MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019736	CTG	2	6	31513	31518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308369
502	NC_019736	GAA	2	6	31603	31608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308369
503	NC_019736	TGC	2	6	31619	31624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308369
504	NC_019736	GGA	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308369
505	NC_019736	AGT	2	6	31731	31736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308369
506	NC_019736	TAC	2	6	31776	31781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308369
507	NC_019736	TTGA	2	8	31835	31842	25 %	50 %	25 %	0 %	428308369
508	NC_019736	CAG	3	9	31934	31942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308370
509	NC_019736	TGG	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308370
510	NC_019736	TGC	2	6	32232	32237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308370
511	NC_019736	TGC	2	6	32292	32297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308370
512	NC_019736	GTG	2	6	32432	32437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308370
513	NC_019736	TAA	2	6	32583	32588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308370
514	NC_019736	ATT	2	6	32647	32652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308370
515	NC_019736	GTT	2	6	32714	32719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308370
516	NC_019736	CGG	2	6	32720	32725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308370
517	NC_019736	AAG	2	6	32731	32736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308370
518	NC_019736	GAA	2	6	32779	32784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308370
519	NC_019736	TGG	2	6	32853	32858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308370
520	NC_019736	TGAG	2	8	32885	32892	25 %	25 %	50 %	0 %	428308370
521	NC_019736	CCA	2	6	32938	32943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308370
522	NC_019736	GTA	2	6	32966	32971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308370
523	NC_019736	CGG	2	6	33038	33043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308370
524	NC_019736	TCT	2	6	33476	33481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308371
525	NC_019736	AG	3	6	33534	33539	50 %	0 %	50 %	0 %	428308371
526	NC_019736	CCA	2	6	33569	33574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308371
527	NC_019736	TTG	2	6	33697	33702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308371
528	NC_019736	GAC	2	6	33735	33740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308371
529	NC_019736	ATA	2	6	33773	33778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308371
530	NC_019736	CAG	2	6	33982	33987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308372
531	NC_019736	GTT	2	6	34251	34256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308373
532	NC_019736	ATG	2	6	34263	34268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308373
533	NC_019736	TGA	2	6	34277	34282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308373
534	NC_019736	GTTTT	2	10	34283	34292	0 %	80 %	20 %	0 %	428308373
535	NC_019736	GCC	2	6	34316	34321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308373
536	NC_019736	CTG	2	6	34331	34336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308373
537	NC_019736	AT	3	6	34338	34343	50 %	50 %	0 %	0 %	428308373
538	NC_019736	A	6	6	34399	34404	100 %	0 %	0 %	0 %	428308373
539	NC_019736	AAT	2	6	34407	34412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308373
540	NC_019736	T	6	6	34486	34491	0 %	100 %	0 %	0 %	428308373
541	NC_019736	CGT	2	6	34542	34547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308373
542	NC_019736	ATT	2	6	34606	34611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308373
543	NC_019736	ATT	2	6	34796	34801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308373
544	NC_019736	GAT	2	6	35045	35050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
545	NC_019736	TTG	2	6	35075	35080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
546	NC_019736	CG	3	6	35094	35099	0 %	0 %	50 %	50 %	428308374
547	NC_019736	CCG	2	6	35162	35167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308374
548	NC_019736	TGT	2	6	35235	35240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
549	NC_019736	ACT	2	6	35279	35284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
550	NC_019736	GGGTT	2	10	35287	35296	0 %	40 %	60 %	0 %	428308374
551	NC_019736	CTC	2	6	35317	35322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308374
552	NC_019736	GACCTT	2	12	35350	35361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308374
553	NC_019736	T	6	6	35431	35436	0 %	100 %	0 %	0 %	428308374
554	NC_019736	TTAC	2	8	35498	35505	25 %	50 %	0 %	25 %	428308374
555	NC_019736	AGT	2	6	35509	35514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
556	NC_019736	TTCT	2	8	35541	35548	0 %	75 %	0 %	25 %	428308374
557	NC_019736	AGT	2	6	35554	35559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
558	NC_019736	TG	3	6	35592	35597	0 %	50 %	50 %	0 %	428308374
559	NC_019736	TAA	2	6	35667	35672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308374
560	NC_019736	TC	3	6	35697	35702	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
561	NC_019736	ACT	2	6	35717	35722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
562	NC_019736	GAA	2	6	35738	35743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308374
563	NC_019736	TTA	2	6	35783	35788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308374
564	NC_019736	TCT	2	6	35798	35803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308374
565	NC_019736	AGT	2	6	35827	35832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
566	NC_019736	ACT	2	6	35896	35901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
567	NC_019736	TTC	2	6	36173	36178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308374
568	NC_019736	TAG	2	6	36195	36200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
569	NC_019736	GTC	2	6	36310	36315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
570	NC_019736	TGT	2	6	36336	36341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
571	NC_019736	AGT	2	6	36385	36390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
572	NC_019736	CAT	2	6	36456	36461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
573	NC_019736	TGC	2	6	36475	36480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
574	NC_019736	CAT	2	6	36541	36546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
575	NC_019736	T	6	6	36546	36551	0 %	100 %	0 %	0 %	428308374
576	NC_019736	TAG	2	6	36586	36591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
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578	NC_019736	CGT	2	6	36648	36653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
579	NC_019736	TAA	2	6	36661	36666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308374
580	NC_019736	TCT	2	6	36668	36673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308374
581	NC_019736	TCA	2	6	36674	36679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
582	NC_019736	TCA	2	6	36731	36736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
583	NC_019736	TTGA	2	8	36775	36782	25 %	50 %	25 %	0 %	428308374
584	NC_019736	CT	3	6	36937	36942	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
585	NC_019736	TTG	2	6	36949	36954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
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587	NC_019736	CAA	2	6	37020	37025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308374
588	NC_019736	AGCA	2	8	37118	37125	50 %	0 %	25 %	25 %	428308374
589	NC_019736	T	6	6	37203	37208	0 %	100 %	0 %	0 %	428308374
590	NC_019736	TCG	2	6	37253	37258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
591	NC_019736	CTT	2	6	37263	37268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308374
592	NC_019736	AG	4	8	37338	37345	50 %	0 %	50 %	0 %	428308374
593	NC_019736	CTT	2	6	37428	37433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308374
594	NC_019736	ATT	2	6	37477	37482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308374
595	NC_019736	ATA	2	6	37544	37549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308374
596	NC_019736	TTA	2	6	37571	37576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308374
597	NC_019736	TGC	2	6	37616	37621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
598	NC_019736	CAC	2	6	37649	37654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308374
599	NC_019736	AAT	2	6	37730	37735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308374
600	NC_019736	AGT	2	6	37755	37760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
601	NC_019736	T	6	6	37777	37782	0 %	100 %	0 %	0 %	428308374
602	NC_019736	TGT	3	9	37795	37803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
603	NC_019736	GCA	2	6	37805	37810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308374
604	NC_019736	T	6	6	37921	37926	0 %	100 %	0 %	0 %	428308374
605	NC_019736	TCA	2	6	37931	37936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
606	NC_019736	CAT	2	6	38001	38006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308374
607	NC_019736	TAAT	2	8	38022	38029	50 %	50 %	0 %	0 %	428308374
608	NC_019736	TCG	2	6	38045	38050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
609	NC_019736	TTCC	2	8	38059	38066	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
610	NC_019736	TC	3	6	38089	38094	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
611	NC_019736	TC	5	10	38098	38107	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
612	NC_019736	TAG	2	6	38142	38147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308374
613	NC_019736	TGAT	2	8	38299	38306	25 %	50 %	25 %	0 %	428308374
614	NC_019736	TTTG	2	8	38316	38323	0 %	75 %	25 %	0 %	428308374
615	NC_019736	TGC	2	6	38337	38342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308374
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617	NC_019736	GTA	2	6	38470	38475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308375
618	NC_019736	TA	3	6	38513	38518	50 %	50 %	0 %	0 %	428308375
619	NC_019736	CCTT	2	8	38807	38814	0 %	50 %	0 %	50 %	428308376
620	NC_019736	T	6	6	38822	38827	0 %	100 %	0 %	0 %	428308376
621	NC_019736	T	6	6	38943	38948	0 %	100 %	0 %	0 %	428308376
622	NC_019736	ATT	2	6	38987	38992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308376

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