MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 106969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_019751	GATATG	2	12	866721	866732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297469
13502	NC_019751	GA	3	6	866741	866746	50 %	0 %	50 %	0 %	428297469
13503	NC_019751	GCGG	2	8	866747	866754	0 %	0 %	75 %	25 %	428297469
13504	NC_019751	GAA	2	6	866849	866854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297469
13505	NC_019751	ATT	2	6	866873	866878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297469
13506	NC_019751	TGA	2	6	867342	867347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297470
13507	NC_019751	GGTAAT	2	12	867369	867380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297470
13508	NC_019751	GGT	2	6	867403	867408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297470
13509	NC_019751	GCT	2	6	867508	867513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297470
13510	NC_019751	CAT	2	6	867531	867536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297470
13511	NC_019751	TGC	2	6	867599	867604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297470
13512	NC_019751	GGT	2	6	867616	867621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297470
13513	NC_019751	GGT	2	6	867655	867660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297470
13514	NC_019751	GTAG	2	8	867661	867668	25 %	25 %	50 %	0 %	428297470
13515	NC_019751	CTC	2	6	867769	867774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428297470
13516	NC_019751	AAT	2	6	867793	867798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297470
13517	NC_019751	GTT	2	6	867804	867809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297470
13518	NC_019751	T	6	6	867808	867813	0 %	100 %	0 %	0 %	428297470
13519	NC_019751	TGC	2	6	867821	867826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297470
13520	NC_019751	AGA	2	6	867840	867845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297470
13521	NC_019751	AGA	3	9	867852	867860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297470
13522	NC_019751	AT	3	6	867861	867866	50 %	50 %	0 %	0 %	428297470
13523	NC_019751	GTCC	2	8	867892	867899	0 %	25 %	25 %	50 %	428297470
13524	NC_019751	GAA	2	6	868078	868083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297470
13525	NC_019751	TGA	2	6	868143	868148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297470
13526	NC_019751	ATC	2	6	868173	868178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297470
13527	NC_019751	ATT	2	6	868225	868230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297470
13528	NC_019751	A	6	6	868259	868264	100 %	0 %	0 %	0 %	428297470
13529	NC_019751	TGA	2	6	868463	868468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297471
13530	NC_019751	AAG	2	6	868472	868477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297471
13531	NC_019751	GCT	3	9	868489	868497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297471
13532	NC_019751	ACT	2	6	868540	868545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428297471
13533	NC_019751	AT	3	6	868560	868565	50 %	50 %	0 %	0 %	428297471
13534	NC_019751	ATATTG	2	12	868685	868696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428297471
13535	NC_019751	TTAA	2	8	868735	868742	50 %	50 %	0 %	0 %	428297471
13536	NC_019751	GTG	3	9	868745	868753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297471
13537	NC_019751	ATT	2	6	868781	868786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297471
13538	NC_019751	TGG	3	9	868802	868810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297471
13539	NC_019751	TGG	2	6	868826	868831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297471
13540	NC_019751	TGA	2	6	868892	868897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297471
13541	NC_019751	GGT	2	6	868915	868920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297471
13542	NC_019751	TGG	2	6	868982	868987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297471
13543	NC_019751	TGA	2	6	869001	869006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297471
13544	NC_019751	A	6	6	869030	869035	100 %	0 %	0 %	0 %	428297471
13545	NC_019751	AAT	2	6	869041	869046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297471
13546	NC_019751	T	6	6	869493	869498	0 %	100 %	0 %	0 %	428297472
13547	NC_019751	ATCAAT	2	12	869500	869511	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428297472
13548	NC_019751	T	6	6	869566	869571	0 %	100 %	0 %	0 %	428297472
13549	NC_019751	AAAAT	2	10	869589	869598	80 %	20 %	0 %	0 %	428297472
13550	NC_019751	GCT	2	6	869655	869660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297472
13551	NC_019751	TG	3	6	869683	869688	0 %	50 %	50 %	0 %	428297472
13552	NC_019751	TAG	2	6	869691	869696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297472
13553	NC_019751	TG	4	8	869704	869711	0 %	50 %	50 %	0 %	428297472
13554	NC_019751	ATG	2	6	870189	870194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297473
13555	NC_019751	G	6	6	870246	870251	0 %	0 %	100 %	0 %	428297473
13556	NC_019751	CGA	2	6	870299	870304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297473
13557	NC_019751	ATT	2	6	870441	870446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297473
13558	NC_019751	CAA	2	6	870557	870562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297473
13559	NC_019751	ACCAT	2	10	870577	870586	40 %	20 %	0 %	40 %	428297473
13560	NC_019751	TGG	2	6	870593	870598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297473
13561	NC_019751	ATT	2	6	870681	870686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297473
13562	NC_019751	TAT	2	6	870732	870737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297473
13563	NC_019751	TAT	2	6	870797	870802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297473
13564	NC_019751	GGT	2	6	870819	870824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297473
13565	NC_019751	CCG	2	6	870837	870842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297473
13566	NC_019751	TGG	2	6	870850	870855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297473
13567	NC_019751	ATTT	2	8	870892	870899	25 %	75 %	0 %	0 %	428297473
13568	NC_019751	GCA	2	6	870939	870944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297473
13569	NC_019751	TGA	2	6	870959	870964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297473
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13573	NC_019751	GAA	2	6	871101	871106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428297473
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13578	NC_019751	TGG	2	6	871685	871690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297474
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13582	NC_019751	GTT	2	6	871816	871821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297474
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13584	NC_019751	GCC	2	6	871918	871923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428297474
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13587	NC_019751	GTT	2	6	872028	872033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297474
13588	NC_019751	GATT	2	8	872060	872067	25 %	50 %	25 %	0 %	428297474
13589	NC_019751	TGA	2	6	872079	872084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428297474
13590	NC_019751	GCA	2	6	872255	872260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428297474
13591	NC_019751	TAA	2	6	872274	872279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297474
13592	NC_019751	CTC	2	6	872293	872298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428297474
13593	NC_019751	TTA	2	6	872314	872319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297474
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13595	NC_019751	CT	3	6	872360	872365	0 %	50 %	0 %	50 %	428297474
13596	NC_019751	GTG	2	6	872369	872374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297474
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13599	NC_019751	GTG	2	6	872830	872835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297474
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13601	NC_019751	CGT	2	6	872941	872946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297474
13602	NC_019751	AGTA	2	8	872956	872963	50 %	25 %	25 %	0 %	428297474
13603	NC_019751	GTT	2	6	872983	872988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428297474
13604	NC_019751	TAT	2	6	873032	873037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297474
13605	NC_019751	CAA	2	6	873161	873166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428297474
13606	NC_019751	TGC	2	6	873177	873182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428297474
13607	NC_019751	ATTT	2	8	873207	873214	25 %	75 %	0 %	0 %	428297474
13608	NC_019751	CCA	2	6	873215	873220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297474
13609	NC_019751	TCT	2	6	873249	873254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428297474
13610	NC_019751	A	6	6	873260	873265	100 %	0 %	0 %	0 %	428297474
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13612	NC_019751	TAT	2	6	873359	873364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428297474
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13615	NC_019751	ACC	2	6	873603	873608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428297475
13616	NC_019751	A	6	6	873649	873654	100 %	0 %	0 %	0 %	428297475
13617	NC_019751	TCCC	2	8	873656	873663	0 %	25 %	0 %	75 %	428297475
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