MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019744	GCA	2	6	61419	61424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389998
1002	NC_019744	TCG	2	6	61466	61471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389998
1003	NC_019744	CAG	2	6	61492	61497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389998
1004	NC_019744	ACG	2	6	61510	61515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389998
1005	NC_019744	CAAC	2	8	61557	61564	50 %	0 %	0 %	50 %	434389998
1006	NC_019744	GAG	2	6	61590	61595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389998
1007	NC_019744	TC	3	6	61946	61951	0 %	50 %	0 %	50 %	434389999
1008	NC_019744	TGC	2	6	61971	61976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1009	NC_019744	TCA	2	6	61994	61999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389999
1010	NC_019744	CAG	2	6	62072	62077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1011	NC_019744	AGA	2	6	62094	62099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389999
1012	NC_019744	CGTT	2	8	62163	62170	0 %	50 %	25 %	25 %	434389999
1013	NC_019744	CTT	2	6	62174	62179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389999
1014	NC_019744	GTT	2	6	62203	62208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
1015	NC_019744	CAA	2	6	62263	62268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1016	NC_019744	AAGC	2	8	62274	62281	50 %	0 %	25 %	25 %	434389999
1017	NC_019744	GGAAGG	2	12	62361	62372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389999
1018	NC_019744	TTG	2	6	62420	62425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
1019	NC_019744	GTCA	2	8	62464	62471	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
1020	NC_019744	GGC	2	6	62485	62490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389999
1021	NC_019744	TAG	2	6	62513	62518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1022	NC_019744	CAA	2	6	62523	62528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1023	NC_019744	ACA	2	6	62553	62558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1024	NC_019744	GGC	2	6	62577	62582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389999
1025	NC_019744	TGG	2	6	62598	62603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389999
1026	NC_019744	ACT	2	6	62611	62616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389999
1027	NC_019744	AAAC	2	8	62623	62630	75 %	0 %	0 %	25 %	434389999
1028	NC_019744	TGA	2	6	62664	62669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1029	NC_019744	CAA	2	6	62674	62679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1030	NC_019744	TGG	2	6	62742	62747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389999
1031	NC_019744	TGT	2	6	62790	62795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
1032	NC_019744	AAC	2	6	62810	62815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1033	NC_019744	GAAA	2	8	62886	62893	75 %	0 %	25 %	0 %	434389999
1034	NC_019744	GTCAG	2	10	62950	62959	20 %	20 %	40 %	20 %	434389999
1035	NC_019744	TGG	2	6	62963	62968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389999
1036	NC_019744	GTA	2	6	62972	62977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1037	NC_019744	GCA	2	6	62983	62988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1038	NC_019744	T	6	6	63003	63008	0 %	100 %	0 %	0 %	434389999
1039	NC_019744	TAT	2	6	63077	63082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389999
1040	NC_019744	T	6	6	63084	63089	0 %	100 %	0 %	0 %	434389999
1041	NC_019744	GGA	2	6	63118	63123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389999
1042	NC_019744	CGAT	2	8	63146	63153	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
1043	NC_019744	TTG	2	6	63187	63192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
1044	NC_019744	AAAT	2	8	63198	63205	75 %	25 %	0 %	0 %	434389999
1045	NC_019744	GTC	2	6	63298	63303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1046	NC_019744	TGG	2	6	63371	63376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389999
1047	NC_019744	GCT	2	6	63402	63407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
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1049	NC_019744	GTCA	2	8	63453	63460	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
1050	NC_019744	TTA	2	6	63495	63500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389999
1051	NC_019744	GTT	2	6	63535	63540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
1052	NC_019744	GCG	2	6	63553	63558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389999
1053	NC_019744	AGC	2	6	63567	63572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1054	NC_019744	AAC	2	6	63624	63629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1055	NC_019744	TGC	2	6	63684	63689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1056	NC_019744	GAC	2	6	63715	63720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1057	NC_019744	ATG	2	6	63764	63769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1058	NC_019744	TGC	2	6	63774	63779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1059	NC_019744	TGG	2	6	63900	63905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389999
1060	NC_019744	TGA	2	6	63924	63929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1061	NC_019744	GAA	2	6	63985	63990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389999
1062	NC_019744	CAAATT	2	12	64081	64092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434389999
1063	NC_019744	TGC	2	6	64107	64112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389999
1064	NC_019744	AGT	2	6	64176	64181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
1065	NC_019744	CAA	2	6	64201	64206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1066	NC_019744	TG	3	6	64221	64226	0 %	50 %	50 %	0 %	434389999
1067	NC_019744	CAA	2	6	64245	64250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389999
1068	NC_019744	TGCTAA	2	12	64389	64400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434389999
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1071	NC_019744	AATC	2	8	64589	64596	50 %	25 %	0 %	25 %	434389999
1072	NC_019744	GAT	2	6	64608	64613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389999
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1074	NC_019744	GTT	2	6	64675	64680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389999
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1086	NC_019744	GACA	2	8	65446	65453	50 %	0 %	25 %	25 %	434390000
1087	NC_019744	A	6	6	65522	65527	100 %	0 %	0 %	0 %	434390000
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1089	NC_019744	AGA	2	6	65632	65637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390000
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1092	NC_019744	AAT	2	6	65770	65775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390000
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1094	NC_019744	ATT	2	6	65929	65934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390000
1095	NC_019744	ATC	2	6	66051	66056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390000
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1097	NC_019744	AAT	2	6	66104	66109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390000
1098	NC_019744	CAT	2	6	66155	66160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390000
1099	NC_019744	GTC	2	6	66257	66262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390000
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1101	NC_019744	TCGG	2	8	66342	66349	0 %	25 %	50 %	25 %	434390000
1102	NC_019744	A	6	6	66525	66530	100 %	0 %	0 %	0 %	434390000
1103	NC_019744	GTT	3	9	66576	66584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390000
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1105	NC_019744	TA	3	6	66747	66752	50 %	50 %	0 %	0 %	434390001
1106	NC_019744	GAA	2	6	66920	66925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390002
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1109	NC_019744	TAG	2	6	67130	67135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390002
1110	NC_019744	ATG	2	6	67187	67192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390002
1111	NC_019744	GAA	2	6	67210	67215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390002
1112	NC_019744	GAAAGT	2	12	67410	67421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434390003
1113	NC_019744	CAT	2	6	67445	67450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390003
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1117	NC_019744	ATCGTT	2	12	67671	67682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434390003
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1252	NC_019744	ATC	2	6	77803	77808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390010
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