MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019744	CGC	2	6	29311	29316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389976
502	NC_019744	TGG	2	6	29324	29329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
503	NC_019744	GTG	2	6	29336	29341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
504	NC_019744	ACTG	2	8	29349	29356	25 %	25 %	25 %	25 %	434389976
505	NC_019744	GCC	2	6	29698	29703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389977
506	NC_019744	GAT	2	6	29707	29712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389977
507	NC_019744	ACG	2	6	29726	29731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389977
508	NC_019744	GAC	2	6	29758	29763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389977
509	NC_019744	TCCG	2	8	29793	29800	0 %	25 %	25 %	50 %	434389977
510	NC_019744	CG	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
511	NC_019744	TCCT	2	8	29830	29837	0 %	50 %	0 %	50 %	434389977
512	NC_019744	CAT	2	6	29860	29865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389977
513	NC_019744	GCG	2	6	29915	29920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389977
514	NC_019744	GCT	2	6	29930	29935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389977
515	NC_019744	CGG	2	6	29967	29972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389977
516	NC_019744	GAT	2	6	29998	30003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389977
517	NC_019744	GAG	2	6	30049	30054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389977
518	NC_019744	CTC	4	12	30121	30132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389977
519	NC_019744	GCC	2	6	30149	30154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389977
520	NC_019744	GTT	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389977
521	NC_019744	GCC	2	6	30195	30200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389977
522	NC_019744	CGCC	3	12	30274	30285	0 %	0 %	25 %	75 %	434389977
523	NC_019744	GC	3	6	30301	30306	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
524	NC_019744	ACC	3	9	30341	30349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389977
525	NC_019744	CGCT	2	8	30396	30403	0 %	25 %	25 %	50 %	434389977
526	NC_019744	T	6	6	30459	30464	0 %	100 %	0 %	0 %	434389977
527	NC_019744	CAGA	2	8	30981	30988	50 %	0 %	25 %	25 %	434389978
528	NC_019744	ACTG	2	8	31009	31016	25 %	25 %	25 %	25 %	434389978
529	NC_019744	TCG	2	6	31036	31041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389978
530	NC_019744	CTC	3	9	31084	31092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389978
531	NC_019744	GCA	2	6	31149	31154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389978
532	NC_019744	AAG	2	6	31155	31160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389978
533	NC_019744	TTC	2	6	31161	31166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389978
534	NC_019744	CTG	2	6	31205	31210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389978
535	NC_019744	CAC	2	6	31458	31463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389978
536	NC_019744	CG	3	6	31570	31575	0 %	0 %	50 %	50 %	434389978
537	NC_019744	CCA	2	6	31651	31656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389978
538	NC_019744	AGG	2	6	31716	31721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389978
539	NC_019744	TGC	2	6	31762	31767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389978
540	NC_019744	CAC	2	6	31830	31835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389978
541	NC_019744	GCT	2	6	31865	31870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389978
542	NC_019744	ATG	2	6	31891	31896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389978
543	NC_019744	TTC	2	6	32111	32116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389979
544	NC_019744	TGT	2	6	32137	32142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389979
545	NC_019744	TAC	2	6	32157	32162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389979
546	NC_019744	ATT	2	6	32335	32340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389979
547	NC_019744	ACC	2	6	32341	32346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389979
548	NC_019744	ACA	2	6	32402	32407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389979
549	NC_019744	ATAA	2	8	32464	32471	75 %	25 %	0 %	0 %	434389979
550	NC_019744	ATT	2	6	33281	33286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389980
551	NC_019744	TCA	2	6	33331	33336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389980
552	NC_019744	CTG	2	6	33393	33398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389980
553	NC_019744	CCA	2	6	33446	33451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389980
554	NC_019744	ATC	2	6	33470	33475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389980
555	NC_019744	T	8	8	33539	33546	0 %	100 %	0 %	0 %	434389980
556	NC_019744	TAT	2	6	33555	33560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389980
557	NC_019744	A	6	6	33641	33646	100 %	0 %	0 %	0 %	434389980
558	NC_019744	GGA	2	6	33649	33654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389980
559	NC_019744	AGA	2	6	33831	33836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389981
560	NC_019744	TAT	2	6	33845	33850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389981
561	NC_019744	TCTT	2	8	33859	33866	0 %	75 %	0 %	25 %	434389981
562	NC_019744	ACTC	2	8	33876	33883	25 %	25 %	0 %	50 %	434389981
563	NC_019744	CA	3	6	33907	33912	50 %	0 %	0 %	50 %	434389981
564	NC_019744	CCA	2	6	33967	33972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
565	NC_019744	TAA	2	6	33997	34002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389981
566	NC_019744	ACC	2	6	34085	34090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
567	NC_019744	CCA	2	6	34154	34159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
568	NC_019744	CAG	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389981
569	NC_019744	CTG	2	6	34223	34228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389981
570	NC_019744	TAT	2	6	34230	34235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389981
571	NC_019744	CGC	2	6	34236	34241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389981
572	NC_019744	GTC	2	6	34254	34259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389981
573	NC_019744	TAA	2	6	34263	34268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389981
574	NC_019744	ATC	2	6	34290	34295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389981
575	NC_019744	TAG	2	6	34349	34354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389981
576	NC_019744	CAC	2	6	34389	34394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
577	NC_019744	ACG	2	6	34434	34439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389981
578	NC_019744	T	6	6	34521	34526	0 %	100 %	0 %	0 %	434389981
579	NC_019744	TGG	2	6	34578	34583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389981
580	NC_019744	TCA	2	6	34616	34621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389981
581	NC_019744	ACC	2	6	34707	34712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
582	NC_019744	ATA	2	6	34743	34748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389981
583	NC_019744	TTC	2	6	34749	34754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389981
584	NC_019744	ACCC	2	8	34761	34768	25 %	0 %	0 %	75 %	434389981
585	NC_019744	ACA	3	9	34862	34870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389981
586	NC_019744	TTTGA	2	10	34908	34917	20 %	60 %	20 %	0 %	434389981
587	NC_019744	ACC	2	6	34920	34925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389981
588	NC_019744	ACA	2	6	34957	34962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389981
589	NC_019744	TTA	2	6	35182	35187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389982
590	NC_019744	ATC	3	9	35263	35271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389982
591	NC_019744	TCA	2	6	35279	35284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389982
592	NC_019744	AAATT	2	10	35306	35315	60 %	40 %	0 %	0 %	434389982
593	NC_019744	T	7	7	35520	35526	0 %	100 %	0 %	0 %	434389982
594	NC_019744	ACC	2	6	35536	35541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389982
595	NC_019744	GCT	2	6	35579	35584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389982
596	NC_019744	ATA	2	6	35589	35594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389982
597	NC_019744	AGTA	2	8	35624	35631	50 %	25 %	25 %	0 %	434389982
598	NC_019744	TAA	2	6	35635	35640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389982
599	NC_019744	AATG	2	8	35651	35658	50 %	25 %	25 %	0 %	434389982
600	NC_019744	CTAAAC	2	12	35663	35674	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434389982
601	NC_019744	TTC	2	6	35698	35703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389982
602	NC_019744	TGC	2	6	36628	36633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389983
603	NC_019744	TGA	2	6	36634	36639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389983
604	NC_019744	GAA	2	6	36652	36657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389983
605	NC_019744	TGC	2	6	36703	36708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389983
606	NC_019744	GGC	2	6	36714	36719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389983
607	NC_019744	CCT	2	6	36737	36742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389983
608	NC_019744	GAA	2	6	36767	36772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389983
609	NC_019744	CAAA	2	8	36816	36823	75 %	0 %	0 %	25 %	434389983
610	NC_019744	TAG	2	6	36876	36881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389983
611	NC_019744	CATC	2	8	36894	36901	25 %	25 %	0 %	50 %	434389983
612	NC_019744	CCA	2	6	37137	37142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389984
613	NC_019744	AGA	2	6	37205	37210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389984
614	NC_019744	TC	3	6	37249	37254	0 %	50 %	0 %	50 %	434389984
615	NC_019744	GGA	2	6	37306	37311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389984
616	NC_019744	GAA	2	6	37367	37372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389984
617	NC_019744	ATGG	2	8	37454	37461	25 %	25 %	50 %	0 %	434389984
618	NC_019744	CCG	2	6	37489	37494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389984
619	NC_019744	GGT	2	6	37501	37506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389984
620	NC_019744	CCCAAA	2	12	37623	37634	50 %	0 %	0 %	50 %	434389984
621	NC_019744	ACC	2	6	37660	37665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389984
622	NC_019744	CAT	2	6	37687	37692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389984
623	NC_019744	TGA	2	6	37693	37698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389984
624	NC_019744	ACCA	2	8	37710	37717	50 %	0 %	0 %	50 %	434389984
625	NC_019744	CAG	2	6	37745	37750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389984
626	NC_019744	GTT	2	6	37789	37794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389984
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628	NC_019744	TGC	2	6	37936	37941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389984
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