40 %	20 %	428296915
86	NC_019751	TGGTT	2	10	166634	166643	0 %	60 %	40 %	0 %	428296917
87	NC_019751	GACGC	2	10	168805	168814	20 %	0 %	40 %	40 %	428296919
88	NC_019751	GTGAT	2	10	170832	170841	20 %	40 %	40 %	0 %	428296921
89	NC_019751	CCGTT	2	10	171330	171339	0 %	40 %	20 %	40 %	428296921
90	NC_019751	TTGGG	2	10	175220	175229	0 %	40 %	60 %	0 %	428296926
91	NC_019751	TGGAA	2	10	175755	175764	40 %	20 %	40 %	0 %	428296926
92	NC_019751	GATGG	2	10	176577	176586	20 %	20 %	60 %	0 %	428296927
93	NC_019751	GTAGA	2	10	179288	179297	40 %	20 %	40 %	0 %	428296929
94	NC_019751	TCAAC	2	10	182199	182208	40 %	20 %	0 %	40 %	428296931
95	NC_019751	GCGCA	2	10	182586	182595	20 %	0 %	40 %	40 %	428296931
96	NC_019751	GTAGA	2	10	183251	183260	40 %	20 %	40 %	0 %	428296931
97	NC_019751	TGATT	2	10	188803	188812	20 %	60 %	20 %	0 %	428296934
98	NC_019751	ACACC	2	10	190542	190551	40 %	0 %	0 %	60 %	428296937
99	NC_019751	TGATG	2	10	193237	193246	20 %	40 %	40 %	0 %	428296939
100	NC_019751	ATTTT	2	10	198554	198563	20 %	80 %	0 %	0 %	428296944
101	NC_019751	AAACC	2	10	200372	200381	60 %	0 %	0 %	40 %	428296945
102	NC_019751	ATCCT	2	10	200622	200631	20 %	40 %	0 %	40 %	428296945
103	NC_019751	TAGTG	2	10	203017	203026	20 %	40 %	40 %	0 %	428296947
104	NC_019751	TTGGA	2	10	203501	203510	20 %	40 %	40 %	0 %	428296947
105	NC_019751	CAAAT	2	10	204114	204123	60 %	20 %	0 %	20 %	428296947
106	NC_019751	GTTTA	2	10	204478	204487	20 %	60 %	20 %	0 %	428296947
107	NC_019751	GTGTT	2	10	208440	208449	0 %	60 %	40 %	0 %	428296949
108	NC_019751	TGAAC	2	10	209360	209369	40 %	20 %	20 %	20 %	428296949
109	NC_019751	TAAAT	2	10	211054	211063	60 %	40 %	0 %	0 %	428296949
110	NC_019751	ATTCC	2	10	212925	212934	20 %	40 %	0 %	40 %	428296951
111	NC_019751	AGTGA	2	10	213672	213681	40 %	20 %	40 %	0 %	428296952
112	NC_019751	TCAAA	2	10	213857	213866	60 %	20 %	0 %	20 %	428296952
113	NC_019751	TCAAA	2	10	215357	215366	60 %	20 %	0 %	20 %	428296953
114	NC_019751	TGCTT	2	10	216319	216328	0 %	60 %	20 %	20 %	428296953
115	NC_019751	CGTCA	2	10	219449	219458	20 %	20 %	20 %	40 %	428296955
116	NC_019751	AAATC	2	10	219493	219502	60 %	20 %	0 %	20 %	428296955
117	NC_019751	AACTC	2	10	220062	220071	40 %	20 %	0 %	40 %	428296956
118	NC_019751	ATTGC	2	10	220878	220887	20 %	40 %	20 %	20 %	428296956
119	NC_019751	TCACC	2	10	223842	223851	20 %	20 %	0 %	60 %	428296958
120	NC_019751	GTAAA	2	10	224005	224014	60 %	20 %	20 %	0 %	428296958
121	NC_019751	TAAAC	2	10	224416	224425	60 %	20 %	0 %	20 %	428296958
122	NC_019751	AAATC	2	10	228804	228813	60 %	20 %	0 %	20 %	428296964
123	NC_019751	GTAAA	2	10	232600	232609	60 %	20 %	20 %	0 %	428296967
124	NC_019751	TCCGC	2	10	234383	234392	0 %	20 %	20 %	60 %	428296969
125	NC_019751	ATTTT	2	10	238108	238117	20 %	80 %	0 %	0 %	428296972
126	NC_019751	TTGGA	2	10	243733	243742	20 %	40 %	40 %	0 %	428296974
127	NC_019751	TCCAA	2	10	247500	247509	40 %	20 %	0 %	40 %	428296980
128	NC_019751	ATGGA	2	10	247564	247573	40 %	20 %	40 %	0 %	428296980
129	NC_019751	ATATT	2	10	249108	249117	40 %	60 %	0 %	0 %	428296982
130	NC_019751	TTTGA	2	10	253698	253707	20 %	60 %	20 %	0 %	428296989
131	NC_019751	ATTAA	2	10	254161	254170	60 %	40 %	0 %	0 %	428296989
132	NC_019751	ATCAT	2	10	257796	257805	40 %	40 %	0 %	20 %	428296994
133	NC_019751	GGTGT	2	10	259725	259734	0 %	40 %	60 %	0 %	428296995
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