MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019728	CTT	2	6	26186	26191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303585
502	NC_019728	C	6	6	26238	26243	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
503	NC_019728	TAG	2	6	26265	26270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303585
504	NC_019728	GTCGG	2	10	26292	26301	0 %	20 %	60 %	20 %	428303585
505	NC_019728	TCC	2	6	26340	26345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303585
506	NC_019728	TCA	2	6	26361	26366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303585
507	NC_019728	CAG	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303585
508	NC_019728	ACCA	2	8	26430	26437	50 %	0 %	0 %	50 %	428303585
509	NC_019728	C	7	7	26444	26450	0 %	0 %	0 %	100 %	428303585
510	NC_019728	TAC	2	6	26542	26547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303585
511	NC_019728	A	6	6	26562	26567	100 %	0 %	0 %	0 %	428303585
512	NC_019728	CAG	2	6	26581	26586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303585
513	NC_019728	TGC	2	6	26685	26690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303585
514	NC_019728	ATC	2	6	26805	26810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303585
515	NC_019728	TCA	2	6	26814	26819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303585
516	NC_019728	TAA	2	6	26841	26846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303585
517	NC_019728	CCT	2	6	26860	26865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303585
518	NC_019728	CCA	2	6	26866	26871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303585
519	NC_019728	TAAT	2	8	26898	26905	50 %	50 %	0 %	0 %	428303585
520	NC_019728	TCG	2	6	26923	26928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303585
521	NC_019728	ATG	2	6	27233	27238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303586
522	NC_019728	TATT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	428303586
523	NC_019728	AGG	2	6	27321	27326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303586
524	NC_019728	TGA	2	6	27403	27408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303586
525	NC_019728	CGA	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303587
526	NC_019728	GAT	2	6	28328	28333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303587
527	NC_019728	A	6	6	28494	28499	100 %	0 %	0 %	0 %	428303587
528	NC_019728	ATAA	2	8	28508	28515	75 %	25 %	0 %	0 %	428303587
529	NC_019728	TGC	2	6	28545	28550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303587
530	NC_019728	TAA	2	6	28564	28569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303587
531	NC_019728	AAGT	2	8	28582	28589	50 %	25 %	25 %	0 %	428303587
532	NC_019728	ACA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303587
533	NC_019728	TAT	2	6	28607	28612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303587
534	NC_019728	AGA	2	6	28645	28650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303587
535	NC_019728	GGAAAG	2	12	28696	28707	50 %	0 %	50 %	0 %	428303587
536	NC_019728	CAC	2	6	28716	28721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303587
537	NC_019728	T	8	8	28722	28729	0 %	100 %	0 %	0 %	428303587
538	NC_019728	ATC	2	6	28794	28799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303587
539	NC_019728	ATAAAA	2	12	28810	28821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428303587
540	NC_019728	GACC	2	8	28829	28836	25 %	0 %	25 %	50 %	428303588
541	NC_019728	AAGA	2	8	28837	28844	75 %	0 %	25 %	0 %	428303588
542	NC_019728	AATT	2	8	28849	28856	50 %	50 %	0 %	0 %	428303588
543	NC_019728	GAT	2	6	28932	28937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303588
544	NC_019728	GGA	2	6	28940	28945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303588
545	NC_019728	GAA	2	6	28947	28952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303588
546	NC_019728	AAG	2	6	28969	28974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303588
547	NC_019728	GAA	2	6	29025	29030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303588
548	NC_019728	ATCAAT	2	12	29069	29080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428303588
549	NC_019728	CCA	2	6	29293	29298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303589
550	NC_019728	GGC	2	6	29351	29356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303589
551	NC_019728	CAG	2	6	29405	29410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303589
552	NC_019728	ATG	2	6	29483	29488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303589
553	NC_019728	CTC	2	6	29525	29530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303589
554	NC_019728	TCCA	2	8	29589	29596	25 %	25 %	0 %	50 %	428303589
555	NC_019728	GTAG	2	8	29605	29612	25 %	25 %	50 %	0 %	428303589
556	NC_019728	T	6	6	29635	29640	0 %	100 %	0 %	0 %	428303589
557	NC_019728	A	6	6	29662	29667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303589
558	NC_019728	TTA	2	6	29746	29751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303590
559	NC_019728	TCGC	2	8	29763	29770	0 %	25 %	25 %	50 %	428303590
560	NC_019728	TTCG	2	8	29783	29790	0 %	50 %	25 %	25 %	428303590
561	NC_019728	AAAT	2	8	29797	29804	75 %	25 %	0 %	0 %	428303590
562	NC_019728	TTA	2	6	29890	29895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303590
563	NC_019728	TTAA	2	8	29958	29965	50 %	50 %	0 %	0 %	428303590
564	NC_019728	GCA	2	6	29976	29981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303590
565	NC_019728	TGA	2	6	29993	29998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303590
566	NC_019728	TGA	2	6	30035	30040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303590
567	NC_019728	A	6	6	30046	30051	100 %	0 %	0 %	0 %	428303590
568	NC_019728	AAC	2	6	30203	30208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303590
569	NC_019728	TGA	2	6	30449	30454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303591
570	NC_019728	TGG	2	6	30457	30462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303591
571	NC_019728	TGA	2	6	30503	30508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303591
572	NC_019728	TTA	2	6	30520	30525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303591
573	NC_019728	AATG	2	8	30557	30564	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
574	NC_019728	CCTA	2	8	30582	30589	25 %	25 %	0 %	50 %	428303591
575	NC_019728	TAT	2	6	30590	30595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303591
576	NC_019728	TTTGG	2	10	30639	30648	0 %	60 %	40 %	0 %	428303591
577	NC_019728	AGA	2	6	30854	30859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303591
578	NC_019728	GAT	2	6	30921	30926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303591
579	NC_019728	GAA	2	6	30933	30938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303591
580	NC_019728	GTAA	2	8	31025	31032	50 %	25 %	25 %	0 %	428303591
581	NC_019728	AAT	2	6	31093	31098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303592
582	NC_019728	ATT	2	6	31123	31128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303592
583	NC_019728	TAATC	2	10	31135	31144	40 %	40 %	0 %	20 %	428303592
584	NC_019728	AAT	2	6	31193	31198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303592
585	NC_019728	GAA	3	9	31208	31216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303592
586	NC_019728	GTA	2	6	31254	31259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303592
587	NC_019728	ATT	3	9	31270	31278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303592
588	NC_019728	GCA	2	6	31379	31384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303592
589	NC_019728	CGG	2	6	31431	31436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303592
590	NC_019728	AAT	2	6	31438	31443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303592
591	NC_019728	GAT	2	6	31472	31477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303592
592	NC_019728	GAA	2	6	31487	31492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303592
593	NC_019728	ACT	2	6	31531	31536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303592
594	NC_019728	A	6	6	31557	31562	100 %	0 %	0 %	0 %	428303592
595	NC_019728	GCG	2	6	31574	31579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303592
596	NC_019728	CTT	2	6	31850	31855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303593
597	NC_019728	ATC	2	6	31866	31871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303593
598	NC_019728	TTC	2	6	31932	31937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303593
599	NC_019728	CTG	2	6	31958	31963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303593
600	NC_019728	T	6	6	32013	32018	0 %	100 %	0 %	0 %	428303593
601	NC_019728	A	7	7	32031	32037	100 %	0 %	0 %	0 %	428303593
602	NC_019728	T	8	8	32109	32116	0 %	100 %	0 %	0 %	428303593
603	NC_019728	TACT	2	8	32288	32295	25 %	50 %	0 %	25 %	428303594
604	NC_019728	GCA	2	6	32401	32406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303594
605	NC_019728	ACC	2	6	32515	32520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303594
606	NC_019728	ATT	2	6	32532	32537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303594
607	NC_019728	CAAT	2	8	33382	33389	50 %	25 %	0 %	25 %	428303595
608	NC_019728	AAT	2	6	33427	33432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303595
609	NC_019728	TGC	2	6	33467	33472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303595
610	NC_019728	CAT	3	9	33486	33494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303595
611	NC_019728	ACC	2	6	33601	33606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303595
612	NC_019728	ACA	2	6	33633	33638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303595
613	NC_019728	TGC	2	6	33961	33966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303595
614	NC_019728	ATA	3	9	34001	34009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303595
615	NC_019728	ACC	2	6	34038	34043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303595
616	NC_019728	TTA	2	6	34068	34073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303595
617	NC_019728	CAT	2	6	34113	34118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303595
618	NC_019728	ATT	2	6	34123	34128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303595
619	NC_019728	TC	3	6	34133	34138	0 %	50 %	0 %	50 %	428303595
620	NC_019728	TGG	2	6	34242	34247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303595
621	NC_019728	CTG	2	6	34273	34278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303595
622	NC_019728	TCT	2	6	34279	34284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303595
623	NC_019728	ATT	2	6	34345	34350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303595
624	NC_019728	TTGA	2	8	34352	34359	25 %	50 %	25 %	0 %	428303595
625	NC_019728	TCT	2	6	34379	34384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303595
626	NC_019728	CAA	2	6	34429	34434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303595
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628	NC_019728	GAG	2	6	34621	34626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303595
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