MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019744	CAG	2	6	97842	97847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390026
1502	NC_019744	TGC	2	6	97880	97885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390026
1503	NC_019744	TG	3	6	97919	97924	0 %	50 %	50 %	0 %	434390026
1504	NC_019744	AAG	2	6	97942	97947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390026
1505	NC_019744	CACG	2	8	97986	97993	25 %	0 %	25 %	50 %	434390026
1506	NC_019744	ATT	2	6	97994	97999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390026
1507	NC_019744	CTT	2	6	98635	98640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390027
1508	NC_019744	CTTCAT	2	12	98674	98685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434390027
1509	NC_019744	CTGG	2	8	98731	98738	0 %	25 %	50 %	25 %	434390027
1510	NC_019744	ATT	2	6	98817	98822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390027
1511	NC_019744	CCT	2	6	99028	99033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434390027
1512	NC_019744	ACG	2	6	99044	99049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390027
1513	NC_019744	AGC	2	6	99139	99144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390028
1514	NC_019744	TGA	2	6	99147	99152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390028
1515	NC_019744	TGA	2	6	99261	99266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390028
1516	NC_019744	GCC	2	6	99302	99307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434390028
1517	NC_019744	GTC	2	6	99324	99329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390028
1518	NC_019744	TGC	2	6	99427	99432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390028
1519	NC_019744	GCT	2	6	100467	100472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1520	NC_019744	AGCG	2	8	100551	100558	25 %	0 %	50 %	25 %	434390029
1521	NC_019744	TG	3	6	100569	100574	0 %	50 %	50 %	0 %	434390029
1522	NC_019744	TTTC	2	8	100668	100675	0 %	75 %	0 %	25 %	434390029
1523	NC_019744	AGC	2	6	100726	100731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1524	NC_019744	GA	3	6	100783	100788	50 %	0 %	50 %	0 %	434390029
1525	NC_019744	GAT	2	6	100802	100807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390029
1526	NC_019744	TGGT	2	8	100899	100906	0 %	50 %	50 %	0 %	434390029
1527	NC_019744	AAG	2	6	100926	100931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390029
1528	NC_019744	GAT	2	6	100945	100950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390029
1529	NC_019744	TAT	2	6	100979	100984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390029
1530	NC_019744	TCC	2	6	101008	101013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434390029
1531	NC_019744	TCAA	2	8	101052	101059	50 %	25 %	0 %	25 %	434390029
1532	NC_019744	GCG	2	6	101094	101099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434390029
1533	NC_019744	TGC	2	6	101124	101129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1534	NC_019744	TTG	2	6	101172	101177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390029
1535	NC_019744	GATGCT	2	12	101219	101230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434390029
1536	NC_019744	GTT	2	6	101249	101254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390029
1537	NC_019744	ACTTGG	2	12	101272	101283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434390029
1538	NC_019744	TTGGA	2	10	101308	101317	20 %	40 %	40 %	0 %	434390029
1539	NC_019744	T	6	6	101358	101363	0 %	100 %	0 %	0 %	434390029
1540	NC_019744	TGA	2	6	101371	101376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390029
1541	NC_019744	CTA	3	9	101410	101418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390029
1542	NC_019744	TGCACC	2	12	101512	101523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434390029
1543	NC_019744	AC	3	6	101527	101532	50 %	0 %	0 %	50 %	434390029
1544	NC_019744	TGC	2	6	101566	101571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1545	NC_019744	TGA	2	6	101602	101607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390029
1546	NC_019744	CGC	2	6	101615	101620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434390029
1547	NC_019744	GTT	2	6	101666	101671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390029
1548	NC_019744	GTG	2	6	101736	101741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390029
1549	NC_019744	GCA	2	6	101750	101755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1550	NC_019744	GAC	2	6	101782	101787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1551	NC_019744	CAG	2	6	101799	101804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390029
1552	NC_019744	GTG	2	6	101851	101856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390029
1553	NC_019744	TGG	2	6	101889	101894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390029
1554	NC_019744	TTC	2	6	101907	101912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390030
1555	NC_019744	TTA	2	6	101930	101935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390030
1556	NC_019744	GGA	2	6	102077	102082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390030
1557	NC_019744	TGCCAC	2	12	102197	102208	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434390030
1558	NC_019744	GTT	2	6	102227	102232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390030
1559	NC_019744	CA	3	6	102733	102738	50 %	0 %	0 %	50 %	434390031
1560	NC_019744	GAA	2	6	102743	102748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390031
1561	NC_019744	ACC	2	6	102766	102771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434390031
1562	NC_019744	GCA	2	6	102788	102793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390031
1563	NC_019744	A	6	6	102888	102893	100 %	0 %	0 %	0 %	434390031
1564	NC_019744	TTGCA	2	10	103126	103135	20 %	40 %	20 %	20 %	434390031
1565	NC_019744	TA	3	6	103446	103451	50 %	50 %	0 %	0 %	434390031
1566	NC_019744	TGA	2	6	103591	103596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390031
1567	NC_019744	A	6	6	103623	103628	100 %	0 %	0 %	0 %	434390031
1568	NC_019744	AGA	2	6	103636	103641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390031
1569	NC_019744	CTA	2	6	104060	104065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390032
1570	NC_019744	TGC	2	6	104095	104100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390032
1571	NC_019744	ATC	2	6	104112	104117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390032
1572	NC_019744	CAT	2	6	104182	104187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390032
1573	NC_019744	AGC	2	6	104266	104271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390032
1574	NC_019744	AG	3	6	104284	104289	50 %	0 %	50 %	0 %	434390033
1575	NC_019744	GTG	3	9	104328	104336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390033
1576	NC_019744	TGCT	2	8	104376	104383	0 %	50 %	25 %	25 %	434390033
1577	NC_019744	GGAA	2	8	104431	104438	50 %	0 %	50 %	0 %	434390033
1578	NC_019744	T	6	6	104459	104464	0 %	100 %	0 %	0 %	434390033
1579	NC_019744	GAA	2	6	104678	104683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390033
1580	NC_019744	A	7	7	104732	104738	100 %	0 %	0 %	0 %	434390033
1581	NC_019744	GGC	2	6	104741	104746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434390033
1582	NC_019744	ATA	2	6	104892	104897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390033
1583	NC_019744	A	6	6	104979	104984	100 %	0 %	0 %	0 %	434390033
1584	NC_019744	TCC	2	6	104986	104991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434390033
1585	NC_019744	CAT	2	6	105059	105064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390033
1586	NC_019744	TGG	2	6	105094	105099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390033
1587	NC_019744	TCG	2	6	105217	105222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390033
1588	NC_019744	GCA	2	6	105227	105232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390033
1589	NC_019744	TCT	2	6	105252	105257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390033
1590	NC_019744	TCA	2	6	105355	105360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390033
1591	NC_019744	GAT	2	6	105361	105366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390033
1592	NC_019744	GTT	2	6	105389	105394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390033
1593	NC_019744	TTC	2	6	105405	105410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390033
1594	NC_019744	ATT	2	6	105416	105421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390033
1595	NC_019744	CAA	2	6	105517	105522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390033
1596	NC_019744	A	6	6	105539	105544	100 %	0 %	0 %	0 %	434390033
1597	NC_019744	ATTT	2	8	105588	105595	25 %	75 %	0 %	0 %	434390033
1598	NC_019744	T	6	6	105593	105598	0 %	100 %	0 %	0 %	434390033
1599	NC_019744	ATT	2	6	106046	106051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390034
1600	NC_019744	CAT	2	6	106087	106092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390034
1601	NC_019744	GAC	2	6	106198	106203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390034
1602	NC_019744	TC	3	6	106221	106226	0 %	50 %	0 %	50 %	434390034
1603	NC_019744	AAAAC	2	10	106272	106281	80 %	0 %	0 %	20 %	434390034
1604	NC_019744	G	6	6	106315	106320	0 %	0 %	100 %	0 %	434390034
1605	NC_019744	CA	3	6	106346	106351	50 %	0 %	0 %	50 %	434390034
1606	NC_019744	AGGAAG	2	12	106434	106445	50 %	0 %	50 %	0 %	434390034
1607	NC_019744	AGA	2	6	106561	106566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390034
1608	NC_019744	ACCAAA	2	12	106590	106601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390034
1609	NC_019744	GCG	2	6	106602	106607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434390034
1610	NC_019744	AATGT	2	10	106623	106632	40 %	40 %	20 %	0 %	434390034
1611	NC_019744	AAGC	2	8	106699	106706	50 %	0 %	25 %	25 %	434390034
1612	NC_019744	ATC	2	6	106820	106825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390034
1613	NC_019744	AGA	2	6	106847	106852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390034
1614	NC_019744	GTTTGG	2	12	106921	106932	0 %	50 %	50 %	0 %	434390034
1615	NC_019744	CAT	2	6	106957	106962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390034
1616	NC_019744	ATT	2	6	107003	107008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390034
1617	NC_019744	CAG	2	6	107088	107093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390034
1618	NC_019744	AGCA	2	8	107201	107208	50 %	0 %	25 %	25 %	434390034
1619	NC_019744	GAA	2	6	107210	107215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390034
1620	NC_019744	AGA	2	6	108095	108100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390035
1621	NC_019744	AAC	2	6	108133	108138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390035
1622	NC_019744	GGT	2	6	108167	108172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390035
1623	NC_019744	ATG	2	6	108280	108285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390035
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1635	NC_019744	T	6	6	108670	108675	0 %	100 %	0 %	0 %	434390035
1636	NC_019744	CTG	2	6	108819	108824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390035
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