MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 468

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	GGC	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308293
2	NC_019734	AAC	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
3	NC_019734	TTG	2	6	609	614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308293
4	NC_019734	CCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308293
5	NC_019734	AAC	2	6	700	705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
6	NC_019734	AGT	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
7	NC_019734	AAC	2	6	937	942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308293
8	NC_019734	GGA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308293
9	NC_019734	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308293
10	NC_019734	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
11	NC_019734	AAT	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308293
12	NC_019734	GAC	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308293
13	NC_019734	ATT	2	6	1417	1422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308293
14	NC_019734	TGA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308293
15	NC_019734	ATT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308293
16	NC_019734	TTC	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308293
17	NC_019734	AAG	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308293
18	NC_019734	TGT	2	6	1839	1844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308294
19	NC_019734	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308294
20	NC_019734	CTG	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308294
21	NC_019734	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308294
22	NC_019734	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308294
23	NC_019734	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308294
24	NC_019734	TAG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308294
25	NC_019734	GGT	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308295
26	NC_019734	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308295
27	NC_019734	TCA	2	6	2853	2858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308295
28	NC_019734	CAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308295
29	NC_019734	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
30	NC_019734	AGA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308295
31	NC_019734	TAT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308295
32	NC_019734	ACG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
33	NC_019734	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308295
34	NC_019734	TTG	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308295
35	NC_019734	GCA	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308295
36	NC_019734	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
37	NC_019734	CAA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308296
38	NC_019734	TTA	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
39	NC_019734	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
40	NC_019734	TTA	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308296
41	NC_019734	TCT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308296
42	NC_019734	TAA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308296
43	NC_019734	TCA	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308296
44	NC_019734	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308296
45	NC_019734	CTG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308296
46	NC_019734	GTT	2	6	5665	5670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308296
47	NC_019734	CGT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308296
48	NC_019734	CAG	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308296
49	NC_019734	CAA	2	6	5786	5791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308296
50	NC_019734	TCA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308296
51	NC_019734	TGG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308296
52	NC_019734	GTA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308296
53	NC_019734	GTA	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308297
54	NC_019734	TGG	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308297
55	NC_019734	TAT	2	6	6177	6182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308297
56	NC_019734	TTC	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308297
57	NC_019734	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308297
58	NC_019734	TCC	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308297
59	NC_019734	GAG	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308297
60	NC_019734	TGT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308297
61	NC_019734	CAG	2	6	6507	6512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
62	NC_019734	AGC	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
63	NC_019734	ACG	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
64	NC_019734	CTC	3	9	6907	6915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308297
65	NC_019734	ATC	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308297
66	NC_019734	CTT	2	6	7092	7097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308297
67	NC_019734	GAC	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
68	NC_019734	ACG	3	9	7171	7179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308297
69	NC_019734	TTG	2	6	7306	7311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
70	NC_019734	CAG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308298
71	NC_019734	TAA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308298
72	NC_019734	TTG	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
73	NC_019734	TGT	2	6	7474	7479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
74	NC_019734	TTC	2	6	7554	7559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
75	NC_019734	TAC	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
76	NC_019734	TGT	2	6	7805	7810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308298
77	NC_019734	CAT	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
78	NC_019734	CAT	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308298
79	NC_019734	TGG	2	6	7898	7903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308298
80	NC_019734	TCT	2	6	7918	7923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
81	NC_019734	TTC	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308298
82	NC_019734	AGA	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308298
83	NC_019734	GTT	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308299
84	NC_019734	CTG	2	6	8244	8249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308299
85	NC_019734	AGA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308299
86	NC_019734	CAA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308299
87	NC_019734	TTG	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308299
88	NC_019734	TAA	2	6	8649	8654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308299
89	NC_019734	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308299
90	NC_019734	AGA	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308299
91	NC_019734	TTA	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308299
92	NC_019734	CAT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308299
93	NC_019734	ATT	2	6	9968	9973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308300
94	NC_019734	TCA	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308300
95	NC_019734	TTC	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308300
96	NC_019734	CTG	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308300
97	NC_019734	GGA	2	6	10234	10239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308300
98	NC_019734	CCT	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
99	NC_019734	CTT	2	6	10280	10285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308300
100	NC_019734	ATC	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308300
101	NC_019734	TAA	2	6	10634	10639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308300
102	NC_019734	CTC	2	6	10673	10678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
103	NC_019734	TCC	2	6	10770	10775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308300
104	NC_019734	CTT	2	6	11204	11209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308301
105	NC_019734	TAA	2	6	11237	11242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308301
106	NC_019734	ATA	2	6	11309	11314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308301
107	NC_019734	TAA	2	6	11406	11411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308301
108	NC_019734	CTA	2	6	11508	11513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308301
109	NC_019734	AGC	2	6	11527	11532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308301
110	NC_019734	ATT	2	6	11651	11656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308301
111	NC_019734	AAT	2	6	11677	11682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308301
112	NC_019734	TTC	2	6	11873	11878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308301
113	NC_019734	TTC	2	6	11914	11919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308301
114	NC_019734	AAC	2	6	12016	12021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308301
115	NC_019734	TGC	2	6	12305	12310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308302
116	NC_019734	CAG	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308302
117	NC_019734	TTC	2	6	12581	12586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308302
118	NC_019734	TCA	2	6	12589	12594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308302
119	NC_019734	CCA	2	6	12885	12890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308303
120	NC_019734	GTT	2	6	12906	12911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308303
121	NC_019734	CAT	2	6	12981	12986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308303
122	NC_019734	CAA	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308303
123	NC_019734	ATC	2	6	13098	13103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308303
124	NC_019734	TTC	2	6	13215	13220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308303
125	NC_019734	TAA	2	6	13227	13232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308303
126	NC_019734	TCA	2	6	13273	13278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308303
127	NC_019734	ATA	2	6	13552	13557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308303
128	NC_019734	CAC	2	6	13625	13630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308303
129	NC_019734	CAG	2	6	13667	13672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308303
130	NC_019734	CAA	2	6	13679	13684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308303
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133	NC_019734	TGA	2	6	13842	13847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308303
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135	NC_019734	CTT	2	6	14000	14005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308303
136	NC_019734	GTA	2	6	14109	14114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308303
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