MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	CAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308344
2	NC_019736	CAG	3	9	188	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308344
3	NC_019736	TG	4	8	226	233	0 %	50 %	50 %	0 %	428308344
4	NC_019736	AAC	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308345
5	NC_019736	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308345
6	NC_019736	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308345
7	NC_019736	TGG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308345
8	NC_019736	GT	3	6	714	719	0 %	50 %	50 %	0 %	428308345
9	NC_019736	CAAA	2	8	781	788	75 %	0 %	0 %	25 %	428308345
10	NC_019736	TAA	2	6	811	816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308345
11	NC_019736	ACT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
12	NC_019736	TGG	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308346
13	NC_019736	ACG	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
14	NC_019736	CTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
15	NC_019736	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
16	NC_019736	GTA	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308346
17	NC_019736	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308346
18	NC_019736	AGCTGA	2	12	1029	1040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308346
19	NC_019736	AAAG	2	8	1065	1072	75 %	0 %	25 %	0 %	428308346
20	NC_019736	AC	3	6	1140	1145	50 %	0 %	0 %	50 %	428308346
21	NC_019736	ACA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308346
22	NC_019736	CAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
23	NC_019736	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
24	NC_019736	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308347
25	NC_019736	GGT	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308347
26	NC_019736	GTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308347
27	NC_019736	TATT	2	8	1523	1530	25 %	75 %	0 %	0 %	428308347
28	NC_019736	GAC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308347
29	NC_019736	TACA	2	8	1575	1582	50 %	25 %	0 %	25 %	428308347
30	NC_019736	AT	3	6	1587	1592	50 %	50 %	0 %	0 %	428308347
31	NC_019736	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308347
32	NC_019736	TCG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308348
33	NC_019736	GTA	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308348
34	NC_019736	TGG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308348
35	NC_019736	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308348
36	NC_019736	CAG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
37	NC_019736	CAC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308348
38	NC_019736	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308348
39	NC_019736	AAC	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308348
40	NC_019736	ATCA	2	8	1972	1979	50 %	25 %	0 %	25 %	428308348
41	NC_019736	CAG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
42	NC_019736	AT	3	6	2372	2377	50 %	50 %	0 %	0 %	428308349
43	NC_019736	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
44	NC_019736	AAC	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
45	NC_019736	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
46	NC_019736	TCTA	2	8	2465	2472	25 %	50 %	0 %	25 %	428308349
47	NC_019736	TCAC	2	8	2482	2489	25 %	25 %	0 %	50 %	428308349
48	NC_019736	ACA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
49	NC_019736	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
50	NC_019736	ATTTT	2	10	2649	2658	20 %	80 %	0 %	0 %	428308349
51	NC_019736	CGAG	2	8	3156	3163	25 %	0 %	50 %	25 %	428308350
52	NC_019736	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
53	NC_019736	GAC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
54	NC_019736	AGA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
55	NC_019736	AGC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
56	NC_019736	GTT	2	6	3380	3385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308350
57	NC_019736	CCAG	2	8	3420	3427	25 %	0 %	25 %	50 %	428308350
58	NC_019736	TGA	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308350
59	NC_019736	GCG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308350
60	NC_019736	GCC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308350
61	NC_019736	A	6	6	3631	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	428308350
62	NC_019736	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
63	NC_019736	AGC	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
64	NC_019736	GCA	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
65	NC_019736	ACC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
66	NC_019736	GTA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
67	NC_019736	GACC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	428308351
68	NC_019736	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
69	NC_019736	CAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308351
70	NC_019736	TGC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308351
71	NC_019736	GCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
72	NC_019736	AAG	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308351
73	NC_019736	TAAT	2	8	6148	6155	50 %	50 %	0 %	0 %	428308351
74	NC_019736	GACGT	2	10	6181	6190	20 %	20 %	40 %	20 %	428308351
75	NC_019736	CAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
76	NC_019736	TGT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
77	NC_019736	GTA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308352
78	NC_019736	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308352
79	NC_019736	T	6	6	6640	6645	0 %	100 %	0 %	0 %	428308352
80	NC_019736	TGT	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
81	NC_019736	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
82	NC_019736	TC	3	6	6877	6882	0 %	50 %	0 %	50 %	428308353
83	NC_019736	GAT	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308353
84	NC_019736	CATCG	2	10	6908	6917	20 %	20 %	20 %	40 %	428308353
85	NC_019736	ATT	2	6	6936	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308353
86	NC_019736	AGA	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308353
87	NC_019736	ATCT	2	8	6978	6985	25 %	50 %	0 %	25 %	428308353
88	NC_019736	CTA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308353
89	NC_019736	CTG	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308353
90	NC_019736	AAC	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
91	NC_019736	AATT	2	8	7465	7472	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
92	NC_019736	GA	3	6	7480	7485	50 %	0 %	50 %	0 %	428308354
93	NC_019736	GTA	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
94	NC_019736	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
95	NC_019736	TTG	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
96	NC_019736	AGT	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
97	NC_019736	GAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
98	NC_019736	TTTA	2	8	7664	7671	25 %	75 %	0 %	0 %	428308354
99	NC_019736	TGG	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308354
100	NC_019736	ATT	2	6	7745	7750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
101	NC_019736	CAG	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
102	NC_019736	AAT	2	6	7787	7792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
103	NC_019736	TGA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
104	NC_019736	GAA	2	6	7910	7915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308354
105	NC_019736	A	6	6	7917	7922	100 %	0 %	0 %	0 %	428308354
106	NC_019736	TTG	2	6	7930	7935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308354
107	NC_019736	CAGAGT	2	12	8051	8062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308354
108	NC_019736	AAT	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
109	NC_019736	TAGAGC	2	12	8122	8133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308354
110	NC_019736	GCT	2	6	8175	8180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308354
111	NC_019736	ATTA	2	8	8309	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
112	NC_019736	TCA	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308354
113	NC_019736	GAT	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
114	NC_019736	TGA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
115	NC_019736	CAAAC	2	10	8514	8523	60 %	0 %	0 %	40 %	428308354
116	NC_019736	TA	3	6	8635	8640	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
117	NC_019736	ACA	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
118	NC_019736	AAC	2	6	8669	8674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308354
119	NC_019736	AGT	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
120	NC_019736	GCGG	2	8	8930	8937	0 %	0 %	75 %	25 %	428308354
121	NC_019736	TTA	2	6	8967	8972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
122	NC_019736	CTT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308354
123	NC_019736	TCC	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308354
124	NC_019736	CAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308354
125	NC_019736	TGG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308354
126	NC_019736	TAT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
127	NC_019736	CCA	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308354
128	NC_019736	TTA	2	6	9153	9158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308354
129	NC_019736	GAG	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308354
130	NC_019736	GCA	2	6	9233	9238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308354
131	NC_019736	TGA	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
132	NC_019736	TAA	3	9	9257	9265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308354
133	NC_019736	TAG	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308354
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262	NC_019736	GTT	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308361
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380	NC_019736	CATC	2	8	24710	24717	25 %	25 %	0 %	50 %	428308365
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382	NC_019736	T	6	6	24837	24842	0 %	100 %	0 %	0 %	428308365
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384	NC_019736	AG	3	6	24973	24978	50 %	0 %	50 %	0 %	428308365
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386	NC_019736	CTT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
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388	NC_019736	GAC	2	6	25100	25105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308365
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390	NC_019736	GATC	2	8	25190	25197	25 %	25 %	25 %	25 %	428308365
391	NC_019736	TTCCCC	2	12	25221	25232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308365
392	NC_019736	TCG	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308365
393	NC_019736	T	6	6	25404	25409	0 %	100 %	0 %	0 %	428308365
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395	NC_019736	T	6	6	25860	25865	0 %	100 %	0 %	0 %	428308366
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399	NC_019736	TG	3	6	25929	25934	0 %	50 %	50 %	0 %	428308366
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403	NC_019736	GATT	2	8	26157	26164	25 %	50 %	25 %	0 %	428308366
404	NC_019736	GAAG	2	8	26250	26257	50 %	0 %	50 %	0 %	428308366
405	NC_019736	CTT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308366
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424	NC_019736	TCT	2	6	27710	27715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
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497	NC_019736	AGTA	2	8	30914	30921	50 %	25 %	25 %	0 %	428308368
498	NC_019736	CTG	2	6	30947	30952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308368
499	NC_019736	TTGAA	2	10	31451	31460	40 %	40 %	20 %	0 %	428308369
500	NC_019736	AGC	2	6	31481	31486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308369

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