MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	AT	3	6	1673	1678	50 %	50 %	0 %	0 %	428204732
2	NC_019699	TA	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	428204732
3	NC_019699	CG	3	6	2587	2592	0 %	0 %	50 %	50 %	428204733
4	NC_019699	TC	3	6	2838	2843	0 %	50 %	0 %	50 %	428204733
5	NC_019699	AT	3	6	3490	3495	50 %	50 %	0 %	0 %	428204734
6	NC_019699	TA	3	6	3594	3599	50 %	50 %	0 %	0 %	428204734
7	NC_019699	CA	3	6	4132	4137	50 %	0 %	0 %	50 %	428204735
8	NC_019699	AG	3	6	4580	4585	50 %	0 %	50 %	0 %	428204735
9	NC_019699	TC	3	6	8134	8139	0 %	50 %	0 %	50 %	428204740
10	NC_019699	AC	3	6	8712	8717	50 %	0 %	0 %	50 %	428204740
11	NC_019699	TC	3	6	10351	10356	0 %	50 %	0 %	50 %	428204742
12	NC_019699	AT	3	6	12390	12395	50 %	50 %	0 %	0 %	428204744
13	NC_019699	TC	3	6	12928	12933	0 %	50 %	0 %	50 %	428204745
14	NC_019699	AT	3	6	13562	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	428204745
15	NC_019699	AT	3	6	13642	13647	50 %	50 %	0 %	0 %	428204745
16	NC_019699	TA	3	6	14299	14304	50 %	50 %	0 %	0 %	428204746
17	NC_019699	AT	3	6	16302	16307	50 %	50 %	0 %	0 %	428204748
18	NC_019699	TC	3	6	16340	16345	0 %	50 %	0 %	50 %	428204748
19	NC_019699	GA	3	6	22318	22323	50 %	0 %	50 %	0 %	428204754
20	NC_019699	GT	3	6	24260	24265	0 %	50 %	50 %	0 %	428204756
21	NC_019699	CT	3	6	24874	24879	0 %	50 %	0 %	50 %	428204756
22	NC_019699	TC	3	6	26080	26085	0 %	50 %	0 %	50 %	428204758
23	NC_019699	TG	3	6	30368	30373	0 %	50 %	50 %	0 %	428204759
24	NC_019699	TC	3	6	31091	31096	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
25	NC_019699	TC	3	6	31990	31995	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
26	NC_019699	GA	3	6	32350	32355	50 %	0 %	50 %	0 %	428204760
27	NC_019699	CT	3	6	33055	33060	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
28	NC_019699	CT	3	6	33548	33553	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
29	NC_019699	TG	3	6	34824	34829	0 %	50 %	50 %	0 %	428204762
30	NC_019699	TC	3	6	34938	34943	0 %	50 %	0 %	50 %	428204762
31	NC_019699	CG	3	6	42062	42067	0 %	0 %	50 %	50 %	428204766
32	NC_019699	AT	3	6	45131	45136	50 %	50 %	0 %	0 %	428204767
33	NC_019699	TG	3	6	45987	45992	0 %	50 %	50 %	0 %	428204768
34	NC_019699	AG	3	6	46186	46191	50 %	0 %	50 %	0 %	428204768
35	NC_019699	TC	3	6	50570	50575	0 %	50 %	0 %	50 %	428204771
36	NC_019699	AG	3	6	50832	50837	50 %	0 %	50 %	0 %	428204771
37	NC_019699	CT	3	6	51074	51079	0 %	50 %	0 %	50 %	428204771
38	NC_019699	TG	3	6	54597	54602	0 %	50 %	50 %	0 %	428204776
39	NC_019699	TG	3	6	54888	54893	0 %	50 %	50 %	0 %	428204776
40	NC_019699	AG	3	6	59820	59825	50 %	0 %	50 %	0 %	428204782
41	NC_019699	CT	3	6	60895	60900	0 %	50 %	0 %	50 %	428204783
42	NC_019699	GA	3	6	62284	62289	50 %	0 %	50 %	0 %	428204784
43	NC_019699	CG	3	6	64276	64281	0 %	0 %	50 %	50 %	428204787
44	NC_019699	AT	3	6	65101	65106	50 %	50 %	0 %	0 %	428204788
45	NC_019699	CT	3	6	66054	66059	0 %	50 %	0 %	50 %	428204789
46	NC_019699	TC	3	6	67434	67439	0 %	50 %	0 %	50 %	428204790
47	NC_019699	TG	3	6	69799	69804	0 %	50 %	50 %	0 %	428204792
48	NC_019699	TC	3	6	70648	70653	0 %	50 %	0 %	50 %	428204793
49	NC_019699	GA	3	6	71707	71712	50 %	0 %	50 %	0 %	428204794
50	NC_019699	AT	3	6	72571	72576	50 %	50 %	0 %	0 %	428204795
51	NC_019699	TG	3	6	73577	73582	0 %	50 %	50 %	0 %	428204797
52	NC_019699	TG	3	6	74040	74045	0 %	50 %	50 %	0 %	428204797
53	NC_019699	AG	3	6	75117	75122	50 %	0 %	50 %	0 %	428204798
54	NC_019699	CT	3	6	76789	76794	0 %	50 %	0 %	50 %	428204800
55	NC_019699	GA	3	6	80017	80022	50 %	0 %	50 %	0 %	428204804
56	NC_019699	GA	3	6	80582	80587	50 %	0 %	50 %	0 %	428204804
57	NC_019699	GA	3	6	82505	82510	50 %	0 %	50 %	0 %	428204807
58	NC_019699	CG	3	6	85973	85978	0 %	0 %	50 %	50 %	428204811
59	NC_019699	AG	3	6	86480	86485	50 %	0 %	50 %	0 %	428204811
60	NC_019699	TC	3	6	86676	86681	0 %	50 %	0 %	50 %	428204811
61	NC_019699	TC	3	6	87859	87864	0 %	50 %	0 %	50 %	428204812
62	NC_019699	GT	3	6	89056	89061	0 %	50 %	50 %	0 %	428204813
63	NC_019699	TC	3	6	91449	91454	0 %	50 %	0 %	50 %	428204815
64	NC_019699	TA	3	6	91540	91545	50 %	50 %	0 %	0 %	428204815
65	NC_019699	CT	3	6	92265	92270	0 %	50 %	0 %	50 %	428204816
66	NC_019699	TC	3	6	92403	92408	0 %	50 %	0 %	50 %	428204816
67	NC_019699	CA	3	6	92590	92595	50 %	0 %	0 %	50 %	428204816
68	NC_019699	TC	3	6	97774	97779	0 %	50 %	0 %	50 %	428204822
69	NC_019699	TA	3	6	98887	98892	50 %	50 %	0 %	0 %	428204822
70	NC_019699	AG	3	6	99904	99909	50 %	0 %	50 %	0 %	428204823
71	NC_019699	TA	3	6	101717	101722	50 %	50 %	0 %	0 %	428204824
72	NC_019699	GC	3	6	102893	102898	0 %	0 %	50 %	50 %	428204825
73	NC_019699	GA	3	6	104722	104727	50 %	0 %	50 %	0 %	428204826
74	NC_019699	TC	3	6	106421	106426	0 %	50 %	0 %	50 %	428204828
75	NC_019699	AC	3	6	106536	106541	50 %	0 %	0 %	50 %	428204828
76	NC_019699	GA	3	6	106598	106603	50 %	0 %	50 %	0 %	428204828
77	NC_019699	CT	3	6	106610	106615	0 %	50 %	0 %	50 %	428204828
78	NC_019699	GT	3	6	106637	106642	0 %	50 %	50 %	0 %	428204828
79	NC_019699	GC	3	6	108027	108032	0 %	0 %	50 %	50 %	428204830
80	NC_019699	TG	3	6	109085	109090	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
81	NC_019699	AG	3	6	109985	109990	50 %	0 %	50 %	0 %	428204831
82	NC_019699	TC	3	6	110121	110126	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
83	NC_019699	CG	3	6	110820	110825	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
84	NC_019699	TC	3	6	110999	111004	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
85	NC_019699	TC	3	6	111247	111252	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
86	NC_019699	GC	3	6	111578	111583	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
87	NC_019699	CA	3	6	111584	111589	50 %	0 %	0 %	50 %	428204831
88	NC_019699	GT	3	6	111712	111717	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
89	NC_019699	AG	3	6	112573	112578	50 %	0 %	50 %	0 %	428204832
90	NC_019699	CT	3	6	114467	114472	0 %	50 %	0 %	50 %	428204833
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92	NC_019699	TA	4	8	118932	118939	50 %	50 %	0 %	0 %	428204837
93	NC_019699	CA	3	6	120283	120288	50 %	0 %	0 %	50 %	428204838
94	NC_019699	CA	3	6	120574	120579	50 %	0 %	0 %	50 %	428204838
95	NC_019699	TG	3	6	122109	122114	0 %	50 %	50 %	0 %	428204840
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99	NC_019699	TC	3	6	125445	125450	0 %	50 %	0 %	50 %	428204842
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101	NC_019699	GA	4	8	128767	128774	50 %	0 %	50 %	0 %	428204845
102	NC_019699	TC	3	6	133783	133788	0 %	50 %	0 %	50 %	428204849
103	NC_019699	CA	3	6	136582	136587	50 %	0 %	0 %	50 %	428204851
104	NC_019699	CA	3	6	138235	138240	50 %	0 %	0 %	50 %	428204855
105	NC_019699	GA	3	6	139070	139075	50 %	0 %	50 %	0 %	428204856
106	NC_019699	GA	3	6	142296	142301	50 %	0 %	50 %	0 %	428204858
107	NC_019699	TG	3	6	144361	144366	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
108	NC_019699	AT	3	6	144503	144508	50 %	50 %	0 %	0 %	428204860
109	NC_019699	GT	3	6	144755	144760	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
110	NC_019699	TG	3	6	144880	144885	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
111	NC_019699	GT	3	6	145395	145400	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
112	NC_019699	GT	3	6	145647	145652	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
113	NC_019699	GT	3	6	146704	146709	0 %	50 %	50 %	0 %	428204860
114	NC_019699	TC	3	6	146844	146849	0 %	50 %	0 %	50 %	428204860
115	NC_019699	TC	3	6	147072	147077	0 %	50 %	0 %	50 %	428204860
116	NC_019699	GC	3	6	148168	148173	0 %	0 %	50 %	50 %	428204861
117	NC_019699	CT	4	8	150323	150330	0 %	50 %	0 %	50 %	428204862
118	NC_019699	TG	3	6	151523	151528	0 %	50 %	50 %	0 %	428204864
119	NC_019699	TG	3	6	159554	159559	0 %	50 %	50 %	0 %	428204869
120	NC_019699	TC	3	6	166195	166200	0 %	50 %	0 %	50 %	428204877
121	NC_019699	AT	3	6	166507	166512	50 %	50 %	0 %	0 %	428204877
122	NC_019699	AG	3	6	166819	166824	50 %	0 %	50 %	0 %	428204877
123	NC_019699	CG	3	6	167536	167541	0 %	0 %	50 %	50 %	428204878
124	NC_019699	TC	3	6	172345	172350	0 %	50 %	0 %	50 %	428204885
125	NC_019699	CG	3	6	172981	172986	0 %	0 %	50 %	50 %	428204885
126	NC_019699	TC	3	6	174264	174269	0 %	50 %	0 %	50 %	428204888
127	NC_019699	TC	3	6	174797	174802	0 %	50 %	0 %	50 %	428204889
128	NC_019699	AG	3	6	175040	175045	50 %	0 %	50 %	0 %	428204889
129	NC_019699	CA	3	6	175740	175745	50 %	0 %	0 %	50 %	428204890
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131	NC_019699	CT	3	6	177964	177969	0 %	50 %	0 %	50 %	428204892
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.