MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	CAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308344
2	NC_019736	CAG	3	9	188	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308344
3	NC_019736	AAC	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308345
4	NC_019736	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308345
5	NC_019736	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308345
6	NC_019736	TGG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308345
7	NC_019736	TAA	2	6	811	816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308345
8	NC_019736	ACT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
9	NC_019736	TGG	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308346
10	NC_019736	ACG	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
11	NC_019736	CTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
12	NC_019736	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
13	NC_019736	GTA	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308346
14	NC_019736	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308346
15	NC_019736	ACA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308346
16	NC_019736	CAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
17	NC_019736	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
18	NC_019736	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308347
19	NC_019736	GGT	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308347
20	NC_019736	GTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308347
21	NC_019736	GAC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308347
22	NC_019736	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308347
23	NC_019736	TCG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308348
24	NC_019736	GTA	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308348
25	NC_019736	TGG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308348
26	NC_019736	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308348
27	NC_019736	CAG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
28	NC_019736	CAC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308348
29	NC_019736	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308348
30	NC_019736	AAC	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308348
31	NC_019736	CAG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
32	NC_019736	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
33	NC_019736	AAC	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
34	NC_019736	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
35	NC_019736	ACA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
36	NC_019736	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
37	NC_019736	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
38	NC_019736	GAC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
39	NC_019736	AGA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
40	NC_019736	AGC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
41	NC_019736	GTT	2	6	3380	3385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308350
42	NC_019736	TGA	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308350
43	NC_019736	GCG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308350
44	NC_019736	GCC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308350
45	NC_019736	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
46	NC_019736	AGC	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
47	NC_019736	GCA	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
48	NC_019736	ACC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
49	NC_019736	GTA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
50	NC_019736	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
51	NC_019736	CAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308351
52	NC_019736	TGC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308351
53	NC_019736	GCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
54	NC_019736	AAG	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308351
55	NC_019736	CAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
56	NC_019736	TGT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
57	NC_019736	GTA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308352
58	NC_019736	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308352
59	NC_019736	TGT	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
60	NC_019736	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
61	NC_019736	GAT	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308353
62	NC_019736	ATT	2	6	6936	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
63	NC_019736	AGA	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308353
64	NC_019736	CTA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308353
65	NC_019736	CTG	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308353
66	NC_019736	AAC	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
67	NC_019736	GTA	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
68	NC_019736	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
69	NC_019736	TTG	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
70	NC_019736	AGT	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
71	NC_019736	GAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
72	NC_019736	TGG	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308354
73	NC_019736	ATT	2	6	7745	7750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
74	NC_019736	CAG	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
75	NC_019736	AAT	2	6	7787	7792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
76	NC_019736	TGA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
77	NC_019736	GAA	2	6	7910	7915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
78	NC_019736	TTG	2	6	7930	7935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
79	NC_019736	AAT	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
80	NC_019736	GCT	2	6	8175	8180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308354
81	NC_019736	TCA	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308354
82	NC_019736	GAT	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
83	NC_019736	TGA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
84	NC_019736	ACA	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
85	NC_019736	AAC	2	6	8669	8674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
86	NC_019736	AGT	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
87	NC_019736	TTA	2	6	8967	8972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
88	NC_019736	CTT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308354
89	NC_019736	TCC	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308354
90	NC_019736	CAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308354
91	NC_019736	TGG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308354
92	NC_019736	TAT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
93	NC_019736	CCA	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308354
94	NC_019736	TTA	2	6	9153	9158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
95	NC_019736	GAG	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308354
96	NC_019736	GCA	2	6	9233	9238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
97	NC_019736	TGA	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
98	NC_019736	TAA	3	9	9257	9265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
99	NC_019736	TAG	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
100	NC_019736	CAC	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308354
101	NC_019736	TGC	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308354
102	NC_019736	ATG	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
103	NC_019736	CTG	2	6	9586	9591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308354
104	NC_019736	ATT	2	6	9594	9599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
105	NC_019736	GCA	2	6	9689	9694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
106	NC_019736	AGC	3	9	9710	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
107	NC_019736	TGT	2	6	9735	9740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
108	NC_019736	AAG	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
109	NC_019736	TAG	2	6	10160	10165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308355
110	NC_019736	ATT	2	6	10197	10202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308355
111	NC_019736	ATT	2	6	10272	10277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308355
112	NC_019736	TAA	2	6	10295	10300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308355
113	NC_019736	CTA	2	6	10339	10344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308355
114	NC_019736	TGA	2	6	10382	10387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308355
115	NC_019736	TCA	2	6	10391	10396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308355
116	NC_019736	GCA	2	6	10404	10409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308355
117	NC_019736	GTG	2	6	10518	10523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308355
118	NC_019736	ATA	2	6	10591	10596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308355
119	NC_019736	TGG	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308355
120	NC_019736	ATT	2	6	10740	10745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308355
121	NC_019736	TGC	2	6	10748	10753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308355
122	NC_019736	TAG	2	6	10790	10795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308355
123	NC_019736	TTA	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308355
124	NC_019736	ATA	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308355
125	NC_019736	ATT	2	6	11037	11042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308355
126	NC_019736	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308355
127	NC_019736	CAT	2	6	11088	11093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308355
128	NC_019736	CAA	2	6	11107	11112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308355
129	NC_019736	TGT	2	6	11139	11144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308355
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134	NC_019736	TAC	2	6	11459	11464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308355
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257	NC_019736	CTT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
258	NC_019736	TCT	2	6	25048	25053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.