MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 1247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019727	TG	3	6	30886	30891	0 %	50 %	50 %	0 %	428303497
502	NC_019727	AGA	2	6	30938	30943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303497
503	NC_019727	CAA	2	6	30972	30977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303497
504	NC_019727	AATA	2	8	31049	31056	75 %	25 %	0 %	0 %	428303498
505	NC_019727	GTT	2	6	31078	31083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303498
506	NC_019727	C	6	6	31104	31109	0 %	0 %	0 %	100 %	428303498
507	NC_019727	TAA	2	6	31144	31149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303498
508	NC_019727	TGC	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303498
509	NC_019727	AACCAG	2	12	31192	31203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428303498
510	NC_019727	GAACGA	2	12	31214	31225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428303498
511	NC_019727	ACCC	2	8	31276	31283	25 %	0 %	0 %	75 %	428303498
512	NC_019727	CCG	2	6	31300	31305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303498
513	NC_019727	CAACCC	2	12	31327	31338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303498
514	NC_019727	A	6	6	31874	31879	100 %	0 %	0 %	0 %	428303499
515	NC_019727	AAGA	2	8	31915	31922	75 %	0 %	25 %	0 %	428303499
516	NC_019727	ATT	2	6	31981	31986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303499
517	NC_019727	GATGTT	2	12	32064	32075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428303499
518	NC_019727	TGG	2	6	32079	32084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303499
519	NC_019727	CCG	2	6	32096	32101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303499
520	NC_019727	GGTT	2	8	32167	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	428303499
521	NC_019727	CAA	2	6	32239	32244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303499
522	NC_019727	A	6	6	32269	32274	100 %	0 %	0 %	0 %	428303499
523	NC_019727	TTCCC	2	10	32316	32325	0 %	40 %	0 %	60 %	428303499
524	NC_019727	CAC	2	6	32448	32453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303499
525	NC_019727	CCA	2	6	32525	32530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303499
526	NC_019727	TTGG	2	8	32546	32553	0 %	50 %	50 %	0 %	428303499
527	NC_019727	AAT	2	6	33039	33044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303500
528	NC_019727	TCA	2	6	33050	33055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303500
529	NC_019727	GCG	2	6	33128	33133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303500
530	NC_019727	TGG	2	6	33327	33332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303500
531	NC_019727	ATTG	2	8	33384	33391	25 %	50 %	25 %	0 %	428303500
532	NC_019727	ACA	2	6	33425	33430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303500
533	NC_019727	GAA	2	6	33517	33522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303500
534	NC_019727	TTA	2	6	33544	33549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303500
535	NC_019727	ATT	2	6	33626	33631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303500
536	NC_019727	TTG	2	6	33638	33643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303500
537	NC_019727	CAA	2	6	33814	33819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303500
538	NC_019727	ATT	2	6	33826	33831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303500
539	NC_019727	ACC	2	6	33837	33842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303500
540	NC_019727	ACC	2	6	33861	33866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303500
541	NC_019727	ATC	2	6	33957	33962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303500
542	NC_019727	A	6	6	33966	33971	100 %	0 %	0 %	0 %	428303500
543	NC_019727	CA	3	6	34112	34117	50 %	0 %	0 %	50 %	428303500
544	NC_019727	CAA	2	6	34121	34126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303500
545	NC_019727	TTA	2	6	34144	34149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303500
546	NC_019727	CAGAG	2	10	34167	34176	40 %	0 %	40 %	20 %	428303500
547	NC_019727	GGT	2	6	34201	34206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303500
548	NC_019727	CCAAA	2	10	34320	34329	60 %	0 %	0 %	40 %	428303500
549	NC_019727	TTA	2	6	34381	34386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303500
550	NC_019727	A	7	7	34462	34468	100 %	0 %	0 %	0 %	428303500
551	NC_019727	GAT	2	6	34495	34500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303500
552	NC_019727	ATGG	2	8	34563	34570	25 %	25 %	50 %	0 %	428303500
553	NC_019727	ATAC	2	8	34575	34582	50 %	25 %	0 %	25 %	428303500
554	NC_019727	TGT	2	6	34617	34622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303500
555	NC_019727	T	6	6	34773	34778	0 %	100 %	0 %	0 %	428303500
556	NC_019727	TTC	2	6	34903	34908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303500
557	NC_019727	TGG	2	6	34916	34921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303500
558	NC_019727	ATA	2	6	34922	34927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303500
559	NC_019727	TCA	2	6	34945	34950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303500
560	NC_019727	AT	3	6	34961	34966	50 %	50 %	0 %	0 %	428303500
561	NC_019727	TGA	2	6	35061	35066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303500
562	NC_019727	AGTT	2	8	35213	35220	25 %	50 %	25 %	0 %	428303500
563	NC_019727	AAG	2	6	35249	35254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303500
564	NC_019727	TAA	2	6	35268	35273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303500
565	NC_019727	GA	3	6	35877	35882	50 %	0 %	50 %	0 %	428303501
566	NC_019727	TTTA	2	8	35899	35906	25 %	75 %	0 %	0 %	428303501
567	NC_019727	ATT	2	6	36037	36042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303501
568	NC_019727	AAG	2	6	36096	36101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303501
569	NC_019727	TTG	2	6	36231	36236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303501
570	NC_019727	ATC	2	6	36342	36347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303501
571	NC_019727	AGCA	2	8	36354	36361	50 %	0 %	25 %	25 %	428303501
572	NC_019727	AGA	3	9	36415	36423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303501
573	NC_019727	CAT	2	6	36546	36551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303501
574	NC_019727	CGAG	2	8	36556	36563	25 %	0 %	50 %	25 %	428303501
575	NC_019727	ATCG	2	8	36574	36581	25 %	25 %	25 %	25 %	428303501
576	NC_019727	CAA	2	6	36653	36658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303501
577	NC_019727	CAA	2	6	37121	37126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303502
578	NC_019727	A	6	6	37159	37164	100 %	0 %	0 %	0 %	428303502
579	NC_019727	CCT	2	6	37280	37285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303502
580	NC_019727	CAG	2	6	37346	37351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303502
581	NC_019727	TAAA	2	8	37446	37453	75 %	25 %	0 %	0 %	428303502
582	NC_019727	AAG	2	6	37618	37623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303502
583	NC_019727	GTC	2	6	37673	37678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303502
584	NC_019727	TTG	2	6	37701	37706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303502
585	NC_019727	GTA	2	6	37724	37729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303502
586	NC_019727	TTC	2	6	37821	37826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303502
587	NC_019727	TTC	2	6	37842	37847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303502
588	NC_019727	GAC	2	6	37964	37969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303502
589	NC_019727	CGA	2	6	37984	37989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303502
590	NC_019727	CAGC	2	8	38000	38007	25 %	0 %	25 %	50 %	428303502
591	NC_019727	TCC	2	6	38020	38025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303502
592	NC_019727	AGA	2	6	38098	38103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303502
593	NC_019727	AGC	2	6	38278	38283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303502
594	NC_019727	TAT	2	6	38322	38327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303502
595	NC_019727	CTT	2	6	38360	38365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303503
596	NC_019727	TTC	2	6	38417	38422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303503
597	NC_019727	GAC	2	6	38587	38592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303503
598	NC_019727	CGA	3	9	38637	38645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303503
599	NC_019727	CTA	2	6	38656	38661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303503
600	NC_019727	CTG	2	6	38734	38739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303503
601	NC_019727	T	6	6	38749	38754	0 %	100 %	0 %	0 %	428303503
602	NC_019727	CAA	2	6	38768	38773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303503
603	NC_019727	ATA	2	6	38979	38984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303503
604	NC_019727	CCAA	2	8	39006	39013	50 %	0 %	0 %	50 %	428303503
605	NC_019727	TCT	2	6	39118	39123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303503
606	NC_019727	CAAC	2	8	39262	39269	50 %	0 %	0 %	50 %	428303503
607	NC_019727	TCA	2	6	39294	39299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303503
608	NC_019727	GAG	2	6	39334	39339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303503
609	NC_019727	A	6	6	39459	39464	100 %	0 %	0 %	0 %	428303503
610	NC_019727	ATT	2	6	39575	39580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303503
611	NC_019727	TCT	2	6	39627	39632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303503
612	NC_019727	CT	3	6	39662	39667	0 %	50 %	0 %	50 %	428303503
613	NC_019727	ATG	2	6	39692	39697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303503
614	NC_019727	TTGT	2	8	39727	39734	0 %	75 %	25 %	0 %	428303503
615	NC_019727	TCT	2	6	39774	39779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303503
616	NC_019727	GCT	2	6	39832	39837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303503
617	NC_019727	TGA	2	6	39852	39857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303503
618	NC_019727	ATCC	2	8	39862	39869	25 %	25 %	0 %	50 %	428303503
619	NC_019727	TAA	2	6	39889	39894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303503
620	NC_019727	AAT	2	6	39903	39908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303503
621	NC_019727	TA	3	6	39955	39960	50 %	50 %	0 %	0 %	428303503
622	NC_019727	TTTA	2	8	39962	39969	25 %	75 %	0 %	0 %	428303503
623	NC_019727	GTT	2	6	40031	40036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303504
624	NC_019727	ATA	2	6	40049	40054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303504
625	NC_019727	ATA	2	6	40079	40084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303504
626	NC_019727	GAG	2	6	40122	40127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303504
627	NC_019727	T	6	6	40183	40188	0 %	100 %	0 %	0 %	428303504
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