MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019751	GA	3	6	156035	156040	50 %	0 %	50 %	0 %	428296908
2502	NC_019751	A	6	6	156051	156056	100 %	0 %	0 %	0 %	428296908
2503	NC_019751	GAT	2	6	156062	156067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296908
2504	NC_019751	ACC	2	6	156077	156082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296908
2505	NC_019751	ATG	2	6	156098	156103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296908
2506	NC_019751	ACA	2	6	156208	156213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296908
2507	NC_019751	GAT	2	6	156218	156223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296908
2508	NC_019751	G	6	6	156253	156258	0 %	0 %	100 %	0 %	428296908
2509	NC_019751	TTGC	2	8	156285	156292	0 %	50 %	25 %	25 %	428296908
2510	NC_019751	AGA	2	6	156328	156333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296908
2511	NC_019751	ATTT	2	8	156401	156408	25 %	75 %	0 %	0 %	428296908
2512	NC_019751	GAA	2	6	156416	156421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296908
2513	NC_019751	CCA	3	9	156658	156666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296909
2514	NC_019751	AAC	2	6	156870	156875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296909
2515	NC_019751	AGC	2	6	156942	156947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296909
2516	NC_019751	CCA	2	6	156955	156960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296909
2517	NC_019751	CTTGGG	2	12	157022	157033	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428296909
2518	NC_019751	GAC	2	6	157250	157255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296910
2519	NC_019751	CCA	2	6	157311	157316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296910
2520	NC_019751	GAA	2	6	157319	157324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296910
2521	NC_019751	CCA	2	6	157678	157683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296910
2522	NC_019751	ACT	2	6	157691	157696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296910
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2524	NC_019751	TTTA	2	8	157766	157773	25 %	75 %	0 %	0 %	428296910
2525	NC_019751	GCTT	2	8	157809	157816	0 %	50 %	25 %	25 %	428296910
2526	NC_019751	CAT	2	6	157846	157851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296910
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2528	NC_019751	ATTA	2	8	158066	158073	50 %	50 %	0 %	0 %	428296910
2529	NC_019751	TGC	2	6	158094	158099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296910
2530	NC_019751	GTC	2	6	158180	158185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296910
2531	NC_019751	TGCT	2	8	158213	158220	0 %	50 %	25 %	25 %	428296910
2532	NC_019751	TAG	2	6	158231	158236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296910
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2534	NC_019751	CGA	2	6	158412	158417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296910
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2536	NC_019751	TTC	2	6	158555	158560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296910
2537	NC_019751	CTT	2	6	158599	158604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296910
2538	NC_019751	CATTC	2	10	158614	158623	20 %	40 %	0 %	40 %	428296910
2539	NC_019751	TTGACG	2	12	158636	158647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428296910
2540	NC_019751	GTG	2	6	158650	158655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296910
2541	NC_019751	TTTCC	2	10	158715	158724	0 %	60 %	0 %	40 %	428296910
2542	NC_019751	CACC	2	8	158746	158753	25 %	0 %	0 %	75 %	428296910
2543	NC_019751	AC	3	6	158779	158784	50 %	0 %	0 %	50 %	428296910
2544	NC_019751	ATA	2	6	158815	158820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296910
2545	NC_019751	TA	3	6	158819	158824	50 %	50 %	0 %	0 %	428296910
2546	NC_019751	GGT	2	6	158889	158894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296910
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2549	NC_019751	ACT	2	6	159084	159089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296910
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2552	NC_019751	CTA	2	6	159459	159464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296911
2553	NC_019751	C	6	6	159511	159516	0 %	0 %	0 %	100 %	428296911
2554	NC_019751	AGA	2	6	159598	159603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296911
2555	NC_019751	GAT	3	9	159659	159667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296911
2556	NC_019751	TGAT	2	8	159712	159719	25 %	50 %	25 %	0 %	428296911
2557	NC_019751	TAT	2	6	160524	160529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296912
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2559	NC_019751	TAA	2	6	160680	160685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296912
2560	NC_019751	CTTA	2	8	160748	160755	25 %	50 %	0 %	25 %	428296912
2561	NC_019751	ATT	2	6	160788	160793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296912
2562	NC_019751	TGG	2	6	160806	160811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296912
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2565	NC_019751	TA	3	6	160894	160899	50 %	50 %	0 %	0 %	428296912
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2567	NC_019751	A	7	7	160949	160955	100 %	0 %	0 %	0 %	428296912
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2573	NC_019751	GAT	2	6	161279	161284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296913
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2581	NC_019751	A	7	7	161948	161954	100 %	0 %	0 %	0 %	428296914
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2586	NC_019751	ATCCTC	2	12	162242	162253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428296914
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2589	NC_019751	T	6	6	162397	162402	0 %	100 %	0 %	0 %	428296914
2590	NC_019751	AATCTA	2	12	162481	162492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428296914
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2593	NC_019751	TGCAAG	2	12	162920	162931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428296914
2594	NC_019751	TGG	2	6	162938	162943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296914
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2597	NC_019751	CTTTG	2	10	163049	163058	0 %	60 %	20 %	20 %	428296914
2598	NC_019751	TCT	2	6	163080	163085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296914
2599	NC_019751	ACT	2	6	163204	163209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296915
2600	NC_019751	ACTGG	2	10	163213	163222	20 %	20 %	40 %	20 %	428296915
2601	NC_019751	TGT	3	9	163235	163243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296915
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2603	NC_019751	CAG	2	6	163413	163418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296915
2604	NC_019751	AGAA	2	8	163435	163442	75 %	0 %	25 %	0 %	428296915
2605	NC_019751	TAAA	2	8	163468	163475	75 %	25 %	0 %	0 %	428296915
2606	NC_019751	ATA	2	6	163502	163507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296915
2607	NC_019751	ATC	2	6	163621	163626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296915
2608	NC_019751	T	6	6	163664	163669	0 %	100 %	0 %	0 %	428296915
2609	NC_019751	TA	3	6	163712	163717	50 %	50 %	0 %	0 %	428296915
2610	NC_019751	CAT	2	6	163758	163763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296915
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2612	NC_019751	ATTTGA	2	12	163841	163852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428296915
2613	NC_019751	ATT	2	6	163864	163869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296915
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2618	NC_019751	CAA	2	6	164203	164208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296915
2619	NC_019751	AT	3	6	164211	164216	50 %	50 %	0 %	0 %	428296915
2620	NC_019751	CTT	2	6	164277	164282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296915
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2622	NC_019751	AGTT	2	8	164349	164356	25 %	50 %	25 %	0 %	428296915
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2989	NC_019751	A	6	6	189404	189409	100 %	0 %	0 %	0 %	428296935
2990	NC_019751	TAA	2	6	189462	189467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296936
2991	NC_019751	AT	3	6	189493	189498	50 %	50 %	0 %	0 %	428296936
2992	NC_019751	CTT	2	6	189629	189634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296936
2993	NC_019751	CAT	2	6	189650	189655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296936
2994	NC_019751	GTC	2	6	189706	189711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296936
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2996	NC_019751	TCT	2	6	189742	189747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296936
2997	NC_019751	TAA	2	6	189779	189784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296936
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3000	NC_019751	ACT	2	6	189847	189852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296936

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